MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aciduliprofundum boonei T469 chromosome

Total Repeats: 18054

< Previous12...25262728293031323334353637Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_013926	TCC	3	9	1481366	1481374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289597218
18002	NC_013926	TTA	2	6	1481568	1481573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597218
18003	NC_013926	CTT	2	6	1481976	1481981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597219
18004	NC_013926	GAT	2	6	1481999	1482004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597219
18005	NC_013926	GTT	2	6	1482008	1482013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289597219
18006	NC_013926	GAA	2	6	1482049	1482054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597219
18007	NC_013926	ATA	2	6	1482116	1482121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597219
18008	NC_013926	GAT	2	6	1482125	1482130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597219
18009	NC_013926	GGA	2	6	1482131	1482136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597219
18010	NC_013926	ACC	2	6	1482203	1482208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289597219
18011	NC_013926	GTG	2	6	1482377	1482382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289597219
18012	NC_013926	GAA	2	6	1482707	1482712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597219
18013	NC_013926	CAA	2	6	1482724	1482729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597219
18014	NC_013926	TAG	2	6	1482768	1482773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597219
18015	NC_013926	AGA	2	6	1482979	1482984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597219
18016	NC_013926	AAG	2	6	1483131	1483136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597220
18017	NC_013926	AAG	2	6	1483318	1483323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597220
18018	NC_013926	AAG	2	6	1483370	1483375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597220
18019	NC_013926	ATA	2	6	1483554	1483559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597220
18020	NC_013926	GAT	2	6	1483581	1483586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597220
18021	NC_013926	GTA	2	6	1483713	1483718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597220
18022	NC_013926	AGG	2	6	1483747	1483752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597220
18023	NC_013926	AGC	2	6	1483977	1483982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289597220
18024	NC_013926	CAA	2	6	1483985	1483990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597220
18025	NC_013926	CTT	2	6	1483996	1484001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597220
18026	NC_013926	TAT	2	6	1484124	1484129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597220
18027	NC_013926	ACA	2	6	1484149	1484154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289597220
18028	NC_013926	GCC	2	6	1484173	1484178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289597220
18029	NC_013926	AAT	2	6	1484592	1484597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597221
18030	NC_013926	TTC	2	6	1484632	1484637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597221
18031	NC_013926	GGA	2	6	1484713	1484718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597221
18032	NC_013926	GAG	2	6	1484890	1484895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597221
18033	NC_013926	AGA	2	6	1485264	1485269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597221
18034	NC_013926	TGA	2	6	1485309	1485314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597221
18035	NC_013926	AAG	2	6	1485343	1485348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597221
18036	NC_013926	GAA	2	6	1485486	1485491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597221
18037	NC_013926	AAT	2	6	1485492	1485497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597221
18038	NC_013926	TCT	2	6	1485516	1485521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597221
18039	NC_013926	GAG	2	6	1485579	1485584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597222
18040	NC_013926	TAC	2	6	1485651	1485656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289597222
18041	NC_013926	TCT	2	6	1485689	1485694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597222
18042	NC_013926	TGA	2	6	1485785	1485790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222
18043	NC_013926	GAT	2	6	1485845	1485850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222
18044	NC_013926	CCA	2	6	1485905	1485910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289597222
18045	NC_013926	ATT	2	6	1485967	1485972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289597222
18046	NC_013926	GAA	2	6	1486045	1486050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289597222
18047	NC_013926	TAA	2	6	1486261	1486266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
18048	NC_013926	GGA	2	6	1486286	1486291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289597222
18049	NC_013926	CTT	2	6	1486320	1486325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289597222
18050	NC_013926	TAA	2	6	1486417	1486422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
18051	NC_013926	ATA	2	6	1486608	1486613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
18052	NC_013926	ATA	2	6	1486626	1486631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289597222
18053	NC_013926	ATG	2	6	1486650	1486655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222
18054	NC_013926	ATG	2	6	1486729	1486734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289597222

< Previous12...25262728293031323334353637Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.