MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013862	GTGGA	2	10	2914	2923	20 %	20 %	60 %	0 %	288986937
2	NC_013862	CCTGG	2	10	6800	6809	0 %	20 %	40 %	40 %	288986944
3	NC_013862	TCAAC	2	10	6816	6825	40 %	20 %	0 %	40 %	288986944
4	NC_013862	CCGGA	2	10	8167	8176	20 %	0 %	40 %	40 %	288986944
5	NC_013862	CCGTA	2	10	9793	9802	20 %	20 %	20 %	40 %	288986944
6	NC_013862	CAAAG	2	10	11749	11758	60 %	0 %	20 %	20 %	288986947
7	NC_013862	GTTTG	2	10	15373	15382	0 %	60 %	40 %	0 %	288986950
8	NC_013862	GGTGG	2	10	17581	17590	0 %	20 %	80 %	0 %	288986951
9	NC_013862	GGTGA	2	10	17605	17614	20 %	20 %	60 %	0 %	288986951
10	NC_013862	ATCCC	2	10	18970	18979	20 %	20 %	0 %	60 %	288986953
11	NC_013862	GGTCG	2	10	21598	21607	0 %	20 %	60 %	20 %	288986957
12	NC_013862	CAGGA	2	10	23395	23404	40 %	0 %	40 %	20 %	288986958
13	NC_013862	TCCCA	2	10	24478	24487	20 %	20 %	0 %	60 %	288986959
14	NC_013862	GGGGC	2	10	24939	24948	0 %	0 %	80 %	20 %	288986959
15	NC_013862	ACTCA	2	10	28174	28183	40 %	20 %	0 %	40 %	288986965
16	NC_013862	CTTTT	2	10	29435	29444	0 %	80 %	0 %	20 %	288986965
17	NC_013862	ATTGA	2	10	30008	30017	40 %	40 %	20 %	0 %	288986966
18	NC_013862	CACCT	2	10	31665	31674	20 %	20 %	0 %	60 %	288986968
19	NC_013862	TCCCC	2	10	33046	33055	0 %	20 %	0 %	80 %	288986970
20	NC_013862	CATTC	2	10	34766	34775	20 %	40 %	0 %	40 %	288986972
21	NC_013862	TGAAT	2	10	35184	35193	40 %	40 %	20 %	0 %	288986973

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.