MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510f

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013860	CCAGG	2	10	1294	1303	20 %	0 %	40 %	40 %	288963026
2	NC_013860	GCGAG	2	10	2920	2929	20 %	0 %	60 %	20 %	288963028
3	NC_013860	TGGCG	2	10	3868	3877	0 %	20 %	60 %	20 %	288963028
4	NC_013860	GTCCT	2	10	5372	5381	0 %	40 %	20 %	40 %	288963029
5	NC_013860	CGGGC	2	10	7178	7187	0 %	0 %	60 %	40 %	288963031
6	NC_013860	GGGCG	2	10	7580	7589	0 %	0 %	80 %	20 %	288963031
7	NC_013860	CATGG	2	10	7641	7650	20 %	20 %	40 %	20 %	288963031
8	NC_013860	GCCGG	2	10	8681	8690	0 %	0 %	60 %	40 %	288963032
9	NC_013860	ACGGC	2	10	9548	9557	20 %	0 %	40 %	40 %	288963032
10	NC_013860	CCGTC	2	10	11772	11781	0 %	20 %	20 %	60 %	288963034
11	NC_013860	GGGCG	2	10	12259	12268	0 %	0 %	80 %	20 %	288963034
12	NC_013860	GGTGA	2	10	12911	12920	20 %	20 %	60 %	0 %	288963034
13	NC_013860	CTCCG	2	10	13427	13436	0 %	20 %	20 %	60 %	288963035
14	NC_013860	TGCGG	2	10	14108	14117	0 %	20 %	60 %	20 %	288963036
15	NC_013860	GGGAG	2	10	14295	14304	20 %	0 %	80 %	0 %	288963036
16	NC_013860	GGCCG	2	10	20930	20939	0 %	0 %	60 %	40 %	288963040
17	NC_013860	GCCGG	2	10	21071	21080	0 %	0 %	60 %	40 %	288963040
18	NC_013860	CTGTC	2	10	21624	21633	0 %	40 %	20 %	40 %	288963040
19	NC_013860	CAGGA	2	10	24215	24224	40 %	0 %	40 %	20 %	288963043
20	NC_013860	TCGGC	2	10	26308	26317	0 %	20 %	40 %	40 %	288963044
21	NC_013860	GATCG	2	10	26559	26568	20 %	20 %	40 %	20 %	288963045
22	NC_013860	CCGGC	2	10	29047	29056	0 %	0 %	40 %	60 %	288963049
23	NC_013860	GCCGG	2	10	30056	30065	0 %	0 %	60 %	40 %	288963051
24	NC_013860	GGCGG	2	10	30078	30087	0 %	0 %	80 %	20 %	288963051
25	NC_013860	GCGAC	2	10	30625	30634	20 %	0 %	40 %	40 %	288963051
26	NC_013860	TTCCA	2	10	31491	31500	20 %	40 %	0 %	40 %	288963052
27	NC_013860	CCGAT	2	10	32090	32099	20 %	20 %	20 %	40 %	288963053
28	NC_013860	CGAAG	2	10	32189	32198	40 %	0 %	40 %	20 %	288963053
29	NC_013860	GCCGG	2	10	32319	32328	0 %	0 %	60 %	40 %	288963053
30	NC_013860	GCGGG	2	10	33640	33649	0 %	0 %	80 %	20 %	288963054
31	NC_013860	GGCGG	2	10	33791	33800	0 %	0 %	80 %	20 %	288963054
32	NC_013860	CCGCC	2	10	35224	35233	0 %	0 %	20 %	80 %	288963055
33	NC_013860	GTCGG	2	10	35428	35437	0 %	20 %	60 %	20 %	288963055
34	NC_013860	CCGTG	2	10	37346	37355	0 %	20 %	40 %	40 %	288963057
35	NC_013860	GGCCC	2	10	38157	38166	0 %	0 %	40 %	60 %	288963058
36	NC_013860	ACCCG	2	10	38793	38802	20 %	0 %	20 %	60 %	288963059
37	NC_013860	ACCTC	2	10	39794	39803	20 %	20 %	0 %	60 %	288963060
38	NC_013860	ATCGG	2	10	39832	39841	20 %	20 %	40 %	20 %	288963060
39	NC_013860	CGGGA	2	10	41237	41246	20 %	0 %	60 %	20 %	288963061
40	NC_013860	GGAAC	2	10	42369	42378	40 %	0 %	40 %	20 %	288963062
41	NC_013860	CGAAA	2	10	42597	42606	60 %	0 %	20 %	20 %	288963062
42	NC_013860	CGGCG	2	10	44726	44735	0 %	0 %	60 %	40 %	288963063
43	NC_013860	AGGCA	2	10	46941	46950	40 %	0 %	40 %	20 %	288963065
44	NC_013860	CCCCG	2	10	48387	48396	0 %	0 %	20 %	80 %	288963066
45	NC_013860	GCGCT	2	10	51602	51611	0 %	20 %	40 %	40 %	288963068
46	NC_013860	CCTGC	2	10	51931	51940	0 %	20 %	20 %	60 %	288963068
47	NC_013860	GATCG	2	10	54432	54441	20 %	20 %	40 %	20 %	288963071
48	NC_013860	GGACG	2	10	59700	59709	20 %	0 %	60 %	20 %	288963076
49	NC_013860	CGTCA	2	10	62490	62499	20 %	20 %	20 %	40 %	288963079
50	NC_013860	CACGG	2	10	62679	62688	20 %	0 %	40 %	40 %	288963079
51	NC_013860	GCTGG	2	10	63577	63586	0 %	20 %	60 %	20 %	288963080
52	NC_013860	ACCGC	2	10	64116	64125	20 %	0 %	20 %	60 %	288963080
53	NC_013860	CGGCC	2	10	64657	64666	0 %	0 %	40 %	60 %	288963080
54	NC_013860	GGTGG	2	10	66223	66232	0 %	20 %	80 %	0 %	288963082
55	NC_013860	GCTCA	2	10	66788	66797	20 %	20 %	20 %	40 %	288963082
56	NC_013860	GTGCT	2	10	67450	67459	0 %	40 %	40 %	20 %	288963084
57	NC_013860	CATGC	2	10	70271	70280	20 %	20 %	20 %	40 %	288963087
58	NC_013860	AGGCG	2	10	70468	70477	20 %	0 %	60 %	20 %	288963087
59	NC_013860	ACCGC	2	10	70881	70890	20 %	0 %	20 %	60 %	288963088
60	NC_013860	GGACG	2	10	71850	71859	20 %	0 %	60 %	20 %	288963089
61	NC_013860	CAGCC	2	10	72651	72660	20 %	0 %	20 %	60 %	288963090
62	NC_013860	GCCCC	2	10	73614	73623	0 %	0 %	20 %	80 %	288963091
63	NC_013860	GACCG	2	10	74510	74519	20 %	0 %	40 %	40 %	288963091
64	NC_013860	GAAGG	2	10	77865	77874	40 %	0 %	60 %	0 %	288963095
65	NC_013860	TCACC	2	10	78604	78613	20 %	20 %	0 %	60 %	288963096
66	NC_013860	GACGC	2	10	81779	81788	20 %	0 %	40 %	40 %	288963098
67	NC_013860	CAGAT	2	10	82912	82921	40 %	20 %	20 %	20 %	288963098
68	NC_013860	CGGCG	2	10	84828	84837	0 %	0 %	60 %	40 %	288963098
69	NC_013860	GCTCT	2	10	87115	87124	0 %	40 %	20 %	40 %	288963099
70	NC_013860	CAATC	2	10	87816	87825	40 %	20 %	0 %	40 %	288963099
71	NC_013860	GGCCG	2	10	88719	88728	0 %	0 %	60 %	40 %	288963100
72	NC_013860	GCCGG	2	10	88906	88915	0 %	0 %	60 %	40 %	288963100
73	NC_013860	GTCCT	2	10	89629	89638	0 %	40 %	20 %	40 %	288963100
74	NC_013860	CCCGG	2	10	89845	89854	0 %	0 %	40 %	60 %	288963100
75	NC_013860	ACGGC	2	10	90876	90885	20 %	0 %	40 %	40 %	288963100
76	NC_013860	GCGGT	2	10	91353	91362	0 %	20 %	60 %	20 %	288963100
77	NC_013860	GCATC	2	10	91737	91746	20 %	20 %	20 %	40 %	288963100
78	NC_013860	GGCCG	2	10	92086	92095	0 %	0 %	60 %	40 %	288963100
79	NC_013860	GCCCC	2	10	92157	92166	0 %	0 %	20 %	80 %	288963100
80	NC_013860	GCCTC	2	10	92384	92393	0 %	20 %	20 %	60 %	288963100
81	NC_013860	GGGTC	2	10	92943	92952	0 %	20 %	60 %	20 %	288963100
82	NC_013860	TCCGG	2	10	94056	94065	0 %	20 %	40 %	40 %	288963100
83	NC_013860	CACCG	2	10	94075	94084	20 %	0 %	20 %	60 %	288963100
84	NC_013860	CCCGT	2	10	94286	94295	0 %	20 %	20 %	60 %	288963100
85	NC_013860	GCCAA	2	10	94452	94461	40 %	0 %	20 %	40 %	288963100
86	NC_013860	GTCCC	3	15	94757	94771	0 %	20 %	20 %	60 %	288963100
87	NC_013860	TCGGC	2	10	95712	95721	0 %	20 %	40 %	40 %	288963100
88	NC_013860	AACGA	2	10	97045	97054	60 %	0 %	20 %	20 %	288963101
89	NC_013860	ACCGT	2	10	97114	97123	20 %	20 %	20 %	40 %	288963101
90	NC_013860	CCGGC	2	10	97194	97203	0 %	0 %	40 %	60 %	288963101
91	NC_013860	ACCAG	2	10	97217	97226	40 %	0 %	20 %	40 %	288963101
92	NC_013860	CCGGT	2	10	100686	100695	0 %	20 %	40 %	40 %	288963103
93	NC_013860	CGGCC	2	10	100855	100864	0 %	0 %	40 %	60 %	288963103
94	NC_013860	GCCGT	2	10	101051	101060	0 %	20 %	40 %	40 %	288963103
95	NC_013860	GGACG	2	10	102830	102839	20 %	0 %	60 %	20 %	288963105
96	NC_013860	GCCGC	2	10	104146	104155	0 %	0 %	40 %	60 %	288963108
97	NC_013860	GCATG	2	10	107262	107271	20 %	20 %	40 %	20 %	288963112
98	NC_013860	GACCG	2	10	109118	109127	20 %	0 %	40 %	40 %	288963114
99	NC_013860	GCTGG	2	10	113419	113428	0 %	20 %	60 %	20 %	288963120
100	NC_013860	ACCGC	2	10	113958	113967	20 %	0 %	20 %	60 %	288963120
101	NC_013860	CGGCC	2	10	114499	114508	0 %	0 %	40 %	60 %	288963120
102	NC_013860	GGGCC	2	10	115712	115721	0 %	0 %	60 %	40 %	288963122
103	NC_013860	GCCGG	2	10	116247	116256	0 %	0 %	60 %	40 %	288963122
104	NC_013860	GCCGT	2	10	116725	116734	0 %	20 %	40 %	40 %	288963122
105	NC_013860	CAAAA	2	10	117469	117478	80 %	0 %	0 %	20 %	288963123
106	NC_013860	CAAGC	2	10	119207	119216	40 %	0 %	20 %	40 %	288963124
107	NC_013860	CCCGC	2	10	120318	120327	0 %	0 %	20 %	80 %	288963124
108	NC_013860	CCAGC	2	10	120456	120465	20 %	0 %	20 %	60 %	288963125
109	NC_013860	CGATG	2	10	120538	120547	20 %	20 %	40 %	20 %	288963125
110	NC_013860	CGGAG	2	10	120881	120890	20 %	0 %	60 %	20 %	288963125
111	NC_013860	TCGGG	2	10	121059	121068	0 %	20 %	60 %	20 %	288963125
112	NC_013860	AACCG	2	10	121718	121727	40 %	0 %	20 %	40 %	288963125
113	NC_013860	TTCCA	2	10	122654	122663	20 %	40 %	0 %	40 %	288963126
114	NC_013860	GACGG	2	10	123241	123250	20 %	0 %	60 %	20 %	288963126
115	NC_013860	GCGCC	2	10	124781	124790	0 %	0 %	40 %	60 %	288963127
116	NC_013860	CCCAG	2	10	126753	126762	20 %	0 %	20 %	60 %	288963129
117	NC_013860	CATCG	2	10	127701	127710	20 %	20 %	20 %	40 %	288963130
118	NC_013860	ACGCC	3	15	131679	131693	20 %	0 %	20 %	60 %	288963133
119	NC_013860	TCCCC	2	10	132121	132130	0 %	20 %	0 %	80 %	288963133
120	NC_013860	GCCAG	2	10	132350	132359	20 %	0 %	40 %	40 %	288963133
121	NC_013860	CCCGC	2	10	134315	134324	0 %	0 %	20 %	80 %	288963135
122	NC_013860	GGCAT	2	10	136877	136886	20 %	20 %	40 %	20 %	288963137
123	NC_013860	CGGCA	2	10	137497	137506	20 %	0 %	40 %	40 %	288963137
124	NC_013860	GGATC	2	10	139490	139499	20 %	20 %	40 %	20 %	288963139
125	NC_013860	CTGCT	2	10	139681	139690	0 %	40 %	20 %	40 %	288963139
126	NC_013860	CTGCG	2	10	141225	141234	0 %	20 %	40 %	40 %	288963140
127	NC_013860	CCAGC	2	10	142336	142345	20 %	0 %	20 %	60 %	288963141
128	NC_013860	GCCCG	2	10	142422	142431	0 %	0 %	40 %	60 %	288963141
129	NC_013860	CCGGC	2	10	142717	142726	0 %	0 %	40 %	60 %	288963141
130	NC_013860	TCCCG	2	10	143956	143965	0 %	20 %	20 %	60 %	288963142
131	NC_013860	CACCG	2	10	144419	144428	20 %	0 %	20 %	60 %	288963142
132	NC_013860	CCTCG	2	10	148402	148411	0 %	20 %	20 %	60 %	288963145
133	NC_013860	GGCGC	2	10	149268	149277	0 %	0 %	60 %	40 %	288963146
134	NC_013860	TGCGC	2	10	154704	154713	0 %	20 %	40 %	40 %	288963150
135	NC_013860	GCGTC	2	10	156583	156592	0 %	20 %	40 %	40 %	288963152
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212	NC_013860	GCCGT	2	10	260314	260323	0 %	20 %	40 %	40 %	288963212
213	NC_013860	CGGCG	2	10	261164	261173	0 %	0 %	60 %	40 %	288963212

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.