MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum sp. B510 plasmid pAB510e

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013859	CGGCC	2	10	1237	1246	0 %	0 %	40 %	60 %	288962596
2	NC_013859	GGGCG	2	10	2695	2704	0 %	0 %	80 %	20 %	288962597
3	NC_013859	ATCGG	2	10	2973	2982	20 %	20 %	40 %	20 %	288962597
4	NC_013859	GGCCG	2	10	5558	5567	0 %	0 %	60 %	40 %	288962600
5	NC_013859	CCGGC	2	10	6380	6389	0 %	0 %	40 %	60 %	288962601
6	NC_013859	CGGCG	2	10	6903	6912	0 %	0 %	60 %	40 %	288962601
7	NC_013859	ATCCA	2	10	10345	10354	40 %	20 %	0 %	40 %	288962604
8	NC_013859	CGATC	2	10	10966	10975	20 %	20 %	20 %	40 %	288962605
9	NC_013859	CGCGC	2	10	11353	11362	0 %	0 %	40 %	60 %	288962605
10	NC_013859	GGCGA	2	10	14094	14103	20 %	0 %	60 %	20 %	288962606
11	NC_013859	CGGAG	2	10	15923	15932	20 %	0 %	60 %	20 %	288962607
12	NC_013859	GGGAG	2	10	21966	21975	20 %	0 %	80 %	0 %	288962608
13	NC_013859	GACGA	2	10	23010	23019	40 %	0 %	40 %	20 %	288962608
14	NC_013859	CCGCC	2	10	23108	23117	0 %	0 %	20 %	80 %	288962608
15	NC_013859	CCAGT	2	10	25421	25430	20 %	20 %	20 %	40 %	288962610
16	NC_013859	CGGGT	2	10	28744	28753	0 %	20 %	60 %	20 %	288962612
17	NC_013859	CTTGG	2	10	29207	29216	0 %	40 %	40 %	20 %	288962613
18	NC_013859	GCCGG	2	10	32803	32812	0 %	0 %	60 %	40 %	288962617
19	NC_013859	TCCCG	2	10	32933	32942	0 %	20 %	20 %	60 %	288962618
20	NC_013859	TGGCG	2	10	33660	33669	0 %	20 %	60 %	20 %	288962619
21	NC_013859	CCGTG	2	10	34438	34447	0 %	20 %	40 %	40 %	288962620
22	NC_013859	TGCGG	2	10	39137	39146	0 %	20 %	60 %	20 %	288962622
23	NC_013859	GTCCG	2	10	41770	41779	0 %	20 %	40 %	40 %	288962623
24	NC_013859	TGAAC	2	10	42283	42292	40 %	20 %	20 %	20 %	288962623
25	NC_013859	TGAAC	2	10	42379	42388	40 %	20 %	20 %	20 %	288962623
26	NC_013859	TCGCG	2	10	43123	43132	0 %	20 %	40 %	40 %	288962623
27	NC_013859	GGATT	2	10	44441	44450	20 %	40 %	40 %	0 %	288962623
28	NC_013859	CGATC	2	10	44614	44623	20 %	20 %	20 %	40 %	288962623
29	NC_013859	AGCGG	2	10	46602	46611	20 %	0 %	60 %	20 %	288962625
30	NC_013859	CGGGC	2	10	49577	49586	0 %	0 %	60 %	40 %	288962626
31	NC_013859	ATGGC	2	10	49894	49903	20 %	20 %	40 %	20 %	288962626
32	NC_013859	TCCGC	2	10	50546	50555	0 %	20 %	20 %	60 %	288962626
33	NC_013859	GCTGG	2	10	50986	50995	0 %	20 %	60 %	20 %	288962627
34	NC_013859	ACCGC	2	10	51525	51534	20 %	0 %	20 %	60 %	288962627
35	NC_013859	CGGCC	2	10	52066	52075	0 %	0 %	40 %	60 %	288962627
36	NC_013859	CCCGT	2	10	53737	53746	0 %	20 %	20 %	60 %	288962629
37	NC_013859	CGGAC	2	10	54359	54368	20 %	0 %	40 %	40 %	288962630
38	NC_013859	CCTTC	2	10	54428	54437	0 %	40 %	0 %	60 %	288962630
39	NC_013859	TCACG	2	10	58363	58372	20 %	20 %	20 %	40 %	288962634
40	NC_013859	CCATC	2	10	60260	60269	20 %	20 %	0 %	60 %	288962637
41	NC_013859	CATCG	2	10	66223	66232	20 %	20 %	20 %	40 %	288962639
42	NC_013859	CCGAT	2	10	68115	68124	20 %	20 %	20 %	40 %	288962639
43	NC_013859	GGCAC	2	10	68207	68216	20 %	0 %	40 %	40 %	288962639
44	NC_013859	GGCGC	2	10	68815	68824	0 %	0 %	60 %	40 %	288962639
45	NC_013859	TGGCT	2	10	69218	69227	0 %	40 %	40 %	20 %	288962639
46	NC_013859	TGGCT	2	10	69392	69401	0 %	40 %	40 %	20 %	288962639
47	NC_013859	CCGAC	2	10	69520	69529	20 %	0 %	20 %	60 %	288962639
48	NC_013859	CAATC	2	10	69715	69724	40 %	20 %	0 %	40 %	288962639
49	NC_013859	GACCG	2	10	70058	70067	20 %	0 %	40 %	40 %	288962639
50	NC_013859	CCGTC	2	10	70572	70581	0 %	20 %	20 %	60 %	288962640
51	NC_013859	GTCCC	2	10	70883	70892	0 %	20 %	20 %	60 %	288962640
52	NC_013859	CCGTC	2	10	71154	71163	0 %	20 %	20 %	60 %	288962640
53	NC_013859	TCGGC	2	10	71508	71517	0 %	20 %	40 %	40 %	288962640
54	NC_013859	GCGAC	2	10	72863	72872	20 %	0 %	40 %	40 %	288962641
55	NC_013859	TGCGA	2	10	73116	73125	20 %	20 %	40 %	20 %	288962641
56	NC_013859	CATTC	2	10	75190	75199	20 %	40 %	0 %	40 %	288962642
57	NC_013859	CTTCA	2	10	75961	75970	20 %	40 %	0 %	40 %	288962644
58	NC_013859	ACGTC	2	10	76200	76209	20 %	20 %	20 %	40 %	288962644
59	NC_013859	GTCCC	2	10	76286	76295	0 %	20 %	20 %	60 %	288962644
60	NC_013859	TGCGG	2	10	83467	83476	0 %	20 %	60 %	20 %	288962650
61	NC_013859	ATGGC	2	10	84209	84218	20 %	20 %	40 %	20 %	288962651
62	NC_013859	CGGCC	2	10	86660	86669	0 %	0 %	40 %	60 %	288962653
63	NC_013859	GCATC	2	10	88225	88234	20 %	20 %	20 %	40 %	288962653
64	NC_013859	CGGAG	2	10	89212	89221	20 %	0 %	60 %	20 %	288962653
65	NC_013859	TCGCC	2	10	90685	90694	0 %	20 %	20 %	60 %	288962653
66	NC_013859	CGGGC	2	10	93268	93277	0 %	0 %	60 %	40 %	288962656
67	NC_013859	GAACC	2	10	93709	93718	40 %	0 %	20 %	40 %	288962656
68	NC_013859	GCGCC	2	10	95236	95245	0 %	0 %	40 %	60 %	288962658
69	NC_013859	CCGGA	2	10	95888	95897	20 %	0 %	40 %	40 %	288962659
70	NC_013859	TCGGG	2	10	99086	99095	0 %	20 %	60 %	20 %	288962661
71	NC_013859	GGCAA	2	10	100195	100204	40 %	0 %	40 %	20 %	288962661
72	NC_013859	CCGAC	2	10	103979	103988	20 %	0 %	20 %	60 %	288962661
73	NC_013859	CCGCC	2	10	107903	107912	0 %	0 %	20 %	80 %	288962662
74	NC_013859	CCGTG	2	10	108717	108726	0 %	20 %	40 %	40 %	288962662
75	NC_013859	CCAGG	2	10	109296	109305	20 %	0 %	40 %	40 %	288962662
76	NC_013859	CGCGG	2	10	111736	111745	0 %	0 %	60 %	40 %	288962664
77	NC_013859	CCTCG	2	10	113766	113775	0 %	20 %	20 %	60 %	288962666
78	NC_013859	GCGGG	2	10	117901	117910	0 %	0 %	80 %	20 %	288962671
79	NC_013859	TGGCG	2	10	120580	120589	0 %	20 %	60 %	20 %	288962673
80	NC_013859	TCGCC	2	10	120636	120645	0 %	20 %	20 %	60 %	288962673
81	NC_013859	AGCCC	2	10	121701	121710	20 %	0 %	20 %	60 %	288962674
82	NC_013859	GCCGA	2	10	121805	121814	20 %	0 %	40 %	40 %	288962674
83	NC_013859	GGCTG	2	10	122622	122631	0 %	20 %	60 %	20 %	288962675
84	NC_013859	CATGG	2	10	125071	125080	20 %	20 %	40 %	20 %	288962676
85	NC_013859	GCCGG	2	10	125825	125834	0 %	0 %	60 %	40 %	288962676
86	NC_013859	CCCCG	2	10	126594	126603	0 %	0 %	20 %	80 %	288962677
87	NC_013859	GGCAG	2	10	126949	126958	20 %	0 %	60 %	20 %	288962678
88	NC_013859	GGCCG	2	10	127898	127907	0 %	0 %	60 %	40 %	288962679
89	NC_013859	TGACC	2	10	127972	127981	20 %	20 %	20 %	40 %	288962679
90	NC_013859	GCGCC	2	10	129812	129821	0 %	0 %	40 %	60 %	288962682
91	NC_013859	GTCGG	2	10	130927	130936	0 %	20 %	60 %	20 %	288962683
92	NC_013859	GTGCG	2	10	131030	131039	0 %	20 %	60 %	20 %	288962683
93	NC_013859	GGCTG	2	10	131373	131382	0 %	20 %	60 %	20 %	288962683
94	NC_013859	CGGCG	2	10	131478	131487	0 %	0 %	60 %	40 %	288962683
95	NC_013859	CTGCG	2	10	131628	131637	0 %	20 %	40 %	40 %	288962683
96	NC_013859	CGGCG	2	10	132005	132014	0 %	0 %	60 %	40 %	288962684
97	NC_013859	CCGAC	2	10	132642	132651	20 %	0 %	20 %	60 %	288962685
98	NC_013859	GCCAG	2	10	133429	133438	20 %	0 %	40 %	40 %	288962686
99	NC_013859	TCCCG	2	10	134929	134938	0 %	20 %	20 %	60 %	288962687
100	NC_013859	GCCGC	2	10	135681	135690	0 %	0 %	40 %	60 %	288962688
101	NC_013859	GCGCC	2	10	137236	137245	0 %	0 %	40 %	60 %	288962689
102	NC_013859	TGGGG	2	10	137986	137995	0 %	20 %	80 %	0 %	288962691
103	NC_013859	GCGCC	2	10	138628	138637	0 %	0 %	40 %	60 %	288962691
104	NC_013859	ATCGA	2	10	139678	139687	40 %	20 %	20 %	20 %	288962693
105	NC_013859	CGTCA	2	10	142905	142914	20 %	20 %	20 %	40 %	288962697
106	NC_013859	GCGCC	2	10	144832	144841	0 %	0 %	40 %	60 %	288962699
107	NC_013859	GCCAG	2	10	145725	145734	20 %	0 %	40 %	40 %	288962700
108	NC_013859	GCGCC	2	10	146559	146568	0 %	0 %	40 %	60 %	288962701
109	NC_013859	GGCGC	2	10	146955	146964	0 %	0 %	60 %	40 %	288962701
110	NC_013859	TGACC	2	10	147189	147198	20 %	20 %	20 %	40 %	288962701
111	NC_013859	GGGCA	2	10	148509	148518	20 %	0 %	60 %	20 %	288962703
112	NC_013859	CGGTG	2	10	148556	148565	0 %	20 %	60 %	20 %	288962703
113	NC_013859	GCCCC	2	10	153689	153698	0 %	0 %	20 %	80 %	288962710
114	NC_013859	GTCCA	2	10	153941	153950	20 %	20 %	20 %	40 %	288962710
115	NC_013859	CCGGC	2	10	154295	154304	0 %	0 %	40 %	60 %	288962710
116	NC_013859	CCGCT	2	10	154353	154362	0 %	20 %	20 %	60 %	288962711
117	NC_013859	GGCCC	2	10	154375	154384	0 %	0 %	40 %	60 %	288962711
118	NC_013859	CAGGC	2	10	155447	155456	20 %	0 %	40 %	40 %	288962712
119	NC_013859	CGGCC	2	10	156987	156996	0 %	0 %	40 %	60 %	288962713
120	NC_013859	CCGGC	2	10	159154	159163	0 %	0 %	40 %	60 %	288962715
121	NC_013859	TCGGC	2	10	160814	160823	0 %	20 %	40 %	40 %	288962716
122	NC_013859	CGCGC	2	10	160971	160980	0 %	0 %	40 %	60 %	288962716
123	NC_013859	CGACC	2	10	161313	161322	20 %	0 %	20 %	60 %	288962716
124	NC_013859	GACGC	2	10	161350	161359	20 %	0 %	40 %	40 %	288962716
125	NC_013859	GGCGA	2	10	164472	164481	20 %	0 %	60 %	20 %	288962719
126	NC_013859	GCGCC	2	10	168701	168710	0 %	0 %	40 %	60 %	288962723
127	NC_013859	CGGCC	2	10	170345	170354	0 %	0 %	40 %	60 %	288962725
128	NC_013859	GGCGT	2	10	174975	174984	0 %	20 %	60 %	20 %	288962729
129	NC_013859	CTGGC	2	10	175761	175770	0 %	20 %	40 %	40 %	288962729
130	NC_013859	CGGCG	2	10	177694	177703	0 %	0 %	60 %	40 %	288962732
131	NC_013859	CCGGC	2	10	180472	180481	0 %	0 %	40 %	60 %	288962733
132	NC_013859	CGGTG	2	10	181655	181664	0 %	20 %	60 %	20 %	288962733
133	NC_013859	CCGGT	2	10	181909	181918	0 %	20 %	40 %	40 %	288962733
134	NC_013859	GGCCT	2	10	183334	183343	0 %	20 %	40 %	40 %	288962734
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.