MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 75679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_013851	GAA	2	6	314986	314991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288940021
6502	NC_013851	GGC	2	6	315006	315011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940021
6503	NC_013851	GC	5	10	315153	315162	0 %	0 %	50 %	50 %	288940021
6504	NC_013851	ATC	2	6	315218	315223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940021
6505	NC_013851	AGC	2	6	315224	315229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940021
6506	NC_013851	GGT	2	6	315250	315255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940021
6507	NC_013851	CGC	2	6	315295	315300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940021
6508	NC_013851	GCC	2	6	315301	315306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940021
6509	NC_013851	CGA	2	6	315321	315326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940021
6510	NC_013851	TCG	2	6	315374	315379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940021
6511	NC_013851	GGC	3	9	315454	315462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940021
6512	NC_013851	TGT	2	6	315489	315494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288940021
6513	NC_013851	CGC	2	6	315823	315828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940022
6514	NC_013851	TGC	2	6	316014	316019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940022
6515	NC_013851	CTG	2	6	316025	316030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940022
6516	NC_013851	GC	3	6	316037	316042	0 %	0 %	50 %	50 %	288940022
6517	NC_013851	GGTC	2	8	316129	316136	0 %	25 %	50 %	25 %	288940022
6518	NC_013851	GGC	2	6	316137	316142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940022
6519	NC_013851	TAC	2	6	316148	316153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940022
6520	NC_013851	TGA	2	6	316200	316205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940022
6521	NC_013851	CAT	2	6	316749	316754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
6522	NC_013851	GAC	2	6	316834	316839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6523	NC_013851	CGG	2	6	316899	316904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6524	NC_013851	CGT	2	6	316926	316931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6525	NC_013851	TGG	2	6	316985	316990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940023
6526	NC_013851	ACA	2	6	316994	316999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6527	NC_013851	AAC	2	6	317026	317031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6528	NC_013851	GGCG	2	8	317100	317107	0 %	0 %	75 %	25 %	288940023
6529	NC_013851	CGG	2	6	317121	317126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6530	NC_013851	GCC	2	6	317332	317337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940023
6531	NC_013851	GGC	2	6	317350	317355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6532	NC_013851	CGA	2	6	317361	317366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6533	NC_013851	CGGC	2	8	317447	317454	0 %	0 %	50 %	50 %	288940023
6534	NC_013851	CAA	2	6	317532	317537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6535	NC_013851	AAC	2	6	317560	317565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6536	NC_013851	GCG	2	6	317630	317635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6537	NC_013851	GTC	2	6	317653	317658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6538	NC_013851	CGA	2	6	317667	317672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6539	NC_013851	TCC	2	6	317701	317706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940023
6540	NC_013851	GATC	2	8	317712	317719	25 %	25 %	25 %	25 %	288940023
6541	NC_013851	GAC	2	6	317781	317786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6542	NC_013851	CCT	2	6	317820	317825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940023
6543	NC_013851	CAA	2	6	317841	317846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6544	NC_013851	CTC	2	6	317892	317897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940023
6545	NC_013851	ATCA	2	8	317932	317939	50 %	25 %	0 %	25 %	288940023
6546	NC_013851	CCA	2	6	317999	318004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940023
6547	NC_013851	CAA	2	6	318027	318032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6548	NC_013851	AGC	2	6	318082	318087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6549	NC_013851	CGG	2	6	318102	318107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6550	NC_013851	CGG	2	6	318129	318134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6551	NC_013851	CTA	2	6	318150	318155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
6552	NC_013851	ACA	2	6	318278	318283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6553	NC_013851	ATC	2	6	318316	318321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
6554	NC_013851	CGG	2	6	318354	318359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6555	NC_013851	GGC	2	6	318376	318381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6556	NC_013851	CAT	2	6	318453	318458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
6557	NC_013851	CAA	2	6	318477	318482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
6558	NC_013851	CTG	4	12	318508	318519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6559	NC_013851	TCC	2	6	318613	318618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940023
6560	NC_013851	CGG	2	6	318656	318661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6561	NC_013851	GCT	2	6	318681	318686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940023
6562	NC_013851	GGC	2	6	318706	318711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6563	NC_013851	CTA	2	6	318762	318767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
6564	NC_013851	GGC	2	6	318817	318822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
6565	NC_013851	ATC	2	6	318865	318870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
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6568	NC_013851	ATCG	2	8	318927	318934	25 %	25 %	25 %	25 %	288940023
6569	NC_013851	CAT	2	6	318966	318971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940023
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6571	NC_013851	ATGG	2	8	318994	319001	25 %	25 %	50 %	0 %	288940023
6572	NC_013851	CGG	2	6	319086	319091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940023
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6574	NC_013851	GAT	2	6	319225	319230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940023
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6583	NC_013851	TCG	2	6	319649	319654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940023
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6585	NC_013851	CAA	2	6	319707	319712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940023
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6587	NC_013851	CGCA	2	8	320593	320600	25 %	0 %	25 %	50 %	288940024
6588	NC_013851	TCA	2	6	320646	320651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940024
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6590	NC_013851	CAG	2	6	320794	320799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940024
6591	NC_013851	CGA	2	6	320878	320883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940024
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6593	NC_013851	GGC	2	6	320926	320931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940024
6594	NC_013851	TCC	2	6	320948	320953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940024
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6599	NC_013851	CG	3	6	321329	321334	0 %	0 %	50 %	50 %	288940024
6600	NC_013851	GCG	2	6	321525	321530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940024
6601	NC_013851	CGA	2	6	321570	321575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940024
6602	NC_013851	CTC	2	6	321592	321597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940024
6603	NC_013851	TGC	2	6	321611	321616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940024
6604	NC_013851	CG	3	6	321628	321633	0 %	0 %	50 %	50 %	288940024
6605	NC_013851	CAG	2	6	321661	321666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940024
6606	NC_013851	TCC	2	6	321692	321697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940024
6607	NC_013851	CTC	2	6	321733	321738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940024
6608	NC_013851	GTC	2	6	321751	321756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940024
6609	NC_013851	ATCG	2	8	321778	321785	25 %	25 %	25 %	25 %	288940024
6610	NC_013851	GCTTG	2	10	321798	321807	0 %	40 %	40 %	20 %	288940024
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6612	NC_013851	CCGTC	2	10	321972	321981	0 %	20 %	20 %	60 %	288940024
6613	NC_013851	TCG	3	9	321983	321991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940024
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6616	NC_013851	GACC	2	8	322029	322036	25 %	0 %	25 %	50 %	288940024
6617	NC_013851	GCC	2	6	322102	322107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940024
6618	NC_013851	GTC	2	6	322108	322113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940024
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6620	NC_013851	ACCG	2	8	322186	322193	25 %	0 %	25 %	50 %	288940024
6621	NC_013851	CGCCA	2	10	322215	322224	20 %	0 %	20 %	60 %	288940024
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6982	NC_013851	CG	3	6	340494	340499	0 %	0 %	50 %	50 %	288940039
6983	NC_013851	GCG	2	6	340514	340519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940039
6984	NC_013851	CGAT	2	8	340536	340543	25 %	25 %	25 %	25 %	288940039
6985	NC_013851	TGG	2	6	340582	340587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940039
6986	NC_013851	GGA	2	6	340648	340653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288940039
6987	NC_013851	CCGC	2	8	340732	340739	0 %	0 %	25 %	75 %	288940039
6988	NC_013851	GC	3	6	340738	340743	0 %	0 %	50 %	50 %	288940039
6989	NC_013851	TCGAG	2	10	340749	340758	20 %	20 %	40 %	20 %	288940039
6990	NC_013851	ACG	2	6	340818	340823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940039
6991	NC_013851	GC	3	6	340837	340842	0 %	0 %	50 %	50 %	288940039
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