MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 51912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013851	GGC	2	6	351066	351071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940048
5002	NC_013851	GCA	2	6	351092	351097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940048
5003	NC_013851	CGG	2	6	351121	351126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940048
5004	NC_013851	TGA	2	6	351164	351169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940048
5005	NC_013851	CCG	2	6	351214	351219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940048
5006	NC_013851	TCG	2	6	351307	351312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940048
5007	NC_013851	TCG	2	6	351427	351432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940048
5008	NC_013851	CGG	3	9	351518	351526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940048
5009	NC_013851	CAG	2	6	351537	351542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940048
5010	NC_013851	GCC	2	6	351548	351553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940048
5011	NC_013851	TCC	2	6	351751	351756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940048
5012	NC_013851	GCG	2	6	351797	351802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940048
5013	NC_013851	TGA	2	6	351863	351868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940048
5014	NC_013851	GCC	2	6	351880	351885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940048
5015	NC_013851	CGG	3	9	351893	351901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940048
5016	NC_013851	GCC	2	6	352018	352023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940048
5017	NC_013851	GCC	2	6	352122	352127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940048
5018	NC_013851	CCG	2	6	352420	352425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940049
5019	NC_013851	GGA	2	6	352451	352456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288940049
5020	NC_013851	CGT	2	6	352479	352484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940049
5021	NC_013851	CAG	2	6	352565	352570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940049
5022	NC_013851	ATC	2	6	352963	352968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940050
5023	NC_013851	ACC	2	6	352975	352980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940050
5024	NC_013851	CGG	2	6	353019	353024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940050
5025	NC_013851	CGT	2	6	353242	353247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940050
5026	NC_013851	CCG	2	6	353265	353270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940050
5027	NC_013851	ACG	2	6	353342	353347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940050
5028	NC_013851	CAT	2	6	353349	353354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940050
5029	NC_013851	CGC	3	9	353358	353366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940050
5030	NC_013851	CGA	3	9	353472	353480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940050
5031	NC_013851	CGC	2	6	353501	353506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940050
5032	NC_013851	ACC	2	6	353521	353526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940050
5033	NC_013851	CGG	2	6	353568	353573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940050
5034	NC_013851	CGG	2	6	353589	353594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940050
5035	NC_013851	ACC	2	6	353644	353649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288940050
5036	NC_013851	CGA	2	6	353724	353729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940050
5037	NC_013851	CCG	2	6	353834	353839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940051
5038	NC_013851	GCC	2	6	353858	353863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940051
5039	NC_013851	CGG	2	6	353873	353878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940051
5040	NC_013851	CTG	2	6	353965	353970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940051
5041	NC_013851	GGC	2	6	354048	354053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940051
5042	NC_013851	GCT	2	6	354138	354143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940051
5043	NC_013851	CGG	2	6	354175	354180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940051
5044	NC_013851	TCG	2	6	354270	354275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940051
5045	NC_013851	CGC	2	6	354299	354304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940051
5046	NC_013851	GCT	2	6	354378	354383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940051
5047	NC_013851	AGG	2	6	354389	354394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288940051
5048	NC_013851	CTG	2	6	354406	354411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940051
5049	NC_013851	CGC	2	6	354416	354421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940051
5050	NC_013851	TGG	2	6	354422	354427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940051
5051	NC_013851	CGA	2	6	354498	354503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940051
5052	NC_013851	CGC	2	6	354715	354720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940052
5053	NC_013851	CTG	3	9	354733	354741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
5054	NC_013851	TCG	2	6	354947	354952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
5055	NC_013851	CTG	2	6	355063	355068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
5056	NC_013851	CGA	2	6	355071	355076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940052
5057	NC_013851	TGA	2	6	355100	355105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940052
5058	NC_013851	TCA	2	6	355226	355231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288940052
5059	NC_013851	TGC	2	6	355352	355357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
5060	NC_013851	GCG	2	6	355376	355381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940052
5061	NC_013851	CGG	2	6	355388	355393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940052
5062	NC_013851	ATG	2	6	355394	355399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940052
5063	NC_013851	CAA	2	6	355560	355565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288940052
5064	NC_013851	CGG	2	6	355590	355595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940052
5065	NC_013851	CTG	2	6	355603	355608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
5066	NC_013851	GCG	2	6	355622	355627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940052
5067	NC_013851	GGC	2	6	355683	355688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940052
5068	NC_013851	GCT	2	6	355716	355721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
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5070	NC_013851	TGG	2	6	355793	355798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940052
5071	NC_013851	GCT	2	6	355980	355985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940052
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5073	NC_013851	CGA	2	6	356016	356021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940052
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5083	NC_013851	GCT	2	6	356897	356902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940053
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5086	NC_013851	TGG	2	6	357566	357571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288940054
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5090	NC_013851	CCT	2	6	357844	357849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288940055
5091	NC_013851	CGC	2	6	357870	357875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940055
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5100	NC_013851	CGC	2	6	358285	358290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940055
5101	NC_013851	ATG	2	6	358332	358337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288940055
5102	NC_013851	GCC	2	6	358369	358374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940055
5103	NC_013851	CGA	2	6	358465	358470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940055
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5105	NC_013851	GCT	2	6	358524	358529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940056
5106	NC_013851	CGA	2	6	358569	358574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940056
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5108	NC_013851	ACG	2	6	358700	358705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940056
5109	NC_013851	CGC	2	6	358717	358722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288940056
5110	NC_013851	CGA	2	6	358809	358814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940056
5111	NC_013851	AGC	2	6	358832	358837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288940056
5112	NC_013851	GTC	2	6	358840	358845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288940056
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5116	NC_013851	GCG	2	6	359069	359074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288940057
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