MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013741	GTTCAC	2	12	1388801	1388812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284162728
502	NC_013741	AAGCTA	2	12	1397774	1397785	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284162739
503	NC_013741	GAAAGC	2	12	1403366	1403377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284162744
504	NC_013741	TTTGAG	2	12	1405491	1405502	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284162747
505	NC_013741	AAAGAG	2	12	1406764	1406775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162749
506	NC_013741	ACCGTA	2	12	1410389	1410400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284162753
507	NC_013741	ACCATC	2	12	1410583	1410594	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284162753
508	NC_013741	TCCCTT	2	12	1411805	1411816	0 %	50 %	0 %	50 %	284162753
509	NC_013741	ACTGGG	2	12	1414957	1414968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284162757
510	NC_013741	TTGAAG	2	12	1423869	1423880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162774
511	NC_013741	AGGCTA	2	12	1425096	1425107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284162774
512	NC_013741	AGGACA	2	12	1425446	1425457	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284162774
513	NC_013741	GTTACG	2	12	1426752	1426763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284162776
514	NC_013741	TCGTGT	2	12	1428751	1428762	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284162778
515	NC_013741	GAAACA	2	12	1429017	1429028	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284162779
516	NC_013741	TCCACC	2	12	1436384	1436395	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	284162788
517	NC_013741	ACATCG	2	12	1442102	1442113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284162795
518	NC_013741	ATATCT	2	12	1442700	1442711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284162796
519	NC_013741	TTGGGG	2	12	1443115	1443126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284162797
520	NC_013741	TGTGAT	2	12	1443438	1443449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284162798
521	NC_013741	TAGCAA	2	12	1444591	1444602	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284162802
522	NC_013741	GATGCA	2	12	1446775	1446786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284162806
523	NC_013741	ATCGAA	2	12	1450520	1450531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284162810
524	NC_013741	AAGAGA	2	12	1454140	1454151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284162815
525	NC_013741	TACGAT	2	12	1459250	1459261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284162822
526	NC_013741	GGCTTT	2	12	1466599	1466610	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284162830
527	NC_013741	GTTAGA	2	12	1467743	1467754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284162833
528	NC_013741	TCTCCT	2	12	1471209	1471220	0 %	50 %	0 %	50 %	284162839
529	NC_013741	AAAAAT	2	12	1471330	1471341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284162840
530	NC_013741	CTACAA	2	12	1472231	1472242	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	284162843
531	NC_013741	GTTAAA	2	12	1473632	1473643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284162845
532	NC_013741	ATCGTT	2	12	1473716	1473727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284162845
533	NC_013741	AAATCG	2	12	1481086	1481097	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284162859
534	NC_013741	CCAACC	2	12	1491086	1491097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284162871
535	NC_013741	CGACAA	2	12	1491132	1491143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284162871
536	NC_013741	CCTACA	2	12	1491212	1491223	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284162871
537	NC_013741	TTGAGG	2	12	1494116	1494127	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284162873
538	NC_013741	CCAACG	2	12	1498185	1498196	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284162876
539	NC_013741	TCCACC	2	12	1498715	1498726	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	284162876
540	NC_013741	CACAAC	2	12	1501918	1501929	50 %	0 %	0 %	50 %	284162882
541	NC_013741	TAACCT	2	12	1503208	1503219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284162884
542	NC_013741	GGAAAG	2	12	1512990	1513001	50 %	0 %	50 %	0 %	284162896
543	NC_013741	TCACCA	2	12	1524198	1524209	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284162910
544	NC_013741	GCTAAC	2	12	1524774	1524785	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284162911
545	NC_013741	AGTTGC	2	12	1524792	1524803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284162911
546	NC_013741	TTTGGA	2	12	1525161	1525172	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284162911
547	NC_013741	TTTCAG	2	12	1525782	1525793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284162912
548	NC_013741	GAACAA	2	12	1528386	1528397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284162914
549	NC_013741	TCTCTA	2	12	1531568	1531579	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284162917
550	NC_013741	TCCCTC	2	12	1532287	1532298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284162917
551	NC_013741	AAAGGT	2	12	1541896	1541907	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284162928
552	NC_013741	AACACC	2	12	1543939	1543950	50 %	0 %	0 %	50 %	284162928
553	NC_013741	CCAACA	2	12	1543985	1543996	50 %	0 %	0 %	50 %	284162928
554	NC_013741	CAACAC	2	12	1544022	1544033	50 %	0 %	0 %	50 %	284162928
555	NC_013741	CAACAC	2	12	1544058	1544069	50 %	0 %	0 %	50 %	284162928
556	NC_013741	GAACTG	2	12	1544903	1544914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284162930
557	NC_013741	CATAGA	2	12	1551852	1551863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284162938
558	NC_013741	GTTGTG	2	12	1552857	1552868	0 %	50 %	50 %	0 %	284162939
559	NC_013741	TGGACT	2	12	1552895	1552906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284162939
560	NC_013741	CTTCTG	2	12	1553780	1553791	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284162940
561	NC_013741	ATGGTT	2	12	1554295	1554306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284162941
562	NC_013741	TGTCGG	2	12	1555386	1555397	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284162942
563	NC_013741	TGAACG	2	12	1558159	1558170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284162945
564	NC_013741	AAGTTA	2	12	1558806	1558817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284162946

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