MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 1389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	TTCCC	2	10	722	731	0 %	40 %	0 %	60 %	284047387
2	NC_013740	GAACA	2	10	2102	2111	60 %	0 %	20 %	20 %	284047388
3	NC_013740	ACCAC	2	10	4033	4042	40 %	0 %	0 %	60 %	284047389
4	NC_013740	GGACC	2	10	4767	4776	20 %	0 %	40 %	40 %	284047390
5	NC_013740	CCGGC	2	10	5443	5452	0 %	0 %	40 %	60 %	284047390
6	NC_013740	ACATA	2	10	5579	5588	60 %	20 %	0 %	20 %	284047391
7	NC_013740	GTGCT	2	10	9997	10006	0 %	40 %	40 %	20 %	284047395
8	NC_013740	AATGA	2	10	10629	10638	60 %	20 %	20 %	0 %	284047396
9	NC_013740	TGCCC	2	10	10865	10874	0 %	20 %	20 %	60 %	284047396
10	NC_013740	AGATG	2	10	11120	11129	40 %	20 %	40 %	0 %	284047397
11	NC_013740	AGAAA	2	10	13878	13887	80 %	0 %	20 %	0 %	284047398
12	NC_013740	TCCAG	2	10	14385	14394	20 %	20 %	20 %	40 %	284047399
13	NC_013740	GGCCA	2	10	16742	16751	20 %	0 %	40 %	40 %	284047400
14	NC_013740	GATCA	2	10	17606	17615	40 %	20 %	20 %	20 %	284047401
15	NC_013740	AAAGA	2	10	18569	18578	80 %	0 %	20 %	0 %	284047401
16	NC_013740	TACGG	2	10	22566	22575	20 %	20 %	40 %	20 %	284047406
17	NC_013740	CCGAT	2	10	30507	30516	20 %	20 %	20 %	40 %	284047411
18	NC_013740	TTCTT	2	10	31272	31281	0 %	80 %	0 %	20 %	284047412
19	NC_013740	GCTTC	2	10	33486	33495	0 %	40 %	20 %	40 %	284047414
20	NC_013740	TGCCC	2	10	34851	34860	0 %	20 %	20 %	60 %	284047415
21	NC_013740	ACGGG	2	10	35741	35750	20 %	0 %	60 %	20 %	284047415
22	NC_013740	CCTTC	2	10	37988	37997	0 %	40 %	0 %	60 %	284047418
23	NC_013740	GGTCC	2	10	38087	38096	0 %	20 %	40 %	40 %	284047418
24	NC_013740	ACGGA	2	10	40809	40818	40 %	0 %	40 %	20 %	284047420
25	NC_013740	TGAAC	2	10	41164	41173	40 %	20 %	20 %	20 %	284047420
26	NC_013740	CGAAG	2	10	43450	43459	40 %	0 %	40 %	20 %	284047420
27	NC_013740	CAGAT	2	10	43746	43755	40 %	20 %	20 %	20 %	284047420
28	NC_013740	CTTCG	2	10	48919	48928	0 %	40 %	20 %	40 %	284047424
29	NC_013740	CGGGG	2	10	51546	51555	0 %	0 %	80 %	20 %	284047427
30	NC_013740	CAATT	2	10	64692	64701	40 %	40 %	0 %	20 %	284047433
31	NC_013740	CCGTC	2	10	67190	67199	0 %	20 %	20 %	60 %	284047434
32	NC_013740	TGGAC	2	10	68273	68282	20 %	20 %	40 %	20 %	284047435
33	NC_013740	GAGCA	2	10	68290	68299	40 %	0 %	40 %	20 %	284047435
34	NC_013740	GGGGC	2	10	70728	70737	0 %	0 %	80 %	20 %	284047438
35	NC_013740	GATGT	2	10	75616	75625	20 %	40 %	40 %	0 %	284047443
36	NC_013740	ATCGG	2	10	77082	77091	20 %	20 %	40 %	20 %	284047444
37	NC_013740	GGGTG	2	10	77833	77842	0 %	20 %	80 %	0 %	284047445
38	NC_013740	GGAAA	2	10	79352	79361	60 %	0 %	40 %	0 %	284047447
39	NC_013740	CTGGG	2	10	80396	80405	0 %	20 %	60 %	20 %	284047448
40	NC_013740	CCAAC	2	10	81014	81023	40 %	0 %	0 %	60 %	284047449
41	NC_013740	TCCGG	2	10	83335	83344	0 %	20 %	40 %	40 %	284047450
42	NC_013740	TGGGC	2	10	83551	83560	0 %	20 %	60 %	20 %	284047450
43	NC_013740	GTTCC	2	10	85412	85421	0 %	40 %	20 %	40 %	284047452
44	NC_013740	GCCCG	2	10	85864	85873	0 %	0 %	40 %	60 %	284047452
45	NC_013740	ACGGA	2	10	87041	87050	40 %	0 %	40 %	20 %	284047453
46	NC_013740	GGAAC	3	15	87539	87553	40 %	0 %	40 %	20 %	284047454
47	NC_013740	GCCGG	3	15	89509	89523	0 %	0 %	60 %	40 %	284047455
48	NC_013740	AGAAA	2	10	94396	94405	80 %	0 %	20 %	0 %	284047460
49	NC_013740	CAGCG	2	10	94706	94715	20 %	0 %	40 %	40 %	284047460
50	NC_013740	TGAAC	2	10	96925	96934	40 %	20 %	20 %	20 %	284047463
51	NC_013740	CGGAA	2	10	98487	98496	40 %	0 %	40 %	20 %	284047463
52	NC_013740	AGTGA	2	10	103138	103147	40 %	20 %	40 %	0 %	284047467
53	NC_013740	GAAAT	2	10	103222	103231	60 %	20 %	20 %	0 %	284047467
54	NC_013740	ACCCC	2	10	103277	103286	20 %	0 %	0 %	80 %	284047467
55	NC_013740	GCCCG	2	10	105844	105853	0 %	0 %	40 %	60 %	284047469
56	NC_013740	AAGGT	2	10	107320	107329	40 %	20 %	40 %	0 %	284047471
57	NC_013740	ATTGT	2	10	107714	107723	20 %	60 %	20 %	0 %	284047472
58	NC_013740	GAACA	2	10	108344	108353	60 %	0 %	20 %	20 %	284047472
59	NC_013740	CCGGG	2	10	109953	109962	0 %	0 %	60 %	40 %	284047474
60	NC_013740	CCGGA	2	10	111106	111115	20 %	0 %	40 %	40 %	284047475
61	NC_013740	GGGCG	2	10	111399	111408	0 %	0 %	80 %	20 %	284047475
62	NC_013740	CCTTC	2	10	112918	112927	0 %	40 %	0 %	60 %	284047477
63	NC_013740	CGGTG	2	10	113381	113390	0 %	20 %	60 %	20 %	284047478
64	NC_013740	CGGTG	2	10	113732	113741	0 %	20 %	60 %	20 %	284047479
65	NC_013740	CTTCC	2	10	114489	114498	0 %	40 %	0 %	60 %	284047480
66	NC_013740	TGGGG	2	10	116202	116211	0 %	20 %	80 %	0 %	284047481
67	NC_013740	CCATC	2	10	116796	116805	20 %	20 %	0 %	60 %	284047481
68	NC_013740	GGTCC	2	10	116862	116871	0 %	20 %	40 %	40 %	284047481
69	NC_013740	ACGCC	2	10	118843	118852	20 %	0 %	20 %	60 %	284047482
70	NC_013740	TCCGG	2	10	124250	124259	0 %	20 %	40 %	40 %	284047488
71	NC_013740	GCCAG	2	10	126859	126868	20 %	0 %	40 %	40 %	284047490
72	NC_013740	AGGAC	2	10	127085	127094	40 %	0 %	40 %	20 %	284047491
73	NC_013740	GGAAC	2	10	127248	127257	40 %	0 %	40 %	20 %	284047491
74	NC_013740	CCAGG	2	10	130657	130666	20 %	0 %	40 %	40 %	284047496
75	NC_013740	GGGCA	2	10	132173	132182	20 %	0 %	60 %	20 %	284047498
76	NC_013740	ACGGC	2	10	132607	132616	20 %	0 %	40 %	40 %	284047498
77	NC_013740	GAACA	2	10	135830	135839	60 %	0 %	20 %	20 %	284047501
78	NC_013740	GCCCT	2	10	135911	135920	0 %	20 %	20 %	60 %	284047501
79	NC_013740	GCTCC	2	10	136074	136083	0 %	20 %	20 %	60 %	284047501
80	NC_013740	CCAGC	2	10	141285	141294	20 %	0 %	20 %	60 %	284047504
81	NC_013740	AAGGA	2	10	141557	141566	60 %	0 %	40 %	0 %	284047504
82	NC_013740	AAAGA	2	10	143296	143305	80 %	0 %	20 %	0 %	284047507
83	NC_013740	CCGTC	2	10	145192	145201	0 %	20 %	20 %	60 %	284047510
84	NC_013740	GGCCC	2	10	145680	145689	0 %	0 %	40 %	60 %	284047510
85	NC_013740	GTTCC	2	10	145971	145980	0 %	40 %	20 %	40 %	284047510
86	NC_013740	GAACG	2	10	151129	151138	40 %	0 %	40 %	20 %	284047514
87	NC_013740	TTCCA	2	10	151540	151549	20 %	40 %	0 %	40 %	284047514
88	NC_013740	TGGAA	2	10	152617	152626	40 %	20 %	40 %	0 %	284047515
89	NC_013740	GTACG	2	10	153107	153116	20 %	20 %	40 %	20 %	284047515
90	NC_013740	TGCCC	2	10	153346	153355	0 %	20 %	20 %	60 %	284047515
91	NC_013740	CCGGG	2	10	155389	155398	0 %	0 %	60 %	40 %	284047516
92	NC_013740	GAACA	2	10	157350	157359	60 %	0 %	20 %	20 %	284047518
93	NC_013740	CACGG	2	10	159698	159707	20 %	0 %	40 %	40 %	284047520
94	NC_013740	CCCGG	2	10	159755	159764	0 %	0 %	40 %	60 %	284047520
95	NC_013740	GAAAT	2	10	159774	159783	60 %	20 %	20 %	0 %	284047520
96	NC_013740	TCCGG	2	10	160195	160204	0 %	20 %	40 %	40 %	284047520
97	NC_013740	GCCAG	2	10	161285	161294	20 %	0 %	40 %	40 %	284047522
98	NC_013740	CCGGA	2	10	161390	161399	20 %	0 %	40 %	40 %	284047522
99	NC_013740	GGACG	2	10	161475	161484	20 %	0 %	60 %	20 %	284047522
100	NC_013740	CCTGG	2	10	162657	162666	0 %	20 %	40 %	40 %	284047523
101	NC_013740	CCGGA	2	10	162933	162942	20 %	0 %	40 %	40 %	284047523
102	NC_013740	CGGTA	2	10	163104	163113	20 %	20 %	40 %	20 %	284047523
103	NC_013740	GGACC	2	10	163269	163278	20 %	0 %	40 %	40 %	284047523
104	NC_013740	TATGA	2	10	163727	163736	40 %	40 %	20 %	0 %	284047524
105	NC_013740	TCCGG	2	10	164101	164110	0 %	20 %	40 %	40 %	284047524
106	NC_013740	CGGGG	2	10	166056	166065	0 %	0 %	80 %	20 %	284047526
107	NC_013740	GCCCG	2	10	166218	166227	0 %	0 %	40 %	60 %	284047526
108	NC_013740	TACCA	2	10	166787	166796	40 %	20 %	0 %	40 %	284047527
109	NC_013740	GAACA	2	10	167591	167600	60 %	0 %	20 %	20 %	284047528
110	NC_013740	GGAAG	2	10	168275	168284	40 %	0 %	60 %	0 %	284047529
111	NC_013740	CAGCA	2	10	171125	171134	40 %	0 %	20 %	40 %	284047532
112	NC_013740	GGACC	2	10	173702	173711	20 %	0 %	40 %	40 %	284047534
113	NC_013740	CGGGA	2	10	174069	174078	20 %	0 %	60 %	20 %	284047535
114	NC_013740	TCGGA	2	10	174943	174952	20 %	20 %	40 %	20 %	284047535
115	NC_013740	GGACC	2	10	175031	175040	20 %	0 %	40 %	40 %	284047535
116	NC_013740	GAAAA	2	10	175164	175173	80 %	0 %	20 %	0 %	284047535
117	NC_013740	TGACC	2	10	175657	175666	20 %	20 %	20 %	40 %	284047536
118	NC_013740	GGAAT	2	10	181247	181256	40 %	20 %	40 %	0 %	284047541
119	NC_013740	TTTCA	2	10	181958	181967	20 %	60 %	0 %	20 %	284047542
120	NC_013740	GGTCC	2	10	184809	184818	0 %	20 %	40 %	40 %	284047544
121	NC_013740	CGGAC	2	10	185067	185076	20 %	0 %	40 %	40 %	284047544
122	NC_013740	CGGAC	2	10	186497	186506	20 %	0 %	40 %	40 %	284047545
123	NC_013740	TCCCG	2	10	187578	187587	0 %	20 %	20 %	60 %	284047545
124	NC_013740	TCATC	2	10	187968	187977	20 %	40 %	0 %	40 %	284047546
125	NC_013740	TCCGG	2	10	188690	188699	0 %	20 %	40 %	40 %	284047547
126	NC_013740	CCCCT	2	10	189841	189850	0 %	20 %	0 %	80 %	284047548
127	NC_013740	CCCGG	2	10	193425	193434	0 %	0 %	40 %	60 %	284047551
128	NC_013740	GTCAT	2	10	193564	193573	20 %	40 %	20 %	20 %	284047551
129	NC_013740	TGGGC	2	10	193982	193991	0 %	20 %	60 %	20 %	284047551
130	NC_013740	GGCAC	2	10	195549	195558	20 %	0 %	40 %	40 %	284047552
131	NC_013740	GGGGT	2	10	200683	200692	0 %	20 %	80 %	0 %	284047553
132	NC_013740	GGGCA	2	10	201855	201864	20 %	0 %	60 %	20 %	284047555
133	NC_013740	CATCC	2	10	208959	208968	20 %	20 %	0 %	60 %	284047561
134	NC_013740	GCTCC	2	10	209277	209286	0 %	20 %	20 %	60 %	284047562
135	NC_013740	TACGG	2	10	212320	212329	20 %	20 %	40 %	20 %	284047564
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