MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 1389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013740	AGCTG	2	10	790672	790681	20 %	20 %	40 %	20 %	284048051
502	NC_013740	CCCAT	2	10	792538	792547	20 %	20 %	0 %	60 %	284048052
503	NC_013740	ACGGA	2	10	793192	793201	40 %	0 %	40 %	20 %	284048053
504	NC_013740	GAAGT	2	10	794271	794280	40 %	20 %	40 %	0 %	284048054
505	NC_013740	TCCAT	2	10	795892	795901	20 %	40 %	0 %	40 %	284048054
506	NC_013740	GGAAG	2	10	799258	799267	40 %	0 %	60 %	0 %	284048059
507	NC_013740	GAGAA	2	10	799763	799772	60 %	0 %	40 %	0 %	284048060
508	NC_013740	CTGTA	2	10	800255	800264	20 %	40 %	20 %	20 %	284048061
509	NC_013740	AGGGA	2	10	803619	803628	40 %	0 %	60 %	0 %	284048064
510	NC_013740	CGGAT	2	10	804281	804290	20 %	20 %	40 %	20 %	284048064
511	NC_013740	TCCGT	2	10	804309	804318	0 %	40 %	20 %	40 %	284048064
512	NC_013740	CATCA	2	10	807711	807720	40 %	20 %	0 %	40 %	284048065
513	NC_013740	TTACC	2	10	808307	808316	20 %	40 %	0 %	40 %	284048065
514	NC_013740	ATGCC	2	10	811754	811763	20 %	20 %	20 %	40 %	284048068
515	NC_013740	GCCAT	2	10	812579	812588	20 %	20 %	20 %	40 %	284048068
516	NC_013740	AGAGA	2	10	817779	817788	60 %	0 %	40 %	0 %	284048073
517	NC_013740	CCTGA	2	10	817876	817885	20 %	20 %	20 %	40 %	284048073
518	NC_013740	ATGCC	2	10	821065	821074	20 %	20 %	20 %	40 %	284048075
519	NC_013740	TGGAC	2	10	821164	821173	20 %	20 %	40 %	20 %	284048075
520	NC_013740	GGGGA	2	10	821445	821454	20 %	0 %	80 %	0 %	284048075
521	NC_013740	AACAA	2	10	822682	822691	80 %	0 %	0 %	20 %	284048075
522	NC_013740	CTACA	2	10	822988	822997	40 %	20 %	0 %	40 %	284048075
523	NC_013740	CATCA	2	10	828893	828902	40 %	20 %	0 %	40 %	284048078
524	NC_013740	GGGAA	2	10	830679	830688	40 %	0 %	60 %	0 %	284048079
525	NC_013740	TATAA	2	10	830881	830890	60 %	40 %	0 %	0 %	284048079
526	NC_013740	GTATG	2	10	831655	831664	20 %	40 %	40 %	0 %	284048082
527	NC_013740	AGGCC	2	10	831965	831974	20 %	0 %	40 %	40 %	284048082
528	NC_013740	GAACG	2	10	833026	833035	40 %	0 %	40 %	20 %	284048083
529	NC_013740	TGTCC	2	10	835424	835433	0 %	40 %	20 %	40 %	284048086
530	NC_013740	GGCCA	2	10	836106	836115	20 %	0 %	40 %	40 %	284048086
531	NC_013740	ATAAG	2	10	836246	836255	60 %	20 %	20 %	0 %	284048086
532	NC_013740	AAGGC	2	10	837780	837789	40 %	0 %	40 %	20 %	284048088
533	NC_013740	AACTG	2	10	838428	838437	40 %	20 %	20 %	20 %	284048088
534	NC_013740	AAGGA	2	10	838947	838956	60 %	0 %	40 %	0 %	284048088
535	NC_013740	TGTGG	2	10	839098	839107	0 %	40 %	60 %	0 %	284048089
536	NC_013740	ACCGG	2	10	840911	840920	20 %	0 %	40 %	40 %	284048091
537	NC_013740	GCCCG	2	10	841200	841209	0 %	0 %	40 %	60 %	284048091
538	NC_013740	CCTGG	2	10	841415	841424	0 %	20 %	40 %	40 %	284048091
539	NC_013740	GGCCT	2	10	843228	843237	0 %	20 %	40 %	40 %	284048093
540	NC_013740	CTGGG	2	10	845029	845038	0 %	20 %	60 %	20 %	284048094
541	NC_013740	GAAAA	2	10	851110	851119	80 %	0 %	20 %	0 %	284048100
542	NC_013740	CAGCA	2	10	852500	852509	40 %	0 %	20 %	40 %	284048102
543	NC_013740	AATAT	2	10	855599	855608	60 %	40 %	0 %	0 %	284048105
544	NC_013740	CAGCA	2	10	859232	859241	40 %	0 %	20 %	40 %	284048108
545	NC_013740	TGAAA	2	10	860289	860298	60 %	20 %	20 %	0 %	284048109
546	NC_013740	AATGC	2	10	860869	860878	40 %	20 %	20 %	20 %	284048109
547	NC_013740	TTCCT	2	10	862304	862313	0 %	60 %	0 %	40 %	284048111
548	NC_013740	AGCAA	2	10	862526	862535	60 %	0 %	20 %	20 %	284048111
549	NC_013740	TTTGT	2	10	864286	864295	0 %	80 %	20 %	0 %	284048113
550	NC_013740	TGGTG	2	10	868998	869007	0 %	40 %	60 %	0 %	284048115
551	NC_013740	ACCTT	2	10	870370	870379	20 %	40 %	0 %	40 %	284048116
552	NC_013740	GTAAA	2	10	870552	870561	60 %	20 %	20 %	0 %	284048116
553	NC_013740	ACATT	2	10	872811	872820	40 %	40 %	0 %	20 %	284048119
554	NC_013740	TGTGG	2	10	873430	873439	0 %	40 %	60 %	0 %	284048119
555	NC_013740	GGTGC	2	10	875078	875087	0 %	20 %	60 %	20 %	284048120
556	NC_013740	CCATG	2	10	875977	875986	20 %	20 %	20 %	40 %	284048120
557	NC_013740	GGGAA	2	10	876129	876138	40 %	0 %	60 %	0 %	284048120
558	NC_013740	GAACA	2	10	880886	880895	60 %	0 %	20 %	20 %	284048125
559	NC_013740	GGAAC	2	10	881275	881284	40 %	0 %	40 %	20 %	284048125
560	NC_013740	GAATG	2	10	889010	889019	40 %	20 %	40 %	0 %	284048130
561	NC_013740	GGAAC	2	10	891456	891465	40 %	0 %	40 %	20 %	284048131
562	NC_013740	CAGCC	2	10	892305	892314	20 %	0 %	20 %	60 %	284048132
563	NC_013740	ACGGT	2	10	892678	892687	20 %	20 %	40 %	20 %	284048133
564	NC_013740	TTTCC	2	10	892751	892760	0 %	60 %	0 %	40 %	284048133
565	NC_013740	AGAGA	2	10	895105	895114	60 %	0 %	40 %	0 %	284048135
566	NC_013740	TTCTT	2	10	900448	900457	0 %	80 %	0 %	20 %	284048139
567	NC_013740	CTGAC	2	10	900853	900862	20 %	20 %	20 %	40 %	284048139
568	NC_013740	TACGG	2	10	902248	902257	20 %	20 %	40 %	20 %	284048140
569	NC_013740	CGGAA	2	10	903974	903983	40 %	0 %	40 %	20 %	284048142
570	NC_013740	AGCGG	2	10	905877	905886	20 %	0 %	60 %	20 %	284048144
571	NC_013740	AAAAT	2	10	906071	906080	80 %	20 %	0 %	0 %	284048144
572	NC_013740	ACGGA	2	10	908412	908421	40 %	0 %	40 %	20 %	284048147
573	NC_013740	CCGGT	2	10	909097	909106	0 %	20 %	40 %	40 %	284048147
574	NC_013740	GAACG	2	10	909222	909231	40 %	0 %	40 %	20 %	284048147
575	NC_013740	TGCCA	2	10	909918	909927	20 %	20 %	20 %	40 %	284048149
576	NC_013740	TGCTG	2	10	909938	909947	0 %	40 %	40 %	20 %	284048149
577	NC_013740	CCGGG	2	10	910816	910825	0 %	0 %	60 %	40 %	284048150
578	NC_013740	GAACA	2	10	910934	910943	60 %	0 %	20 %	20 %	284048150
579	NC_013740	TGCCG	2	10	911836	911845	0 %	20 %	40 %	40 %	284048150
580	NC_013740	TCCAT	2	10	912880	912889	20 %	40 %	0 %	40 %	284048152
581	NC_013740	GAACC	2	10	914802	914811	40 %	0 %	20 %	40 %	284048153
582	NC_013740	ACACC	2	10	915485	915494	40 %	0 %	0 %	60 %	284048153
583	NC_013740	GCAGC	2	10	916820	916829	20 %	0 %	40 %	40 %	284048154
584	NC_013740	CCGGA	2	10	919232	919241	20 %	0 %	40 %	40 %	284048156
585	NC_013740	TGAAG	2	10	921186	921195	40 %	20 %	40 %	0 %	284048158
586	NC_013740	ACCGG	2	10	925382	925391	20 %	0 %	40 %	40 %	284048161
587	NC_013740	GGACG	2	10	925585	925594	20 %	0 %	60 %	20 %	284048161
588	NC_013740	GCTGG	2	10	927354	927363	0 %	20 %	60 %	20 %	284048162
589	NC_013740	GTCCG	2	10	929030	929039	0 %	20 %	40 %	40 %	284048163
590	NC_013740	CCGGA	2	10	934372	934381	20 %	0 %	40 %	40 %	284048166
591	NC_013740	TGATG	2	10	934644	934653	20 %	40 %	40 %	0 %	284048166
592	NC_013740	TCCGT	2	10	934908	934917	0 %	40 %	20 %	40 %	284048166
593	NC_013740	ACCGG	2	10	936644	936653	20 %	0 %	40 %	40 %	284048168
594	NC_013740	AAAAG	2	10	937141	937150	80 %	0 %	20 %	0 %	284048169
595	NC_013740	CCATG	2	10	937621	937630	20 %	20 %	20 %	40 %	284048169
596	NC_013740	TCTCC	2	10	938495	938504	0 %	40 %	0 %	60 %	284048169
597	NC_013740	CCCGG	2	10	939761	939770	0 %	0 %	40 %	60 %	284048170
598	NC_013740	CCGGA	2	10	942142	942151	20 %	0 %	40 %	40 %	284048172
599	NC_013740	AAGGG	2	10	943749	943758	40 %	0 %	60 %	0 %	284048175
600	NC_013740	GGAAC	2	10	944376	944385	40 %	0 %	40 %	20 %	284048175
601	NC_013740	GGGAA	2	10	946562	946571	40 %	0 %	60 %	0 %	284048177
602	NC_013740	GAAAA	2	10	946693	946702	80 %	0 %	20 %	0 %	284048177
603	NC_013740	GTCAT	2	10	950056	950065	20 %	40 %	20 %	20 %	284048181
604	NC_013740	TGAAG	2	10	950195	950204	40 %	20 %	40 %	0 %	284048181
605	NC_013740	CCGGG	2	10	954417	954426	0 %	0 %	60 %	40 %	284048186
606	NC_013740	CTTTC	2	10	955876	955885	0 %	60 %	0 %	40 %	284048188
607	NC_013740	GCCAC	2	10	956657	956666	20 %	0 %	20 %	60 %	284048188
608	NC_013740	CCATC	2	10	956931	956940	20 %	20 %	0 %	60 %	284048189
609	NC_013740	GGAAA	2	10	958760	958769	60 %	0 %	40 %	0 %	284048192
610	NC_013740	AAGGC	2	10	959019	959028	40 %	0 %	40 %	20 %	284048192
611	NC_013740	CCGGT	2	10	961414	961423	0 %	20 %	40 %	40 %	284048193
612	NC_013740	TGTAT	2	10	961849	961858	20 %	60 %	20 %	0 %	284048194
613	NC_013740	GGCTG	2	10	962006	962015	0 %	20 %	60 %	20 %	284048194
614	NC_013740	GGAAG	2	10	964915	964924	40 %	0 %	60 %	0 %	284048196
615	NC_013740	CCGGA	2	10	967617	967626	20 %	0 %	40 %	40 %	284048198
616	NC_013740	TCCGG	2	10	967954	967963	0 %	20 %	40 %	40 %	284048198
617	NC_013740	GAAAA	2	10	969127	969136	80 %	0 %	20 %	0 %	284048199
618	NC_013740	GGCTG	2	10	969330	969339	0 %	20 %	60 %	20 %	284048199
619	NC_013740	CAGGC	2	10	970892	970901	20 %	0 %	40 %	40 %	284048200
620	NC_013740	TGCGG	2	10	971620	971629	0 %	20 %	60 %	20 %	284048201
621	NC_013740	TATGA	2	10	973382	973391	40 %	40 %	20 %	0 %	284048203
622	NC_013740	TTCTG	2	10	975674	975683	0 %	60 %	20 %	20 %	284048206
623	NC_013740	AAAAG	2	10	977379	977388	80 %	0 %	20 %	0 %	284048207
624	NC_013740	ACATC	2	10	981658	981667	40 %	20 %	0 %	40 %	284048214
625	NC_013740	CGGGG	2	10	981747	981756	0 %	0 %	80 %	20 %	284048214
626	NC_013740	GGCCT	2	10	981819	981828	0 %	20 %	40 %	40 %	284048214
627	NC_013740	GGGAC	2	10	983123	983132	20 %	0 %	60 %	20 %	284048215
628	NC_013740	GGAAG	2	10	984204	984213	40 %	0 %	60 %	0 %	284048216
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