MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 44337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013740	GCC	2	6	310443	310448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047637
6002	NC_013740	CCA	2	6	310459	310464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047637
6003	NC_013740	TCA	2	6	310492	310497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047637
6004	NC_013740	A	6	6	310497	310502	100 %	0 %	0 %	0 %	284047637
6005	NC_013740	TGA	2	6	310555	310560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047637
6006	NC_013740	CGGAA	2	10	310567	310576	40 %	0 %	40 %	20 %	284047637
6007	NC_013740	CTT	2	6	310649	310654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047637
6008	NC_013740	CCA	2	6	310696	310701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047637
6009	NC_013740	CTG	2	6	310713	310718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047637
6010	NC_013740	TCA	2	6	310756	310761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047637
6011	NC_013740	TGG	3	9	310777	310785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047637
6012	NC_013740	CTGT	2	8	310787	310794	0 %	50 %	25 %	25 %	284047637
6013	NC_013740	CTG	2	6	310800	310805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047637
6014	NC_013740	AGG	2	6	310826	310831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284047637
6015	NC_013740	TGG	2	6	310873	310878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047637
6016	NC_013740	TCC	2	6	310909	310914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047637
6017	NC_013740	TCC	2	6	310951	310956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047637
6018	NC_013740	TG	3	6	310970	310975	0 %	50 %	50 %	0 %	284047637
6019	NC_013740	GAC	2	6	311697	311702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047638
6020	NC_013740	GAA	2	6	311791	311796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047638
6021	NC_013740	GAAACC	2	12	311839	311850	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284047638
6022	NC_013740	TGC	2	6	311913	311918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047638
6023	NC_013740	GTT	2	6	311941	311946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047638
6024	NC_013740	GCT	2	6	311950	311955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047638
6025	NC_013740	CTG	2	6	311989	311994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047638
6026	NC_013740	CTG	2	6	312097	312102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047638
6027	NC_013740	GAT	2	6	312124	312129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047638
6028	NC_013740	GTT	2	6	312139	312144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047638
6029	NC_013740	ACA	2	6	312188	312193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047638
6030	NC_013740	TGA	2	6	312203	312208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047638
6031	NC_013740	GTG	2	6	312329	312334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047638
6032	NC_013740	TCG	2	6	312362	312367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047638
6033	NC_013740	GAA	2	6	312376	312381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047638
6034	NC_013740	ACA	2	6	312449	312454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047638
6035	NC_013740	CTGC	2	8	312459	312466	0 %	25 %	25 %	50 %	284047638
6036	NC_013740	CCAT	2	8	312524	312531	25 %	25 %	0 %	50 %	284047638
6037	NC_013740	AGA	2	6	312573	312578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047638
6038	NC_013740	GGC	2	6	312580	312585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047638
6039	NC_013740	TTC	2	6	312598	312603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284047638
6040	NC_013740	ACC	2	6	312634	312639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047638
6041	NC_013740	CCTG	2	8	312660	312667	0 %	25 %	25 %	50 %	284047638
6042	NC_013740	GTG	2	6	312700	312705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047638
6043	NC_013740	GGC	2	6	312769	312774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047638
6044	NC_013740	GTT	2	6	312793	312798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047638
6045	NC_013740	GAA	2	6	313026	313031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047639
6046	NC_013740	GCA	2	6	313131	313136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047640
6047	NC_013740	GGT	2	6	313176	313181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047640
6048	NC_013740	CGA	2	6	313225	313230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047640
6049	NC_013740	CT	4	8	313271	313278	0 %	50 %	0 %	50 %	284047640
6050	NC_013740	T	6	6	313286	313291	0 %	100 %	0 %	0 %	284047640
6051	NC_013740	TCAT	2	8	313380	313387	25 %	50 %	0 %	25 %	284047641
6052	NC_013740	GAC	2	6	313574	313579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047641
6053	NC_013740	AAG	2	6	313695	313700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047641
6054	NC_013740	CGGC	2	8	313716	313723	0 %	0 %	50 %	50 %	284047641
6055	NC_013740	GAA	2	6	313733	313738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047641
6056	NC_013740	ACG	2	6	313836	313841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047641
6057	NC_013740	CAG	2	6	313844	313849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047641
6058	NC_013740	TAAG	2	8	313928	313935	50 %	25 %	25 %	0 %	284047641
6059	NC_013740	CTG	2	6	313988	313993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047642
6060	NC_013740	CAT	2	6	314049	314054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047642
6061	NC_013740	AACG	2	8	314074	314081	50 %	0 %	25 %	25 %	284047642
6062	NC_013740	ATC	2	6	314104	314109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047642
6063	NC_013740	CTC	2	6	314162	314167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284047642
6064	NC_013740	CTG	2	6	314179	314184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047642
6065	NC_013740	AAG	2	6	314185	314190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047642
6066	NC_013740	CAA	2	6	314223	314228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047642
6067	NC_013740	CCA	2	6	314240	314245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047642
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6069	NC_013740	CGC	2	6	314457	314462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047643
6070	NC_013740	TCCG	2	8	314560	314567	0 %	25 %	25 %	50 %	284047643
6071	NC_013740	CAG	2	6	314596	314601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047643
6072	NC_013740	AAG	2	6	314681	314686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047643
6073	NC_013740	TTG	2	6	314708	314713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284047643
6074	NC_013740	TGA	2	6	314718	314723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284047643
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6077	NC_013740	GTACC	2	10	314913	314922	20 %	20 %	20 %	40 %	284047643
6078	NC_013740	GCT	2	6	314979	314984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047643
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6080	NC_013740	CAC	2	6	315072	315077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047643
6081	NC_013740	CAA	2	6	315120	315125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047643
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6084	NC_013740	ACTGA	2	10	315404	315413	40 %	20 %	20 %	20 %	284047644
6085	NC_013740	GCC	2	6	315476	315481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047644
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6088	NC_013740	AGA	2	6	315685	315690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047644
6089	NC_013740	CTG	2	6	315692	315697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047644
6090	NC_013740	GCA	2	6	315711	315716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047644
6091	NC_013740	AAAG	2	8	315799	315806	75 %	0 %	25 %	0 %	284047644
6092	NC_013740	GCT	3	9	315994	316002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047645
6093	NC_013740	GCT	3	9	316015	316023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047645
6094	NC_013740	CTG	2	6	316025	316030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047645
6095	NC_013740	GCT	2	6	316042	316047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047645
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6098	NC_013740	GGCCTG	2	12	316129	316140	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284047645
6099	NC_013740	AAG	2	6	316142	316147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047645
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6101	NC_013740	GAA	2	6	316231	316236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047645
6102	NC_013740	AGCGG	2	10	316691	316700	20 %	0 %	60 %	20 %	284047646
6103	NC_013740	CTG	2	6	316787	316792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047646
6104	NC_013740	ATC	2	6	316850	316855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047646
6105	NC_013740	CAG	2	6	316913	316918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047646
6106	NC_013740	CTG	2	6	316925	316930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047646
6107	NC_013740	CCA	2	6	317115	317120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047646
6108	NC_013740	CGA	2	6	317140	317145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047646
6109	NC_013740	CCA	2	6	317148	317153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047646
6110	NC_013740	GCT	2	6	317191	317196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047646
6111	NC_013740	CGG	2	6	317198	317203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047646
6112	NC_013740	CAG	2	6	317261	317266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047646
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6114	NC_013740	ACGG	2	8	317295	317302	25 %	0 %	50 %	25 %	284047646
6115	NC_013740	GTG	2	6	317303	317308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047646
6116	NC_013740	CAG	2	6	317345	317350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047646
6117	NC_013740	A	6	6	317420	317425	100 %	0 %	0 %	0 %	284047646
6118	NC_013740	GCT	2	6	317443	317448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047646
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6120	NC_013740	GGAG	2	8	317479	317486	25 %	0 %	75 %	0 %	284047646
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6483	NC_013740	TGG	2	6	335053	335058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284047664
6484	NC_013740	AGCCAC	2	12	335111	335122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284047664
6485	NC_013740	CGG	2	6	335125	335130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284047664
6486	NC_013740	ATCC	2	8	335195	335202	25 %	25 %	0 %	50 %	284047664
6487	NC_013740	CAT	2	6	335222	335227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284047664
6488	NC_013740	CAA	2	6	335312	335317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284047665
6489	NC_013740	GACCT	2	10	335322	335331	20 %	20 %	20 %	40 %	284047665
6490	NC_013740	AAG	2	6	335344	335349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284047665
6491	NC_013740	G	7	7	335366	335372	0 %	0 %	100 %	0 %	284047665
6492	NC_013740	ACC	2	6	335376	335381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047665
6493	NC_013740	CCCA	2	8	335382	335389	25 %	0 %	0 %	75 %	284047665
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6497	NC_013740	CCA	2	6	335566	335571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284047665
6498	NC_013740	GCC	2	6	335589	335594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284047665
6499	NC_013740	GCT	2	6	335628	335633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284047665
6500	NC_013740	CAG	2	6	335685	335690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284047665

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