MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 37973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013416	GCC	2	6	169068	169073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866901
3002	NC_013416	CA	3	6	169078	169083	50 %	0 %	0 %	50 %	261866901
3003	NC_013416	TA	3	6	169160	169165	50 %	50 %	0 %	0 %	261866901
3004	NC_013416	ACATC	2	10	169184	169193	40 %	20 %	0 %	40 %	261866901
3005	NC_013416	T	6	6	169252	169257	0 %	100 %	0 %	0 %	261866901
3006	NC_013416	TGC	2	6	169271	169276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866901
3007	NC_013416	GCA	2	6	169466	169471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866901
3008	NC_013416	TC	3	6	169500	169505	0 %	50 %	0 %	50 %	261866902
3009	NC_013416	AAT	2	6	169506	169511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866902
3010	NC_013416	CATC	2	8	169534	169541	25 %	25 %	0 %	50 %	261866902
3011	NC_013416	ATG	2	6	169655	169660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866902
3012	NC_013416	CGG	2	6	169672	169677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866902
3013	NC_013416	T	6	6	169769	169774	0 %	100 %	0 %	0 %	261866902
3014	NC_013416	GGC	2	6	169799	169804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866902
3015	NC_013416	GCGTG	2	10	169813	169822	0 %	20 %	60 %	20 %	261866902
3016	NC_013416	CAT	2	6	169867	169872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866902
3017	NC_013416	GGCAT	2	10	169887	169896	20 %	20 %	40 %	20 %	261866902
3018	NC_013416	TCA	2	6	169903	169908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866902
3019	NC_013416	ATA	2	6	169950	169955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866903
3020	NC_013416	CCA	2	6	169989	169994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866903
3021	NC_013416	CCAT	2	8	170039	170046	25 %	25 %	0 %	50 %	261866903
3022	NC_013416	CAT	2	6	170079	170084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866903
3023	NC_013416	CAA	2	6	170232	170237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866904
3024	NC_013416	TCG	2	6	170281	170286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866904
3025	NC_013416	ATG	2	6	170358	170363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866904
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3027	NC_013416	CGG	2	6	171194	171199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866905
3028	NC_013416	CAA	2	6	171239	171244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866905
3029	NC_013416	CGT	2	6	171285	171290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3030	NC_013416	ACG	2	6	171350	171355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3031	NC_013416	CTT	2	6	171358	171363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866905
3032	NC_013416	CTT	2	6	171406	171411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866905
3033	NC_013416	TCA	2	6	171466	171471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
3034	NC_013416	CAT	2	6	171487	171492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
3035	NC_013416	CGC	2	6	171502	171507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866905
3036	NC_013416	TTGA	2	8	171545	171552	25 %	50 %	25 %	0 %	261866905
3037	NC_013416	TCG	2	6	171573	171578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866905
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3039	NC_013416	TGG	2	6	171652	171657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866905
3040	NC_013416	TTC	2	6	171674	171679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866905
3041	NC_013416	AGC	2	6	171810	171815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3042	NC_013416	TCAAAA	2	12	171816	171827	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261866905
3043	NC_013416	CAAA	2	8	171835	171842	75 %	0 %	0 %	25 %	261866905
3044	NC_013416	CGT	3	9	171937	171945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866905
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3046	NC_013416	CAT	2	6	171974	171979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
3047	NC_013416	ACG	2	6	172006	172011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
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3050	NC_013416	T	6	6	172232	172237	0 %	100 %	0 %	0 %	261866905
3051	NC_013416	ATC	2	6	172343	172348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866905
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3053	NC_013416	CCA	2	6	172441	172446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866905
3054	NC_013416	TGGTGT	2	12	172471	172482	0 %	50 %	50 %	0 %	261866905
3055	NC_013416	CCA	2	6	172495	172500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866905
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3057	NC_013416	GCA	2	6	172567	172572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866905
3058	NC_013416	GC	3	6	172605	172610	0 %	0 %	50 %	50 %	261866905
3059	NC_013416	GTT	2	6	172612	172617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866905
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3065	NC_013416	TTG	2	6	172962	172967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866905
3066	NC_013416	CGG	2	6	172978	172983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866905
3067	NC_013416	TGA	2	6	173035	173040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866905
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3069	NC_013416	GATC	2	8	173287	173294	25 %	25 %	25 %	25 %	261866906
3070	NC_013416	ACC	2	6	173301	173306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866906
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3086	NC_013416	TGA	2	6	174512	174517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866908
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3093	NC_013416	ACA	2	6	174697	174702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866908
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3100	NC_013416	A	6	6	174850	174855	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
3101	NC_013416	GCA	2	6	174883	174888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866908
3102	NC_013416	A	6	6	174957	174962	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
3103	NC_013416	TGATG	2	10	175019	175028	20 %	40 %	40 %	0 %	261866908
3104	NC_013416	ACG	2	6	175072	175077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866908
3105	NC_013416	TGA	2	6	175129	175134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866908
3106	NC_013416	GCA	2	6	175203	175208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866908
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3108	NC_013416	TGG	2	6	175381	175386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866908
3109	NC_013416	GCG	2	6	175416	175421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866908
3110	NC_013416	A	7	7	175468	175474	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
3111	NC_013416	GAC	2	6	175650	175655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866908
3112	NC_013416	GGCAAA	2	12	175707	175718	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	261866908
3113	NC_013416	TCAA	2	8	175732	175739	50 %	25 %	0 %	25 %	261866908
3114	NC_013416	GGCG	2	8	175754	175761	0 %	0 %	75 %	25 %	261866908
3115	NC_013416	CGG	2	6	175768	175773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866908
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3119	NC_013416	TGAT	2	8	175912	175919	25 %	50 %	25 %	0 %	261866908
3120	NC_013416	CCA	2	6	176020	176025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866908
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3122	NC_013416	A	6	6	176074	176079	100 %	0 %	0 %	0 %	261866908
3123	NC_013416	GAA	2	6	176118	176123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866908
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3235	NC_013416	GAT	2	6	182326	182331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866915
3236	NC_013416	TGCAA	2	10	182340	182349	40 %	20 %	20 %	20 %	261866915
3237	NC_013416	A	6	6	182375	182380	100 %	0 %	0 %	0 %	261866915
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3243	NC_013416	A	6	6	182869	182874	100 %	0 %	0 %	0 %	261866915
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3245	NC_013416	A	6	6	182937	182942	100 %	0 %	0 %	0 %	261866915
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3490	NC_013416	GAA	2	6	197031	197036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866930
3491	NC_013416	A	6	6	197097	197102	100 %	0 %	0 %	0 %	261866930
3492	NC_013416	ATT	2	6	198259	198264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866931
3493	NC_013416	GAA	2	6	198473	198478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866931
3494	NC_013416	GAC	2	6	198487	198492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866931
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