MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 37973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013416	CT	3	6	384	389	0 %	50 %	0 %	50 %	261866723
2	NC_013416	CTT	2	6	404	409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866723
3	NC_013416	TCT	2	6	412	417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866723
4	NC_013416	GCG	3	9	428	436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866723
5	NC_013416	CCT	2	6	473	478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866723
6	NC_013416	AC	3	6	486	491	50 %	0 %	0 %	50 %	261866723
7	NC_013416	TCG	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866723
8	NC_013416	CGC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866724
9	NC_013416	CGC	2	6	662	667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866724
10	NC_013416	CCGC	2	8	699	706	0 %	0 %	25 %	75 %	261866724
11	NC_013416	TTA	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866724
12	NC_013416	TCA	2	6	733	738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866724
13	NC_013416	CGC	2	6	748	753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866724
14	NC_013416	TTC	2	6	950	955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866724
15	NC_013416	ATC	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866724
16	NC_013416	CA	3	6	1143	1148	50 %	0 %	0 %	50 %	261866724
17	NC_013416	TTC	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866724
18	NC_013416	GCA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866724
19	NC_013416	TTC	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866724
20	NC_013416	CAA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866724
21	NC_013416	AAGC	2	8	1330	1337	50 %	0 %	25 %	25 %	261866724
22	NC_013416	GTT	2	6	1412	1417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866724
23	NC_013416	CG	3	6	1429	1434	0 %	0 %	50 %	50 %	261866724
24	NC_013416	CTTG	2	8	1440	1447	0 %	50 %	25 %	25 %	261866724
25	NC_013416	T	8	8	1498	1505	0 %	100 %	0 %	0 %	261866724
26	NC_013416	TCT	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
27	NC_013416	TCA	2	6	1572	1577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866725
28	NC_013416	TCT	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
29	NC_013416	TCA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866725
30	NC_013416	CTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
31	NC_013416	GCT	2	6	1754	1759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866725
32	NC_013416	TGC	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866725
33	NC_013416	GGC	2	6	1828	1833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866725
34	NC_013416	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
35	NC_013416	AGTA	2	8	2054	2061	50 %	25 %	25 %	0 %	261866725
36	NC_013416	GTT	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
37	NC_013416	CTT	2	6	2193	2198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866725
38	NC_013416	TAAAA	2	10	2206	2215	80 %	20 %	0 %	0 %	261866725
39	NC_013416	TTG	2	6	2237	2242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
40	NC_013416	GGCTT	2	10	2357	2366	0 %	40 %	40 %	20 %	261866725
41	NC_013416	CCG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866725
42	NC_013416	TGG	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866725
43	NC_013416	ACC	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866725
44	NC_013416	CCAACG	2	12	3150	3161	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	261866725
45	NC_013416	TGT	2	6	3236	3241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
46	NC_013416	CAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866725
47	NC_013416	CAC	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866725
48	NC_013416	ACC	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866725
49	NC_013416	T	6	6	3423	3428	0 %	100 %	0 %	0 %	261866725
50	NC_013416	AGT	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866725
51	NC_013416	GT	3	6	3526	3531	0 %	50 %	50 %	0 %	261866725
52	NC_013416	GTT	2	6	3538	3543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866725
53	NC_013416	ATAA	2	8	3551	3558	75 %	25 %	0 %	0 %	261866725
54	NC_013416	T	6	6	3582	3587	0 %	100 %	0 %	0 %	261866726
55	NC_013416	GTTGC	2	10	3591	3600	0 %	40 %	40 %	20 %	261866726
56	NC_013416	AAT	2	6	3651	3656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866726
57	NC_013416	T	6	6	3691	3696	0 %	100 %	0 %	0 %	261866726
58	NC_013416	T	7	7	3753	3759	0 %	100 %	0 %	0 %	261866726
59	NC_013416	TCT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866726
60	NC_013416	CAAT	2	8	3790	3797	50 %	25 %	0 %	25 %	261866726
61	NC_013416	T	7	7	3803	3809	0 %	100 %	0 %	0 %	261866726
62	NC_013416	ACGC	2	8	4440	4447	25 %	0 %	25 %	50 %	261866727
63	NC_013416	TGA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866727
64	NC_013416	GTTG	2	8	4508	4515	0 %	50 %	50 %	0 %	261866727
65	NC_013416	CT	3	6	4518	4523	0 %	50 %	0 %	50 %	261866727
66	NC_013416	A	6	6	4524	4529	100 %	0 %	0 %	0 %	261866727
67	NC_013416	ACA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866727
68	NC_013416	AAG	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866727
69	NC_013416	T	6	6	4742	4747	0 %	100 %	0 %	0 %	261866728
70	NC_013416	T	7	7	4810	4816	0 %	100 %	0 %	0 %	261866728
71	NC_013416	AACT	2	8	4821	4828	50 %	25 %	0 %	25 %	261866728
72	NC_013416	ACC	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866728
73	NC_013416	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	261866728
74	NC_013416	TTAA	2	8	5001	5008	50 %	50 %	0 %	0 %	261866729
75	NC_013416	TCA	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866729
76	NC_013416	GGC	2	6	5113	5118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866729
77	NC_013416	AAT	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
78	NC_013416	TTG	2	6	5145	5150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
79	NC_013416	TTGGCA	2	12	5219	5230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261866729
80	NC_013416	TGT	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
81	NC_013416	GTT	2	6	5309	5314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
82	NC_013416	TTAA	2	8	5389	5396	50 %	50 %	0 %	0 %	261866729
83	NC_013416	A	6	6	5470	5475	100 %	0 %	0 %	0 %	261866729
84	NC_013416	ACA	2	6	5561	5566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866729
85	NC_013416	CCAT	2	8	5623	5630	25 %	25 %	0 %	50 %	261866729
86	NC_013416	AC	3	6	5636	5641	50 %	0 %	0 %	50 %	261866729
87	NC_013416	CAC	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866729
88	NC_013416	AAT	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
89	NC_013416	AAT	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
90	NC_013416	CGA	2	6	5792	5797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866729
91	NC_013416	GTTT	2	8	5803	5810	0 %	75 %	25 %	0 %	261866729
92	NC_013416	AGCA	2	8	5863	5870	50 %	0 %	25 %	25 %	261866729
93	NC_013416	CCG	2	6	5877	5882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866729
94	NC_013416	CGA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866729
95	NC_013416	AGG	2	6	5954	5959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261866729
96	NC_013416	T	6	6	5985	5990	0 %	100 %	0 %	0 %	261866729
97	NC_013416	TTG	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866729
98	NC_013416	CAA	2	6	6077	6082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866729
99	NC_013416	TG	3	6	6148	6153	0 %	50 %	50 %	0 %	261866729
100	NC_013416	AAT	2	6	6158	6163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866729
101	NC_013416	CT	3	6	6184	6189	0 %	50 %	0 %	50 %	261866730
102	NC_013416	GCC	2	6	6194	6199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866730
103	NC_013416	ATA	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866730
104	NC_013416	GTT	3	9	6426	6434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866730
105	NC_013416	CAC	2	6	6555	6560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866730
106	NC_013416	CCG	2	6	6617	6622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866730
107	NC_013416	AAT	2	6	6680	6685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866730
108	NC_013416	TCA	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866730
109	NC_013416	TTG	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866730
110	NC_013416	GTT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866730
111	NC_013416	TCC	2	6	6796	6801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261866730
112	NC_013416	TCT	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866730
113	NC_013416	AAG	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866730
114	NC_013416	GGAA	2	8	6926	6933	50 %	0 %	50 %	0 %	261866730
115	NC_013416	A	6	6	7132	7137	100 %	0 %	0 %	0 %	261866730
116	NC_013416	TAA	2	6	7159	7164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866730
117	NC_013416	CCA	2	6	7296	7301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866730
118	NC_013416	TGG	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866731
119	NC_013416	TGC	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866731
120	NC_013416	TGT	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866731
121	NC_013416	AGCGA	2	10	7842	7851	40 %	0 %	40 %	20 %	261866732
122	NC_013416	A	6	6	7851	7856	100 %	0 %	0 %	0 %	261866732
123	NC_013416	T	6	6	7890	7895	0 %	100 %	0 %	0 %	261866732
124	NC_013416	AAAT	2	8	7924	7931	75 %	25 %	0 %	0 %	261866732
125	NC_013416	TTGC	2	8	7949	7956	0 %	50 %	25 %	25 %	261866732
126	NC_013416	GAC	2	6	7992	7997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866732
127	NC_013416	ATT	3	9	8000	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866732
128	NC_013416	T	6	6	8024	8029	0 %	100 %	0 %	0 %	261866732
129	NC_013416	GGCG	2	8	8048	8055	0 %	0 %	75 %	25 %	261866732
130	NC_013416	GAA	2	6	8058	8063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261866732
131	NC_013416	CCA	2	6	8095	8100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866732
132	NC_013416	ACC	2	6	8122	8127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866732
133	NC_013416	TGG	2	6	8293	8298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866732
134	NC_013416	GGGC	2	8	8332	8339	0 %	0 %	75 %	25 %	261866732
135	NC_013416	CCG	2	6	8349	8354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866732
136	NC_013416	CG	3	6	8353	8358	0 %	0 %	50 %	50 %	261866732
137	NC_013416	TCA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866732
138	NC_013416	AATT	2	8	8544	8551	50 %	50 %	0 %	0 %	261866732
139	NC_013416	ACA	2	6	8570	8575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866733
140	NC_013416	T	6	6	8587	8592	0 %	100 %	0 %	0 %	261866733
141	NC_013416	ATT	2	6	8661	8666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866733
142	NC_013416	CAA	2	6	8773	8778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866733
143	NC_013416	ACA	3	9	8781	8789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866733
144	NC_013416	CTT	2	6	8844	8849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866733
145	NC_013416	TACAC	2	10	8960	8969	40 %	20 %	0 %	40 %	261866733
146	NC_013416	CGG	2	6	9023	9028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866733
147	NC_013416	ATG	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261866733
148	NC_013416	CGGT	2	8	9083	9090	0 %	25 %	50 %	25 %	261866733
149	NC_013416	GTG	2	6	9137	9142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261866733
150	NC_013416	ATT	2	6	9189	9194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866733
151	NC_013416	TGT	2	6	9329	9334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261866734
152	NC_013416	CCTTG	2	10	9411	9420	0 %	40 %	20 %	40 %	261866734
153	NC_013416	CAC	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866734
154	NC_013416	CTG	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866734
155	NC_013416	CCG	2	6	9480	9485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866734
156	NC_013416	TCATC	2	10	9530	9539	20 %	40 %	0 %	40 %	261866735
157	NC_013416	CGGCG	2	10	9561	9570	0 %	0 %	60 %	40 %	261866735
158	NC_013416	CTGC	2	8	9602	9609	0 %	25 %	25 %	50 %	261866735
159	NC_013416	CCA	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866735
160	NC_013416	CAT	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866735
161	NC_013416	AAT	2	6	9699	9704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866735
162	NC_013416	CAA	2	6	9714	9719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866735
163	NC_013416	CTG	2	6	9857	9862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866735
164	NC_013416	GGTG	2	8	9885	9892	0 %	25 %	75 %	0 %	261866735
165	NC_013416	CGAC	2	8	9919	9926	25 %	0 %	25 %	50 %	261866735
166	NC_013416	ACGA	2	8	9990	9997	50 %	0 %	25 %	25 %	261866735
167	NC_013416	CAT	2	6	10002	10007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261866735
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169	NC_013416	TAT	2	6	10077	10082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866736
170	NC_013416	TC	3	6	10100	10105	0 %	50 %	0 %	50 %	261866736
171	NC_013416	ACA	2	6	10320	10325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261866737
172	NC_013416	CGT	2	6	10341	10346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866737
173	NC_013416	CGGCT	2	10	10363	10372	0 %	20 %	40 %	40 %	261866737
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177	NC_013416	A	6	6	10567	10572	100 %	0 %	0 %	0 %	261866737
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238	NC_013416	TAAA	2	8	13470	13477	75 %	25 %	0 %	0 %	261866741
239	NC_013416	CGGT	2	8	13487	13494	0 %	25 %	50 %	25 %	261866741
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245	NC_013416	ATCC	2	8	13930	13937	25 %	25 %	0 %	50 %	261866742
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248	NC_013416	A	6	6	14050	14055	100 %	0 %	0 %	0 %	261866742
249	NC_013416	ATT	2	6	14063	14068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866742
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251	NC_013416	CGC	2	6	14177	14182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866743
252	NC_013416	TTTG	2	8	14221	14228	0 %	75 %	25 %	0 %	261866743
253	NC_013416	CCA	2	6	14269	14274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866743
254	NC_013416	CAC	2	6	14300	14305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261866743
255	NC_013416	GAAATA	2	12	14346	14357	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261866743
256	NC_013416	AAT	2	6	14489	14494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866743
257	NC_013416	CTGG	2	8	14528	14535	0 %	25 %	50 %	25 %	261866743
258	NC_013416	TGC	2	6	14550	14555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261866743
259	NC_013416	TAA	3	9	14574	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261866743
260	NC_013416	GCG	2	6	14643	14648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866743
261	NC_013416	TTC	2	6	14657	14662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261866743
262	NC_013416	CGC	2	6	14683	14688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866743
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264	NC_013416	ATT	2	6	14951	14956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261866744
265	NC_013416	CGC	2	6	14957	14962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261866744
266	NC_013416	CGA	2	6	14983	14988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261866744
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268	NC_013416	ATTT	2	8	15088	15095	25 %	75 %	0 %	0 %	261866744
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281	NC_013416	GGC	3	9	15491	15499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261866744
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