MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013385	GGA	2	6	201501	201506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892127
4002	NC_013385	GAG	2	6	201514	201519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892127
4003	NC_013385	CGC	2	6	201539	201544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892127
4004	NC_013385	TAG	2	6	201629	201634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892127
4005	NC_013385	CTA	2	6	201684	201689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892127
4006	NC_013385	GGC	2	6	201732	201737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892127
4007	NC_013385	AGG	2	6	201890	201895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892127
4008	NC_013385	GCG	2	6	201925	201930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892127
4009	NC_013385	TTC	2	6	201996	202001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892127
4010	NC_013385	CCG	2	6	202014	202019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892127
4011	NC_013385	CCA	2	6	202073	202078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892127
4012	NC_013385	GGA	2	6	202092	202097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892127
4013	NC_013385	CCTCT	2	10	202101	202110	0 %	40 %	0 %	60 %	260892127
4014	NC_013385	CGG	2	6	202117	202122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892127
4015	NC_013385	GGA	2	6	202125	202130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892127
4016	NC_013385	TGG	2	6	202145	202150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892127
4017	NC_013385	AGC	2	6	202266	202271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892127
4018	NC_013385	CG	3	6	202318	202323	0 %	0 %	50 %	50 %	260892128
4019	NC_013385	GGTG	2	8	202345	202352	0 %	25 %	75 %	0 %	260892128
4020	NC_013385	TCC	2	6	202422	202427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892128
4021	NC_013385	A	6	6	202434	202439	100 %	0 %	0 %	0 %	260892128
4022	NC_013385	CTT	2	6	202583	202588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892128
4023	NC_013385	CGG	2	6	202656	202661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892128
4024	NC_013385	GACCTT	2	12	202685	202696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260892128
4025	NC_013385	CAG	2	6	202735	202740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892128
4026	NC_013385	AAG	2	6	202778	202783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892128
4027	NC_013385	GAA	2	6	202823	202828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892128
4028	NC_013385	CGG	2	6	202875	202880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892128
4029	NC_013385	CGG	2	6	202911	202916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892128
4030	NC_013385	G	6	6	203028	203033	0 %	0 %	100 %	0 %	260892128
4031	NC_013385	TAT	2	6	203039	203044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260892128
4032	NC_013385	CCG	2	6	203239	203244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892129
4033	NC_013385	GCC	2	6	203247	203252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892129
4034	NC_013385	CGC	2	6	203263	203268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892129
4035	NC_013385	GCT	2	6	203288	203293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892129
4036	NC_013385	GGC	2	6	203294	203299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892129
4037	NC_013385	CCG	2	6	203343	203348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892129
4038	NC_013385	TCC	2	6	203378	203383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892129
4039	NC_013385	CAT	2	6	203414	203419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892129
4040	NC_013385	CCA	2	6	203422	203427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892129
4041	NC_013385	CCG	2	6	203446	203451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892129
4042	NC_013385	AGG	2	6	203521	203526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892129
4043	NC_013385	CCG	2	6	203567	203572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892129
4044	NC_013385	TGG	2	6	203584	203589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892129
4045	NC_013385	GGC	2	6	203642	203647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892129
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4047	NC_013385	CCGG	2	8	203908	203915	0 %	0 %	50 %	50 %	260892130
4048	NC_013385	ATC	2	6	203927	203932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892130
4049	NC_013385	CGG	2	6	203944	203949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892130
4050	NC_013385	GGT	2	6	203962	203967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892130
4051	NC_013385	TGG	2	6	203997	204002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892130
4052	NC_013385	CGA	2	6	204007	204012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892130
4053	NC_013385	ACG	2	6	204132	204137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892130
4054	NC_013385	GGC	3	9	204211	204219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892130
4055	NC_013385	GAAG	2	8	204223	204230	50 %	0 %	50 %	0 %	260892130
4056	NC_013385	C	6	6	204258	204263	0 %	0 %	0 %	100 %	260892130
4057	NC_013385	TACCT	2	10	204332	204341	20 %	40 %	0 %	40 %	260892130
4058	NC_013385	GGGA	2	8	204358	204365	25 %	0 %	75 %	0 %	260892130
4059	NC_013385	AAG	2	6	204389	204394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892130
4060	NC_013385	CT	4	8	204432	204439	0 %	50 %	0 %	50 %	260892130
4061	NC_013385	TAC	2	6	204446	204451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892130
4062	NC_013385	TGC	2	6	204469	204474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892130
4063	NC_013385	AAG	2	6	204532	204537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892131
4064	NC_013385	GGT	2	6	204580	204585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892131
4065	NC_013385	TGG	2	6	204588	204593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892131
4066	NC_013385	CCGG	2	8	204622	204629	0 %	0 %	50 %	50 %	260892131
4067	NC_013385	GAA	2	6	204677	204682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892131
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4069	NC_013385	CTA	2	6	204883	204888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892131
4070	NC_013385	TGG	2	6	204897	204902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892131
4071	NC_013385	CGA	2	6	204934	204939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892131
4072	NC_013385	CCACG	2	10	204961	204970	20 %	0 %	20 %	60 %	260892131
4073	NC_013385	GCG	2	6	204976	204981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892131
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4080	NC_013385	GCC	2	6	205720	205725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892132
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4085	NC_013385	CTG	2	6	205957	205962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892132
4086	NC_013385	CCT	2	6	206046	206051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892132
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4088	NC_013385	G	7	7	206139	206145	0 %	0 %	100 %	0 %	260892132
4089	NC_013385	AAG	2	6	206176	206181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892132
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4091	NC_013385	GTTT	2	8	206215	206222	0 %	75 %	25 %	0 %	260892132
4092	NC_013385	GGC	2	6	206230	206235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892132
4093	NC_013385	CACC	2	8	206319	206326	25 %	0 %	0 %	75 %	260892132
4094	NC_013385	CTA	2	6	206388	206393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892132
4095	NC_013385	CGC	2	6	206413	206418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892132
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4099	NC_013385	CCG	2	6	206549	206554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892132
4100	NC_013385	GC	3	6	206613	206618	0 %	0 %	50 %	50 %	260892132
4101	NC_013385	GGC	2	6	206634	206639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892132
4102	NC_013385	AGG	2	6	206651	206656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892132
4103	NC_013385	TAG	3	9	206660	206668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892132
4104	NC_013385	GAA	2	6	206765	206770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892133
4105	NC_013385	AGG	2	6	206868	206873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892133
4106	NC_013385	ATG	2	6	206907	206912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892133
4107	NC_013385	CAC	2	6	206921	206926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892133
4108	NC_013385	GC	3	6	206958	206963	0 %	0 %	50 %	50 %	260892133
4109	NC_013385	CGGG	2	8	207076	207083	0 %	0 %	75 %	25 %	260892133
4110	NC_013385	TTTC	2	8	207169	207176	0 %	75 %	0 %	25 %	260892133
4111	NC_013385	ACC	3	9	207225	207233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892133
4112	NC_013385	GTC	2	6	207275	207280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892133
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4119	NC_013385	CGGC	2	8	207531	207538	0 %	0 %	50 %	50 %	260892133
4120	NC_013385	A	6	6	207590	207595	100 %	0 %	0 %	0 %	260892133
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4122	NC_013385	CTT	2	6	207686	207691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892133
4123	NC_013385	CAG	2	6	207736	207741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892133
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4243	NC_013385	TGG	2	6	213152	213157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892140
4244	NC_013385	CGG	2	6	213338	213343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892140
4245	NC_013385	CCCTA	2	10	213361	213370	20 %	20 %	0 %	60 %	260892140
4246	NC_013385	AGG	2	6	213380	213385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892140
4247	NC_013385	CG	3	6	213441	213446	0 %	0 %	50 %	50 %	260892140
4248	NC_013385	CCAC	2	8	213497	213504	25 %	0 %	0 %	75 %	260892140
4249	NC_013385	GCGG	2	8	213543	213550	0 %	0 %	75 %	25 %	260892140
4250	NC_013385	GAGC	2	8	213604	213611	25 %	0 %	50 %	25 %	260892140
4251	NC_013385	CTT	2	6	213670	213675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892141
4252	NC_013385	GC	4	8	213739	213746	0 %	0 %	50 %	50 %	260892141
4253	NC_013385	GAA	2	6	213752	213757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892141
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4255	NC_013385	TGG	2	6	213772	213777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892141
4256	NC_013385	GCT	2	6	213786	213791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892141
4257	NC_013385	CTG	2	6	213813	213818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892141
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4259	NC_013385	GGT	2	6	213854	213859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892141
4260	NC_013385	G	6	6	213878	213883	0 %	0 %	100 %	0 %	260892141
4261	NC_013385	CTTT	2	8	213887	213894	0 %	75 %	0 %	25 %	260892141
4262	NC_013385	AGC	2	6	213956	213961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892141
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4264	NC_013385	GTG	2	6	213994	213999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892141
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4267	NC_013385	CTG	2	6	214110	214115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892141
4268	NC_013385	CTT	2	6	214127	214132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892141
4269	NC_013385	CTTT	2	8	214154	214161	0 %	75 %	0 %	25 %	260892141
4270	NC_013385	GGT	2	6	214169	214174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892141
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4272	NC_013385	TCC	2	6	214361	214366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892142
4273	NC_013385	TAT	2	6	214367	214372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260892142
4274	NC_013385	GCG	2	6	214409	214414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892142
4275	NC_013385	AGG	2	6	214420	214425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892142
4276	NC_013385	AGG	2	6	214443	214448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892142
4277	NC_013385	GGC	2	6	214469	214474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892142
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4281	NC_013385	TGG	2	6	214618	214623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892142
4282	NC_013385	C	6	6	214696	214701	0 %	0 %	0 %	100 %	260892142
4283	NC_013385	G	6	6	214718	214723	0 %	0 %	100 %	0 %	260892142
4284	NC_013385	GGT	2	6	214736	214741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892142
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4316	NC_013385	T	6	6	215724	215729	0 %	100 %	0 %	0 %	260892143
4317	NC_013385	GTC	2	6	215750	215755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892143
4318	NC_013385	GTC	2	6	215757	215762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892143
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4325	NC_013385	TCCT	2	8	216207	216214	0 %	50 %	0 %	50 %	260892143
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4328	NC_013385	TAC	2	6	216343	216348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892143
4329	NC_013385	CTG	2	6	216350	216355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892143
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4332	NC_013385	CGC	2	6	216483	216488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892143
4333	NC_013385	TGA	2	6	216562	216567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892143
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4335	NC_013385	GCC	2	6	216594	216599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892143
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4348	NC_013385	C	7	7	219189	219195	0 %	0 %	0 %	100 %	260892144
4349	NC_013385	GAG	2	6	219311	219316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892144
4350	NC_013385	CGG	3	9	219333	219341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892144
4351	NC_013385	GCGG	2	8	219495	219502	0 %	0 %	75 %	25 %	260892145
4352	NC_013385	AAG	2	6	219507	219512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892145
4353	NC_013385	CT	4	8	219535	219542	0 %	50 %	0 %	50 %	260892145
4354	NC_013385	AGA	2	6	219565	219570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892145
4355	NC_013385	G	6	6	219679	219684	0 %	0 %	100 %	0 %	260892145
4356	NC_013385	CG	3	6	219765	219770	0 %	0 %	50 %	50 %	260892145
4357	NC_013385	GCA	2	6	219836	219841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892145
4358	NC_013385	GCT	3	9	219872	219880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892145
4359	NC_013385	G	6	6	219939	219944	0 %	0 %	100 %	0 %	260892145
4360	NC_013385	GGA	2	6	220027	220032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892145
4361	NC_013385	CGG	2	6	220140	220145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892145
4362	NC_013385	CGG	2	6	220157	220162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892145
4363	NC_013385	GCGG	2	8	220186	220193	0 %	0 %	75 %	25 %	260892145
4364	NC_013385	AGG	2	6	220206	220211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892145
4365	NC_013385	CTT	2	6	220242	220247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892145
4366	NC_013385	CCA	2	6	220287	220292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892145
4367	NC_013385	TGC	2	6	220299	220304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892145
4368	NC_013385	GGC	2	6	220309	220314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892145
4369	NC_013385	AGCG	2	8	220367	220374	25 %	0 %	50 %	25 %	260892145
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4372	NC_013385	CGG	2	6	220449	220454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892145
4373	NC_013385	CTT	2	6	220466	220471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892145
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4379	NC_013385	CG	3	6	220751	220756	0 %	0 %	50 %	50 %	260892145
4380	NC_013385	CGG	2	6	220792	220797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892145
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4388	NC_013385	CGCTA	2	10	221096	221105	20 %	20 %	20 %	40 %	260892145
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4479	NC_013385	GGC	2	6	225032	225037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892149
4480	NC_013385	GCGG	2	8	225089	225096	0 %	0 %	75 %	25 %	260892149
4481	NC_013385	GCC	2	6	225102	225107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892149
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4483	NC_013385	AGT	2	6	225116	225121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892149
4484	NC_013385	CGCC	2	8	225134	225141	0 %	0 %	25 %	75 %	260892149
4485	NC_013385	ACC	2	6	225159	225164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892149
4486	NC_013385	TCC	2	6	225207	225212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892149
4487	NC_013385	CAA	2	6	225236	225241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892149
4488	NC_013385	CCA	2	6	225284	225289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892149
4489	NC_013385	CAC	2	6	225311	225316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892149
4490	NC_013385	ATC	2	6	225324	225329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892149
4491	NC_013385	CGG	2	6	225334	225339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892149
4492	NC_013385	GGA	3	9	225434	225442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892149
4493	NC_013385	CGC	2	6	225449	225454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892149
4494	NC_013385	CGA	3	9	225500	225508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892149
4495	NC_013385	CTG	2	6	225510	225515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892149
4496	NC_013385	TGG	2	6	225520	225525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892149
4497	NC_013385	GAA	2	6	225528	225533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892149
4498	NC_013385	CCT	2	6	225546	225551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892149
4499	NC_013385	TAC	2	6	225587	225592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892149
4500	NC_013385	CCACCG	2	12	225601	225612	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260892149

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