MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013385	GTA	2	6	49100	49105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891982
1002	NC_013385	GTG	2	6	49163	49168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891982
1003	NC_013385	GAG	2	6	49178	49183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891982
1004	NC_013385	CAT	2	6	49237	49242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891982
1005	NC_013385	TCTT	2	8	49251	49258	0 %	75 %	0 %	25 %	260891982
1006	NC_013385	GGTA	2	8	49270	49277	25 %	25 %	50 %	0 %	260891982
1007	NC_013385	AGG	2	6	49297	49302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891982
1008	NC_013385	TGG	2	6	49358	49363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891983
1009	NC_013385	CGG	2	6	49410	49415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891983
1010	NC_013385	GGA	2	6	49416	49421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891983
1011	NC_013385	CGG	2	6	49482	49487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891983
1012	NC_013385	GGA	2	6	49488	49493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891983
1013	NC_013385	GTG	2	6	49525	49530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891983
1014	NC_013385	GCG	2	6	49552	49557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891983
1015	NC_013385	TTG	2	6	49616	49621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260891983
1016	NC_013385	TCT	2	6	49759	49764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891984
1017	NC_013385	GGA	2	6	49861	49866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891984
1018	NC_013385	GAG	2	6	50075	50080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891984
1019	NC_013385	ACT	2	6	50115	50120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891984
1020	NC_013385	TGG	2	6	50157	50162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891984
1021	NC_013385	GAA	2	6	50174	50179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891984
1022	NC_013385	GGA	2	6	50180	50185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891984
1023	NC_013385	TCC	2	6	50226	50231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891984
1024	NC_013385	GGTT	2	8	50238	50245	0 %	50 %	50 %	0 %	260891984
1025	NC_013385	TGG	2	6	50274	50279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891984
1026	NC_013385	TCT	2	6	50329	50334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891984
1027	NC_013385	GCGG	2	8	50350	50357	0 %	0 %	75 %	25 %	260891984
1028	NC_013385	ACC	2	6	50360	50365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891984
1029	NC_013385	GCG	2	6	50374	50379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891984
1030	NC_013385	CGG	2	6	50478	50483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891985
1031	NC_013385	AAT	2	6	50513	50518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260891985
1032	NC_013385	CGG	2	6	50544	50549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891985
1033	NC_013385	GCCA	2	8	50582	50589	25 %	0 %	25 %	50 %	260891985
1034	NC_013385	GGT	2	6	50665	50670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891985
1035	NC_013385	GCC	2	6	50720	50725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891985
1036	NC_013385	TGA	2	6	50739	50744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891985
1037	NC_013385	GGA	2	6	50767	50772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891985
1038	NC_013385	AGG	2	6	50790	50795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891985
1039	NC_013385	GGC	2	6	50803	50808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891985
1040	NC_013385	GAC	2	6	50864	50869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891985
1041	NC_013385	CTT	2	6	50893	50898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891985
1042	NC_013385	TGA	2	6	50908	50913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891985
1043	NC_013385	TGC	2	6	51054	51059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891985
1044	NC_013385	CGG	2	6	51078	51083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891985
1045	NC_013385	AGG	2	6	51093	51098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891985
1046	NC_013385	GC	3	6	51224	51229	0 %	0 %	50 %	50 %	260891985
1047	NC_013385	GGC	2	6	51232	51237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891985
1048	NC_013385	AGA	2	6	51255	51260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891985
1049	NC_013385	GGA	2	6	51357	51362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891986
1050	NC_013385	CCG	2	6	51371	51376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891986
1051	NC_013385	ACC	2	6	51403	51408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891986
1052	NC_013385	TGG	2	6	51419	51424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891986
1053	NC_013385	GAT	2	6	51522	51527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891986
1054	NC_013385	GCC	2	6	51548	51553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891986
1055	NC_013385	TAA	2	6	51569	51574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260891986
1056	NC_013385	GAC	2	6	51719	51724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891986
1057	NC_013385	ACG	2	6	51740	51745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891986
1058	NC_013385	TCT	2	6	51776	51781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891986
1059	NC_013385	AAT	2	6	51804	51809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260891986
1060	NC_013385	GTG	2	6	51838	51843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891986
1061	NC_013385	CGCGG	2	10	51846	51855	0 %	0 %	60 %	40 %	260891986
1062	NC_013385	CTT	2	6	51939	51944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891986
1063	NC_013385	ACT	2	6	52166	52171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891987
1064	NC_013385	T	6	6	52353	52358	0 %	100 %	0 %	0 %	260891987
1065	NC_013385	CGA	2	6	52386	52391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891987
1066	NC_013385	TTA	2	6	52495	52500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260891987
1067	NC_013385	CGA	2	6	52530	52535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891987
1068	NC_013385	CAT	2	6	52629	52634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891987
1069	NC_013385	CTC	2	6	52682	52687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891987
1070	NC_013385	ACC	2	6	52742	52747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891987
1071	NC_013385	TCA	2	6	52760	52765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891987
1072	NC_013385	CGA	2	6	52776	52781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891987
1073	NC_013385	GGA	2	6	52788	52793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891987
1074	NC_013385	GGT	2	6	52827	52832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891987
1075	NC_013385	GCC	2	6	52851	52856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891987
1076	NC_013385	TGG	2	6	52907	52912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891987
1077	NC_013385	TCCC	2	8	52982	52989	0 %	25 %	0 %	75 %	260891987
1078	NC_013385	CGG	2	6	53007	53012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891987
1079	NC_013385	CGG	2	6	53021	53026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891987
1080	NC_013385	CTT	2	6	53046	53051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891987
1081	NC_013385	GAG	2	6	53146	53151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891987
1082	NC_013385	AGG	2	6	53249	53254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891987
1083	NC_013385	GCT	2	6	53256	53261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891987
1084	NC_013385	GAG	2	6	53272	53277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891987
1085	NC_013385	CTGGT	2	10	53284	53293	0 %	40 %	40 %	20 %	260891987
1086	NC_013385	CGG	2	6	53299	53304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891987
1087	NC_013385	CTG	2	6	53344	53349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891987
1088	NC_013385	GAG	2	6	53350	53355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891987
1089	NC_013385	CGC	2	6	53359	53364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891987
1090	NC_013385	GAG	2	6	53377	53382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891987
1091	NC_013385	C	6	6	53441	53446	0 %	0 %	0 %	100 %	260891987
1092	NC_013385	GTTT	2	8	53472	53479	0 %	75 %	25 %	0 %	260891988
1093	NC_013385	GTC	2	6	53481	53486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891988
1094	NC_013385	TCG	2	6	53554	53559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891988
1095	NC_013385	CAG	2	6	53682	53687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891988
1096	NC_013385	TGGCG	2	10	53699	53708	0 %	20 %	60 %	20 %	260891988
1097	NC_013385	TGA	2	6	53741	53746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891988
1098	NC_013385	GGGT	2	8	53800	53807	0 %	25 %	75 %	0 %	260891988
1099	NC_013385	TGCC	2	8	53841	53848	0 %	25 %	25 %	50 %	260891988
1100	NC_013385	CTTC	2	8	53911	53918	0 %	50 %	0 %	50 %	260891988
1101	NC_013385	GCCG	2	8	53924	53931	0 %	0 %	50 %	50 %	260891988
1102	NC_013385	A	7	7	53977	53983	100 %	0 %	0 %	0 %	260891988
1103	NC_013385	GA	3	6	53998	54003	50 %	0 %	50 %	0 %	260891988
1104	NC_013385	TCC	2	6	54179	54184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891989
1105	NC_013385	GCT	2	6	54242	54247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891989
1106	NC_013385	CAGAGG	2	12	54256	54267	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260891989
1107	NC_013385	GGA	2	6	54274	54279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891989
1108	NC_013385	AGA	2	6	54482	54487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891990
1109	NC_013385	GAA	2	6	54489	54494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891990
1110	NC_013385	ATCC	2	8	54499	54506	25 %	25 %	0 %	50 %	260891990
1111	NC_013385	AAGA	2	8	54568	54575	75 %	0 %	25 %	0 %	260891990
1112	NC_013385	GAT	2	6	54630	54635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891990
1113	NC_013385	AAG	3	9	54667	54675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891990
1114	NC_013385	CGG	2	6	54710	54715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891991
1115	NC_013385	TGA	2	6	54736	54741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891991
1116	NC_013385	GAG	2	6	54807	54812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891991
1117	NC_013385	CCGG	2	8	54821	54828	0 %	0 %	50 %	50 %	260891991
1118	NC_013385	GTG	2	6	54858	54863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891991
1119	NC_013385	CTT	2	6	54864	54869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891991
1120	NC_013385	CCA	2	6	54964	54969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891991
1121	NC_013385	AGT	2	6	54992	54997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891991
1122	NC_013385	GGC	2	6	55022	55027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891991
1123	NC_013385	CCA	2	6	55040	55045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891991
1124	NC_013385	CCTTA	2	10	55208	55217	20 %	40 %	0 %	40 %	260891991
1125	NC_013385	ATT	2	6	55239	55244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260891991
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1499	NC_013385	ACGGT	2	10	73307	73316	20 %	20 %	40 %	20 %	260892012
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