MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 42276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013385	GGA	2	6	225629	225634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892149
4502	NC_013385	AGG	2	6	225643	225648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892149
4503	NC_013385	GCC	2	6	225706	225711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892149
4504	NC_013385	CGA	2	6	225791	225796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892149
4505	NC_013385	ACCT	2	8	225810	225817	25 %	25 %	0 %	50 %	260892149
4506	NC_013385	CAA	2	6	225878	225883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892149
4507	NC_013385	GGC	2	6	225887	225892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892149
4508	NC_013385	GA	3	6	226009	226014	50 %	0 %	50 %	0 %	260892150
4509	NC_013385	CTC	2	6	226060	226065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892150
4510	NC_013385	CAA	2	6	226148	226153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260892150
4511	NC_013385	CGC	2	6	226200	226205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892150
4512	NC_013385	ACT	2	6	226219	226224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892150
4513	NC_013385	CCT	2	6	226256	226261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892150
4514	NC_013385	GTA	2	6	226278	226283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892150
4515	NC_013385	GGGT	2	8	226354	226361	0 %	25 %	75 %	0 %	260892150
4516	NC_013385	GGC	3	9	226373	226381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892150
4517	NC_013385	CCT	2	6	226413	226418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892150
4518	NC_013385	TGGG	2	8	226455	226462	0 %	25 %	75 %	0 %	260892150
4519	NC_013385	G	6	6	226460	226465	0 %	0 %	100 %	0 %	260892150
4520	NC_013385	ACCGG	2	10	226536	226545	20 %	0 %	40 %	40 %	260892150
4521	NC_013385	ATC	2	6	226620	226625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892150
4522	NC_013385	CGA	2	6	226631	226636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892150
4523	NC_013385	CCG	2	6	226642	226647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892150
4524	NC_013385	GGGCC	2	10	226658	226667	0 %	0 %	60 %	40 %	260892150
4525	NC_013385	CGC	2	6	226668	226673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892150
4526	NC_013385	CCCG	2	8	226783	226790	0 %	0 %	25 %	75 %	260892150
4527	NC_013385	GGT	2	6	226823	226828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892150
4528	NC_013385	AGA	2	6	226856	226861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892150
4529	NC_013385	GGC	2	6	226871	226876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892150
4530	NC_013385	GAA	2	6	226892	226897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892150
4531	NC_013385	AGGG	2	8	226962	226969	25 %	0 %	75 %	0 %	260892150
4532	NC_013385	CCTG	2	8	227026	227033	0 %	25 %	25 %	50 %	260892150
4533	NC_013385	GCGG	2	8	227066	227073	0 %	0 %	75 %	25 %	260892150
4534	NC_013385	CCA	3	9	227077	227085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892150
4535	NC_013385	GGC	3	9	227150	227158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892150
4536	NC_013385	GCC	2	6	227173	227178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892150
4537	NC_013385	CGA	2	6	227189	227194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892150
4538	NC_013385	GGT	2	6	227195	227200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892150
4539	NC_013385	TCA	2	6	227256	227261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892151
4540	NC_013385	ACC	2	6	227282	227287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892151
4541	NC_013385	CGG	2	6	227292	227297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892151
4542	NC_013385	AG	3	6	227402	227407	50 %	0 %	50 %	0 %	260892151
4543	NC_013385	GCG	2	6	227429	227434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892151
4544	NC_013385	CTG	2	6	227507	227512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892151
4545	NC_013385	C	6	6	227526	227531	0 %	0 %	0 %	100 %	260892151
4546	NC_013385	ATC	2	6	227642	227647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892151
4547	NC_013385	GCG	2	6	227648	227653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892151
4548	NC_013385	AGT	2	6	227713	227718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892152
4549	NC_013385	TAC	2	6	227728	227733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892152
4550	NC_013385	AGG	2	6	227833	227838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892152
4551	NC_013385	CCG	2	6	227952	227957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892152
4552	NC_013385	GAA	2	6	228062	228067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892152
4553	NC_013385	ACG	2	6	228129	228134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892152
4554	NC_013385	CTT	2	6	228142	228147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892152
4555	NC_013385	GGC	2	6	228193	228198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892152
4556	NC_013385	G	6	6	228242	228247	0 %	0 %	100 %	0 %	260892152
4557	NC_013385	GGC	2	6	228268	228273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892152
4558	NC_013385	GCG	2	6	228277	228282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892152
4559	NC_013385	GGT	2	6	228283	228288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892152
4560	NC_013385	GGT	2	6	228358	228363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892152
4561	NC_013385	TCC	2	6	228447	228452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892152
4562	NC_013385	CAC	2	6	228478	228483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892152
4563	NC_013385	TGG	2	6	228510	228515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892152
4564	NC_013385	CAG	2	6	228563	228568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892152
4565	NC_013385	CAT	2	6	228622	228627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892152
4566	NC_013385	GCT	2	6	228639	228644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892152
4567	NC_013385	CT	3	6	228661	228666	0 %	50 %	0 %	50 %	260892152
4568	NC_013385	CGG	3	9	228677	228685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892152
4569	NC_013385	ACTT	2	8	228717	228724	25 %	50 %	0 %	25 %	260892152
4570	NC_013385	CTTC	2	8	228840	228847	0 %	50 %	0 %	50 %	260892152
4571	NC_013385	GGC	2	6	228865	228870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892152
4572	NC_013385	GAAG	2	8	228925	228932	50 %	0 %	50 %	0 %	260892152
4573	NC_013385	GGT	2	6	228982	228987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892152
4574	NC_013385	CGG	3	9	228993	229001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892152
4575	NC_013385	CCG	2	6	229119	229124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892152
4576	NC_013385	GGT	2	6	229135	229140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892152
4577	NC_013385	CAT	2	6	229204	229209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892152
4578	NC_013385	CTG	2	6	229253	229258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892152
4579	NC_013385	GCG	2	6	229542	229547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892153
4580	NC_013385	GTCT	2	8	229581	229588	0 %	50 %	25 %	25 %	260892153
4581	NC_013385	GC	3	6	229632	229637	0 %	0 %	50 %	50 %	260892153
4582	NC_013385	GCG	2	6	229641	229646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892153
4583	NC_013385	CCG	2	6	229678	229683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892153
4584	NC_013385	TTC	2	6	229701	229706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892153
4585	NC_013385	GAA	2	6	229743	229748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892153
4586	NC_013385	TTCC	2	8	229783	229790	0 %	50 %	0 %	50 %	260892153
4587	NC_013385	GGGC	2	8	229809	229816	0 %	0 %	75 %	25 %	260892153
4588	NC_013385	GGA	2	6	229838	229843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892153
4589	NC_013385	TCC	2	6	229871	229876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892153
4590	NC_013385	GCC	2	6	229920	229925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892153
4591	NC_013385	CTG	2	6	229944	229949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892153
4592	NC_013385	ACG	2	6	230008	230013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892153
4593	NC_013385	CCA	2	6	230023	230028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892153
4594	NC_013385	GGCCT	2	10	230076	230085	0 %	20 %	40 %	40 %	260892153
4595	NC_013385	CGT	2	6	230147	230152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892153
4596	NC_013385	GC	3	6	230166	230171	0 %	0 %	50 %	50 %	260892153
4597	NC_013385	GAAG	2	8	230195	230202	50 %	0 %	50 %	0 %	260892153
4598	NC_013385	GTG	2	6	230211	230216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892153
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4600	NC_013385	TGG	2	6	230336	230341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892153
4601	NC_013385	CAT	2	6	230357	230362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892153
4602	NC_013385	ACC	2	6	230379	230384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892153
4603	NC_013385	ATG	2	6	230406	230411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892153
4604	NC_013385	GGA	2	6	230447	230452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892153
4605	NC_013385	GGC	2	6	230543	230548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892153
4606	NC_013385	AGGG	2	8	230582	230589	25 %	0 %	75 %	0 %	260892153
4607	NC_013385	CGTC	2	8	230594	230601	0 %	25 %	25 %	50 %	260892153
4608	NC_013385	TGG	2	6	230632	230637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892153
4609	NC_013385	GGC	3	9	230720	230728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892153
4610	NC_013385	GGAGCT	2	12	230737	230748	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260892153
4611	NC_013385	CAT	2	6	231018	231023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892154
4612	NC_013385	CGG	2	6	231101	231106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892154
4613	NC_013385	GGA	2	6	231120	231125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892154
4614	NC_013385	TCC	2	6	231137	231142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892154
4615	NC_013385	AGA	2	6	231143	231148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892154
4616	NC_013385	GC	3	6	231242	231247	0 %	0 %	50 %	50 %	260892154
4617	NC_013385	CCCATC	2	12	231263	231274	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260892154
4618	NC_013385	GGT	2	6	231297	231302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892154
4619	NC_013385	ATC	2	6	231313	231318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892154
4620	NC_013385	GCGG	2	8	231336	231343	0 %	0 %	75 %	25 %	260892154
4621	NC_013385	CTG	2	6	231403	231408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892154
4622	NC_013385	GAG	2	6	231409	231414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892154
4623	NC_013385	CCT	2	6	231429	231434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892154
4624	NC_013385	GCC	2	6	231484	231489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892154
4625	NC_013385	TCCG	2	8	231493	231500	0 %	25 %	25 %	50 %	260892154
4626	NC_013385	TGG	3	9	231515	231523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892154
4627	NC_013385	CGG	2	6	231526	231531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892154
4628	NC_013385	CTGGGG	2	12	231547	231558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	260892154
4629	NC_013385	GA	3	6	231563	231568	50 %	0 %	50 %	0 %	260892154
4630	NC_013385	CTT	2	6	231595	231600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892154
4631	NC_013385	CGC	2	6	231610	231615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892154
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4633	NC_013385	ACG	2	6	231674	231679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892154
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4635	NC_013385	AAG	2	6	231700	231705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892154
4636	NC_013385	CGG	4	12	231728	231739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892154
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4640	NC_013385	CGG	2	6	231883	231888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892154
4641	NC_013385	GTG	2	6	232030	232035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892154
4642	NC_013385	TCA	2	6	232040	232045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260892154
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4644	NC_013385	CGG	2	6	232061	232066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892154
4645	NC_013385	GGC	2	6	232074	232079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892154
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4647	NC_013385	TGC	2	6	232229	232234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892154
4648	NC_013385	CTTC	2	8	232279	232286	0 %	50 %	0 %	50 %	260892154
4649	NC_013385	GAG	2	6	232288	232293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892154
4650	NC_013385	ATT	2	6	232294	232299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260892154
4651	NC_013385	TGG	2	6	232304	232309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892154
4652	NC_013385	GAG	2	6	232357	232362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892154
4653	NC_013385	AGGAGC	2	12	232391	232402	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260892154
4654	NC_013385	TCT	2	6	232406	232411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892154
4655	NC_013385	AGA	2	6	232443	232448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892154
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4658	NC_013385	CGA	2	6	232650	232655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892154
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4698	NC_013385	TCG	2	6	236206	236211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892158
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4713	NC_013385	CAACCT	2	12	236659	236670	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	260892159
4714	NC_013385	AG	3	6	236723	236728	50 %	0 %	50 %	0 %	260892159
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4721	NC_013385	AGG	2	6	237365	237370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892159
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4723	NC_013385	GAGAA	2	10	237495	237504	60 %	0 %	40 %	0 %	260892159
4724	NC_013385	GAA	2	6	237514	237519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892159
4725	NC_013385	GCCG	2	8	237622	237629	0 %	0 %	50 %	50 %	260892159
4726	NC_013385	GCC	2	6	237654	237659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892159
4727	NC_013385	TC	3	6	237729	237734	0 %	50 %	0 %	50 %	260892159
4728	NC_013385	GCGG	2	8	237799	237806	0 %	0 %	75 %	25 %	260892159
4729	NC_013385	GGC	2	6	237838	237843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892159
4730	NC_013385	GCA	2	6	237963	237968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892160
4731	NC_013385	CGGCT	2	10	237973	237982	0 %	20 %	40 %	40 %	260892160
4732	NC_013385	CGG	2	6	238019	238024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892160
4733	NC_013385	GCG	2	6	238101	238106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892160
4734	NC_013385	CAC	2	6	238135	238140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892160
4735	NC_013385	TGG	2	6	238143	238148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892160
4736	NC_013385	GAC	2	6	238270	238275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892160
4737	NC_013385	G	6	6	238287	238292	0 %	0 %	100 %	0 %	260892160
4738	NC_013385	CAC	2	6	238339	238344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892160
4739	NC_013385	TTC	2	6	238354	238359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892160
4740	NC_013385	TCT	2	6	238425	238430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260892160
4741	NC_013385	CCG	2	6	238454	238459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892160
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4743	NC_013385	CTC	3	9	238548	238556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892160
4744	NC_013385	GAA	2	6	238633	238638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892160
4745	NC_013385	AGG	2	6	238646	238651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892160
4746	NC_013385	TGA	2	6	238653	238658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892160
4747	NC_013385	GGCT	2	8	238689	238696	0 %	25 %	50 %	25 %	260892160
4748	NC_013385	TCCT	2	8	238736	238743	0 %	50 %	0 %	50 %	260892161
4749	NC_013385	AAG	2	6	238776	238781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892161
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4762	NC_013385	ATG	3	9	239394	239402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260892161
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4772	NC_013385	CAAG	2	8	239900	239907	50 %	0 %	25 %	25 %	260892162
4773	NC_013385	GAA	2	6	239920	239925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892162
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4815	NC_013385	GATC	2	8	242304	242311	25 %	25 %	25 %	25 %	260892165
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4822	NC_013385	TCC	2	6	242593	242598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892165
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4855	NC_013385	ACC	2	6	243902	243907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260892166
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4858	NC_013385	TGG	2	6	243995	244000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260892166
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4860	NC_013385	GACC	2	8	244083	244090	25 %	0 %	25 %	50 %	260892166
4861	NC_013385	CGGG	2	8	244095	244102	0 %	0 %	75 %	25 %	260892166
4862	NC_013385	CCCG	2	8	244166	244173	0 %	0 %	25 %	75 %	260892166
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4866	NC_013385	CGG	2	6	244389	244394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892166
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4984	NC_013385	CCGG	2	8	250123	250130	0 %	0 %	50 %	50 %	260892174
4985	NC_013385	AGGA	2	8	250144	250151	50 %	0 %	50 %	0 %	260892174
4986	NC_013385	CTAT	2	8	250169	250176	25 %	50 %	0 %	25 %	260892174
4987	NC_013385	AAG	2	6	250256	250261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260892174
4988	NC_013385	CTG	2	6	250283	250288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260892174
4989	NC_013385	GCGG	2	8	250291	250298	0 %	0 %	75 %	25 %	260892174
4990	NC_013385	CGC	2	6	250369	250374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260892174
4991	NC_013385	GGC	2	6	250393	250398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260892174
4992	NC_013385	ACG	2	6	250485	250490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260892174
4993	NC_013385	CCT	2	6	250543	250548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892174
4994	NC_013385	CTTC	2	8	250602	250609	0 %	50 %	0 %	50 %	260892174
4995	NC_013385	GAG	2	6	250610	250615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892174
4996	NC_013385	CCTGG	2	10	250675	250684	0 %	20 %	40 %	40 %	260892174
4997	NC_013385	CTC	2	6	250802	250807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892174
4998	NC_013385	CTC	2	6	250844	250849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260892174
4999	NC_013385	GGA	2	6	250864	250869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260892174
5000	NC_013385	GCCT	2	8	250877	250884	0 %	25 %	25 %	50 %	260892174

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