MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-011

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013210	CTTC	2	8	304	311	0 %	50 %	0 %	50 %	258512910
2	NC_013210	CTGA	2	8	386	393	25 %	25 %	25 %	25 %	258512910
3	NC_013210	GTCA	2	8	693	700	25 %	25 %	25 %	25 %	258512911
4	NC_013210	GCTG	2	8	2359	2366	0 %	25 %	50 %	25 %	258512913
5	NC_013210	CTGC	2	8	3728	3735	0 %	25 %	25 %	50 %	258512914
6	NC_013210	CAGC	2	8	4440	4447	25 %	0 %	25 %	50 %	258512915
7	NC_013210	TGAT	2	8	5955	5962	25 %	50 %	25 %	0 %	258512917
8	NC_013210	GCAC	2	8	6255	6262	25 %	0 %	25 %	50 %	258512917
9	NC_013210	CCAT	2	8	7542	7549	25 %	25 %	0 %	50 %	258512918
10	NC_013210	GAAA	2	8	8320	8327	75 %	0 %	25 %	0 %	258512919
11	NC_013210	TTGC	2	8	9119	9126	0 %	50 %	25 %	25 %	258512920
12	NC_013210	TTGG	2	8	9140	9147	0 %	50 %	50 %	0 %	258512920
13	NC_013210	TCTT	2	8	9275	9282	0 %	75 %	0 %	25 %	258512920
14	NC_013210	GTCA	2	8	9672	9679	25 %	25 %	25 %	25 %	258512921
15	NC_013210	CCAG	2	8	10192	10199	25 %	0 %	25 %	50 %	258512921
16	NC_013210	TTCT	2	8	10646	10653	0 %	75 %	0 %	25 %	258512921
17	NC_013210	ATGG	2	8	11231	11238	25 %	25 %	50 %	0 %	258512921
18	NC_013210	CAGC	2	8	11815	11822	25 %	0 %	25 %	50 %	258512921
19	NC_013210	AAAG	2	8	11963	11970	75 %	0 %	25 %	0 %	258512921
20	NC_013210	CTTG	2	8	12327	12334	0 %	50 %	25 %	25 %	258512921
21	NC_013210	TTCG	2	8	12710	12717	0 %	50 %	25 %	25 %	258512921
22	NC_013210	GTCA	2	8	13365	13372	25 %	25 %	25 %	25 %	258512921
23	NC_013210	CAGA	2	8	14375	14382	50 %	0 %	25 %	25 %	258512922
24	NC_013210	TGGC	2	8	14715	14722	0 %	25 %	50 %	25 %	258512922
25	NC_013210	GCAC	2	8	14842	14849	25 %	0 %	25 %	50 %	258512922
26	NC_013210	GACA	2	8	15001	15008	50 %	0 %	25 %	25 %	258512922
27	NC_013210	GAAG	2	8	15019	15026	50 %	0 %	50 %	0 %	258512922
28	NC_013210	CGTC	2	8	15658	15665	0 %	25 %	25 %	50 %	258512922
29	NC_013210	TCGG	2	8	16128	16135	0 %	25 %	50 %	25 %	258512923
30	NC_013210	TTGC	2	8	16434	16441	0 %	50 %	25 %	25 %	258512923
31	NC_013210	CGGG	2	8	16931	16938	0 %	0 %	75 %	25 %	258512924
32	NC_013210	CTTC	2	8	17786	17793	0 %	50 %	0 %	50 %	258512924
33	NC_013210	GACG	2	8	19050	19057	25 %	0 %	50 %	25 %	258512926
34	NC_013210	GCGG	2	8	19858	19865	0 %	0 %	75 %	25 %	258512926
35	NC_013210	GCCA	2	8	19993	20000	25 %	0 %	25 %	50 %	258512926
36	NC_013210	TCTG	2	8	20333	20340	0 %	50 %	25 %	25 %	258512926
37	NC_013210	TCGA	2	8	20720	20727	25 %	25 %	25 %	25 %	258512927
38	NC_013210	GAAG	2	8	20887	20894	50 %	0 %	50 %	0 %	258512927
39	NC_013210	AAGA	2	8	20930	20937	75 %	0 %	25 %	0 %	258512927
40	NC_013210	GAAG	2	8	21315	21322	50 %	0 %	50 %	0 %	258512928
41	NC_013210	TGGA	2	8	21730	21737	25 %	25 %	50 %	0 %	258512929
42	NC_013210	GTCA	2	8	21903	21910	25 %	25 %	25 %	25 %	258512929
43	NC_013210	AGAT	2	8	22711	22718	50 %	25 %	25 %	0 %	258512930
44	NC_013210	GCTC	2	8	23384	23391	0 %	25 %	25 %	50 %	258512931
45	NC_013210	CTAT	2	8	23414	23421	25 %	50 %	0 %	25 %	258512931
46	NC_013210	GCTG	2	8	24522	24529	0 %	25 %	50 %	25 %	258512931
47	NC_013210	AGAA	2	8	25217	25224	75 %	0 %	25 %	0 %	258512931
48	NC_013210	GATA	2	8	25245	25252	50 %	25 %	25 %	0 %	258512931
49	NC_013210	CAAA	2	8	25658	25665	75 %	0 %	0 %	25 %	258512932
50	NC_013210	GGCA	2	8	26428	26435	25 %	0 %	50 %	25 %	258512933
51	NC_013210	TGCG	2	8	26460	26467	0 %	25 %	50 %	25 %	258512933
52	NC_013210	AAGG	2	8	26498	26505	50 %	0 %	50 %	0 %	258512933
53	NC_013210	CCAT	2	8	27184	27191	25 %	25 %	0 %	50 %	258512934
54	NC_013210	CAGA	2	8	28616	28623	50 %	0 %	25 %	25 %	258512936
55	NC_013210	TGGC	2	8	28956	28963	0 %	25 %	50 %	25 %	258512936
56	NC_013210	GCAC	2	8	29083	29090	25 %	0 %	25 %	50 %	258512936
57	NC_013210	GAAG	2	8	29260	29267	50 %	0 %	50 %	0 %	258512936
58	NC_013210	CGTC	2	8	29899	29906	0 %	25 %	25 %	50 %	258512936
59	NC_013210	GTCA	2	8	30517	30524	25 %	25 %	25 %	25 %	258512937
60	NC_013210	ATCT	2	8	31520	31527	25 %	50 %	0 %	25 %	258512938
61	NC_013210	AGGT	2	8	31788	31795	25 %	25 %	50 %	0 %	258512938
62	NC_013210	TTCC	2	8	32012	32019	0 %	50 %	0 %	50 %	258512938
63	NC_013210	AACG	2	8	32353	32360	50 %	0 %	25 %	25 %	258512939
64	NC_013210	GAAC	2	8	32436	32443	50 %	0 %	25 %	25 %	258512939
65	NC_013210	CCAA	2	8	32495	32502	50 %	0 %	0 %	50 %	258512939
66	NC_013210	GGAA	2	8	33174	33181	50 %	0 %	50 %	0 %	258512939
67	NC_013210	TGAT	2	8	34161	34168	25 %	50 %	25 %	0 %	258512940
68	NC_013210	TGGT	2	8	34418	34425	0 %	50 %	50 %	0 %	258512941
69	NC_013210	GCGT	2	8	34822	34829	0 %	25 %	50 %	25 %	258512942
70	NC_013210	ACCC	2	8	35374	35381	25 %	0 %	0 %	75 %	258512942
71	NC_013210	GACA	2	8	36070	36077	50 %	0 %	25 %	25 %	258512942
72	NC_013210	CGTG	2	8	36221	36228	0 %	25 %	50 %	25 %	258512942
73	NC_013210	ATCA	2	8	36240	36247	50 %	25 %	0 %	25 %	258512942
74	NC_013210	CTGG	2	8	36344	36351	0 %	25 %	50 %	25 %	258512942
75	NC_013210	TCAT	2	8	36421	36428	25 %	50 %	0 %	25 %	258512942
76	NC_013210	CGCA	2	8	36698	36705	25 %	0 %	25 %	50 %	258512942
77	NC_013210	CCGT	2	8	36838	36845	0 %	25 %	25 %	50 %	258512942
78	NC_013210	GAGC	2	8	37204	37211	25 %	0 %	50 %	25 %	258512942
79	NC_013210	GAAT	2	8	37365	37372	50 %	25 %	25 %	0 %	258512942
80	NC_013210	CGAT	2	8	37850	37857	25 %	25 %	25 %	25 %	258512943
81	NC_013210	CGGG	2	8	38130	38137	0 %	0 %	75 %	25 %	258512943
82	NC_013210	TTGA	2	8	38457	38464	25 %	50 %	25 %	0 %	258512944
83	NC_013210	ACCC	2	8	39134	39141	25 %	0 %	0 %	75 %	258512945
84	NC_013210	CGCA	2	8	39281	39288	25 %	0 %	25 %	50 %	258512945
85	NC_013210	GGGA	2	8	39904	39911	25 %	0 %	75 %	0 %	258512946
86	NC_013210	CAGA	2	8	40079	40086	50 %	0 %	25 %	25 %	258512947
87	NC_013210	TGGC	2	8	40419	40426	0 %	25 %	50 %	25 %	258512947
88	NC_013210	CAGA	2	8	40598	40605	50 %	0 %	25 %	25 %	258512948
89	NC_013210	TGGC	2	8	40938	40945	0 %	25 %	50 %	25 %	258512948
90	NC_013210	GCAC	2	8	41065	41072	25 %	0 %	25 %	50 %	258512948
91	NC_013210	GAAG	2	8	41242	41249	50 %	0 %	50 %	0 %	258512948
92	NC_013210	CGTC	2	8	41881	41888	0 %	25 %	25 %	50 %	258512948
93	NC_013210	CAGA	2	8	42267	42274	50 %	0 %	25 %	25 %	258512949
94	NC_013210	TGGC	2	8	42607	42614	0 %	25 %	50 %	25 %	258512949
95	NC_013210	GCAC	2	8	42734	42741	25 %	0 %	25 %	50 %	258512949
96	NC_013210	GAAG	2	8	42911	42918	50 %	0 %	50 %	0 %	258512949
97	NC_013210	CGTC	2	8	43550	43557	0 %	25 %	25 %	50 %	258512949
98	NC_013210	TCCG	2	8	44470	44477	0 %	25 %	25 %	50 %	258512950
99	NC_013210	CTGG	2	8	45464	45471	0 %	25 %	50 %	25 %	258512951
100	NC_013210	GGCA	2	8	45526	45533	25 %	0 %	50 %	25 %	258512951
101	NC_013210	ATGG	2	8	45936	45943	25 %	25 %	50 %	0 %	258512952
102	NC_013210	TGCC	2	8	46054	46061	0 %	25 %	25 %	50 %	258512952
103	NC_013210	GCAC	2	8	46432	46439	25 %	0 %	25 %	50 %	258512952
104	NC_013210	GTCT	2	8	46663	46670	0 %	50 %	25 %	25 %	258512952
105	NC_013210	TGGT	2	8	46705	46712	0 %	50 %	50 %	0 %	258512952
106	NC_013210	AATG	2	8	47036	47043	50 %	25 %	25 %	0 %	258512953
107	NC_013210	ACCT	2	8	48160	48167	25 %	25 %	0 %	50 %	258512953
108	NC_013210	ATTG	2	8	48203	48210	25 %	50 %	25 %	0 %	258512953
109	NC_013210	CGTC	2	8	49280	49287	0 %	25 %	25 %	50 %	258512955
110	NC_013210	GCGT	2	8	49444	49451	0 %	25 %	50 %	25 %	258512955
111	NC_013210	GCGT	2	8	50265	50272	0 %	25 %	50 %	25 %	258512956
112	NC_013210	CATC	2	8	50746	50753	25 %	25 %	0 %	50 %	258512956
113	NC_013210	AGCG	2	8	50861	50868	25 %	0 %	50 %	25 %	258512956
114	NC_013210	ACGA	2	8	51266	51273	50 %	0 %	25 %	25 %	258512957
115	NC_013210	GGAC	2	8	51394	51401	25 %	0 %	50 %	25 %	258512957
116	NC_013210	GGTC	2	8	52381	52388	0 %	25 %	50 %	25 %	258512958
117	NC_013210	GAAA	2	8	53019	53026	75 %	0 %	25 %	0 %	258512958
118	NC_013210	TGCC	2	8	54699	54706	0 %	25 %	25 %	50 %	258512959
119	NC_013210	GTGG	2	8	55041	55048	0 %	25 %	75 %	0 %	258512959
120	NC_013210	CCTT	2	8	55054	55061	0 %	50 %	0 %	50 %	258512959
121	NC_013210	CCTT	2	8	55794	55801	0 %	50 %	0 %	50 %	258512960
122	NC_013210	CAGG	2	8	56149	56156	25 %	0 %	50 %	25 %	258512960
123	NC_013210	TGTT	2	8	56979	56986	0 %	75 %	25 %	0 %	258512960
124	NC_013210	TTTC	2	8	57303	57310	0 %	75 %	0 %	25 %	258512961
125	NC_013210	GCGG	2	8	57378	57385	0 %	0 %	75 %	25 %	258512961
126	NC_013210	GGTT	2	8	57413	57420	0 %	50 %	50 %	0 %	258512961
127	NC_013210	TGGA	2	8	58265	58272	25 %	25 %	50 %	0 %	258512962
128	NC_013210	CTCC	2	8	59276	59283	0 %	25 %	0 %	75 %	258512962
129	NC_013210	AGAA	2	8	59740	59747	75 %	0 %	25 %	0 %	258512962
130	NC_013210	CGTC	2	8	60306	60313	0 %	25 %	25 %	50 %	258512962
131	NC_013210	ATGG	2	8	60742	60749	25 %	25 %	50 %	0 %	258512963
132	NC_013210	GGAT	2	8	62166	62173	25 %	25 %	50 %	0 %	258512964
133	NC_013210	CCCG	2	8	62633	62640	0 %	0 %	25 %	75 %	258512964
134	NC_013210	CTGT	2	8	62665	62672	0 %	50 %	25 %	25 %	258512964
135	NC_013210	AATC	2	8	63363	63370	50 %	25 %	0 %	25 %	258512965
136	NC_013210	GACG	2	8	64059	64066	25 %	0 %	50 %	25 %	258512966
137	NC_013210	GGTC	2	8	64329	64336	0 %	25 %	50 %	25 %	258512966
138	NC_013210	CTTC	2	8	64698	64705	0 %	50 %	0 %	50 %	258512966
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408	NC_013210	ATGG	2	8	185785	185792	25 %	25 %	50 %	0 %	258513085
409	NC_013210	CCGG	2	8	185836	185843	0 %	0 %	50 %	50 %	258513085
410	NC_013210	ACCG	2	8	186256	186263	25 %	0 %	25 %	50 %	258513085
411	NC_013210	CATC	2	8	186282	186289	25 %	25 %	0 %	50 %	258513085
412	NC_013210	CCGC	2	8	186474	186481	0 %	0 %	25 %	75 %	258513085
413	NC_013210	GGCC	2	8	186939	186946	0 %	0 %	50 %	50 %	258513085
414	NC_013210	CTTC	2	8	187634	187641	0 %	50 %	0 %	50 %	258513086
415	NC_013210	CCAA	2	8	188426	188433	50 %	0 %	0 %	50 %	258513086
416	NC_013210	GATC	2	8	190325	190332	25 %	25 %	25 %	25 %	258513087

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.