MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI02

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013207	AGTA	2	8	356	363	50 %	25 %	25 %	0 %	257793043
2	NC_013207	CAGT	2	8	2115	2122	25 %	25 %	25 %	25 %	257793045
3	NC_013207	GTCG	2	8	2220	2227	0 %	25 %	50 %	25 %	257793045
4	NC_013207	TCAT	2	8	3408	3415	25 %	50 %	0 %	25 %	257793048
5	NC_013207	CACG	2	8	3748	3755	25 %	0 %	25 %	50 %	257793048
6	NC_013207	GAAG	2	8	3814	3821	50 %	0 %	50 %	0 %	257793048
7	NC_013207	CCGA	2	8	4199	4206	25 %	0 %	25 %	50 %	257793048
8	NC_013207	CCAT	2	8	4817	4824	25 %	25 %	0 %	50 %	257793048
9	NC_013207	CGTG	2	8	4902	4909	0 %	25 %	50 %	25 %	257793049
10	NC_013207	CGAG	2	8	5265	5272	25 %	0 %	50 %	25 %	257793049
11	NC_013207	TGGA	2	8	5855	5862	25 %	25 %	50 %	0 %	257793049
12	NC_013207	CGGA	2	8	6273	6280	25 %	0 %	50 %	25 %	257793049
13	NC_013207	CAGT	2	8	8293	8300	25 %	25 %	25 %	25 %	257793050
14	NC_013207	TCCA	2	8	8370	8377	25 %	25 %	0 %	50 %	257793050
15	NC_013207	CATC	2	8	9219	9226	25 %	25 %	0 %	50 %	257793051
16	NC_013207	GGCA	2	8	9521	9528	25 %	0 %	50 %	25 %	257793051
17	NC_013207	TTCG	2	8	10454	10461	0 %	50 %	25 %	25 %	257793051
18	NC_013207	GCTG	2	8	10475	10482	0 %	25 %	50 %	25 %	257793051
19	NC_013207	GATG	2	8	11833	11840	25 %	25 %	50 %	0 %	257793052
20	NC_013207	CCGG	2	8	11960	11967	0 %	0 %	50 %	50 %	257793052
21	NC_013207	ATGT	2	8	12308	12315	25 %	50 %	25 %	0 %	257793052
22	NC_013207	TCGC	2	8	13109	13116	0 %	25 %	25 %	50 %	257793053
23	NC_013207	CGCT	2	8	13433	13440	0 %	25 %	25 %	50 %	257793053
24	NC_013207	CATT	2	8	13528	13535	25 %	50 %	0 %	25 %	257793054
25	NC_013207	GACG	2	8	14206	14213	25 %	0 %	50 %	25 %	257793055
26	NC_013207	AATG	2	8	14243	14250	50 %	25 %	25 %	0 %	257793055
27	NC_013207	CCCT	2	8	14260	14267	0 %	25 %	0 %	75 %	257793055
28	NC_013207	GGTT	2	8	14533	14540	0 %	50 %	50 %	0 %	257793055
29	NC_013207	AGCG	2	8	16168	16175	25 %	0 %	50 %	25 %	257793057
30	NC_013207	CGAT	2	8	17021	17028	25 %	25 %	25 %	25 %	257793058
31	NC_013207	GGCC	2	8	18031	18038	0 %	0 %	50 %	50 %	257793059
32	NC_013207	TCGA	2	8	18042	18049	25 %	25 %	25 %	25 %	257793059
33	NC_013207	ATCA	2	8	18294	18301	50 %	25 %	0 %	25 %	257793059
34	NC_013207	CCCG	2	8	19126	19133	0 %	0 %	25 %	75 %	257793059
35	NC_013207	GACG	2	8	19635	19642	25 %	0 %	50 %	25 %	257793060
36	NC_013207	GGAC	2	8	19892	19899	25 %	0 %	50 %	25 %	257793060
37	NC_013207	AGTC	2	8	19940	19947	25 %	25 %	25 %	25 %	257793060
38	NC_013207	TCAT	2	8	20347	20354	25 %	50 %	0 %	25 %	257793060
39	NC_013207	GGCG	2	8	20508	20515	0 %	0 %	75 %	25 %	257793061
40	NC_013207	CATG	2	8	20840	20847	25 %	25 %	25 %	25 %	257793062
41	NC_013207	TCCG	2	8	21133	21140	0 %	25 %	25 %	50 %	257793062
42	NC_013207	CGTC	2	8	21295	21302	0 %	25 %	25 %	50 %	257793062
43	NC_013207	CTTA	2	8	21357	21364	25 %	50 %	0 %	25 %	257793062
44	NC_013207	GCCA	2	8	22202	22209	25 %	0 %	25 %	50 %	257793064
45	NC_013207	GCAT	2	8	22498	22505	25 %	25 %	25 %	25 %	257793064
46	NC_013207	TGCC	2	8	22660	22667	0 %	25 %	25 %	50 %	257793064
47	NC_013207	GTTT	2	8	23177	23184	0 %	75 %	25 %	0 %	257793064
48	NC_013207	TTGT	2	8	24043	24050	0 %	75 %	25 %	0 %	257793065
49	NC_013207	GGCC	2	8	24114	24121	0 %	0 %	50 %	50 %	257793065
50	NC_013207	GTCG	2	8	24489	24496	0 %	25 %	50 %	25 %	257793065
51	NC_013207	AATA	2	8	28061	28068	75 %	25 %	0 %	0 %	257793066
52	NC_013207	GAAA	2	8	29388	29395	75 %	0 %	25 %	0 %	257793067
53	NC_013207	TTCG	2	8	29505	29512	0 %	50 %	25 %	25 %	257793067
54	NC_013207	GCGG	2	8	29745	29752	0 %	0 %	75 %	25 %	257793067
55	NC_013207	AATC	2	8	29938	29945	50 %	25 %	0 %	25 %	257793068
56	NC_013207	ACAG	2	8	30020	30027	50 %	0 %	25 %	25 %	257793068
57	NC_013207	TGAA	2	8	30623	30630	50 %	25 %	25 %	0 %	257793068
58	NC_013207	TCAT	2	8	30812	30819	25 %	50 %	0 %	25 %	257793068
59	NC_013207	TCAT	2	8	31235	31242	25 %	50 %	0 %	25 %	257793068
60	NC_013207	GATG	2	8	32919	32926	25 %	25 %	50 %	0 %	257793071
61	NC_013207	ATTC	2	8	33064	33071	25 %	50 %	0 %	25 %	257793071
62	NC_013207	CATG	2	8	35343	35350	25 %	25 %	25 %	25 %	257793072
63	NC_013207	TGTT	2	8	35410	35417	0 %	75 %	25 %	0 %	257793072
64	NC_013207	GACC	2	8	35597	35604	25 %	0 %	25 %	50 %	257793073
65	NC_013207	GAAG	2	8	36083	36090	50 %	0 %	50 %	0 %	257793073
66	NC_013207	TCTT	2	8	36456	36463	0 %	75 %	0 %	25 %	257793073
67	NC_013207	ATCG	2	8	37478	37485	25 %	25 %	25 %	25 %	257793074
68	NC_013207	ATCC	2	8	37986	37993	25 %	25 %	0 %	50 %	257793074
69	NC_013207	AGGA	2	8	38070	38077	50 %	0 %	50 %	0 %	257793074
70	NC_013207	TGGA	2	8	38775	38782	25 %	25 %	50 %	0 %	257793074
71	NC_013207	TTCT	2	8	38871	38878	0 %	75 %	0 %	25 %	257793074
72	NC_013207	GTGG	2	8	39028	39035	0 %	25 %	75 %	0 %	257793074
73	NC_013207	TCGT	2	8	39666	39673	0 %	50 %	25 %	25 %	257793074
74	NC_013207	TCGG	2	8	40892	40899	0 %	25 %	50 %	25 %	257793076
75	NC_013207	ACGA	2	8	41506	41513	50 %	0 %	25 %	25 %	257793078
76	NC_013207	TGGG	2	8	42726	42733	0 %	25 %	75 %	0 %	257793080
77	NC_013207	GGCT	2	8	43747	43754	0 %	25 %	50 %	25 %	257793082
78	NC_013207	GAAA	2	8	43838	43845	75 %	0 %	25 %	0 %	257793082
79	NC_013207	TTTG	2	8	44138	44145	0 %	75 %	25 %	0 %	257793083
80	NC_013207	GTCG	2	8	44568	44575	0 %	25 %	50 %	25 %	257793083
81	NC_013207	ATGG	2	8	44589	44596	25 %	25 %	50 %	0 %	257793083
82	NC_013207	TTCA	2	8	44662	44669	25 %	50 %	0 %	25 %	257793083
83	NC_013207	ATGA	2	8	45408	45415	50 %	25 %	25 %	0 %	257793084
84	NC_013207	GCAT	2	8	45532	45539	25 %	25 %	25 %	25 %	257793084
85	NC_013207	CCGT	2	8	45603	45610	0 %	25 %	25 %	50 %	257793084
86	NC_013207	CCTT	2	8	45611	45618	0 %	50 %	0 %	50 %	257793084
87	NC_013207	GCCT	2	8	45687	45694	0 %	25 %	25 %	50 %	257793084
88	NC_013207	CGGG	2	8	45949	45956	0 %	0 %	75 %	25 %	257793085
89	NC_013207	GCAG	2	8	47358	47365	25 %	0 %	50 %	25 %	257793086
90	NC_013207	GAGC	2	8	47522	47529	25 %	0 %	50 %	25 %	257793086
91	NC_013207	GTGG	2	8	47913	47920	0 %	25 %	75 %	0 %	257793086
92	NC_013207	AATC	2	8	48222	48229	50 %	25 %	0 %	25 %	257793086
93	NC_013207	ATCA	2	8	48731	48738	50 %	25 %	0 %	25 %	257793087
94	NC_013207	ATGT	2	8	48957	48964	25 %	50 %	25 %	0 %	257793087
95	NC_013207	GTGG	2	8	49422	49429	0 %	25 %	75 %	0 %	257793087
96	NC_013207	ACCA	2	8	49671	49678	50 %	0 %	0 %	50 %	257793087
97	NC_013207	AGCC	2	8	49917	49924	25 %	0 %	25 %	50 %	257793087
98	NC_013207	ACGA	2	8	50775	50782	50 %	0 %	25 %	25 %	257793087
99	NC_013207	ATGT	2	8	51243	51250	25 %	50 %	25 %	0 %	257793087
100	NC_013207	AAGC	2	8	51796	51803	50 %	0 %	25 %	25 %	257793089
101	NC_013207	TGAA	2	8	52161	52168	50 %	25 %	25 %	0 %	257793089
102	NC_013207	GCGG	2	8	53765	53772	0 %	0 %	75 %	25 %	257793091
103	NC_013207	GTTG	2	8	54801	54808	0 %	50 %	50 %	0 %	257793092
104	NC_013207	GACG	2	8	55951	55958	25 %	0 %	50 %	25 %	257793094
105	NC_013207	ACAT	2	8	56879	56886	50 %	25 %	0 %	25 %	257793096
106	NC_013207	TTCT	2	8	57290	57297	0 %	75 %	0 %	25 %	257793096
107	NC_013207	TGCC	2	8	58911	58918	0 %	25 %	25 %	50 %	257793099
108	NC_013207	TGGC	2	8	59494	59501	0 %	25 %	50 %	25 %	257793101
109	NC_013207	CGAT	2	8	60367	60374	25 %	25 %	25 %	25 %	257793102
110	NC_013207	CTTG	2	8	61703	61710	0 %	50 %	25 %	25 %	257793102
111	NC_013207	CGTC	2	8	62286	62293	0 %	25 %	25 %	50 %	257793102
112	NC_013207	CATC	2	8	62564	62571	25 %	25 %	0 %	50 %	257793103
113	NC_013207	GACG	2	8	63880	63887	25 %	0 %	50 %	25 %	257793103
114	NC_013207	ACGC	2	8	64393	64400	25 %	0 %	25 %	50 %	257793103
115	NC_013207	CGTC	2	8	65199	65206	0 %	25 %	25 %	50 %	257793103
116	NC_013207	CGTC	2	8	65733	65740	0 %	25 %	25 %	50 %	257793104
117	NC_013207	GCGG	2	8	65918	65925	0 %	0 %	75 %	25 %	257793104
118	NC_013207	TGAT	2	8	66909	66916	25 %	50 %	25 %	0 %	257793105
119	NC_013207	GATT	2	8	68495	68502	25 %	50 %	25 %	0 %	257793107
120	NC_013207	TTCA	2	8	69090	69097	25 %	50 %	0 %	25 %	257793107
121	NC_013207	TCGA	2	8	69688	69695	25 %	25 %	25 %	25 %	257793107
122	NC_013207	GGCG	2	8	70210	70217	0 %	0 %	75 %	25 %	257793108
123	NC_013207	GATG	2	8	70257	70264	25 %	25 %	50 %	0 %	257793108
124	NC_013207	CGTC	2	8	70282	70289	0 %	25 %	25 %	50 %	257793108
125	NC_013207	GTTG	2	8	71094	71101	0 %	50 %	50 %	0 %	257793109
126	NC_013207	GTTG	2	8	71130	71137	0 %	50 %	50 %	0 %	257793109
127	NC_013207	TATG	2	8	71175	71182	25 %	50 %	25 %	0 %	257793109
128	NC_013207	TCAT	2	8	71208	71215	25 %	50 %	0 %	25 %	257793109
129	NC_013207	ATGG	2	8	71429	71436	25 %	25 %	50 %	0 %	257793109
130	NC_013207	CGGA	2	8	72058	72065	25 %	0 %	50 %	25 %	257793110
131	NC_013207	TCGG	2	8	72068	72075	0 %	25 %	50 %	25 %	257793110
132	NC_013207	TCGC	2	8	72214	72221	0 %	25 %	25 %	50 %	257793110
133	NC_013207	TTCA	2	8	72494	72501	25 %	50 %	0 %	25 %	257793111
134	NC_013207	ACGA	2	8	72852	72859	50 %	0 %	25 %	25 %	257793112
135	NC_013207	AAGC	2	8	73707	73714	50 %	0 %	25 %	25 %	257793115
136	NC_013207	CATC	2	8	73839	73846	25 %	25 %	0 %	50 %	257793116
137	NC_013207	GGAT	2	8	74410	74417	25 %	25 %	50 %	0 %	257793117
138	NC_013207	GCAG	2	8	74964	74971	25 %	0 %	50 %	25 %	257793118
139	NC_013207	ACGG	2	8	75306	75313	25 %	0 %	50 %	25 %	257793119
140	NC_013207	TGCG	2	8	75790	75797	0 %	25 %	50 %	25 %	257793119
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.