MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmid pAACI01

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013206	CG	3	6	760	765	0 %	0 %	50 %	50 %	257792944
2	NC_013206	CG	3	6	1167	1172	0 %	0 %	50 %	50 %	257792945
3	NC_013206	GT	3	6	1787	1792	0 %	50 %	50 %	0 %	257792945
4	NC_013206	CG	4	8	2404	2411	0 %	0 %	50 %	50 %	257792946
5	NC_013206	GC	3	6	2413	2418	0 %	0 %	50 %	50 %	257792946
6	NC_013206	TC	3	6	3517	3522	0 %	50 %	0 %	50 %	257792947
7	NC_013206	CG	3	6	5368	5373	0 %	0 %	50 %	50 %	257792951
8	NC_013206	CG	3	6	5535	5540	0 %	0 %	50 %	50 %	257792951
9	NC_013206	CG	3	6	6083	6088	0 %	0 %	50 %	50 %	257792954
10	NC_013206	CG	4	8	6816	6823	0 %	0 %	50 %	50 %	257792954
11	NC_013206	AC	3	6	7109	7114	50 %	0 %	0 %	50 %	257792955
12	NC_013206	GC	3	6	7156	7161	0 %	0 %	50 %	50 %	257792955
13	NC_013206	GC	3	6	7301	7306	0 %	0 %	50 %	50 %	257792955
14	NC_013206	GC	3	6	7351	7356	0 %	0 %	50 %	50 %	257792955
15	NC_013206	GC	3	6	8030	8035	0 %	0 %	50 %	50 %	257792956
16	NC_013206	CG	3	6	8344	8349	0 %	0 %	50 %	50 %	257792956
17	NC_013206	CG	3	6	8480	8485	0 %	0 %	50 %	50 %	257792956
18	NC_013206	CG	4	8	8557	8564	0 %	0 %	50 %	50 %	257792956
19	NC_013206	CG	3	6	8779	8784	0 %	0 %	50 %	50 %	257792956
20	NC_013206	CG	3	6	9308	9313	0 %	0 %	50 %	50 %	257792956
21	NC_013206	GC	3	6	9713	9718	0 %	0 %	50 %	50 %	257792957
22	NC_013206	AC	3	6	10058	10063	50 %	0 %	0 %	50 %	257792957
23	NC_013206	CG	3	6	10127	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	257792957
24	NC_013206	GT	3	6	10590	10595	0 %	50 %	50 %	0 %	257792958
25	NC_013206	CG	3	6	10968	10973	0 %	0 %	50 %	50 %	257792958
26	NC_013206	GA	3	6	11363	11368	50 %	0 %	50 %	0 %	257792959
27	NC_013206	GC	3	6	11753	11758	0 %	0 %	50 %	50 %	257792959
28	NC_013206	GC	3	6	11972	11977	0 %	0 %	50 %	50 %	257792959
29	NC_013206	AC	3	6	12060	12065	50 %	0 %	0 %	50 %	257792959
30	NC_013206	CA	3	6	12072	12077	50 %	0 %	0 %	50 %	257792959
31	NC_013206	CG	3	6	12129	12134	0 %	0 %	50 %	50 %	257792959
32	NC_013206	GT	3	6	13043	13048	0 %	50 %	50 %	0 %	257792960
33	NC_013206	CG	3	6	13083	13088	0 %	0 %	50 %	50 %	257792960
34	NC_013206	TC	3	6	15131	15136	0 %	50 %	0 %	50 %	257792962
35	NC_013206	CT	3	6	15203	15208	0 %	50 %	0 %	50 %	257792962
36	NC_013206	CG	3	6	15231	15236	0 %	0 %	50 %	50 %	257792962
37	NC_013206	CA	3	6	15772	15777	50 %	0 %	0 %	50 %	257792963
38	NC_013206	GC	3	6	16471	16476	0 %	0 %	50 %	50 %	257792965
39	NC_013206	GC	3	6	17039	17044	0 %	0 %	50 %	50 %	257792965
40	NC_013206	CG	3	6	17940	17945	0 %	0 %	50 %	50 %	257792965
41	NC_013206	GA	3	6	19093	19098	50 %	0 %	50 %	0 %	257792966
42	NC_013206	CG	3	6	20382	20387	0 %	0 %	50 %	50 %	257792966
43	NC_013206	GT	3	6	20599	20604	0 %	50 %	50 %	0 %	257792967
44	NC_013206	GC	3	6	20972	20977	0 %	0 %	50 %	50 %	257792967
45	NC_013206	CG	3	6	21312	21317	0 %	0 %	50 %	50 %	257792968
46	NC_013206	GC	3	6	21677	21682	0 %	0 %	50 %	50 %	257792969
47	NC_013206	GC	3	6	21824	21829	0 %	0 %	50 %	50 %	257792969
48	NC_013206	GC	3	6	22124	22129	0 %	0 %	50 %	50 %	257792970
49	NC_013206	CG	3	6	22144	22149	0 %	0 %	50 %	50 %	257792970
50	NC_013206	GC	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	257792970
51	NC_013206	AC	3	6	23124	23129	50 %	0 %	0 %	50 %	257792971
52	NC_013206	AT	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	257792972
53	NC_013206	AC	3	6	24231	24236	50 %	0 %	0 %	50 %	257792973
54	NC_013206	AC	3	6	25525	25530	50 %	0 %	0 %	50 %	257792974
55	NC_013206	GT	3	6	25573	25578	0 %	50 %	50 %	0 %	257792974
56	NC_013206	CA	3	6	25638	25643	50 %	0 %	0 %	50 %	257792974
57	NC_013206	GT	3	6	25716	25721	0 %	50 %	50 %	0 %	257792974
58	NC_013206	GT	3	6	26111	26116	0 %	50 %	50 %	0 %	257792975
59	NC_013206	CG	3	6	26958	26963	0 %	0 %	50 %	50 %	257792975
60	NC_013206	AT	3	6	29814	29819	50 %	50 %	0 %	0 %	257792980
61	NC_013206	TG	3	6	29963	29968	0 %	50 %	50 %	0 %	257792980
62	NC_013206	AT	3	6	30396	30401	50 %	50 %	0 %	0 %	257792980
63	NC_013206	TA	3	6	30507	30512	50 %	50 %	0 %	0 %	257792981
64	NC_013206	GC	3	6	30753	30758	0 %	0 %	50 %	50 %	257792981
65	NC_013206	AT	3	6	30874	30879	50 %	50 %	0 %	0 %	257792981
66	NC_013206	TA	4	8	32845	32852	50 %	50 %	0 %	0 %	257792983
67	NC_013206	CA	3	6	32972	32977	50 %	0 %	0 %	50 %	257792983
68	NC_013206	GA	3	6	33686	33691	50 %	0 %	50 %	0 %	257792983
69	NC_013206	AG	3	6	35389	35394	50 %	0 %	50 %	0 %	257792984
70	NC_013206	GA	3	6	35523	35528	50 %	0 %	50 %	0 %	257792984
71	NC_013206	TA	3	6	35780	35785	50 %	50 %	0 %	0 %	257792984
72	NC_013206	GA	3	6	37068	37073	50 %	0 %	50 %	0 %	257792986
73	NC_013206	CA	3	6	37363	37368	50 %	0 %	0 %	50 %	257792986
74	NC_013206	AC	3	6	38006	38011	50 %	0 %	0 %	50 %	257792987
75	NC_013206	GC	3	6	38141	38146	0 %	0 %	50 %	50 %	257792987
76	NC_013206	CG	3	6	38189	38194	0 %	0 %	50 %	50 %	257792987
77	NC_013206	AC	3	6	38788	38793	50 %	0 %	0 %	50 %	257792988
78	NC_013206	GC	3	6	38823	38828	0 %	0 %	50 %	50 %	257792988
79	NC_013206	AG	3	6	38909	38914	50 %	0 %	50 %	0 %	257792988
80	NC_013206	CG	3	6	38916	38921	0 %	0 %	50 %	50 %	257792988
81	NC_013206	GC	4	8	39001	39008	0 %	0 %	50 %	50 %	257792988
82	NC_013206	AG	3	6	39476	39481	50 %	0 %	50 %	0 %	257792988
83	NC_013206	GC	3	6	40836	40841	0 %	0 %	50 %	50 %	257792990
84	NC_013206	CG	4	8	40848	40855	0 %	0 %	50 %	50 %	257792990
85	NC_013206	CA	3	6	40912	40917	50 %	0 %	0 %	50 %	257792990
86	NC_013206	TG	4	8	41291	41298	0 %	50 %	50 %	0 %	257792990
87	NC_013206	CG	3	6	41312	41317	0 %	0 %	50 %	50 %	257792990
88	NC_013206	GC	3	6	41890	41895	0 %	0 %	50 %	50 %	257792991
89	NC_013206	CA	3	6	42045	42050	50 %	0 %	0 %	50 %	257792991
90	NC_013206	TC	3	6	42382	42387	0 %	50 %	0 %	50 %	257792992
91	NC_013206	TC	3	6	42449	42454	0 %	50 %	0 %	50 %	257792992
92	NC_013206	GC	3	6	42531	42536	0 %	0 %	50 %	50 %	257792992
93	NC_013206	TC	4	8	42851	42858	0 %	50 %	0 %	50 %	257792992
94	NC_013206	CG	3	6	42999	43004	0 %	0 %	50 %	50 %	257792992
95	NC_013206	CT	3	6	44339	44344	0 %	50 %	0 %	50 %	257792994
96	NC_013206	TG	3	6	45270	45275	0 %	50 %	50 %	0 %	257792996
97	NC_013206	TG	3	6	45342	45347	0 %	50 %	50 %	0 %	257792996
98	NC_013206	GA	3	6	45415	45420	50 %	0 %	50 %	0 %	257792996
99	NC_013206	CT	3	6	45616	45621	0 %	50 %	0 %	50 %	257792996
100	NC_013206	CG	3	6	46947	46952	0 %	0 %	50 %	50 %	257792998
101	NC_013206	GT	3	6	47089	47094	0 %	50 %	50 %	0 %	257792998
102	NC_013206	GC	3	6	48859	48864	0 %	0 %	50 %	50 %	257793002
103	NC_013206	CG	3	6	48984	48989	0 %	0 %	50 %	50 %	257793002
104	NC_013206	GC	3	6	49035	49040	0 %	0 %	50 %	50 %	257793002
105	NC_013206	CG	3	6	49577	49582	0 %	0 %	50 %	50 %	257793002
106	NC_013206	GC	3	6	49807	49812	0 %	0 %	50 %	50 %	257793002
107	NC_013206	GC	3	6	51797	51802	0 %	0 %	50 %	50 %	257793005
108	NC_013206	CG	3	6	52083	52088	0 %	0 %	50 %	50 %	257793005
109	NC_013206	TC	3	6	54778	54783	0 %	50 %	0 %	50 %	257793008
110	NC_013206	CG	3	6	55057	55062	0 %	0 %	50 %	50 %	257793008
111	NC_013206	CA	3	6	55816	55821	50 %	0 %	0 %	50 %	257793009
112	NC_013206	TG	4	8	56032	56039	0 %	50 %	50 %	0 %	257793009
113	NC_013206	TC	3	6	56265	56270	0 %	50 %	0 %	50 %	257793010
114	NC_013206	GC	3	6	56377	56382	0 %	0 %	50 %	50 %	257793010
115	NC_013206	CG	5	10	56418	56427	0 %	0 %	50 %	50 %	257793010
116	NC_013206	GC	3	6	57033	57038	0 %	0 %	50 %	50 %	257793010
117	NC_013206	GC	3	6	57408	57413	0 %	0 %	50 %	50 %	257793010
118	NC_013206	GC	3	6	58490	58495	0 %	0 %	50 %	50 %	257793010
119	NC_013206	GT	3	6	59744	59749	0 %	50 %	50 %	0 %	257793012
120	NC_013206	CA	3	6	60201	60206	50 %	0 %	0 %	50 %	257793012
121	NC_013206	GT	3	6	60253	60258	0 %	50 %	50 %	0 %	257793012
122	NC_013206	CG	4	8	60623	60630	0 %	0 %	50 %	50 %	257793013
123	NC_013206	CG	3	6	60774	60779	0 %	0 %	50 %	50 %	257793013
124	NC_013206	GA	3	6	60893	60898	50 %	0 %	50 %	0 %	257793013
125	NC_013206	CG	3	6	61146	61151	0 %	0 %	50 %	50 %	257793013
126	NC_013206	GT	3	6	61225	61230	0 %	50 %	50 %	0 %	257793013
127	NC_013206	AC	3	6	61460	61465	50 %	0 %	0 %	50 %	257793013
128	NC_013206	AC	3	6	61911	61916	50 %	0 %	0 %	50 %	257793013
129	NC_013206	GC	3	6	61938	61943	0 %	0 %	50 %	50 %	257793013
130	NC_013206	CG	3	6	62169	62174	0 %	0 %	50 %	50 %	257793013
131	NC_013206	CG	3	6	62195	62200	0 %	0 %	50 %	50 %	257793013
132	NC_013206	GC	3	6	62519	62524	0 %	0 %	50 %	50 %	257793014
133	NC_013206	CG	3	6	62808	62813	0 %	0 %	50 %	50 %	257793015
134	NC_013206	GC	3	6	63715	63720	0 %	0 %	50 %	50 %	257793016
135	NC_013206	GC	3	6	64561	64566	0 %	0 %	50 %	50 %	257793016
136	NC_013206	GC	3	6	65687	65692	0 %	0 %	50 %	50 %	257793017
137	NC_013206	GC	3	6	66286	66291	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
138	NC_013206	CG	4	8	66313	66320	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
139	NC_013206	TG	3	6	66393	66398	0 %	50 %	50 %	0 %	257793018
140	NC_013206	GT	3	6	66727	66732	0 %	50 %	50 %	0 %	257793018
141	NC_013206	CG	3	6	66830	66835	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
142	NC_013206	GC	3	6	67050	67055	0 %	0 %	50 %	50 %	257793018
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.