MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 6624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013205	TCGT	2	8	481	488	0 %	50 %	25 %	25 %	258510021
2	NC_013205	ACGA	2	8	682	689	50 %	0 %	25 %	25 %	258510021
3	NC_013205	CGCC	2	8	871	878	0 %	0 %	25 %	75 %	258510021
4	NC_013205	TTCG	2	8	908	915	0 %	50 %	25 %	25 %	258510021
5	NC_013205	CCAA	2	8	1040	1047	50 %	0 %	0 %	50 %	258510021
6	NC_013205	GAAG	2	8	1113	1120	50 %	0 %	50 %	0 %	258510021
7	NC_013205	GCCC	2	8	1928	1935	0 %	0 %	25 %	75 %	258510022
8	NC_013205	ATCG	2	8	2514	2521	25 %	25 %	25 %	25 %	258510022
9	NC_013205	GCTG	2	8	3523	3530	0 %	25 %	50 %	25 %	258510024
10	NC_013205	GCGG	2	8	4883	4890	0 %	0 %	75 %	25 %	258510025
11	NC_013205	GCAC	2	8	5083	5090	25 %	0 %	25 %	50 %	258510025
12	NC_013205	GATG	2	8	6041	6048	25 %	25 %	50 %	0 %	258510025
13	NC_013205	GCAT	2	8	6196	6203	25 %	25 %	25 %	25 %	258510026
14	NC_013205	AGGC	2	8	6368	6375	25 %	0 %	50 %	25 %	258510026
15	NC_013205	CACC	2	8	7731	7738	25 %	0 %	0 %	75 %	258510026
16	NC_013205	CGGC	2	8	7932	7939	0 %	0 %	50 %	50 %	258510026
17	NC_013205	GACG	2	8	8175	8182	25 %	0 %	50 %	25 %	258510026
18	NC_013205	GATG	2	8	8316	8323	25 %	25 %	50 %	0 %	258510026
19	NC_013205	CGGC	2	8	8940	8947	0 %	0 %	50 %	50 %	258510028
20	NC_013205	GCGG	2	8	9606	9613	0 %	0 %	75 %	25 %	258510028
21	NC_013205	GCTC	2	8	9902	9909	0 %	25 %	25 %	50 %	258510029
22	NC_013205	GCGG	2	8	10016	10023	0 %	0 %	75 %	25 %	258510029
23	NC_013205	GTCG	2	8	10364	10371	0 %	25 %	50 %	25 %	258510030
24	NC_013205	ATCT	2	8	16461	16468	25 %	50 %	0 %	25 %	258510031
25	NC_013205	TTCG	2	8	16960	16967	0 %	50 %	25 %	25 %	258510031
26	NC_013205	GGCG	2	8	17099	17106	0 %	0 %	75 %	25 %	258510031
27	NC_013205	CGGC	2	8	17224	17231	0 %	0 %	50 %	50 %	258510031
28	NC_013205	GCAG	2	8	17305	17312	25 %	0 %	50 %	25 %	258510031
29	NC_013205	GCCG	2	8	18056	18063	0 %	0 %	50 %	50 %	258510032
30	NC_013205	CGCC	2	8	18382	18389	0 %	0 %	25 %	75 %	258510032
31	NC_013205	CGAG	2	8	19500	19507	25 %	0 %	50 %	25 %	258510034
32	NC_013205	AGCG	2	8	19748	19755	25 %	0 %	50 %	25 %	258510034
33	NC_013205	CGAT	2	8	21038	21045	25 %	25 %	25 %	25 %	258510035
34	NC_013205	GCCG	2	8	21509	21516	0 %	0 %	50 %	50 %	258510036
35	NC_013205	GCCC	2	8	21772	21779	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
36	NC_013205	GGCG	2	8	22127	22134	0 %	0 %	75 %	25 %	258510036
37	NC_013205	CCGC	2	8	22408	22415	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
38	NC_013205	CAGC	2	8	22481	22488	25 %	0 %	25 %	50 %	258510036
39	NC_013205	GCTG	2	8	22636	22643	0 %	25 %	50 %	25 %	258510036
40	NC_013205	CGCC	2	8	22748	22755	0 %	0 %	25 %	75 %	258510036
41	NC_013205	AACG	2	8	23629	23636	50 %	0 %	25 %	25 %	258510037
42	NC_013205	AGGA	2	8	23755	23762	50 %	0 %	50 %	0 %	258510037
43	NC_013205	ACTT	2	8	23879	23886	25 %	50 %	0 %	25 %	258510037
44	NC_013205	GTTA	2	8	24033	24040	25 %	50 %	25 %	0 %	258510037
45	NC_013205	CCAT	2	8	24339	24346	25 %	25 %	0 %	50 %	258510037
46	NC_013205	GACG	2	8	25343	25350	25 %	0 %	50 %	25 %	258510038
47	NC_013205	TGGA	2	8	26484	26491	25 %	25 %	50 %	0 %	258510039
48	NC_013205	GCGG	2	8	28104	28111	0 %	0 %	75 %	25 %	258510040
49	NC_013205	ACTG	2	8	28125	28132	25 %	25 %	25 %	25 %	258510040
50	NC_013205	GACG	2	8	28215	28222	25 %	0 %	50 %	25 %	258510040
51	NC_013205	TGTA	2	8	28949	28956	25 %	50 %	25 %	0 %	258510040
52	NC_013205	GACC	2	8	29549	29556	25 %	0 %	25 %	50 %	258510041
53	NC_013205	CGAG	2	8	29623	29630	25 %	0 %	50 %	25 %	258510041
54	NC_013205	GTCA	2	8	30023	30030	25 %	25 %	25 %	25 %	258510041
55	NC_013205	ATGG	2	8	31344	31351	25 %	25 %	50 %	0 %	258510042
56	NC_013205	CGGT	2	8	32282	32289	0 %	25 %	50 %	25 %	258510043
57	NC_013205	GGAC	2	8	32351	32358	25 %	0 %	50 %	25 %	258510043
58	NC_013205	ACCA	2	8	32568	32575	50 %	0 %	0 %	50 %	258510043
59	NC_013205	GGCG	2	8	32870	32877	0 %	0 %	75 %	25 %	258510043
60	NC_013205	GGCG	2	8	34066	34073	0 %	0 %	75 %	25 %	258510045
61	NC_013205	GGCG	2	8	34622	34629	0 %	0 %	75 %	25 %	258510045
62	NC_013205	TGTC	2	8	34822	34829	0 %	50 %	25 %	25 %	258510045
63	NC_013205	GCCC	2	8	34970	34977	0 %	0 %	25 %	75 %	258510045
64	NC_013205	CCGT	2	8	36137	36144	0 %	25 %	25 %	50 %	258510046
65	NC_013205	GGCG	2	8	36147	36154	0 %	0 %	75 %	25 %	258510046
66	NC_013205	CGCC	2	8	36441	36448	0 %	0 %	25 %	75 %	258510046
67	NC_013205	TGCG	2	8	36719	36726	0 %	25 %	50 %	25 %	258510046
68	NC_013205	AGGC	2	8	37638	37645	25 %	0 %	50 %	25 %	258510047
69	NC_013205	GGGC	2	8	37960	37967	0 %	0 %	75 %	25 %	258510047
70	NC_013205	CGGG	2	8	38403	38410	0 %	0 %	75 %	25 %	258510047
71	NC_013205	CTAC	2	8	41364	41371	25 %	25 %	0 %	50 %	258510048
72	NC_013205	GATG	2	8	41591	41598	25 %	25 %	50 %	0 %	258510048
73	NC_013205	AGCG	2	8	42282	42289	25 %	0 %	50 %	25 %	258510049
74	NC_013205	GCCC	2	8	43613	43620	0 %	0 %	25 %	75 %	258510050
75	NC_013205	AACG	2	8	43692	43699	50 %	0 %	25 %	25 %	258510050
76	NC_013205	TGCC	2	8	43721	43728	0 %	25 %	25 %	50 %	258510050
77	NC_013205	CAGC	2	8	43776	43783	25 %	0 %	25 %	50 %	258510050
78	NC_013205	ACCC	2	8	43806	43813	25 %	0 %	0 %	75 %	258510050
79	NC_013205	CGGG	2	8	44431	44438	0 %	0 %	75 %	25 %	258510051
80	NC_013205	CCCG	2	8	44653	44660	0 %	0 %	25 %	75 %	258510051
81	NC_013205	GCCC	2	8	45283	45290	0 %	0 %	25 %	75 %	258510051
82	NC_013205	CGTC	2	8	45751	45758	0 %	25 %	25 %	50 %	258510052
83	NC_013205	AAAC	2	8	47081	47088	75 %	0 %	0 %	25 %	258510053
84	NC_013205	GGCG	2	8	47344	47351	0 %	0 %	75 %	25 %	258510053
85	NC_013205	GCCT	2	8	47528	47535	0 %	25 %	25 %	50 %	258510053
86	NC_013205	GGGC	2	8	47756	47763	0 %	0 %	75 %	25 %	258510054
87	NC_013205	TCCT	2	8	48152	48159	0 %	50 %	0 %	50 %	258510054
88	NC_013205	TCGC	2	8	48188	48195	0 %	25 %	25 %	50 %	258510054
89	NC_013205	AGGA	2	8	48650	48657	50 %	0 %	50 %	0 %	258510055
90	NC_013205	CCGC	2	8	48935	48942	0 %	0 %	25 %	75 %	258510056
91	NC_013205	GAGG	2	8	49039	49046	25 %	0 %	75 %	0 %	258510056
92	NC_013205	ATGC	2	8	49531	49538	25 %	25 %	25 %	25 %	258510057
93	NC_013205	CGGC	2	8	50207	50214	0 %	0 %	50 %	50 %	258510058
94	NC_013205	CGCC	2	8	50843	50850	0 %	0 %	25 %	75 %	258510058
95	NC_013205	GCCG	2	8	50907	50914	0 %	0 %	50 %	50 %	258510058
96	NC_013205	CGGC	2	8	50971	50978	0 %	0 %	50 %	50 %	258510059
97	NC_013205	TCGC	2	8	51111	51118	0 %	25 %	25 %	50 %	258510059
98	NC_013205	CAAG	2	8	51535	51542	50 %	0 %	25 %	25 %	258510059
99	NC_013205	CAGC	2	8	52220	52227	25 %	0 %	25 %	50 %	258510059
100	NC_013205	GCCG	2	8	52556	52563	0 %	0 %	50 %	50 %	258510059
101	NC_013205	GACG	2	8	52717	52724	25 %	0 %	50 %	25 %	258510060
102	NC_013205	CCGG	2	8	52739	52746	0 %	0 %	50 %	50 %	258510060
103	NC_013205	CAGG	2	8	53124	53131	25 %	0 %	50 %	25 %	258510060
104	NC_013205	CCCA	2	8	53177	53184	25 %	0 %	0 %	75 %	258510060
105	NC_013205	GCGA	2	8	53822	53829	25 %	0 %	50 %	25 %	258510061
106	NC_013205	GCCG	2	8	54618	54625	0 %	0 %	50 %	50 %	258510062
107	NC_013205	CGAT	2	8	54847	54854	25 %	25 %	25 %	25 %	258510062
108	NC_013205	GAGC	2	8	56352	56359	25 %	0 %	50 %	25 %	258510064
109	NC_013205	CGGA	2	8	56869	56876	25 %	0 %	50 %	25 %	258510064
110	NC_013205	GAGC	2	8	56924	56931	25 %	0 %	50 %	25 %	258510064
111	NC_013205	CTCG	2	8	56969	56976	0 %	25 %	25 %	50 %	258510064
112	NC_013205	TGCG	2	8	57044	57051	0 %	25 %	50 %	25 %	258510064
113	NC_013205	GAAG	2	8	57209	57216	50 %	0 %	50 %	0 %	258510064
114	NC_013205	TCCG	2	8	57259	57266	0 %	25 %	25 %	50 %	258510064
115	NC_013205	TGGC	2	8	57849	57856	0 %	25 %	50 %	25 %	258510066
116	NC_013205	CTGC	2	8	57861	57868	0 %	25 %	25 %	50 %	258510066
117	NC_013205	GTCG	2	8	58760	58767	0 %	25 %	50 %	25 %	258510067
118	NC_013205	CGCC	2	8	59770	59777	0 %	0 %	25 %	75 %	258510067
119	NC_013205	GGTT	2	8	60231	60238	0 %	50 %	50 %	0 %	258510067
120	NC_013205	GGCG	2	8	60652	60659	0 %	0 %	75 %	25 %	258510067
121	NC_013205	CGGA	2	8	60802	60809	25 %	0 %	50 %	25 %	258510067
122	NC_013205	CTGC	2	8	61171	61178	0 %	25 %	25 %	50 %	258510067
123	NC_013205	CGGC	2	8	61281	61288	0 %	0 %	50 %	50 %	258510067
124	NC_013205	GATC	2	8	62051	62058	25 %	25 %	25 %	25 %	258510068
125	NC_013205	GCGG	2	8	62165	62172	0 %	0 %	75 %	25 %	258510068
126	NC_013205	CCGG	2	8	62537	62544	0 %	0 %	50 %	50 %	258510068
127	NC_013205	CGGC	2	8	63081	63088	0 %	0 %	50 %	50 %	258510069
128	NC_013205	GCAG	2	8	63350	63357	25 %	0 %	50 %	25 %	258510070
129	NC_013205	CCCA	2	8	64366	64373	25 %	0 %	0 %	75 %	258510070
130	NC_013205	GTTG	2	8	64437	64444	0 %	50 %	50 %	0 %	258510070
131	NC_013205	TCAC	2	8	64872	64879	25 %	25 %	0 %	50 %	258510070
132	NC_013205	CAAG	2	8	65024	65031	50 %	0 %	25 %	25 %	258510071
133	NC_013205	GATG	2	8	67334	67341	25 %	25 %	50 %	0 %	258510072
134	NC_013205	ATGA	2	8	68086	68093	50 %	25 %	25 %	0 %	258510072
135	NC_013205	GGGC	2	8	68133	68140	0 %	0 %	75 %	25 %	258510072
136	NC_013205	GCTC	2	8	68168	68175	0 %	25 %	25 %	50 %	258510072
137	NC_013205	TGTT	2	8	68297	68304	0 %	75 %	25 %	0 %	258510072
138	NC_013205	GGCA	2	8	68389	68396	25 %	0 %	50 %	25 %	258510073
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