MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_013205	TCC	2	6	2106446	2106451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512022
41503	NC_013205	CAAAC	2	10	2106479	2106488	60 %	0 %	0 %	40 %	258512022
41504	NC_013205	CGC	2	6	2106502	2106507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512022
41505	NC_013205	GC	3	6	2106506	2106511	0 %	0 %	50 %	50 %	258512022
41506	NC_013205	CTC	2	6	2106539	2106544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512022
41507	NC_013205	CCG	2	6	2106609	2106614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512022
41508	NC_013205	CG	3	6	2106617	2106622	0 %	0 %	50 %	50 %	258512022
41509	NC_013205	TCC	2	6	2106630	2106635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512022
41510	NC_013205	TCC	2	6	2106681	2106686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512022
41511	NC_013205	ATC	2	6	2106819	2106824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512022
41512	NC_013205	CCG	3	9	2109031	2109039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
41513	NC_013205	GCC	2	6	2109066	2109071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
41514	NC_013205	GCG	2	6	2109072	2109077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512023
41515	NC_013205	AGC	2	6	2109091	2109096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512023
41516	NC_013205	GCC	2	6	2109150	2109155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
41517	NC_013205	GCG	2	6	2109214	2109219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512023
41518	NC_013205	GAGGTC	2	12	2109240	2109251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512023
41519	NC_013205	CCCG	2	8	2109265	2109272	0 %	0 %	25 %	75 %	258512023
41520	NC_013205	GCC	2	6	2109412	2109417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
41521	NC_013205	CGT	2	6	2109422	2109427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512023
41522	NC_013205	CGT	2	6	2109504	2109509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512023
41523	NC_013205	TCG	2	6	2109526	2109531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512023
41524	NC_013205	CCG	2	6	2109558	2109563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
41525	NC_013205	GCCT	2	8	2109600	2109607	0 %	25 %	25 %	50 %	258512023
41526	NC_013205	GC	3	6	2109622	2109627	0 %	0 %	50 %	50 %	258512023
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41529	NC_013205	GCC	2	6	2109837	2109842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
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41531	NC_013205	CGT	2	6	2109930	2109935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512023
41532	NC_013205	CG	3	6	2109960	2109965	0 %	0 %	50 %	50 %	258512023
41533	NC_013205	CGC	2	6	2109969	2109974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512023
41534	NC_013205	CGCC	2	8	2109998	2110005	0 %	0 %	25 %	75 %	258512023
41535	NC_013205	GCA	2	6	2110007	2110012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512023
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41537	NC_013205	GA	3	6	2110114	2110119	50 %	0 %	50 %	0 %	258512023
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41540	NC_013205	TCG	2	6	2110277	2110282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512024
41541	NC_013205	GCA	2	6	2110308	2110313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512024
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41543	NC_013205	CAC	2	6	2110366	2110371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512024
41544	NC_013205	GGC	2	6	2110392	2110397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512024
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41549	NC_013205	GCC	2	6	2110585	2110590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512024
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41551	NC_013205	CCG	2	6	2110641	2110646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512024
41552	NC_013205	TGA	2	6	2110668	2110673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512024
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41554	NC_013205	GGT	2	6	2110764	2110769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512024
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41558	NC_013205	ATGA	2	8	2110991	2110998	50 %	25 %	25 %	0 %	258512025
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41562	NC_013205	TGA	2	6	2111140	2111145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512025
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41587	NC_013205	GCA	2	6	2112397	2112402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512027
41588	NC_013205	GCCC	2	8	2112424	2112431	0 %	0 %	25 %	75 %	258512027
41589	NC_013205	AAGC	2	8	2112437	2112444	50 %	0 %	25 %	25 %	258512027
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41591	NC_013205	CG	3	6	2112554	2112559	0 %	0 %	50 %	50 %	258512027
41592	NC_013205	GC	3	6	2112561	2112566	0 %	0 %	50 %	50 %	258512027
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41599	NC_013205	GCGCC	2	10	2112791	2112800	0 %	0 %	40 %	60 %	258512027
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41601	NC_013205	CCGG	2	8	2112904	2112911	0 %	0 %	50 %	50 %	258512027
41602	NC_013205	TCGCC	2	10	2112995	2113004	0 %	20 %	20 %	60 %	258512027
41603	NC_013205	CG	3	6	2113008	2113013	0 %	0 %	50 %	50 %	258512027
41604	NC_013205	GCC	2	6	2113036	2113041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512027
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41611	NC_013205	CA	3	6	2113321	2113326	50 %	0 %	0 %	50 %	258512028
41612	NC_013205	CCA	2	6	2113389	2113394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512028
41613	NC_013205	CGT	2	6	2113462	2113467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512028
41614	NC_013205	TCTCCA	2	12	2113479	2113490	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258512028
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41616	NC_013205	TTGG	2	8	2113675	2113682	0 %	50 %	50 %	0 %	258512029
41617	NC_013205	TCG	2	6	2113701	2113706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512029
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41729	NC_013205	CGCGTT	2	12	2118342	2118353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512034
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41959	NC_013205	CGGG	2	8	2128695	2128702	0 %	0 %	75 %	25 %	258512042
41960	NC_013205	TGCAGC	2	12	2128820	2128831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258512042
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41962	NC_013205	CAC	2	6	2128945	2128950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512042
41963	NC_013205	CG	4	8	2129022	2129029	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
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41966	NC_013205	TGG	2	6	2129156	2129161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512042
41967	NC_013205	TCCGC	2	10	2129280	2129289	0 %	20 %	20 %	60 %	258512042
41968	NC_013205	GAC	2	6	2129370	2129375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512042
41969	NC_013205	GGCA	2	8	2129422	2129429	25 %	0 %	50 %	25 %	258512042
41970	NC_013205	CAC	2	6	2129527	2129532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512042
41971	NC_013205	CG	3	6	2129640	2129645	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
41972	NC_013205	TCGA	2	8	2129651	2129658	25 %	25 %	25 %	25 %	258512042
41973	NC_013205	CGAG	2	8	2129676	2129683	25 %	0 %	50 %	25 %	258512042
41974	NC_013205	TCGC	2	8	2129720	2129727	0 %	25 %	25 %	50 %	258512042
41975	NC_013205	CAC	2	6	2129737	2129742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512042
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41977	NC_013205	GC	3	6	2129792	2129797	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
41978	NC_013205	TCC	2	6	2129804	2129809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512042
41979	NC_013205	GAAG	2	8	2129829	2129836	50 %	0 %	50 %	0 %	258512042
41980	NC_013205	AGGCG	2	10	2129847	2129856	20 %	0 %	60 %	20 %	258512042
41981	NC_013205	TCG	3	9	2129858	2129866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512042
41982	NC_013205	CG	3	6	2129889	2129894	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
41983	NC_013205	CGT	2	6	2129907	2129912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512042
41984	NC_013205	ACG	2	6	2129921	2129926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512042
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41986	NC_013205	GC	4	8	2129954	2129961	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
41987	NC_013205	TCG	2	6	2130092	2130097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512042
41988	NC_013205	GTC	2	6	2130151	2130156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512042
41989	NC_013205	GC	4	8	2130224	2130231	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
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41993	NC_013205	CGC	2	6	2130443	2130448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512042
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41996	NC_013205	CG	3	6	2130663	2130668	0 %	0 %	50 %	50 %	258512042
41997	NC_013205	CA	3	6	2130717	2130722	50 %	0 %	0 %	50 %	258512042
41998	NC_013205	CTC	2	6	2130724	2130729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512042
41999	NC_013205	CGC	2	6	2130759	2130764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512042
42000	NC_013205	GCG	2	6	2130816	2130821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512042

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