MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38005	NC_013205	CGG	2	6	1944512	1944517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511863
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38116	NC_013205	GAC	2	6	1949336	1949341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511867
38117	NC_013205	CTTGGC	2	12	1949383	1949394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511867
38118	NC_013205	TGA	2	6	1949417	1949422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511867
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38123	NC_013205	T	6	6	1949639	1949644	0 %	100 %	0 %	0 %	258511867
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38224	NC_013205	TCG	2	6	1957502	1957507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511876
38225	NC_013205	CGA	2	6	1957530	1957535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511876
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38229	NC_013205	CGGC	2	8	1957613	1957620	0 %	0 %	50 %	50 %	258511877
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38348	NC_013205	CCGA	2	8	1962936	1962943	25 %	0 %	25 %	50 %	258511882
38349	NC_013205	ATG	2	6	1962957	1962962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511882
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38465	NC_013205	TCC	2	6	1968199	1968204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511886
38466	NC_013205	GTC	3	9	1968231	1968239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511886
38467	NC_013205	CCA	2	6	1968248	1968253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511886
38468	NC_013205	CGG	2	6	1968294	1968299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511886
38469	NC_013205	CGG	2	6	1968311	1968316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511886
38470	NC_013205	GCGA	2	8	1968337	1968344	25 %	0 %	50 %	25 %	258511886
38471	NC_013205	AGCG	2	8	1968349	1968356	25 %	0 %	50 %	25 %	258511886
38472	NC_013205	CG	3	6	1968398	1968403	0 %	0 %	50 %	50 %	258511886
38473	NC_013205	CGA	2	6	1968425	1968430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511886
38474	NC_013205	CGG	2	6	1968562	1968567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511887
38475	NC_013205	CGAGC	2	10	1968583	1968592	20 %	0 %	40 %	40 %	258511887
38476	NC_013205	CTC	2	6	1968599	1968604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511887
38477	NC_013205	GC	5	10	1968610	1968619	0 %	0 %	50 %	50 %	258511887
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38479	NC_013205	TCG	2	6	1968684	1968689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38480	NC_013205	CCA	2	6	1968715	1968720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511887
38481	NC_013205	CCCG	2	8	1968773	1968780	0 %	0 %	25 %	75 %	258511887
38482	NC_013205	CG	3	6	1968794	1968799	0 %	0 %	50 %	50 %	258511887
38483	NC_013205	A	6	6	1968816	1968821	100 %	0 %	0 %	0 %	258511887
38484	NC_013205	TCG	2	6	1968828	1968833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38485	NC_013205	GC	3	6	1968874	1968879	0 %	0 %	50 %	50 %	258511887
38486	NC_013205	TAA	2	6	1968903	1968908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258511887
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38488	NC_013205	GT	3	6	1968997	1969002	0 %	50 %	50 %	0 %	258511887
38489	NC_013205	GAC	2	6	1969020	1969025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38490	NC_013205	GC	4	8	1969123	1969130	0 %	0 %	50 %	50 %	258511887
38491	NC_013205	CGG	2	6	1969184	1969189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511887
38492	NC_013205	CG	3	6	1969218	1969223	0 %	0 %	50 %	50 %	258511887
38493	NC_013205	TCG	2	6	1969228	1969233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38494	NC_013205	ACG	2	6	1969308	1969313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38495	NC_013205	CGT	2	6	1969316	1969321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38496	NC_013205	GCC	2	6	1969355	1969360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511887
38497	NC_013205	GTG	2	6	1969485	1969490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511887
38498	NC_013205	GAC	2	6	1969598	1969603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511887
38499	NC_013205	GCG	2	6	1969648	1969653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511887
38500	NC_013205	CCG	2	6	1969654	1969659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511887

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