MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_013205	CGAA	2	8	1821754	1821761	50 %	0 %	25 %	25 %	258511731
35502	NC_013205	CAC	2	6	1821783	1821788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511731
35503	NC_013205	ACG	2	6	1821821	1821826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35504	NC_013205	GCG	2	6	1821885	1821890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511731
35505	NC_013205	TTC	2	6	1821891	1821896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511731
35506	NC_013205	CGA	2	6	1821962	1821967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35507	NC_013205	GCT	2	6	1822022	1822027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35508	NC_013205	CAC	2	6	1822035	1822040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511731
35509	NC_013205	GC	3	6	1822046	1822051	0 %	0 %	50 %	50 %	258511731
35510	NC_013205	CGATAG	2	12	1822052	1822063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258511731
35511	NC_013205	GAT	2	6	1822107	1822112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511731
35512	NC_013205	AC	3	6	1822226	1822231	50 %	0 %	0 %	50 %	258511731
35513	NC_013205	C	6	6	1822255	1822260	0 %	0 %	0 %	100 %	258511731
35514	NC_013205	TTC	2	6	1822269	1822274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511731
35515	NC_013205	GCG	2	6	1822324	1822329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511731
35516	NC_013205	GT	3	6	1822360	1822365	0 %	50 %	50 %	0 %	258511731
35517	NC_013205	CGT	2	6	1822367	1822372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35518	NC_013205	TTC	2	6	1822399	1822404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258511731
35519	NC_013205	CG	3	6	1822455	1822460	0 %	0 %	50 %	50 %	258511731
35520	NC_013205	GGC	2	6	1822481	1822486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511731
35521	NC_013205	CGA	2	6	1822502	1822507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35522	NC_013205	GCC	2	6	1822573	1822578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511731
35523	NC_013205	CGA	2	6	1822634	1822639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511731
35524	NC_013205	CGC	2	6	1822643	1822648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511731
35525	NC_013205	CG	4	8	1822664	1822671	0 %	0 %	50 %	50 %	258511731
35526	NC_013205	CCA	2	6	1822676	1822681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511731
35527	NC_013205	TCA	2	6	1822715	1822720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511732
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35529	NC_013205	GTC	2	6	1822875	1822880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511732
35530	NC_013205	CTTG	2	8	1822904	1822911	0 %	50 %	25 %	25 %	258511732
35531	NC_013205	TGCG	2	8	1823002	1823009	0 %	25 %	50 %	25 %	258511732
35532	NC_013205	GGT	2	6	1823056	1823061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511732
35533	NC_013205	TCGACG	2	12	1823092	1823103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258511732
35534	NC_013205	CGCT	2	8	1823154	1823161	0 %	25 %	25 %	50 %	258511732
35535	NC_013205	AGA	2	6	1823245	1823250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258511732
35536	NC_013205	CG	4	8	1823296	1823303	0 %	0 %	50 %	50 %	258511732
35537	NC_013205	GCA	2	6	1823345	1823350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511732
35538	NC_013205	CGG	2	6	1823351	1823356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511732
35539	NC_013205	CCG	2	6	1823357	1823362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511732
35540	NC_013205	TTCC	2	8	1823376	1823383	0 %	50 %	0 %	50 %	258511732
35541	NC_013205	TGG	2	6	1823606	1823611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258511733
35542	NC_013205	CGCATC	2	12	1823614	1823625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258511733
35543	NC_013205	TGGCGC	2	12	1823661	1823672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258511733
35544	NC_013205	GCC	2	6	1823681	1823686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511733
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35546	NC_013205	GCGAG	2	10	1823909	1823918	20 %	0 %	60 %	20 %	258511733
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35550	NC_013205	CG	3	6	1824109	1824114	0 %	0 %	50 %	50 %	258511734
35551	NC_013205	CGT	2	6	1824130	1824135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511734
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35554	NC_013205	GGC	2	6	1824311	1824316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511734
35555	NC_013205	CAA	2	6	1824336	1824341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511734
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35558	NC_013205	ATG	2	6	1824500	1824505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511734
35559	NC_013205	CGG	2	6	1824511	1824516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511734
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35562	NC_013205	ATC	2	6	1824715	1824720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258511734
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35584	NC_013205	GC	4	8	1825657	1825664	0 %	0 %	50 %	50 %	258511735
35585	NC_013205	CG	3	6	1825781	1825786	0 %	0 %	50 %	50 %	258511735
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35617	NC_013205	ACG	2	6	1827085	1827090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511736
35618	NC_013205	TCC	2	6	1827093	1827098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511736
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35622	NC_013205	CG	3	6	1827266	1827271	0 %	0 %	50 %	50 %	258511736
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35719	NC_013205	TCG	3	9	1832105	1832113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511741
35720	NC_013205	GTC	2	6	1832128	1832133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511741
35721	NC_013205	GCG	2	6	1832174	1832179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511741
35722	NC_013205	CTTC	2	8	1832280	1832287	0 %	50 %	0 %	50 %	258511741
35723	NC_013205	GC	3	6	1832320	1832325	0 %	0 %	50 %	50 %	258511741
35724	NC_013205	GCT	2	6	1832472	1832477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511742
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35727	NC_013205	GCC	2	6	1832577	1832582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511742
35728	NC_013205	GTT	2	6	1832611	1832616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258511742
35729	NC_013205	GCC	2	6	1832624	1832629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511742
35730	NC_013205	TCC	2	6	1832636	1832641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511742
35731	NC_013205	ACCGT	2	10	1832664	1832673	20 %	20 %	20 %	40 %	258511743
35732	NC_013205	TGA	2	6	1832725	1832730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511743
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35734	NC_013205	CGC	2	6	1832769	1832774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511743
35735	NC_013205	CGCCC	2	10	1832912	1832921	0 %	0 %	20 %	80 %	258511743
35736	NC_013205	GCG	2	6	1832984	1832989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511743
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35830	NC_013205	GC	3	6	1837516	1837521	0 %	0 %	50 %	50 %	258511747
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35840	NC_013205	CGG	2	6	1838103	1838108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511749
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35843	NC_013205	ACA	2	6	1838157	1838162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511749
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35845	NC_013205	CAC	2	6	1838179	1838184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511749
35846	NC_013205	ACA	2	6	1838298	1838303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258511749
35847	NC_013205	ATCG	2	8	1838316	1838323	25 %	25 %	25 %	25 %	258511749
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35849	NC_013205	CTC	2	6	1838355	1838360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511750
35850	NC_013205	GCT	2	6	1838371	1838376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511750
35851	NC_013205	GC	4	8	1838396	1838403	0 %	0 %	50 %	50 %	258511750
35852	NC_013205	CAC	2	6	1838430	1838435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258511750
35853	NC_013205	TCGAC	2	10	1838471	1838480	20 %	20 %	20 %	40 %	258511750
35854	NC_013205	GC	3	6	1838571	1838576	0 %	0 %	50 %	50 %	258511750
35855	NC_013205	T	6	6	1838614	1838619	0 %	100 %	0 %	0 %	258511750
35856	NC_013205	TCGT	2	8	1838686	1838693	0 %	50 %	25 %	25 %	258511750
35857	NC_013205	GAT	2	6	1838706	1838711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511750
35858	NC_013205	CCATCT	2	12	1838774	1838785	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258511750
35859	NC_013205	TCC	2	6	1838862	1838867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258511751
35860	NC_013205	GGA	2	6	1838911	1838916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258511751
35861	NC_013205	GTC	2	6	1838937	1838942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258511751
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35864	NC_013205	GTA	2	6	1839044	1839049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258511751
35865	NC_013205	CGG	2	6	1839050	1839055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511751
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35870	NC_013205	GA	3	6	1839225	1839230	50 %	0 %	50 %	0 %	258511751
35871	NC_013205	GCCG	2	8	1839236	1839243	0 %	0 %	50 %	50 %	258511751
35872	NC_013205	GT	3	6	1839352	1839357	0 %	50 %	50 %	0 %	258511751
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35874	NC_013205	GGC	2	6	1839487	1839492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511751
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35884	NC_013205	CGA	2	6	1840303	1840308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511752
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35923	NC_013205	CCG	2	6	1842462	1842467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258511755
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35953	NC_013205	CGG	2	6	1843623	1843628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258511756
35954	NC_013205	GTCG	2	8	1843657	1843664	0 %	25 %	50 %	25 %	258511756
35955	NC_013205	CGA	2	6	1843692	1843697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258511756
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