MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 60313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	GAT	2	6	31122	31127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510042
502	NC_013205	GCC	2	6	31175	31180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510042
503	NC_013205	TCT	2	6	31184	31189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510042
504	NC_013205	GGA	2	6	31209	31214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510042
505	NC_013205	ATGG	2	8	31344	31351	25 %	25 %	50 %	0 %	258510042
506	NC_013205	CGC	2	6	31364	31369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510042
507	NC_013205	GGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510042
508	NC_013205	TCG	2	6	31381	31386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510042
509	NC_013205	GAC	2	6	31395	31400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510042
510	NC_013205	CGA	2	6	31481	31486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510042
511	NC_013205	AAG	2	6	31546	31551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510042
512	NC_013205	GGC	2	6	31627	31632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510042
513	NC_013205	GCC	2	6	31708	31713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510042
514	NC_013205	CCG	2	6	31764	31769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510042
515	NC_013205	TCG	2	6	31801	31806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510042
516	NC_013205	CCA	2	6	31814	31819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510042
517	NC_013205	CGC	2	6	31871	31876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510042
518	NC_013205	GAT	2	6	32060	32065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510043
519	NC_013205	GCG	2	6	32086	32091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510043
520	NC_013205	GCC	2	6	32189	32194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510043
521	NC_013205	GTG	2	6	32211	32216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510043
522	NC_013205	CGA	2	6	32234	32239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510043
523	NC_013205	CGGT	2	8	32282	32289	0 %	25 %	50 %	25 %	258510043
524	NC_013205	CGG	2	6	32296	32301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510043
525	NC_013205	CGC	2	6	32306	32311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510043
526	NC_013205	GGAC	2	8	32351	32358	25 %	0 %	50 %	25 %	258510043
527	NC_013205	GCG	2	6	32410	32415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510043
528	NC_013205	CG	3	6	32427	32432	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
529	NC_013205	GC	3	6	32464	32469	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
530	NC_013205	TGA	2	6	32470	32475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510043
531	NC_013205	GAT	2	6	32508	32513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510043
532	NC_013205	TTG	2	6	32521	32526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510043
533	NC_013205	GC	3	6	32544	32549	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
534	NC_013205	ACCA	2	8	32568	32575	50 %	0 %	0 %	50 %	258510043
535	NC_013205	TGC	2	6	32580	32585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510043
536	NC_013205	GGA	2	6	32681	32686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510043
537	NC_013205	CCG	2	6	32696	32701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510043
538	NC_013205	CGT	2	6	32759	32764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510043
539	NC_013205	GGT	2	6	32816	32821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510043
540	NC_013205	GC	3	6	32825	32830	0 %	0 %	50 %	50 %	258510043
541	NC_013205	GGCG	2	8	32870	32877	0 %	0 %	75 %	25 %	258510043
542	NC_013205	TCG	2	6	32962	32967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510043
543	NC_013205	GCGATG	2	12	33190	33201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258510044
544	NC_013205	GC	3	6	33203	33208	0 %	0 %	50 %	50 %	258510044
545	NC_013205	TCGACG	2	12	33277	33288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510044
546	NC_013205	CCG	2	6	33289	33294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510044
547	NC_013205	CCGCG	2	10	33506	33515	0 %	0 %	40 %	60 %	258510044
548	NC_013205	CTG	2	6	33585	33590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510044
549	NC_013205	GAC	2	6	33634	33639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510044
550	NC_013205	ACG	2	6	33640	33645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510044
551	NC_013205	GCG	2	6	33692	33697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510044
552	NC_013205	TGG	2	6	33704	33709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510044
553	NC_013205	ATC	2	6	33721	33726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510044
554	NC_013205	TGA	2	6	33734	33739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510044
555	NC_013205	GAG	2	6	33798	33803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510044
556	NC_013205	GGC	3	9	33813	33821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510044
557	NC_013205	GA	3	6	33824	33829	50 %	0 %	50 %	0 %	258510044
558	NC_013205	CGT	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
559	NC_013205	GGCG	2	8	34066	34073	0 %	0 %	75 %	25 %	258510045
560	NC_013205	TGC	2	6	34077	34082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
561	NC_013205	GC	3	6	34087	34092	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
562	NC_013205	GGC	2	6	34093	34098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
563	NC_013205	CG	3	6	34115	34120	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
564	NC_013205	CGG	2	6	34184	34189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
565	NC_013205	GAT	2	6	34193	34198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510045
566	NC_013205	CGG	2	6	34212	34217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
567	NC_013205	CGG	2	6	34225	34230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
568	NC_013205	CTTCGC	2	12	34231	34242	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258510045
569	NC_013205	GCGTC	2	10	34339	34348	0 %	20 %	40 %	40 %	258510045
570	NC_013205	GGC	2	6	34349	34354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
571	NC_013205	CGCGG	2	10	34375	34384	0 %	0 %	60 %	40 %	258510045
572	NC_013205	GC	3	6	34436	34441	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
573	NC_013205	GTG	2	6	34442	34447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510045
574	NC_013205	ATG	2	6	34448	34453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510045
575	NC_013205	CGG	2	6	34552	34557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
576	NC_013205	GCC	2	6	34577	34582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
577	NC_013205	AGA	2	6	34585	34590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510045
578	NC_013205	GCC	2	6	34615	34620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
579	NC_013205	GGCG	2	8	34622	34629	0 %	0 %	75 %	25 %	258510045
580	NC_013205	GC	3	6	34681	34686	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
581	NC_013205	GCC	2	6	34711	34716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
582	NC_013205	GCC	2	6	34774	34779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510045
583	NC_013205	GCG	2	6	34788	34793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
584	NC_013205	GGT	2	6	34804	34809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510045
585	NC_013205	TGTC	2	8	34822	34829	0 %	50 %	25 %	25 %	258510045
586	NC_013205	GCCC	2	8	34970	34977	0 %	0 %	25 %	75 %	258510045
587	NC_013205	CAC	2	6	34988	34993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510045
588	NC_013205	GCG	2	6	35089	35094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
589	NC_013205	GC	3	6	35132	35137	0 %	0 %	50 %	50 %	258510045
590	NC_013205	TCG	2	6	35193	35198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510045
591	NC_013205	CGG	2	6	35321	35326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
592	NC_013205	GAT	2	6	35339	35344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510045
593	NC_013205	GGC	2	6	35353	35358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510045
594	NC_013205	CGC	2	6	35442	35447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
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596	NC_013205	CGGGCG	2	12	35519	35530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510046
597	NC_013205	CG	3	6	35771	35776	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
598	NC_013205	GC	3	6	35821	35826	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
599	NC_013205	GCG	2	6	35835	35840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510046
600	NC_013205	GTACGC	2	12	35911	35922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510046
601	NC_013205	GCC	2	6	35938	35943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
602	NC_013205	CG	3	6	35973	35978	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
603	NC_013205	TGC	2	6	36023	36028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510046
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605	NC_013205	CCGT	2	8	36137	36144	0 %	25 %	25 %	50 %	258510046
606	NC_013205	GGCG	2	8	36147	36154	0 %	0 %	75 %	25 %	258510046
607	NC_013205	ACG	2	6	36200	36205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510046
608	NC_013205	CG	3	6	36232	36237	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
609	NC_013205	TCG	2	6	36300	36305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510046
610	NC_013205	CAT	2	6	36334	36339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510046
611	NC_013205	TGC	2	6	36354	36359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510046
612	NC_013205	CGA	2	6	36432	36437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510046
613	NC_013205	CGCC	2	8	36441	36448	0 %	0 %	25 %	75 %	258510046
614	NC_013205	GC	3	6	36482	36487	0 %	0 %	50 %	50 %	258510046
615	NC_013205	CGG	2	6	36489	36494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510046
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617	NC_013205	CGC	2	6	36567	36572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
618	NC_013205	CGC	2	6	36654	36659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510046
619	NC_013205	TGCG	2	8	36719	36726	0 %	25 %	50 %	25 %	258510046
620	NC_013205	CGG	3	9	37203	37211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
621	NC_013205	AGC	2	6	37218	37223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510047
622	NC_013205	GC	3	6	37258	37263	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
623	NC_013205	AC	4	8	37312	37319	50 %	0 %	0 %	50 %	258510047
624	NC_013205	CG	3	6	37376	37381	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
625	NC_013205	GGC	2	6	37462	37467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
626	NC_013205	GCG	2	6	37540	37545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510047
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628	NC_013205	GC	3	6	37564	37569	0 %	0 %	50 %	50 %	258510047
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752	NC_013205	CG	3	6	44684	44689	0 %	0 %	50 %	50 %	258510051
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