MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 20696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	TTG	2	6	272	277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783815
2	NC_013203	AAC	2	6	316	321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783815
3	NC_013203	TGC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783815
4	NC_013203	ATG	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783815
5	NC_013203	GCA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783815
6	NC_013203	GTT	2	6	385	390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783815
7	NC_013203	TTG	2	6	392	397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783815
8	NC_013203	TGA	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783815
9	NC_013203	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783815
10	NC_013203	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783815
11	NC_013203	CAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783815
12	NC_013203	CGT	2	6	775	780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783815
13	NC_013203	AAG	2	6	815	820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783815
14	NC_013203	GAA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783815
15	NC_013203	CAG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783815
16	NC_013203	AAT	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783815
17	NC_013203	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
18	NC_013203	GCT	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783816
19	NC_013203	TCT	2	6	1458	1463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
20	NC_013203	ACT	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783816
21	NC_013203	CTC	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257783816
22	NC_013203	GTT	2	6	1542	1547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783816
23	NC_013203	GAA	2	6	1590	1595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
24	NC_013203	ACA	2	6	1601	1606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783816
25	NC_013203	GAA	2	6	1641	1646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
26	NC_013203	TGT	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783816
27	NC_013203	TGA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
28	NC_013203	ACG	2	6	1735	1740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783816
29	NC_013203	TGA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
30	NC_013203	TGC	2	6	1922	1927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783816
31	NC_013203	AAT	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783816
32	NC_013203	TTA	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783816
33	NC_013203	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783816
34	NC_013203	TCT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
35	NC_013203	TGA	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
36	NC_013203	GTG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783816
37	NC_013203	TCT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
38	NC_013203	TTC	2	6	2237	2242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
39	NC_013203	GAT	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
40	NC_013203	AGA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
41	NC_013203	GAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
42	NC_013203	CGT	2	6	2421	2426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783816
43	NC_013203	AAG	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
44	NC_013203	TTG	2	6	2500	2505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783816
45	NC_013203	TAA	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783816
46	NC_013203	TGG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783816
47	NC_013203	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783816
48	NC_013203	GAA	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
49	NC_013203	AGA	2	6	2666	2671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
50	NC_013203	AAG	2	6	2703	2708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
51	NC_013203	ACA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783817
52	NC_013203	GCA	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783817
53	NC_013203	GAA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783817
54	NC_013203	GTT	2	6	3165	3170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783817
55	NC_013203	TGC	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783817
56	NC_013203	TTC	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783817
57	NC_013203	ACA	2	6	3448	3453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783817
58	NC_013203	ATT	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783817
59	NC_013203	ACG	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783817
60	NC_013203	AAC	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783817
61	NC_013203	AAG	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783817
62	NC_013203	CTT	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783817
63	NC_013203	TGC	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783817
64	NC_013203	TCT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783817
65	NC_013203	GTT	2	6	4120	4125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783818
66	NC_013203	ACT	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783818
67	NC_013203	TGC	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783818
68	NC_013203	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783818
69	NC_013203	CAT	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783818
70	NC_013203	CGT	3	9	4353	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783818
71	NC_013203	GCA	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783818
72	NC_013203	TGA	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
73	NC_013203	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783818
74	NC_013203	CCG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257783818
75	NC_013203	GAA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783818
76	NC_013203	TGA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
77	NC_013203	GCT	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783818
78	NC_013203	GAG	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783818
79	NC_013203	TTC	3	9	4642	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783818
80	NC_013203	TGG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783818
81	NC_013203	TTC	2	6	4745	4750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783818
82	NC_013203	AGA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783818
83	NC_013203	GAT	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
84	NC_013203	GAT	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
85	NC_013203	TGT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783818
86	NC_013203	AGA	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783818
87	NC_013203	TAC	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783818
88	NC_013203	GAT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
89	NC_013203	TAT	2	6	5057	5062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783818
90	NC_013203	ACC	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783818
91	NC_013203	GAG	2	6	5124	5129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783818
92	NC_013203	AAT	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783818
93	NC_013203	GTG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783819
94	NC_013203	TTC	2	6	5526	5531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783819
95	NC_013203	TAC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783819
96	NC_013203	AGA	2	6	5589	5594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783819
97	NC_013203	GTT	2	6	6137	6142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783820
98	NC_013203	AAC	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783820
99	NC_013203	GGT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783820
100	NC_013203	TGT	2	6	6223	6228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783820
101	NC_013203	TTG	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783820
102	NC_013203	CAA	2	6	6448	6453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783820
103	NC_013203	GGC	2	6	6521	6526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783820
104	NC_013203	GTA	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783820
105	NC_013203	TGC	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783820
106	NC_013203	CGT	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783820
107	NC_013203	CTT	2	6	7079	7084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783820
108	NC_013203	TCG	2	6	7155	7160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783820
109	NC_013203	GGT	2	6	7175	7180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783820
110	NC_013203	TTC	2	6	7218	7223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783820
111	NC_013203	TCT	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783820
112	NC_013203	TCA	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783820
113	NC_013203	TTC	3	9	7410	7418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783820
114	NC_013203	CTT	2	6	7423	7428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783820
115	NC_013203	CCT	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257783820
116	NC_013203	AAG	2	6	7511	7516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783820
117	NC_013203	AAG	2	6	7562	7567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783820
118	NC_013203	ACA	2	6	7575	7580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783820
119	NC_013203	AGC	2	6	7629	7634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783820
120	NC_013203	ACT	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783820
121	NC_013203	TTC	2	6	7668	7673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783820
122	NC_013203	GAT	2	6	7688	7693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783820
123	NC_013203	GAA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783821
124	NC_013203	GAC	2	6	7939	7944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783821
125	NC_013203	AGA	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783821
126	NC_013203	TGA	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783821
127	NC_013203	TGA	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783821
128	NC_013203	TTG	2	6	8138	8143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783821
129	NC_013203	CCG	2	6	8187	8192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257783821
130	NC_013203	AAG	2	6	8242	8247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783821
131	NC_013203	ACC	2	6	8282	8287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783821
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133	NC_013203	GCA	2	6	8404	8409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783821
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135	NC_013203	ATG	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783821
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139	NC_013203	ATG	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783821
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144	NC_013203	TCT	2	6	8862	8867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783821
145	NC_013203	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783821
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156	NC_013203	TTG	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783821
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256	NC_013203	TTG	2	6	15924	15929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783825
257	NC_013203	AGC	2	6	16057	16062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783826
258	NC_013203	CTT	2	6	16127	16132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783826
259	NC_013203	GTT	2	6	16191	16196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783826
260	NC_013203	ATT	2	6	16320	16325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783826
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263	NC_013203	CGT	2	6	16523	16528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783826
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268	NC_013203	AAT	2	6	16998	17003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783826
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