MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 27916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013203	TGCT	2	8	172209	172216	0 %	50 %	25 %	25 %	257783959
3002	NC_013203	AGG	2	6	172307	172312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783959
3003	NC_013203	CGT	2	6	172456	172461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3004	NC_013203	TCA	2	6	172472	172477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783959
3005	NC_013203	CAGG	2	8	172501	172508	25 %	0 %	50 %	25 %	257783959
3006	NC_013203	GCT	2	6	172567	172572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3007	NC_013203	TGA	2	6	172617	172622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783959
3008	NC_013203	CTTG	2	8	172627	172634	0 %	50 %	25 %	25 %	257783959
3009	NC_013203	GAG	2	6	172639	172644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783959
3010	NC_013203	TGC	2	6	172775	172780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3011	NC_013203	TTG	2	6	172799	172804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783959
3012	NC_013203	TCAC	2	8	172818	172825	25 %	25 %	0 %	50 %	257783959
3013	NC_013203	TTG	2	6	172847	172852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783959
3014	NC_013203	ACC	2	6	172915	172920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783959
3015	NC_013203	TGC	2	6	172998	173003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3016	NC_013203	CT	3	6	173019	173024	0 %	50 %	0 %	50 %	257783959
3017	NC_013203	AGC	2	6	173042	173047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3018	NC_013203	TTC	2	6	173151	173156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783959
3019	NC_013203	CGTTA	2	10	173365	173374	20 %	40 %	20 %	20 %	257783959
3020	NC_013203	TGG	3	9	173481	173489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783959
3021	NC_013203	CAAC	2	8	173498	173505	50 %	0 %	0 %	50 %	257783959
3022	NC_013203	GCT	2	6	173575	173580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3023	NC_013203	GTT	2	6	173820	173825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783959
3024	NC_013203	GTG	2	6	173839	173844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783959
3025	NC_013203	CAA	2	6	173910	173915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783959
3026	NC_013203	CTGGT	2	10	173963	173972	0 %	40 %	40 %	20 %	257783959
3027	NC_013203	CTT	2	6	173976	173981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783959
3028	NC_013203	TC	3	6	173991	173996	0 %	50 %	0 %	50 %	257783959
3029	NC_013203	CAAT	2	8	174002	174009	50 %	25 %	0 %	25 %	257783959
3030	NC_013203	CAC	2	6	174027	174032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783959
3031	NC_013203	GC	4	8	174084	174091	0 %	0 %	50 %	50 %	257783959
3032	NC_013203	CAAT	2	8	174092	174099	50 %	25 %	0 %	25 %	257783959
3033	NC_013203	TGA	2	6	174144	174149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783959
3034	NC_013203	GCT	2	6	174207	174212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3035	NC_013203	GTT	2	6	174295	174300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783959
3036	NC_013203	TTA	2	6	174311	174316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783959
3037	NC_013203	TTG	2	6	174350	174355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783959
3038	NC_013203	TGA	2	6	174410	174415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783959
3039	NC_013203	TGA	2	6	174477	174482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783959
3040	NC_013203	GTT	2	6	174544	174549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783959
3041	NC_013203	TCG	2	6	174571	174576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783959
3042	NC_013203	CAT	2	6	174577	174582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783959
3043	NC_013203	GAG	2	6	174676	174681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783959
3044	NC_013203	AAG	3	9	174706	174714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783959
3045	NC_013203	GCT	2	6	174763	174768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783960
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3047	NC_013203	GTC	3	9	174932	174940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783960
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3049	NC_013203	GTC	2	6	175151	175156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783960
3050	NC_013203	GCAC	2	8	175259	175266	25 %	0 %	25 %	50 %	257783960
3051	NC_013203	TGC	2	6	175271	175276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783960
3052	NC_013203	CA	3	6	175295	175300	50 %	0 %	0 %	50 %	257783960
3053	NC_013203	TTC	2	6	175355	175360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783960
3054	NC_013203	GAA	2	6	175402	175407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783960
3055	NC_013203	T	6	6	175446	175451	0 %	100 %	0 %	0 %	257783960
3056	NC_013203	AGC	2	6	175514	175519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783960
3057	NC_013203	CAA	2	6	175564	175569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783960
3058	NC_013203	AAT	2	6	175598	175603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783960
3059	NC_013203	GAT	2	6	175655	175660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783960
3060	NC_013203	CAG	2	6	175735	175740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783960
3061	NC_013203	CTG	2	6	176066	176071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783961
3062	NC_013203	TCT	2	6	176091	176096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783961
3063	NC_013203	TGCAGA	2	12	176166	176177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257783961
3064	NC_013203	ACT	2	6	176191	176196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783961
3065	NC_013203	GCG	2	6	176231	176236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783961
3066	NC_013203	GCT	2	6	176266	176271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783961
3067	NC_013203	AGC	2	6	176273	176278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783961
3068	NC_013203	AAGT	2	8	176296	176303	50 %	25 %	25 %	0 %	257783961
3069	NC_013203	AGT	2	6	176377	176382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783962
3070	NC_013203	TTC	2	6	176390	176395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3071	NC_013203	ATG	2	6	176426	176431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783962
3072	NC_013203	ATC	2	6	176435	176440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3073	NC_013203	CAT	2	6	176446	176451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3074	NC_013203	TCA	2	6	176535	176540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3075	NC_013203	GTTG	2	8	176621	176628	0 %	50 %	50 %	0 %	257783962
3076	NC_013203	CAG	2	6	176631	176636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783962
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3080	NC_013203	TCG	2	6	176772	176777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3081	NC_013203	TTG	2	6	176784	176789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783962
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3083	NC_013203	CAT	2	6	176806	176811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3084	NC_013203	TGC	2	6	176821	176826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3085	NC_013203	ATC	2	6	176831	176836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3086	NC_013203	TC	3	6	176916	176921	0 %	50 %	0 %	50 %	257783962
3087	NC_013203	GCTT	2	8	176932	176939	0 %	50 %	25 %	25 %	257783962
3088	NC_013203	TGACAT	2	12	176995	177006	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257783962
3089	NC_013203	TCA	2	6	177078	177083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3090	NC_013203	GCT	2	6	177107	177112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3091	NC_013203	CTT	2	6	177197	177202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3092	NC_013203	CCT	2	6	177211	177216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257783962
3093	NC_013203	CAG	2	6	177248	177253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3094	NC_013203	TGCAGT	2	12	177295	177306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257783962
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3097	NC_013203	ATC	2	6	177482	177487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
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3099	NC_013203	CTG	2	6	177512	177517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3100	NC_013203	TCA	2	6	177540	177545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3101	NC_013203	CA	3	6	177544	177549	50 %	0 %	0 %	50 %	257783962
3102	NC_013203	GGCT	2	8	177562	177569	0 %	25 %	50 %	25 %	257783962
3103	NC_013203	TTC	2	6	177610	177615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3104	NC_013203	CGG	2	6	177637	177642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783962
3105	NC_013203	TGTT	2	8	177660	177667	0 %	75 %	25 %	0 %	257783962
3106	NC_013203	GTA	2	6	177701	177706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783962
3107	NC_013203	AGG	2	6	177759	177764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783962
3108	NC_013203	CTG	2	6	177765	177770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3109	NC_013203	AGG	2	6	177786	177791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783962
3110	NC_013203	TCG	2	6	177936	177941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783963
3111	NC_013203	CGC	2	6	177947	177952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257783963
3112	NC_013203	GCGACC	2	12	177966	177977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257783963
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3114	NC_013203	GCA	2	6	178062	178067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783963
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3116	NC_013203	CGTA	2	8	178288	178295	25 %	25 %	25 %	25 %	257783963
3117	NC_013203	ATG	2	6	178369	178374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783963
3118	NC_013203	GC	3	6	178443	178448	0 %	0 %	50 %	50 %	257783963
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3120	NC_013203	GTG	2	6	178761	178766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783964
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3242	NC_013203	TGG	2	6	186502	186507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783971
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3245	NC_013203	ATGG	2	8	186761	186768	25 %	25 %	50 %	0 %	257783971
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3364	NC_013203	TGA	2	6	192703	192708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783976
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3483	NC_013203	TCT	2	6	200804	200809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783984
3484	NC_013203	TCT	2	6	200846	200851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783984
3485	NC_013203	GC	3	6	200941	200946	0 %	0 %	50 %	50 %	257783984
3486	NC_013203	CGTAAG	2	12	201008	201019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257783984
3487	NC_013203	CT	3	6	201063	201068	0 %	50 %	0 %	50 %	257783984
3488	NC_013203	GC	3	6	201091	201096	0 %	0 %	50 %	50 %	257783984
3489	NC_013203	TGG	2	6	201125	201130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783984
3490	NC_013203	CGC	2	6	201179	201184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257783984
3491	NC_013203	CAA	3	9	201191	201199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783984
3492	NC_013203	CAT	2	6	201559	201564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783985
3493	NC_013203	CTG	2	6	201621	201626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783985
3494	NC_013203	TCA	2	6	201630	201635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783985
3495	NC_013203	CT	3	6	201658	201663	0 %	50 %	0 %	50 %	257783985
3496	NC_013203	GGC	2	6	201728	201733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783985
3497	NC_013203	GGC	2	6	201773	201778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783985
3498	NC_013203	AGT	2	6	201852	201857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783985
3499	NC_013203	AAGA	2	8	202020	202027	75 %	0 %	25 %	0 %	257783986
3500	NC_013203	TGG	2	6	202163	202168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783986

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