MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 27916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_013203	TCA	2	6	1263960	1263965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784915
23002	NC_013203	CCTT	2	8	1263991	1263998	0 %	50 %	0 %	50 %	257784915
23003	NC_013203	CAA	2	6	1263999	1264004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784915
23004	NC_013203	GAAC	2	8	1264033	1264040	50 %	0 %	25 %	25 %	257784915
23005	NC_013203	CTT	2	6	1264221	1264226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784915
23006	NC_013203	A	7	7	1264258	1264264	100 %	0 %	0 %	0 %	257784915
23007	NC_013203	AAT	2	6	1264330	1264335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784915
23008	NC_013203	ATGA	2	8	1264434	1264441	50 %	25 %	25 %	0 %	257784916
23009	NC_013203	TG	3	6	1264474	1264479	0 %	50 %	50 %	0 %	257784916
23010	NC_013203	TGC	2	6	1264498	1264503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784916
23011	NC_013203	TCA	2	6	1264573	1264578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784916
23012	NC_013203	TGC	2	6	1264630	1264635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784916
23013	NC_013203	CCA	2	6	1264639	1264644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784916
23014	NC_013203	GAGCT	2	10	1264647	1264656	20 %	20 %	40 %	20 %	257784916
23015	NC_013203	TCT	2	6	1264702	1264707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784916
23016	NC_013203	GAC	2	6	1264811	1264816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784916
23017	NC_013203	TTCT	2	8	1264826	1264833	0 %	75 %	0 %	25 %	257784916
23018	NC_013203	TAAA	2	8	1264866	1264873	75 %	25 %	0 %	0 %	257784916
23019	NC_013203	GTT	2	6	1264921	1264926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784916
23020	NC_013203	CAA	2	6	1264946	1264951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784916
23021	NC_013203	TC	3	6	1264961	1264966	0 %	50 %	0 %	50 %	257784916
23022	NC_013203	CAA	2	6	1265051	1265056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784916
23023	NC_013203	CTG	2	6	1265180	1265185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784917
23024	NC_013203	GCT	2	6	1265218	1265223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784917
23025	NC_013203	TAC	2	6	1265244	1265249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784917
23026	NC_013203	AGT	2	6	1265271	1265276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784917
23027	NC_013203	AAC	3	9	1265292	1265300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784917
23028	NC_013203	TTC	2	6	1265301	1265306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784917
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23030	NC_013203	AAG	2	6	1265389	1265394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257784917
23031	NC_013203	ATG	2	6	1265404	1265409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784917
23032	NC_013203	GTG	2	6	1265422	1265427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784917
23033	NC_013203	AG	3	6	1265460	1265465	50 %	0 %	50 %	0 %	257784917
23034	NC_013203	AG	3	6	1265496	1265501	50 %	0 %	50 %	0 %	257784917
23035	NC_013203	GCA	2	6	1265557	1265562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784917
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23037	NC_013203	TTTG	2	8	1265620	1265627	0 %	75 %	25 %	0 %	257784917
23038	NC_013203	ATG	2	6	1265692	1265697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257784917
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23040	NC_013203	CT	3	6	1265854	1265859	0 %	50 %	0 %	50 %	257784918
23041	NC_013203	TCT	2	6	1265972	1265977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784918
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23048	NC_013203	CT	3	6	1266264	1266269	0 %	50 %	0 %	50 %	257784919
23049	NC_013203	GAAG	2	8	1266270	1266277	50 %	0 %	50 %	0 %	257784919
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23051	NC_013203	CTT	2	6	1266347	1266352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784919
23052	NC_013203	ACT	2	6	1266359	1266364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784919
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23060	NC_013203	TCT	2	6	1267047	1267052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784919
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23064	NC_013203	CAAA	2	8	1267211	1267218	75 %	0 %	0 %	25 %	257784919
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23100	NC_013203	TAAA	2	8	1269459	1269466	75 %	25 %	0 %	0 %	257784922
23101	NC_013203	CCG	3	9	1269532	1269540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784922
23102	NC_013203	CTT	2	6	1269587	1269592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784922
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23112	NC_013203	TTGA	2	8	1269976	1269983	25 %	50 %	25 %	0 %	257784923
23113	NC_013203	AAAT	2	8	1270030	1270037	75 %	25 %	0 %	0 %	257784923
23114	NC_013203	AAT	2	6	1270048	1270053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257784923
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23117	NC_013203	CTG	2	6	1270201	1270206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784923
23118	NC_013203	CCA	2	6	1270221	1270226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257784923
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23234	NC_013203	CAT	3	9	1275881	1275889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784927
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23346	NC_013203	TCA	2	6	1282573	1282578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784933
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23465	NC_013203	GCT	2	6	1289979	1289984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784945
23466	NC_013203	CTT	2	6	1290040	1290045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784945
23467	NC_013203	CGA	2	6	1290113	1290118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784946
23468	NC_013203	ACG	2	6	1290141	1290146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784946
23469	NC_013203	GCT	2	6	1290151	1290156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784946
23470	NC_013203	TCT	2	6	1290157	1290162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784946
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23476	NC_013203	CTG	2	6	1290594	1290599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784946
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23482	NC_013203	CCT	2	6	1290776	1290781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257784947
23483	NC_013203	GCAGA	2	10	1290832	1290841	40 %	0 %	40 %	20 %	257784947
23484	NC_013203	TTC	2	6	1290845	1290850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784947
23485	NC_013203	CGT	2	6	1290857	1290862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784947
23486	NC_013203	GCG	2	6	1290957	1290962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257784947
23487	NC_013203	CTG	2	6	1290984	1290989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784947
23488	NC_013203	AGC	2	6	1291073	1291078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784948
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23490	NC_013203	TGG	2	6	1291142	1291147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257784948
23491	NC_013203	GACC	2	8	1291177	1291184	25 %	0 %	25 %	50 %	257784948
23492	NC_013203	CTT	2	6	1291346	1291351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784948
23493	NC_013203	CAA	2	6	1291372	1291377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257784948
23494	NC_013203	TGT	2	6	1291381	1291386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257784948
23495	NC_013203	CTG	2	6	1291409	1291414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257784948
23496	NC_013203	TAACGG	2	12	1291525	1291536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257784948
23497	NC_013203	CAG	2	6	1291564	1291569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257784948
23498	NC_013203	CTT	2	6	1291583	1291588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257784948
23499	NC_013203	CGC	2	6	1291654	1291659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257784949
23500	NC_013203	CAT	2	6	1291691	1291696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257784949

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