MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 27916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013203	CAG	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783834
502	NC_013203	CTT	2	6	26705	26710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783834
503	NC_013203	TCG	2	6	26746	26751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783834
504	NC_013203	GCA	2	6	26770	26775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783834
505	NC_013203	GC	3	6	26803	26808	0 %	0 %	50 %	50 %	257783834
506	NC_013203	AG	3	6	26964	26969	50 %	0 %	50 %	0 %	257783835
507	NC_013203	TGG	2	6	27069	27074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783835
508	NC_013203	TTA	2	6	27077	27082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783835
509	NC_013203	CTTT	2	8	27091	27098	0 %	75 %	0 %	25 %	257783835
510	NC_013203	GCT	2	6	27106	27111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783835
511	NC_013203	TTA	2	6	27191	27196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783835
512	NC_013203	GGC	2	6	27234	27239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783835
513	NC_013203	TCT	2	6	27321	27326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783835
514	NC_013203	TTC	2	6	27367	27372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783835
515	NC_013203	AAC	2	6	27387	27392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783835
516	NC_013203	TTGT	2	8	27664	27671	0 %	75 %	25 %	0 %	257783835
517	NC_013203	TTA	2	6	27719	27724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783835
518	NC_013203	GTT	2	6	27751	27756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783835
519	NC_013203	TG	3	6	27792	27797	0 %	50 %	50 %	0 %	257783835
520	NC_013203	GGCA	2	8	27843	27850	25 %	0 %	50 %	25 %	257783835
521	NC_013203	ACA	2	6	27959	27964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783835
522	NC_013203	GCG	2	6	28039	28044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783836
523	NC_013203	CAA	2	6	28097	28102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783836
524	NC_013203	AGC	2	6	28135	28140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783836
525	NC_013203	GAG	2	6	28143	28148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783836
526	NC_013203	CGT	2	6	28149	28154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783836
527	NC_013203	AGC	2	6	28177	28182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783836
528	NC_013203	CTA	2	6	28201	28206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783836
529	NC_013203	CAC	2	6	28280	28285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783836
530	NC_013203	GCT	2	6	28356	28361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783836
531	NC_013203	TTG	2	6	28432	28437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783836
532	NC_013203	AGG	3	9	28462	28470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783836
533	NC_013203	GAG	2	6	28473	28478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783836
534	NC_013203	GTTGAG	3	18	28497	28514	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257783836
535	NC_013203	AGT	2	6	28522	28527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783836
536	NC_013203	TTCT	2	8	29118	29125	0 %	75 %	0 %	25 %	257783837
537	NC_013203	TC	3	6	29134	29139	0 %	50 %	0 %	50 %	257783837
538	NC_013203	GAG	2	6	29151	29156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783837
539	NC_013203	TTA	2	6	29163	29168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783837
540	NC_013203	TTC	2	6	29173	29178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783837
541	NC_013203	ATT	2	6	29207	29212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783837
542	NC_013203	TGG	2	6	29308	29313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783837
543	NC_013203	TAC	2	6	29395	29400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783837
544	NC_013203	GAT	2	6	29410	29415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783837
545	NC_013203	GGA	2	6	29458	29463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783837
546	NC_013203	GTT	2	6	29474	29479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783837
547	NC_013203	TAAC	2	8	29508	29515	50 %	25 %	0 %	25 %	257783837
548	NC_013203	CAG	2	6	29525	29530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783837
549	NC_013203	TGA	2	6	29569	29574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783837
550	NC_013203	TGC	2	6	29599	29604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783837
551	NC_013203	GTT	2	6	29675	29680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783837
552	NC_013203	CTT	2	6	29709	29714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783837
553	NC_013203	TCT	2	6	29766	29771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783837
554	NC_013203	TTC	2	6	29848	29853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783837
555	NC_013203	GCA	2	6	29891	29896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783837
556	NC_013203	TTG	2	6	29922	29927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783837
557	NC_013203	TAA	2	6	29983	29988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783837
558	NC_013203	CCA	2	6	30035	30040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783837
559	NC_013203	CT	3	6	30191	30196	0 %	50 %	0 %	50 %	257783837
560	NC_013203	TGC	2	6	30243	30248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783837
561	NC_013203	TGA	2	6	30265	30270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783837
562	NC_013203	CAT	2	6	30313	30318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783837
563	NC_013203	TAT	2	6	30358	30363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783837
564	NC_013203	CTA	2	6	30378	30383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783837
565	NC_013203	TTG	2	6	30387	30392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783837
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569	NC_013203	AGGGTA	2	12	30648	30659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	257783838
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571	NC_013203	GCGG	2	8	30707	30714	0 %	0 %	75 %	25 %	257783838
572	NC_013203	TATG	2	8	30784	30791	25 %	50 %	25 %	0 %	257783838
573	NC_013203	TTG	2	6	30825	30830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783838
574	NC_013203	TTC	2	6	30840	30845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783838
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577	NC_013203	CCAAT	2	10	31107	31116	40 %	20 %	0 %	40 %	257783838
578	NC_013203	TTG	2	6	31206	31211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783838
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580	NC_013203	CTT	2	6	31320	31325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783838
581	NC_013203	CCAA	2	8	31370	31377	50 %	0 %	0 %	50 %	257783838
582	NC_013203	TCT	2	6	31468	31473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783838
583	NC_013203	ACT	2	6	31502	31507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783838
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585	NC_013203	GCA	2	6	31556	31561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783838
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587	NC_013203	ATC	2	6	31835	31840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783838
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589	NC_013203	TC	3	6	32065	32070	0 %	50 %	0 %	50 %	257783839
590	NC_013203	CTT	2	6	32102	32107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783839
591	NC_013203	A	6	6	32113	32118	100 %	0 %	0 %	0 %	257783839
592	NC_013203	CAT	2	6	32235	32240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783839
593	NC_013203	AGT	2	6	32278	32283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783839
594	NC_013203	TGTATC	2	12	32400	32411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	257783839
595	NC_013203	TGGT	2	8	32415	32422	0 %	50 %	50 %	0 %	257783839
596	NC_013203	GCTC	2	8	32441	32448	0 %	25 %	25 %	50 %	257783839
597	NC_013203	AGC	2	6	32467	32472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783839
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599	NC_013203	GTG	2	6	32541	32546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783839
600	NC_013203	ATG	2	6	32595	32600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783839
601	NC_013203	A	6	6	32639	32644	100 %	0 %	0 %	0 %	257783839
602	NC_013203	ATGA	2	8	32714	32721	50 %	25 %	25 %	0 %	257783839
603	NC_013203	TGG	2	6	32827	32832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783839
604	NC_013203	AAT	2	6	32870	32875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783839
605	NC_013203	TGA	2	6	32878	32883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783839
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609	NC_013203	GAGC	2	8	33056	33063	25 %	0 %	50 %	25 %	257783839
610	NC_013203	GTT	2	6	33146	33151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783839
611	NC_013203	TTG	2	6	33186	33191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783839
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613	NC_013203	GAG	2	6	33275	33280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783839
614	NC_013203	GCT	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783839
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616	NC_013203	TGG	2	6	33397	33402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783839
617	NC_013203	GAA	2	6	33440	33445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783839
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621	NC_013203	CGCT	2	8	33574	33581	0 %	25 %	25 %	50 %	257783839
622	NC_013203	TCA	2	6	33670	33675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783839
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626	NC_013203	GCTCGC	2	12	33902	33913	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257783839
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749	NC_013203	CA	3	6	41208	41213	50 %	0 %	0 %	50 %	257783846
750	NC_013203	GCTAT	2	10	41270	41279	20 %	40 %	20 %	20 %	257783846
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