MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013203	CAATC	2	10	1162725	1162734	40 %	20 %	0 %	40 %	257784830
502	NC_013203	GCAAT	2	10	1163067	1163076	40 %	20 %	20 %	20 %	257784830
503	NC_013203	AAGAA	2	10	1163720	1163729	80 %	0 %	20 %	0 %	257784832
504	NC_013203	ATCAA	2	10	1165747	1165756	60 %	20 %	0 %	20 %	257784836
505	NC_013203	AACCA	2	10	1167338	1167347	60 %	0 %	0 %	40 %	257784837
506	NC_013203	ATTTC	2	10	1174025	1174034	20 %	60 %	0 %	20 %	257784841
507	NC_013203	ATCTG	2	10	1176161	1176170	20 %	40 %	20 %	20 %	257784843
508	NC_013203	AAAGA	2	10	1177696	1177705	80 %	0 %	20 %	0 %	257784843
509	NC_013203	ATCTG	2	10	1178551	1178560	20 %	40 %	20 %	20 %	257784844
510	NC_013203	TCTTT	2	10	1180330	1180339	0 %	80 %	0 %	20 %	257784845
511	NC_013203	AATAT	2	10	1181153	1181162	60 %	40 %	0 %	0 %	257784846
512	NC_013203	CATAG	2	10	1186622	1186631	40 %	20 %	20 %	20 %	257784849
513	NC_013203	AACAT	2	10	1187070	1187079	60 %	20 %	0 %	20 %	257784849
514	NC_013203	TTCCA	2	10	1192443	1192452	20 %	40 %	0 %	40 %	257784853
515	NC_013203	CAATC	2	10	1192677	1192686	40 %	20 %	0 %	40 %	257784853
516	NC_013203	AAAGT	2	10	1195537	1195546	60 %	20 %	20 %	0 %	257784854
517	NC_013203	GTGAG	2	10	1196043	1196052	20 %	20 %	60 %	0 %	257784855
518	NC_013203	CCAAC	2	10	1197118	1197127	40 %	0 %	0 %	60 %	257784856
519	NC_013203	ACATA	2	10	1198367	1198376	60 %	20 %	0 %	20 %	257784856
520	NC_013203	TGAGC	2	10	1199996	1200005	20 %	20 %	40 %	20 %	257784857
521	NC_013203	TTCTC	2	10	1203769	1203778	0 %	60 %	0 %	40 %	257784861
522	NC_013203	AAACT	2	10	1209712	1209721	60 %	20 %	0 %	20 %	257784867
523	NC_013203	TTGTA	2	10	1212286	1212295	20 %	60 %	20 %	0 %	257784871
524	NC_013203	AATCC	2	10	1213845	1213854	40 %	20 %	0 %	40 %	257784873
525	NC_013203	GAAAT	2	10	1218408	1218417	60 %	20 %	20 %	0 %	257784878
526	NC_013203	TCATA	2	10	1221238	1221247	40 %	40 %	0 %	20 %	257784880
527	NC_013203	TAAAA	2	10	1221389	1221398	80 %	20 %	0 %	0 %	257784880
528	NC_013203	AACCA	2	10	1221848	1221857	60 %	0 %	0 %	40 %	257784880
529	NC_013203	GATGC	2	10	1227875	1227884	20 %	20 %	40 %	20 %	257784886
530	NC_013203	GATTT	2	10	1229674	1229683	20 %	60 %	20 %	0 %	257784888
531	NC_013203	TGAGC	2	10	1232159	1232168	20 %	20 %	40 %	20 %	257784890
532	NC_013203	TGCTC	2	10	1233315	1233324	0 %	40 %	20 %	40 %	257784892
533	NC_013203	GTCTG	2	10	1233484	1233493	0 %	40 %	40 %	20 %	257784892
534	NC_013203	TTTTC	2	10	1236418	1236427	0 %	80 %	0 %	20 %	257784895
535	NC_013203	TTTGC	2	10	1236651	1236660	0 %	60 %	20 %	20 %	257784895
536	NC_013203	CCGTT	2	10	1237444	1237453	0 %	40 %	20 %	40 %	257784895
537	NC_013203	CAAAT	2	10	1238502	1238511	60 %	20 %	0 %	20 %	257784895
538	NC_013203	TTCTG	2	10	1241458	1241467	0 %	60 %	20 %	20 %	257784899
539	NC_013203	TGGGA	2	10	1241856	1241865	20 %	20 %	60 %	0 %	257784900
540	NC_013203	CATGC	2	10	1242089	1242098	20 %	20 %	20 %	40 %	257784900
541	NC_013203	TCTGC	2	10	1242549	1242558	0 %	40 %	20 %	40 %	257784900
542	NC_013203	ACTTC	2	10	1245455	1245464	20 %	40 %	0 %	40 %	257784904
543	NC_013203	CAAGT	2	10	1246909	1246918	40 %	20 %	20 %	20 %	257784906
544	NC_013203	GATTT	2	10	1247651	1247660	20 %	60 %	20 %	0 %	257784906
545	NC_013203	GCATT	2	10	1252744	1252753	20 %	40 %	20 %	20 %	257784908
546	NC_013203	ACCAC	2	10	1253350	1253359	40 %	0 %	0 %	60 %	257784909
547	NC_013203	AAAGA	2	10	1253763	1253772	80 %	0 %	20 %	0 %	257784909
548	NC_013203	AAATA	2	10	1260040	1260049	80 %	20 %	0 %	0 %	257784914
549	NC_013203	ATCTG	2	10	1261973	1261982	20 %	40 %	20 %	20 %	257784915
550	NC_013203	GAGCT	2	10	1264647	1264656	20 %	20 %	40 %	20 %	257784916
551	NC_013203	ACTTT	2	10	1268631	1268640	20 %	60 %	0 %	20 %	257784922
552	NC_013203	TACGT	2	10	1270676	1270685	20 %	40 %	20 %	20 %	257784923
553	NC_013203	CTACA	2	10	1271221	1271230	40 %	20 %	0 %	40 %	257784924
554	NC_013203	TGGTC	2	10	1272680	1272689	0 %	40 %	40 %	20 %	257784926
555	NC_013203	TGTGC	2	10	1274291	1274300	0 %	40 %	40 %	20 %	257784926
556	NC_013203	AGTGC	2	10	1275754	1275763	20 %	20 %	40 %	20 %	257784927
557	NC_013203	CATAC	2	10	1277553	1277562	40 %	20 %	0 %	40 %	257784929
558	NC_013203	ATCTG	2	10	1280781	1280790	20 %	40 %	20 %	20 %	257784932
559	NC_013203	AAACA	2	10	1282266	1282275	80 %	0 %	0 %	20 %	257784933
560	NC_013203	GCAGA	2	10	1290832	1290841	40 %	0 %	40 %	20 %	257784947
561	NC_013203	CAGGC	2	10	1291775	1291784	20 %	0 %	40 %	40 %	257784949
562	NC_013203	CTTGC	2	10	1292126	1292135	0 %	40 %	20 %	40 %	257784950
563	NC_013203	TGCCT	2	10	1292468	1292477	0 %	40 %	20 %	40 %	257784951
564	NC_013203	TCTGC	2	10	1294391	1294400	0 %	40 %	20 %	40 %	257784955
565	NC_013203	TGACC	2	10	1295433	1295442	20 %	20 %	20 %	40 %	257784957
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567	NC_013203	CAGTT	2	10	1304793	1304802	20 %	40 %	20 %	20 %	257784970
568	NC_013203	AAGAG	2	10	1305771	1305780	60 %	0 %	40 %	0 %	257784971
569	NC_013203	CAAGT	2	10	1314508	1314517	40 %	20 %	20 %	20 %	257784974
570	NC_013203	AGCTG	2	10	1316028	1316037	20 %	20 %	40 %	20 %	257784976
571	NC_013203	GCCTG	2	10	1316208	1316217	0 %	20 %	40 %	40 %	257784976
572	NC_013203	CTTCT	2	10	1318418	1318427	0 %	60 %	0 %	40 %	257784980
573	NC_013203	CTTGT	2	10	1324407	1324416	0 %	60 %	20 %	20 %	257784984
574	NC_013203	CATGA	2	10	1325225	1325234	40 %	20 %	20 %	20 %	257784985
575	NC_013203	TGAGC	2	10	1329484	1329493	20 %	20 %	40 %	20 %	257784988
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577	NC_013203	TGGAT	2	10	1331882	1331891	20 %	40 %	40 %	0 %	257784989
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581	NC_013203	GGAGC	2	10	1335614	1335623	20 %	0 %	60 %	20 %	257784994
582	NC_013203	GACGC	2	10	1336225	1336234	20 %	0 %	40 %	40 %	257784994
583	NC_013203	GCCAC	2	10	1336921	1336930	20 %	0 %	20 %	60 %	257784995
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595	NC_013203	CCTGC	2	10	1358851	1358860	0 %	20 %	20 %	60 %	257785015
596	NC_013203	CAAGT	2	10	1361994	1362003	40 %	20 %	20 %	20 %	257785017
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599	NC_013203	GGTTG	2	10	1367696	1367705	0 %	40 %	60 %	0 %	257785020
600	NC_013203	TGAAT	2	10	1368758	1368767	40 %	40 %	20 %	0 %	257785021
601	NC_013203	AGATG	2	10	1371119	1371128	40 %	20 %	40 %	0 %	257785022
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604	NC_013203	GCAAT	2	10	1376235	1376244	40 %	20 %	20 %	20 %	257785026
605	NC_013203	GCTCC	2	10	1380995	1381004	0 %	20 %	20 %	60 %	257785030
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607	NC_013203	GCTTT	2	10	1381404	1381413	0 %	60 %	20 %	20 %	257785030
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609	NC_013203	GTTGC	2	10	1386281	1386290	0 %	40 %	40 %	20 %	257785034
610	NC_013203	TTCTC	2	10	1389353	1389362	0 %	60 %	0 %	40 %	257785036
611	NC_013203	GACAT	2	10	1389865	1389874	40 %	20 %	20 %	20 %	257785037
612	NC_013203	CATCT	2	10	1394185	1394194	20 %	40 %	0 %	40 %	257785044
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616	NC_013203	AGCGC	2	10	1396689	1396698	20 %	0 %	40 %	40 %	257785045
617	NC_013203	GCTCT	2	10	1397739	1397748	0 %	40 %	20 %	40 %	257785047
618	NC_013203	AGACG	2	10	1401463	1401472	40 %	0 %	40 %	20 %	257785051
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