MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013164	ATTA	2	8	561	568	50 %	50 %	0 %	0 %	256821125
2	NC_013164	TTTG	2	8	953	960	0 %	75 %	25 %	0 %	256821125
3	NC_013164	CATA	2	8	1535	1542	50 %	25 %	0 %	25 %	256821125
4	NC_013164	TATT	2	8	1877	1884	25 %	75 %	0 %	0 %	256821125
5	NC_013164	GAAA	2	8	1946	1953	75 %	0 %	25 %	0 %	256821125
6	NC_013164	TAGA	2	8	2515	2522	50 %	25 %	25 %	0 %	256821126
7	NC_013164	AAAT	2	8	3377	3384	75 %	25 %	0 %	0 %	256821127
8	NC_013164	GAAA	2	8	3635	3642	75 %	0 %	25 %	0 %	256821127
9	NC_013164	AGAA	2	8	4008	4015	75 %	0 %	25 %	0 %	256821127
10	NC_013164	AAAT	2	8	4711	4718	75 %	25 %	0 %	0 %	256821128
11	NC_013164	TGTA	2	8	4773	4780	25 %	50 %	25 %	0 %	256821128
12	NC_013164	TGAA	2	8	4855	4862	50 %	25 %	25 %	0 %	256821128
13	NC_013164	GTTT	2	8	5996	6003	0 %	75 %	25 %	0 %	256821128
14	NC_013164	CATG	2	8	6295	6302	25 %	25 %	25 %	25 %	256821128
15	NC_013164	ATTT	2	8	6598	6605	25 %	75 %	0 %	0 %	256821128
16	NC_013164	ACTT	2	8	6620	6627	25 %	50 %	0 %	25 %	256821128
17	NC_013164	AAAG	2	8	6752	6759	75 %	0 %	25 %	0 %	256821128
18	NC_013164	AAAT	2	8	7025	7032	75 %	25 %	0 %	0 %	256821128
19	NC_013164	ATTT	2	8	7060	7067	25 %	75 %	0 %	0 %	256821128
20	NC_013164	ATTT	2	8	7654	7661	25 %	75 %	0 %	0 %	256821129
21	NC_013164	AAAT	2	8	7701	7708	75 %	25 %	0 %	0 %	256821129
22	NC_013164	TATG	2	8	7855	7862	25 %	50 %	25 %	0 %	256821129
23	NC_013164	AATT	2	8	8364	8371	50 %	50 %	0 %	0 %	256821129
24	NC_013164	AGAT	2	8	8593	8600	50 %	25 %	25 %	0 %	256821129
25	NC_013164	TATT	2	8	9533	9540	25 %	75 %	0 %	0 %	256821130
26	NC_013164	ATTA	2	8	9604	9611	50 %	50 %	0 %	0 %	256821131
27	NC_013164	TTTG	2	8	9722	9729	0 %	75 %	25 %	0 %	256821131
28	NC_013164	ATTA	2	8	9791	9798	50 %	50 %	0 %	0 %	256821132
29	NC_013164	GAAA	2	8	11165	11172	75 %	0 %	25 %	0 %	256821133
30	NC_013164	AGAA	2	8	11598	11605	75 %	0 %	25 %	0 %	256821133
31	NC_013164	TAAA	2	8	11808	11815	75 %	25 %	0 %	0 %	256821134
32	NC_013164	TAAA	2	8	12138	12145	75 %	25 %	0 %	0 %	256821135
33	NC_013164	ATCT	2	8	12267	12274	25 %	50 %	0 %	25 %	256821135
34	NC_013164	CAAT	2	8	13177	13184	50 %	25 %	0 %	25 %	256821137
35	NC_013164	TAAA	2	8	13355	13362	75 %	25 %	0 %	0 %	256821137
36	NC_013164	ATCA	2	8	13675	13682	50 %	25 %	0 %	25 %	256821137
37	NC_013164	TAAA	2	8	14060	14067	75 %	25 %	0 %	0 %	256821137
38	NC_013164	AATT	2	8	14435	14442	50 %	50 %	0 %	0 %	256821138
39	NC_013164	ATAA	2	8	14716	14723	75 %	25 %	0 %	0 %	256821138
40	NC_013164	TTTC	2	8	14924	14931	0 %	75 %	0 %	25 %	256821139
41	NC_013164	TATT	2	8	15160	15167	25 %	75 %	0 %	0 %	256821139
42	NC_013164	TAGA	2	8	15501	15508	50 %	25 %	25 %	0 %	256821139
43	NC_013164	GAAG	2	8	15926	15933	50 %	0 %	50 %	0 %	256821139
44	NC_013164	ATCT	2	8	16750	16757	25 %	50 %	0 %	25 %	256821139
45	NC_013164	TAAG	2	8	16913	16920	50 %	25 %	25 %	0 %	256821139
46	NC_013164	TAAC	2	8	17801	17808	50 %	25 %	0 %	25 %	256821140
47	NC_013164	AATT	2	8	19421	19428	50 %	50 %	0 %	0 %	256821141
48	NC_013164	TTCT	2	8	19598	19605	0 %	75 %	0 %	25 %	256821141
49	NC_013164	TCTA	2	8	19767	19774	25 %	50 %	0 %	25 %	256821141
50	NC_013164	CTAT	2	8	20026	20033	25 %	50 %	0 %	25 %	256821141
51	NC_013164	GATG	2	8	20218	20225	25 %	25 %	50 %	0 %	256821141
52	NC_013164	TGAA	2	8	20231	20238	50 %	25 %	25 %	0 %	256821141
53	NC_013164	CTTT	2	8	20351	20358	0 %	75 %	0 %	25 %	256821142
54	NC_013164	GACG	2	8	21312	21319	25 %	0 %	50 %	25 %	256821143
55	NC_013164	ATTT	2	8	21815	21822	25 %	75 %	0 %	0 %	256821144
56	NC_013164	GAAA	2	8	21831	21838	75 %	0 %	25 %	0 %	256821144
57	NC_013164	ATTA	2	8	22538	22545	50 %	50 %	0 %	0 %	256821145
58	NC_013164	TAAA	2	8	24221	24228	75 %	25 %	0 %	0 %	256821146
59	NC_013164	AATA	2	8	24324	24331	75 %	25 %	0 %	0 %	256821146
60	NC_013164	AAAT	2	8	24597	24604	75 %	25 %	0 %	0 %	256821146
61	NC_013164	ATTC	2	8	24917	24924	25 %	50 %	0 %	25 %	256821147
62	NC_013164	GAAA	2	8	25479	25486	75 %	0 %	25 %	0 %	256821147
63	NC_013164	GAAA	2	8	25798	25805	75 %	0 %	25 %	0 %	256821147
64	NC_013164	TCAA	2	8	26247	26254	50 %	25 %	0 %	25 %	256821147
65	NC_013164	CAAA	2	8	26469	26476	75 %	0 %	0 %	25 %	256821147
66	NC_013164	AAGT	2	8	26699	26706	50 %	25 %	25 %	0 %	256821147
67	NC_013164	CTAA	2	8	27376	27383	50 %	25 %	0 %	25 %	256821147
68	NC_013164	ATAA	2	8	27880	27887	75 %	25 %	0 %	0 %	256821147
69	NC_013164	AAAT	2	8	28071	28078	75 %	25 %	0 %	0 %	256821147
70	NC_013164	AACT	2	8	28217	28224	50 %	25 %	0 %	25 %	256821147
71	NC_013164	TCTA	2	8	28282	28289	25 %	50 %	0 %	25 %	256821147
72	NC_013164	ATCT	2	8	28301	28308	25 %	50 %	0 %	25 %	256821147
73	NC_013164	TTAT	2	8	28701	28708	25 %	75 %	0 %	0 %	256821147
74	NC_013164	TAAA	2	8	28769	28776	75 %	25 %	0 %	0 %	256821147
75	NC_013164	CAAA	2	8	28825	28832	75 %	0 %	0 %	25 %	256821147
76	NC_013164	AAAG	2	8	28998	29005	75 %	0 %	25 %	0 %	256821147
77	NC_013164	TTGT	2	8	29143	29150	0 %	75 %	25 %	0 %	256821148
78	NC_013164	ATGT	2	8	29917	29924	25 %	50 %	25 %	0 %	256821148
79	NC_013164	TAAT	2	8	30334	30341	50 %	50 %	0 %	0 %	256821148
80	NC_013164	AAAG	2	8	30748	30755	75 %	0 %	25 %	0 %	256821148
81	NC_013164	GAGT	2	8	30794	30801	25 %	25 %	50 %	0 %	256821148
82	NC_013164	AACA	2	8	30824	30831	75 %	0 %	0 %	25 %	256821148
83	NC_013164	GTGG	2	8	31187	31194	0 %	25 %	75 %	0 %	256821148
84	NC_013164	TAAA	2	8	31261	31268	75 %	25 %	0 %	0 %	256821148
85	NC_013164	TATT	2	8	31269	31276	25 %	75 %	0 %	0 %	256821148
86	NC_013164	AATT	2	8	31330	31337	50 %	50 %	0 %	0 %	256821149
87	NC_013164	AAAG	2	8	31449	31456	75 %	0 %	25 %	0 %	256821149
88	NC_013164	ATCA	2	8	31861	31868	50 %	25 %	0 %	25 %	256821149
89	NC_013164	AAAT	2	8	32383	32390	75 %	25 %	0 %	0 %	256821149
90	NC_013164	ATTT	2	8	32713	32720	25 %	75 %	0 %	0 %	256821149
91	NC_013164	AATA	2	8	32810	32817	75 %	25 %	0 %	0 %	256821149
92	NC_013164	TATT	2	8	32965	32972	25 %	75 %	0 %	0 %	256821149
93	NC_013164	ACAG	2	8	33143	33150	50 %	0 %	25 %	25 %	256821149
94	NC_013164	TAGA	2	8	33259	33266	50 %	25 %	25 %	0 %	256821149
95	NC_013164	CAAA	2	8	34091	34098	75 %	0 %	0 %	25 %	256821150
96	NC_013164	GGTT	2	8	34910	34917	0 %	50 %	50 %	0 %	256821150
97	NC_013164	TTTA	2	8	35042	35049	25 %	75 %	0 %	0 %	256821151
98	NC_013164	GTTT	2	8	35242	35249	0 %	75 %	25 %	0 %	256821151
99	NC_013164	AAAT	2	8	35443	35450	75 %	25 %	0 %	0 %	256821151
100	NC_013164	GGTT	2	8	35509	35516	0 %	50 %	50 %	0 %	256821151
101	NC_013164	TTTG	2	8	35563	35570	0 %	75 %	25 %	0 %	256821151
102	NC_013164	AAGT	2	8	35951	35958	50 %	25 %	25 %	0 %	256821152
103	NC_013164	ATAA	2	8	36121	36128	75 %	25 %	0 %	0 %	256821152
104	NC_013164	CTTT	2	8	36582	36589	0 %	75 %	0 %	25 %	256821153
105	NC_013164	AGAA	2	8	36719	36726	75 %	0 %	25 %	0 %	256821153
106	NC_013164	GAAA	2	8	36912	36919	75 %	0 %	25 %	0 %	256821153
107	NC_013164	ACTT	2	8	37111	37118	25 %	50 %	0 %	25 %	256821153
108	NC_013164	AAAG	2	8	37211	37218	75 %	0 %	25 %	0 %	256821153
109	NC_013164	AATT	2	8	38188	38195	50 %	50 %	0 %	0 %	256821154
110	NC_013164	AATC	2	8	38616	38623	50 %	25 %	0 %	25 %	256821154
111	NC_013164	AAAG	2	8	38692	38699	75 %	0 %	25 %	0 %	256821154
112	NC_013164	ACAA	2	8	39443	39450	75 %	0 %	0 %	25 %	256821155
113	NC_013164	GAAA	2	8	39613	39620	75 %	0 %	25 %	0 %	256821155
114	NC_013164	AAGG	2	8	39645	39652	50 %	0 %	50 %	0 %	256821155
115	NC_013164	TTAT	3	12	40091	40102	25 %	75 %	0 %	0 %	256821156
116	NC_013164	ATGT	2	8	40974	40981	25 %	50 %	25 %	0 %	256821156
117	NC_013164	CTGC	2	8	40989	40996	0 %	25 %	25 %	50 %	256821156
118	NC_013164	ATCT	2	8	41013	41020	25 %	50 %	0 %	25 %	256821156
119	NC_013164	ATCT	2	8	41058	41065	25 %	50 %	0 %	25 %	256821156
120	NC_013164	TTTG	2	8	41544	41551	0 %	75 %	25 %	0 %	256821157
121	NC_013164	ACAA	2	8	41948	41955	75 %	0 %	0 %	25 %	256821157
122	NC_013164	GCAA	2	8	43421	43428	50 %	0 %	25 %	25 %	256821158
123	NC_013164	ATTA	2	8	43481	43488	50 %	50 %	0 %	0 %	256821158
124	NC_013164	AGTA	2	8	43710	43717	50 %	25 %	25 %	0 %	256821159
125	NC_013164	ATGG	2	8	44029	44036	25 %	25 %	50 %	0 %	256821159
126	NC_013164	AAAT	2	8	44846	44853	75 %	25 %	0 %	0 %	256821159
127	NC_013164	AAGA	2	8	44915	44922	75 %	0 %	25 %	0 %	256821159
128	NC_013164	AGTT	2	8	44924	44931	25 %	50 %	25 %	0 %	256821159
129	NC_013164	AAAG	2	8	45064	45071	75 %	0 %	25 %	0 %	256821159
130	NC_013164	AAGA	2	8	45584	45591	75 %	0 %	25 %	0 %	256821160
131	NC_013164	TGTA	2	8	47447	47454	25 %	50 %	25 %	0 %	256821161
132	NC_013164	AAGA	2	8	47637	47644	75 %	0 %	25 %	0 %	256821161
133	NC_013164	AGAT	2	8	48941	48948	50 %	25 %	25 %	0 %	256821163
134	NC_013164	TGGT	2	8	49129	49136	0 %	50 %	50 %	0 %	256821163
135	NC_013164	TATG	2	8	49157	49164	25 %	50 %	25 %	0 %	256821163
136	NC_013164	AATC	2	8	49262	49269	50 %	25 %	0 %	25 %	256821163
137	NC_013164	TTTA	2	8	50024	50031	25 %	75 %	0 %	0 %	256821164
138	NC_013164	ATTT	2	8	50105	50112	25 %	75 %	0 %	0 %	256821164
139	NC_013164	ATCA	2	8	50129	50136	50 %	25 %	0 %	25 %	256821164
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.