MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 230497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013093	GAC	2	6	21244	21249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
502	NC_013093	CTG	2	6	21292	21297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
503	NC_013093	TGG	2	6	21342	21347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374181
504	NC_013093	GCC	2	6	21383	21388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
505	NC_013093	CG	3	6	21581	21586	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
506	NC_013093	TCC	2	6	21590	21595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
507	NC_013093	TGATCG	2	12	21648	21659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256374181
508	NC_013093	CGTGC	2	10	21679	21688	0 %	20 %	40 %	40 %	256374181
509	NC_013093	CGA	2	6	21702	21707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
510	NC_013093	CGT	2	6	21831	21836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
511	NC_013093	CCA	2	6	21849	21854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374181
512	NC_013093	CGAC	2	8	21879	21886	25 %	0 %	25 %	50 %	256374181
513	NC_013093	GCTG	2	8	21948	21955	0 %	25 %	50 %	25 %	256374181
514	NC_013093	GGCAC	2	10	21963	21972	20 %	0 %	40 %	40 %	256374181
515	NC_013093	GC	3	6	22008	22013	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
516	NC_013093	CG	3	6	22014	22019	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
517	NC_013093	CGC	2	6	22071	22076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
518	NC_013093	GGA	2	6	22078	22083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374181
519	NC_013093	AGC	2	6	22097	22102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
520	NC_013093	GGT	2	6	22105	22110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374181
521	NC_013093	CGCCAG	2	12	22120	22131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256374181
522	NC_013093	CAG	2	6	22144	22149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
523	NC_013093	GAC	2	6	22150	22155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
524	NC_013093	ATC	2	6	22163	22168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
525	NC_013093	GC	3	6	22180	22185	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
526	NC_013093	CTC	3	9	22201	22209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
527	NC_013093	GCG	2	6	22214	22219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
528	NC_013093	CGCTCC	2	12	22247	22258	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	256374181
529	NC_013093	ACC	2	6	22268	22273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374181
530	NC_013093	TGCC	2	8	22283	22290	0 %	25 %	25 %	50 %	256374181
531	NC_013093	CCG	2	6	22292	22297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
532	NC_013093	TCG	2	6	22299	22304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
533	NC_013093	CTG	2	6	22342	22347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
534	NC_013093	CAG	2	6	22351	22356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
535	NC_013093	CTC	2	6	22366	22371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
536	NC_013093	TCA	2	6	22377	22382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
537	NC_013093	GC	3	6	22430	22435	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
538	NC_013093	CGG	2	6	22440	22445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
539	NC_013093	CGA	2	6	22528	22533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
540	NC_013093	CTC	2	6	22546	22551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374181
541	NC_013093	AGC	2	6	22613	22618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
542	NC_013093	CGG	2	6	22719	22724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
543	NC_013093	CGG	2	6	22734	22739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374181
544	NC_013093	CGT	2	6	22746	22751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
545	NC_013093	GC	4	8	22757	22764	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
546	NC_013093	ATC	2	6	22805	22810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
547	NC_013093	TGCCG	2	10	22842	22851	0 %	20 %	40 %	40 %	256374181
548	NC_013093	GC	3	6	22898	22903	0 %	0 %	50 %	50 %	256374181
549	NC_013093	GTCTCG	2	12	22997	23008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374181
550	NC_013093	CGA	2	6	23025	23030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
551	NC_013093	GGT	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374181
552	NC_013093	ACG	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374181
553	NC_013093	GCC	2	6	23179	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374181
554	NC_013093	TCA	2	6	23238	23243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374181
555	NC_013093	GCAC	2	8	23330	23337	25 %	0 %	25 %	50 %	256374182
556	NC_013093	GCTC	2	8	23384	23391	0 %	25 %	25 %	50 %	256374182
557	NC_013093	GC	3	6	23417	23422	0 %	0 %	50 %	50 %	256374182
558	NC_013093	GC	3	6	23492	23497	0 %	0 %	50 %	50 %	256374182
559	NC_013093	CGGT	2	8	23545	23552	0 %	25 %	50 %	25 %	256374182
560	NC_013093	TCC	2	6	23557	23562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374182
561	NC_013093	TGC	2	6	23588	23593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
562	NC_013093	CCG	2	6	23608	23613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374182
563	NC_013093	CAG	2	6	23700	23705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374182
564	NC_013093	CGG	2	6	23742	23747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
565	NC_013093	GGGT	2	8	23836	23843	0 %	25 %	75 %	0 %	256374182
566	NC_013093	GCT	2	6	23864	23869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
567	NC_013093	CGG	2	6	23880	23885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
568	NC_013093	GCC	2	6	23890	23895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374182
569	NC_013093	GCT	2	6	23897	23902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
570	NC_013093	GCG	3	9	23903	23911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
571	NC_013093	GCT	2	6	23927	23932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
572	NC_013093	GCT	2	6	23945	23950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
573	NC_013093	CGG	2	6	23958	23963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
574	NC_013093	TGGGC	2	10	23972	23981	0 %	20 %	60 %	20 %	256374182
575	NC_013093	GCG	2	6	23990	23995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
576	NC_013093	CTG	2	6	24093	24098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
577	NC_013093	GCT	2	6	24107	24112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
578	NC_013093	GCG	2	6	24119	24124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
579	NC_013093	GCG	2	6	24128	24133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
580	NC_013093	GCCC	2	8	24149	24156	0 %	0 %	25 %	75 %	256374182
581	NC_013093	CCCG	2	8	24196	24203	0 %	0 %	25 %	75 %	256374182
582	NC_013093	CCG	2	6	24215	24220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374182
583	NC_013093	CGC	2	6	24230	24235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374182
584	NC_013093	GGC	2	6	24298	24303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
585	NC_013093	CGG	2	6	24309	24314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
586	NC_013093	GCG	3	9	24317	24325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
587	NC_013093	CAT	2	6	24342	24347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374182
588	NC_013093	CGA	2	6	24389	24394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374182
589	NC_013093	TCGC	2	8	24430	24437	0 %	25 %	25 %	50 %	256374182
590	NC_013093	CGT	2	6	24446	24451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374182
591	NC_013093	GCC	2	6	24529	24534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374182
592	NC_013093	TCC	2	6	24757	24762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374182
593	NC_013093	GGT	2	6	24818	24823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374182
594	NC_013093	GGT	2	6	24834	24839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374182
595	NC_013093	CGG	2	6	24935	24940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374182
596	NC_013093	GCC	2	6	24960	24965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374182
597	NC_013093	GAG	2	6	25002	25007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374182
598	NC_013093	GGA	2	6	25014	25019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374182
599	NC_013093	GCT	2	6	25043	25048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374183
600	NC_013093	CG	3	6	25055	25060	0 %	0 %	50 %	50 %	256374183
601	NC_013093	CCA	2	6	25075	25080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374183
602	NC_013093	GCC	2	6	25109	25114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374183
603	NC_013093	CGA	2	6	25123	25128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374183
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605	NC_013093	CGG	2	6	25282	25287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374183
606	NC_013093	ATC	3	9	25290	25298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374183
607	NC_013093	CAG	2	6	25304	25309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374183
608	NC_013093	TCG	2	6	25335	25340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374183
609	NC_013093	TCGTC	2	10	25354	25363	0 %	40 %	20 %	40 %	256374183
610	NC_013093	CCA	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374183
611	NC_013093	GCG	2	6	25462	25467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374183
612	NC_013093	GCC	2	6	25542	25547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374183
613	NC_013093	GTC	2	6	25574	25579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374183
614	NC_013093	GTT	2	6	25697	25702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256374183
615	NC_013093	TGG	2	6	25756	25761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374183
616	NC_013093	CG	3	6	25764	25769	0 %	0 %	50 %	50 %	256374183
617	NC_013093	CGC	3	9	25808	25816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374183
618	NC_013093	CGGG	2	8	25840	25847	0 %	0 %	75 %	25 %	256374183
619	NC_013093	TCC	2	6	25923	25928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374183
620	NC_013093	CCGGT	2	10	26025	26034	0 %	20 %	40 %	40 %	256374183
621	NC_013093	CTG	2	6	26057	26062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374183
622	NC_013093	GTC	2	6	26150	26155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374183
623	NC_013093	CAG	2	6	26165	26170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374183
624	NC_013093	GCG	2	6	26305	26310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374183
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626	NC_013093	CTC	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374183
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875	NC_013093	GCC	2	6	34983	34988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374191
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