MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidovorax ebreus TPSY chromosome

Total Repeats: 65277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011992	CTC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109226
2	NC_011992	CAG	2	6	175	180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109226
3	NC_011992	TGG	2	6	203	208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109226
4	NC_011992	CTG	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109226
5	NC_011992	CTG	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109226
6	NC_011992	CGA	2	6	447	452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109226
7	NC_011992	TGG	2	6	509	514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109226
8	NC_011992	CGG	2	6	542	547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109226
9	NC_011992	GGC	2	6	601	606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109226
10	NC_011992	CAA	2	6	645	650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109226
11	NC_011992	GCT	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109226
12	NC_011992	CGA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109226
13	NC_011992	CTG	2	6	778	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109226
14	NC_011992	CGA	2	6	789	794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109226
15	NC_011992	CAA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109226
16	NC_011992	GAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109226
17	NC_011992	GCT	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109226
18	NC_011992	AAG	2	6	865	870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109226
19	NC_011992	TGA	2	6	881	886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109226
20	NC_011992	GCC	2	6	972	977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109226
21	NC_011992	CAA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109226
22	NC_011992	CTT	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109226
23	NC_011992	CTG	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109226
24	NC_011992	AGA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109226
25	NC_011992	AAG	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109226
26	NC_011992	CGG	2	6	1374	1379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109226
27	NC_011992	CAG	2	6	1432	1437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109226
28	NC_011992	CAG	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109226
29	NC_011992	TCG	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
30	NC_011992	GCC	2	6	1706	1711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109227
31	NC_011992	TGC	3	9	1736	1744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
32	NC_011992	CAC	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109227
33	NC_011992	CAC	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109227
34	NC_011992	GCG	2	6	1817	1822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109227
35	NC_011992	CAC	3	9	1836	1844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109227
36	NC_011992	CCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109227
37	NC_011992	GGC	2	6	1939	1944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109227
38	NC_011992	AGG	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109227
39	NC_011992	CTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
40	NC_011992	CTA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109227
41	NC_011992	AGG	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109227
42	NC_011992	CTG	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
43	NC_011992	CAA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109227
44	NC_011992	CGG	2	6	2322	2327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109227
45	NC_011992	TGG	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109227
46	NC_011992	ACC	2	6	2393	2398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109227
47	NC_011992	ACA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109227
48	NC_011992	GCT	2	6	2427	2432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
49	NC_011992	CAT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109227
50	NC_011992	CTG	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
51	NC_011992	AAC	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109227
52	NC_011992	CGG	2	6	2571	2576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109227
53	NC_011992	TGA	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109227
54	NC_011992	CGT	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109227
55	NC_011992	AGC	2	6	2915	2920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
56	NC_011992	CAC	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109228
57	NC_011992	GGT	2	6	3063	3068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109228
58	NC_011992	CGA	2	6	3081	3086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
59	NC_011992	CGA	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
60	NC_011992	TCG	2	6	3113	3118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
61	NC_011992	GTG	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109228
62	NC_011992	GAC	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
63	NC_011992	GCC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
64	NC_011992	CGG	2	6	3249	3254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
65	NC_011992	GGC	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
66	NC_011992	AAG	2	6	3331	3336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109228
67	NC_011992	GTG	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109228
68	NC_011992	AAC	2	6	3577	3582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109228
69	NC_011992	CGA	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
70	NC_011992	TCA	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109228
71	NC_011992	AAG	2	6	3682	3687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109228
72	NC_011992	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
73	NC_011992	CGG	2	6	3741	3746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
74	NC_011992	ACG	2	6	3791	3796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
75	NC_011992	CAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109228
76	NC_011992	CGG	2	6	3846	3851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
77	NC_011992	AAG	2	6	3925	3930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109228
78	NC_011992	GCG	2	6	3947	3952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
79	NC_011992	TGC	2	6	3973	3978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
80	NC_011992	CAG	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
81	NC_011992	TCG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
82	NC_011992	GAA	2	6	4099	4104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109228
83	NC_011992	ACG	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
84	NC_011992	TCG	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
85	NC_011992	CGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
86	NC_011992	TCG	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
87	NC_011992	CCG	2	6	4295	4300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
88	NC_011992	GCT	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
89	NC_011992	TCA	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109228
90	NC_011992	GCC	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
91	NC_011992	GCG	2	6	4478	4483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
92	NC_011992	GAC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
93	NC_011992	ACC	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109228
94	NC_011992	CAT	4	12	4521	4532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109228
95	NC_011992	GCT	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
96	NC_011992	CTT	2	6	4581	4586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109228
97	NC_011992	TGG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109228
98	NC_011992	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
99	NC_011992	GAA	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109228
100	NC_011992	CGC	2	6	4689	4694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
101	NC_011992	CTG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109228
102	NC_011992	CAC	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109228
103	NC_011992	GCG	2	6	4751	4756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109228
104	NC_011992	CGA	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
105	NC_011992	CCG	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
106	NC_011992	GCC	2	6	5033	5038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
107	NC_011992	ACC	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109228
108	NC_011992	AGC	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
109	NC_011992	CGA	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
110	NC_011992	CGC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
111	NC_011992	GCC	2	6	5116	5121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
112	NC_011992	AGG	2	6	5186	5191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109228
113	NC_011992	CAC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109228
114	NC_011992	GCC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
115	NC_011992	AGC	2	6	5294	5299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
116	NC_011992	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109228
117	NC_011992	GCC	2	6	5330	5335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
118	NC_011992	CGA	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
119	NC_011992	CGA	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109228
120	NC_011992	CGC	2	6	5413	5418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109228
121	NC_011992	GCC	2	6	5691	5696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109229
122	NC_011992	GCA	2	6	5728	5733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109229
123	NC_011992	GAC	2	6	6057	6062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109230
124	NC_011992	CGG	2	6	6200	6205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109230
125	NC_011992	CCG	2	6	6208	6213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109230
126	NC_011992	CTT	2	6	6230	6235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109230
127	NC_011992	ACT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109230
128	NC_011992	GCC	2	6	6256	6261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109230
129	NC_011992	GCT	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109230
130	NC_011992	CGA	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109230
131	NC_011992	TCG	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109231
132	NC_011992	CTG	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109231
133	NC_011992	CGC	2	6	6829	6834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109231
134	NC_011992	AGC	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109231
135	NC_011992	GCC	2	6	6876	6881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109231
136	NC_011992	AGA	2	6	6891	6896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109231
137	NC_011992	ACC	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109231
138	NC_011992	GAA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109232
139	NC_011992	GGC	3	9	7095	7103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109232
140	NC_011992	CGA	2	6	7181	7186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109232
141	NC_011992	GCG	2	6	7221	7226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109232
142	NC_011992	GCC	2	6	7230	7235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109232
143	NC_011992	CGG	2	6	7261	7266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109232
144	NC_011992	CAG	2	6	7323	7328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109232
145	NC_011992	GCC	2	6	7413	7418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109232
146	NC_011992	GCC	2	6	7527	7532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
147	NC_011992	CCG	2	6	7592	7597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
148	NC_011992	GCC	2	6	7632	7637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
149	NC_011992	ACG	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109233
150	NC_011992	CCG	2	6	7765	7770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
151	NC_011992	CGG	2	6	7782	7787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109233
152	NC_011992	GCT	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109233
153	NC_011992	GCC	2	6	7938	7943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
154	NC_011992	CGC	2	6	8006	8011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
155	NC_011992	GCC	2	6	8153	8158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109233
156	NC_011992	CGG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109233
157	NC_011992	TCA	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109233
158	NC_011992	TGC	2	6	8256	8261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109233
159	NC_011992	GCT	2	6	8376	8381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109234
160	NC_011992	GCG	2	6	8489	8494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109234
161	NC_011992	GGC	2	6	8556	8561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109234
162	NC_011992	GTA	2	6	8587	8592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109234
163	NC_011992	AGC	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109234
164	NC_011992	CGC	2	6	8775	8780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109235
165	NC_011992	TGC	2	6	8835	8840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109235
166	NC_011992	GCC	2	6	9019	9024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109236
167	NC_011992	GGC	2	6	9102	9107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109236
168	NC_011992	GGT	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109236
169	NC_011992	TGA	2	6	9163	9168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109236
170	NC_011992	GGC	2	6	9177	9182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109236
171	NC_011992	CGG	2	6	9323	9328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109236
172	NC_011992	GGC	2	6	9458	9463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109236
173	NC_011992	CGG	2	6	9506	9511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109236
174	NC_011992	CGT	2	6	9592	9597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109236
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182	NC_011992	GTG	3	9	10104	10112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109236
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189	NC_011992	ATC	2	6	10494	10499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109236
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199	NC_011992	GCC	2	6	11216	11221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109237
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214	NC_011992	GCT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109237
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223	NC_011992	CTG	2	6	12110	12115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109237
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250	NC_011992	CTG	2	6	13748	13753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109239
251	NC_011992	CGA	2	6	13783	13788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109239
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253	NC_011992	TGG	2	6	13899	13904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109239
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255	NC_011992	GCC	2	6	14025	14030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109239
256	NC_011992	CGG	2	6	14068	14073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109239
257	NC_011992	TGC	2	6	14076	14081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109239
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259	NC_011992	CAC	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109239
260	NC_011992	GCC	2	6	14267	14272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109239
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286	NC_011992	GGC	2	6	15786	15791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109241
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288	NC_011992	TCA	2	6	15847	15852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109241
289	NC_011992	TGG	2	6	15880	15885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109241
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329	NC_011992	GCG	2	6	18305	18310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109243
330	NC_011992	GCG	2	6	18340	18345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109243
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369	NC_011992	CAG	2	6	20409	20414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109245
370	NC_011992	CGC	2	6	20417	20422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109245
371	NC_011992	TGA	2	6	20446	20451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109245
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374	NC_011992	CGC	2	6	20592	20597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109245
375	NC_011992	AGG	2	6	20901	20906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109246
376	NC_011992	ACG	2	6	20930	20935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109246
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379	NC_011992	GCC	2	6	21019	21024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109246
380	NC_011992	GCC	2	6	21028	21033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109246
381	NC_011992	GCC	2	6	21114	21119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109246
382	NC_011992	CGG	2	6	21256	21261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109246
383	NC_011992	GCG	2	6	21281	21286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109246
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489	NC_011992	GCG	2	6	27688	27693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109250
490	NC_011992	AGC	2	6	27701	27706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109250
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500	NC_011992	GGA	2	6	28678	28683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109251

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