MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011991	TC	3	6	1019	1024	0 %	50 %	0 %	50 %	222109118
2	NC_011991	GC	3	6	1993	1998	0 %	0 %	50 %	50 %	222109119
3	NC_011991	GC	3	6	2827	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	222109120
4	NC_011991	CG	3	6	3666	3671	0 %	0 %	50 %	50 %	222109120
5	NC_011991	CG	3	6	3866	3871	0 %	0 %	50 %	50 %	222109120
6	NC_011991	GC	3	6	4140	4145	0 %	0 %	50 %	50 %	222109121
7	NC_011991	CG	3	6	4189	4194	0 %	0 %	50 %	50 %	222109121
8	NC_011991	GA	3	6	4451	4456	50 %	0 %	50 %	0 %	222109121
9	NC_011991	GT	3	6	4696	4701	0 %	50 %	50 %	0 %	222109121
10	NC_011991	CT	3	6	6374	6379	0 %	50 %	0 %	50 %	222109124
11	NC_011991	GC	3	6	7103	7108	0 %	0 %	50 %	50 %	222109125
12	NC_011991	GC	3	6	7861	7866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109126
13	NC_011991	GC	3	6	9501	9506	0 %	0 %	50 %	50 %	222109128
14	NC_011991	GC	3	6	9706	9711	0 %	0 %	50 %	50 %	222109128
15	NC_011991	CG	3	6	9910	9915	0 %	0 %	50 %	50 %	222109128
16	NC_011991	TA	4	8	10558	10565	50 %	50 %	0 %	0 %	222109129
17	NC_011991	TC	3	6	10643	10648	0 %	50 %	0 %	50 %	222109129
18	NC_011991	CT	3	6	11176	11181	0 %	50 %	0 %	50 %	222109130
19	NC_011991	TC	3	6	11197	11202	0 %	50 %	0 %	50 %	222109130
20	NC_011991	GC	3	6	11275	11280	0 %	0 %	50 %	50 %	222109130
21	NC_011991	AC	3	6	12134	12139	50 %	0 %	0 %	50 %	222109131
22	NC_011991	CG	3	6	12450	12455	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
23	NC_011991	GC	3	6	13019	13024	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
24	NC_011991	AG	3	6	13070	13075	50 %	0 %	50 %	0 %	222109131
25	NC_011991	GA	3	6	13451	13456	50 %	0 %	50 %	0 %	222109131
26	NC_011991	CA	3	6	13537	13542	50 %	0 %	0 %	50 %	222109131
27	NC_011991	CG	3	6	14962	14967	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
28	NC_011991	CA	3	6	15144	15149	50 %	0 %	0 %	50 %	222109131
29	NC_011991	GC	3	6	15420	15425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109131
30	NC_011991	GC	3	6	17364	17369	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
31	NC_011991	CG	3	6	17433	17438	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
32	NC_011991	GC	5	10	18339	18348	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
33	NC_011991	GC	3	6	18469	18474	0 %	0 %	50 %	50 %	222109134
34	NC_011991	AT	3	6	19834	19839	50 %	50 %	0 %	0 %	222109136
35	NC_011991	TC	3	6	21136	21141	0 %	50 %	0 %	50 %	222109137
36	NC_011991	CG	3	6	21646	21651	0 %	0 %	50 %	50 %	222109137
37	NC_011991	GC	3	6	21758	21763	0 %	0 %	50 %	50 %	222109137
38	NC_011991	CG	5	10	21922	21931	0 %	0 %	50 %	50 %	222109137
39	NC_011991	AC	3	6	22247	22252	50 %	0 %	0 %	50 %	222109137
40	NC_011991	AG	3	6	22384	22389	50 %	0 %	50 %	0 %	222109137
41	NC_011991	TC	3	6	23141	23146	0 %	50 %	0 %	50 %	222109138
42	NC_011991	CG	4	8	23755	23762	0 %	0 %	50 %	50 %	222109138
43	NC_011991	CT	3	6	26491	26496	0 %	50 %	0 %	50 %	222109140
44	NC_011991	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	222109142
45	NC_011991	GC	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	222109142
46	NC_011991	TC	3	6	29264	29269	0 %	50 %	0 %	50 %	222109142
47	NC_011991	GC	3	6	29882	29887	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
48	NC_011991	GC	3	6	30093	30098	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
49	NC_011991	GA	3	6	30487	30492	50 %	0 %	50 %	0 %	222109143
50	NC_011991	CT	3	6	30643	30648	0 %	50 %	0 %	50 %	222109143
51	NC_011991	GT	3	6	31315	31320	0 %	50 %	50 %	0 %	222109143
52	NC_011991	GC	3	6	31806	31811	0 %	0 %	50 %	50 %	222109143
53	NC_011991	CG	3	6	36112	36117	0 %	0 %	50 %	50 %	222109145
54	NC_011991	GA	3	6	36429	36434	50 %	0 %	50 %	0 %	222109146
55	NC_011991	AG	4	8	36964	36971	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
56	NC_011991	TC	3	6	37372	37377	0 %	50 %	0 %	50 %	222109148
57	NC_011991	GA	3	6	37741	37746	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
58	NC_011991	GC	3	6	37763	37768	0 %	0 %	50 %	50 %	222109148
59	NC_011991	AG	4	8	37857	37864	50 %	0 %	50 %	0 %	222109148
60	NC_011991	AG	3	6	37993	37998	50 %	0 %	50 %	0 %	222109149
61	NC_011991	GC	3	6	38042	38047	0 %	0 %	50 %	50 %	222109149
62	NC_011991	CG	3	6	39391	39396	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
63	NC_011991	GC	3	6	39553	39558	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
64	NC_011991	CG	3	6	39747	39752	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
65	NC_011991	TC	3	6	40346	40351	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
66	NC_011991	TC	3	6	41091	41096	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
67	NC_011991	GC	3	6	41509	41514	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
68	NC_011991	GC	3	6	41934	41939	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
69	NC_011991	CG	3	6	41953	41958	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
70	NC_011991	TC	3	6	43345	43350	0 %	50 %	0 %	50 %	222109151
71	NC_011991	GC	3	6	43384	43389	0 %	0 %	50 %	50 %	222109151
72	NC_011991	GC	3	6	44420	44425	0 %	0 %	50 %	50 %	222109152
73	NC_011991	CG	3	6	45486	45491	0 %	0 %	50 %	50 %	222109153
74	NC_011991	TC	3	6	46285	46290	0 %	50 %	0 %	50 %	222109155
75	NC_011991	CG	3	6	46471	46476	0 %	0 %	50 %	50 %	222109155
76	NC_011991	GC	3	6	46490	46495	0 %	0 %	50 %	50 %	222109155
77	NC_011991	CG	3	6	47235	47240	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
78	NC_011991	GC	3	6	47946	47951	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
79	NC_011991	CG	3	6	48296	48301	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
80	NC_011991	CG	3	6	48544	48549	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
81	NC_011991	CG	3	6	48692	48697	0 %	0 %	50 %	50 %	222109158
82	NC_011991	AC	3	6	48853	48858	50 %	0 %	0 %	50 %	222109158
83	NC_011991	CG	3	6	49270	49275	0 %	0 %	50 %	50 %	222109159
84	NC_011991	GC	3	6	49705	49710	0 %	0 %	50 %	50 %	222109160
85	NC_011991	GC	3	6	50590	50595	0 %	0 %	50 %	50 %	222109162
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87	NC_011991	CG	3	6	51997	52002	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
88	NC_011991	GC	3	6	52043	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
89	NC_011991	GC	3	6	52178	52183	0 %	0 %	50 %	50 %	222109164
90	NC_011991	GC	3	6	53387	53392	0 %	0 %	50 %	50 %	222109165
91	NC_011991	AG	3	6	54272	54277	50 %	0 %	50 %	0 %	222109165
92	NC_011991	GC	3	6	54646	54651	0 %	0 %	50 %	50 %	222109166
93	NC_011991	GA	3	6	55326	55331	50 %	0 %	50 %	0 %	222109167
94	NC_011991	GC	3	6	55575	55580	0 %	0 %	50 %	50 %	222109167
95	NC_011991	TG	3	6	55687	55692	0 %	50 %	50 %	0 %	222109167
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101	NC_011991	TC	3	6	63510	63515	0 %	50 %	0 %	50 %	222109177
102	NC_011991	CG	3	6	63753	63758	0 %	0 %	50 %	50 %	222109177
103	NC_011991	GA	3	6	64495	64500	50 %	0 %	50 %	0 %	222109177
104	NC_011991	CG	3	6	64861	64866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109178
105	NC_011991	CG	3	6	65072	65077	0 %	0 %	50 %	50 %	222109179
106	NC_011991	CT	3	6	65363	65368	0 %	50 %	0 %	50 %	222109180
107	NC_011991	GC	3	6	65740	65745	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
108	NC_011991	CG	3	6	66165	66170	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
109	NC_011991	CG	3	6	66479	66484	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
110	NC_011991	GC	3	6	67009	67014	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
111	NC_011991	AC	3	6	67718	67723	50 %	0 %	0 %	50 %	222109180
112	NC_011991	GC	3	6	68255	68260	0 %	0 %	50 %	50 %	222109180
113	NC_011991	TG	3	6	68268	68273	0 %	50 %	50 %	0 %	222109180
114	NC_011991	CG	3	6	69784	69789	0 %	0 %	50 %	50 %	222109181
115	NC_011991	CG	3	6	69938	69943	0 %	0 %	50 %	50 %	222109181
116	NC_011991	TC	3	6	69958	69963	0 %	50 %	0 %	50 %	222109181
117	NC_011991	CG	3	6	70154	70159	0 %	0 %	50 %	50 %	222109182
118	NC_011991	GC	3	6	71743	71748	0 %	0 %	50 %	50 %	222109183
119	NC_011991	AT	3	6	71751	71756	50 %	50 %	0 %	0 %	222109183
120	NC_011991	CG	4	8	72712	72719	0 %	0 %	50 %	50 %	222109184
121	NC_011991	CG	4	8	72860	72867	0 %	0 %	50 %	50 %	222109184
122	NC_011991	TC	3	6	72912	72917	0 %	50 %	0 %	50 %	222109184
123	NC_011991	GT	3	6	74026	74031	0 %	50 %	50 %	0 %	222109186
124	NC_011991	GC	3	6	74861	74866	0 %	0 %	50 %	50 %	222109187
125	NC_011991	CG	3	6	74981	74986	0 %	0 %	50 %	50 %	222109187
126	NC_011991	GA	3	6	76414	76419	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189
127	NC_011991	AG	3	6	76623	76628	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189
128	NC_011991	AG	3	6	76684	76689	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189
129	NC_011991	AG	4	8	76935	76942	50 %	0 %	50 %	0 %	222109189
130	NC_011991	AT	3	6	76961	76966	50 %	50 %	0 %	0 %	222109189
131	NC_011991	CG	3	6	77355	77360	0 %	0 %	50 %	50 %	222109189
132	NC_011991	CT	3	6	77563	77568	0 %	50 %	0 %	50 %	222109189
133	NC_011991	CG	3	6	78259	78264	0 %	0 %	50 %	50 %	222109190
134	NC_011991	CG	3	6	78381	78386	0 %	0 %	50 %	50 %	222109190
135	NC_011991	GA	3	6	79796	79801	50 %	0 %	50 %	0 %	222109191
136	NC_011991	TG	3	6	79851	79856	0 %	50 %	50 %	0 %	222109191
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139	NC_011991	CG	3	6	80839	80844	0 %	0 %	50 %	50 %	222109192
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.