MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011990	TTGCCC	2	12	3661	3672	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222108944
2	NC_011990	TCCCGA	2	12	5534	5545	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222108946
3	NC_011990	AACCGC	2	12	8411	8422	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222108949
4	NC_011990	CGGAAG	2	12	10351	10362	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222108951
5	NC_011990	TGTACG	2	12	14293	14304	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222108959
6	NC_011990	CGCCAC	2	12	17387	17398	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222108962
7	NC_011990	CTCAAT	2	12	24570	24581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222108967
8	NC_011990	GGCCTT	2	12	32277	32288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222108974
9	NC_011990	CGCAAG	2	12	33261	33272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222108974
10	NC_011990	CCGATC	2	12	34702	34713	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222108974
11	NC_011990	CGACAA	2	12	35987	35998	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222108974
12	NC_011990	GTGACG	2	12	37062	37073	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222108974
13	NC_011990	TTCGCC	2	12	37206	37217	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222108974
14	NC_011990	TCGAGC	2	12	40624	40635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222108977
15	NC_011990	GCTTTT	2	12	41616	41627	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	222108980
16	NC_011990	TCCGGT	2	12	55669	55680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109000
17	NC_011990	TGCGCA	2	12	55794	55805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222109000
18	NC_011990	TCGATC	2	12	55848	55859	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222109000
19	NC_011990	GGCGAC	2	12	56662	56673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222109000
20	NC_011990	GCCGGC	2	12	59567	59578	0 %	0 %	50 %	50 %	222109003
21	NC_011990	AATGGC	2	12	62506	62517	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222109005
22	NC_011990	GGGATG	2	12	62614	62625	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222109005
23	NC_011990	CTTGGC	2	12	65980	65991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109009
24	NC_011990	GCGAAG	2	12	67790	67801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222109011
25	NC_011990	ACCTCG	2	12	69174	69185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222109012
26	NC_011990	CGCCGA	2	12	76255	76266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222109018
27	NC_011990	CGCAAG	2	12	76418	76429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109018
28	NC_011990	TGCTGT	2	12	77081	77092	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222109018
29	NC_011990	GAAGGT	2	12	84638	84649	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222109026
30	NC_011990	CGACAA	2	12	92874	92885	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222109033
31	NC_011990	TCCCAT	2	12	94497	94508	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222109035
32	NC_011990	CGATCG	2	12	101509	101520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222109042
33	NC_011990	TCGAAA	2	12	112854	112865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222109049
34	NC_011990	CACGAC	2	12	120418	120429	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222109056
35	NC_011990	AGGGCG	2	12	120929	120940	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222109057
36	NC_011990	CGCCGG	2	12	121289	121300	0 %	0 %	50 %	50 %	222109058
37	NC_011990	ATCCCC	2	12	121714	121725	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	222109058
38	NC_011990	ATGTTC	2	12	121849	121860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222109058
39	NC_011990	CGACGG	2	12	122083	122094	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222109059
40	NC_011990	CGATGA	2	12	123696	123707	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222109060
41	NC_011990	CCCTGC	2	12	124416	124427	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222109062
42	NC_011990	TCGATC	2	12	130338	130349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222109068
43	NC_011990	GTTCGT	2	12	131400	131411	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222109069
44	NC_011990	ATCTGA	2	12	133335	133346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222109070
45	NC_011990	AGGATA	2	12	134858	134869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222109071
46	NC_011990	ACTGCC	2	12	148180	148191	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222109086
47	NC_011990	GCGGTG	2	12	154323	154334	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222109090
48	NC_011990	AACACG	2	12	154610	154621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222109091
49	NC_011990	GGGCTG	2	12	154671	154682	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222109092
50	NC_011990	GCCTTG	2	12	170100	170111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109105
51	NC_011990	TGACGA	2	12	174719	174730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222109108
52	NC_011990	CGTGCC	2	12	180029	180040	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222109113

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.