MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011989	CGG	2	6	208210	208215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3502	NC_011989	GGCGCT	2	12	208300	208311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147197
3503	NC_011989	GC	3	6	208400	208405	0 %	0 %	50 %	50 %	222147197
3504	NC_011989	GGC	2	6	208438	208443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3505	NC_011989	TGC	2	6	208488	208493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147197
3506	NC_011989	CGG	2	6	208574	208579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3507	NC_011989	TGA	2	6	208603	208608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147197
3508	NC_011989	TGG	2	6	208609	208614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147197
3509	NC_011989	GCC	2	6	208655	208660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147197
3510	NC_011989	AATG	2	8	208714	208721	50 %	25 %	25 %	0 %	222147197
3511	NC_011989	ATC	2	6	208812	208817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147197
3512	NC_011989	CAG	2	6	208889	208894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147197
3513	NC_011989	GGC	2	6	208895	208900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3514	NC_011989	GAA	2	6	208910	208915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147197
3515	NC_011989	AGG	2	6	208951	208956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147197
3516	NC_011989	CGG	2	6	208969	208974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3517	NC_011989	CTCA	2	8	209018	209025	25 %	25 %	0 %	50 %	222147197
3518	NC_011989	TCC	2	6	209094	209099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147197
3519	NC_011989	GAC	2	6	209114	209119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147197
3520	NC_011989	TAGCG	2	10	209214	209223	20 %	20 %	40 %	20 %	222147197
3521	NC_011989	CGG	2	6	209234	209239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3522	NC_011989	CG	3	6	209320	209325	0 %	0 %	50 %	50 %	222147197
3523	NC_011989	GGC	2	6	209387	209392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3524	NC_011989	TCA	2	6	209437	209442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147197
3525	NC_011989	AAC	2	6	209451	209456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147197
3526	NC_011989	ATT	2	6	209480	209485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147197
3527	NC_011989	GAT	2	6	209564	209569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147197
3528	NC_011989	CCAGA	2	10	209570	209579	40 %	0 %	20 %	40 %	222147197
3529	NC_011989	GC	3	6	209583	209588	0 %	0 %	50 %	50 %	222147197
3530	NC_011989	TTG	2	6	209589	209594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147197
3531	NC_011989	CAGA	2	8	209663	209670	50 %	0 %	25 %	25 %	222147197
3532	NC_011989	CGG	2	6	209734	209739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147197
3533	NC_011989	CGA	2	6	209750	209755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147197
3534	NC_011989	GGC	2	6	209971	209976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147198
3535	NC_011989	TCA	2	6	210012	210017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147198
3536	NC_011989	GCG	2	6	210027	210032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147198
3537	NC_011989	GAT	2	6	210079	210084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147198
3538	NC_011989	GCC	2	6	210097	210102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147198
3539	NC_011989	CGC	2	6	210114	210119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147198
3540	NC_011989	CGG	2	6	210237	210242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147198
3541	NC_011989	ATG	2	6	210439	210444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147198
3542	NC_011989	GCA	2	6	210560	210565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147198
3543	NC_011989	ACA	2	6	210593	210598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147198
3544	NC_011989	CGT	2	6	210603	210608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147198
3545	NC_011989	ATC	2	6	210626	210631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147198
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3547	NC_011989	GCA	2	6	210812	210817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147198
3548	NC_011989	GC	3	6	210841	210846	0 %	0 %	50 %	50 %	222147198
3549	NC_011989	GCC	2	6	210853	210858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147198
3550	NC_011989	ATT	2	6	210962	210967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147199
3551	NC_011989	GACATC	2	12	211056	211067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222147199
3552	NC_011989	CGA	2	6	211091	211096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147199
3553	NC_011989	AGA	2	6	211097	211102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147199
3554	NC_011989	CGC	2	6	211151	211156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147199
3555	NC_011989	CGT	2	6	211202	211207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147199
3556	NC_011989	TGA	2	6	211264	211269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147199
3557	NC_011989	CGC	2	6	211281	211286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147199
3558	NC_011989	TCT	2	6	211325	211330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147199
3559	NC_011989	CGGTGA	2	12	211438	211449	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222147200
3560	NC_011989	CTCG	2	8	211459	211466	0 %	25 %	25 %	50 %	222147200
3561	NC_011989	CAT	2	6	211476	211481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147200
3562	NC_011989	CGC	2	6	211539	211544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147200
3563	NC_011989	GGC	2	6	211634	211639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147200
3564	NC_011989	TCT	2	6	211668	211673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147200
3565	NC_011989	ACC	2	6	211695	211700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147200
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3567	NC_011989	CGGG	2	8	211767	211774	0 %	0 %	75 %	25 %	222147200
3568	NC_011989	T	6	6	211867	211872	0 %	100 %	0 %	0 %	222147200
3569	NC_011989	CGC	2	6	211918	211923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147200
3570	NC_011989	CAG	2	6	211930	211935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147200
3571	NC_011989	ATC	2	6	211994	211999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147200
3572	NC_011989	GCT	2	6	212022	212027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147200
3573	NC_011989	TGG	2	6	212087	212092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147200
3574	NC_011989	CGC	2	6	212118	212123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147200
3575	NC_011989	CAG	2	6	212146	212151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147200
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3577	NC_011989	ATC	2	6	212204	212209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147200
3578	NC_011989	GCG	2	6	212224	212229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147200
3579	NC_011989	CCGGC	2	10	212382	212391	0 %	0 %	40 %	60 %	222147200
3580	NC_011989	ACC	2	6	212811	212816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147201
3581	NC_011989	GTC	2	6	212945	212950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147201
3582	NC_011989	GCA	2	6	212956	212961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147201
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3584	NC_011989	GTC	2	6	213026	213031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147201
3585	NC_011989	CTCG	2	8	213074	213081	0 %	25 %	25 %	50 %	222147201
3586	NC_011989	TCT	2	6	213104	213109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147201
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3588	NC_011989	GAT	2	6	213204	213209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147201
3589	NC_011989	GTT	2	6	213210	213215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147201
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3591	NC_011989	CGG	2	6	213247	213252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147201
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3593	NC_011989	TGT	2	6	213272	213277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147201
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3598	NC_011989	ATCGC	2	10	213466	213475	20 %	20 %	20 %	40 %	222147201
3599	NC_011989	AAT	2	6	213558	213563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147201
3600	NC_011989	TAT	2	6	213585	213590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147201
3601	NC_011989	TGA	2	6	213751	213756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147201
3602	NC_011989	CTT	2	6	213761	213766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147201
3603	NC_011989	CGG	2	6	213777	213782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147201
3604	NC_011989	TTTCGA	2	12	213827	213838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222147201
3605	NC_011989	GCC	2	6	213971	213976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147201
3606	NC_011989	AGC	2	6	214027	214032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147201
3607	NC_011989	AGGC	2	8	214069	214076	25 %	0 %	50 %	25 %	222147201
3608	NC_011989	AAT	2	6	214185	214190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147201
3609	NC_011989	TCC	2	6	214233	214238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147201
3610	NC_011989	ATG	2	6	214270	214275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147201
3611	NC_011989	TAT	2	6	214281	214286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147201
3612	NC_011989	CCA	2	6	214300	214305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147201
3613	NC_011989	AGC	2	6	214318	214323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147201
3614	NC_011989	ACT	2	6	214327	214332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147201
3615	NC_011989	ACC	2	6	214353	214358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147201
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3617	NC_011989	TG	3	6	214520	214525	0 %	50 %	50 %	0 %	222147201
3618	NC_011989	TGG	2	6	214596	214601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147201
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3620	NC_011989	TGA	2	6	214826	214831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147202
3621	NC_011989	CAT	2	6	214848	214853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147202
3622	NC_011989	GGT	2	6	214888	214893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147202
3623	NC_011989	GGT	2	6	214905	214910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147202
3624	NC_011989	GGT	2	6	214957	214962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147202
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3724	NC_011989	GATC	2	8	218768	218775	25 %	25 %	25 %	25 %	222147205
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3726	NC_011989	CGG	2	6	218888	218893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147205
3727	NC_011989	GCA	2	6	219041	219046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147205
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3731	NC_011989	GCG	2	6	219436	219441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147205
3732	NC_011989	GTC	2	6	219507	219512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147205
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3735	NC_011989	CTG	2	6	219853	219858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147206
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3737	NC_011989	ACG	2	6	219946	219951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147206
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3739	NC_011989	GCA	2	6	219969	219974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147206
3740	NC_011989	CCAA	2	8	219981	219988	50 %	0 %	0 %	50 %	222147206
3741	NC_011989	CAC	2	6	219990	219995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147206
3742	NC_011989	GCT	2	6	220275	220280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147207
3743	NC_011989	GAT	2	6	220290	220295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147207
3744	NC_011989	CGA	2	6	220365	220370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147207
3745	NC_011989	CGA	2	6	220374	220379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147207
3746	NC_011989	GC	3	6	220389	220394	0 %	0 %	50 %	50 %	222147207
3747	NC_011989	AAGA	2	8	220429	220436	75 %	0 %	25 %	0 %	222147207
3748	NC_011989	TGGC	2	8	220444	220451	0 %	25 %	50 %	25 %	222147207
3749	NC_011989	CTGGC	2	10	220498	220507	0 %	20 %	40 %	40 %	222147207
3750	NC_011989	GATG	2	8	220580	220587	25 %	25 %	50 %	0 %	222147207
3751	NC_011989	ATC	2	6	220621	220626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147207
3752	NC_011989	CGT	2	6	220771	220776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147207
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3754	NC_011989	GAAG	2	8	220818	220825	50 %	0 %	50 %	0 %	222147207
3755	NC_011989	TGG	2	6	220919	220924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147207
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3759	NC_011989	ATC	2	6	221134	221139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147207
3760	NC_011989	TGG	2	6	221143	221148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147207
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3764	NC_011989	CCG	2	6	221417	221422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147207
3765	NC_011989	TTC	2	6	221443	221448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147207
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3769	NC_011989	GCC	2	6	221793	221798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147208
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3815	NC_011989	CAG	2	6	225935	225940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147211
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3819	NC_011989	TCG	2	6	226047	226052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147211
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3822	NC_011989	TGA	2	6	226228	226233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147212
3823	NC_011989	T	6	6	226304	226309	0 %	100 %	0 %	0 %	222147212
3824	NC_011989	ATC	2	6	226332	226337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147212
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3832	NC_011989	CTG	2	6	226716	226721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147212
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3841	NC_011989	GCG	2	6	227185	227190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147212
3842	NC_011989	TCG	2	6	227233	227238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147212
3843	NC_011989	GCCC	2	8	227322	227329	0 %	0 %	25 %	75 %	222147212
3844	NC_011989	GCCC	2	8	227334	227341	0 %	0 %	25 %	75 %	222147212
3845	NC_011989	CGG	2	6	227524	227529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147213
3846	NC_011989	CTGGG	2	10	227558	227567	0 %	20 %	60 %	20 %	222147213
3847	NC_011989	GGC	2	6	227574	227579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147213
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3850	NC_011989	CT	3	6	227815	227820	0 %	50 %	0 %	50 %	222147213
3851	NC_011989	CAA	2	6	227840	227845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147213
3852	NC_011989	TGG	2	6	227886	227891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147213
3853	NC_011989	CGG	2	6	228055	228060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147213
3854	NC_011989	CGG	2	6	228079	228084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147213
3855	NC_011989	TGCC	2	8	228149	228156	0 %	25 %	25 %	50 %	222147213
3856	NC_011989	GCCCT	2	10	228246	228255	0 %	20 %	20 %	60 %	222147213
3857	NC_011989	CTG	2	6	228273	228278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147213
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3859	NC_011989	GGC	2	6	228366	228371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147214
3860	NC_011989	CCATGC	2	12	228387	228398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222147214
3861	NC_011989	GAT	2	6	228439	228444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147214
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3863	NC_011989	TCG	2	6	228551	228556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147214
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3972	NC_011989	TTGTC	2	10	234465	234474	0 %	60 %	20 %	20 %	222147221
3973	NC_011989	GCG	2	6	234562	234567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147221
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3979	NC_011989	AATGCC	2	12	234917	234928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222147222
3980	NC_011989	GGC	2	6	234945	234950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147222
3981	NC_011989	CGG	2	6	234961	234966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147222
3982	NC_011989	CGA	2	6	235013	235018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147222
3983	NC_011989	CAC	2	6	235019	235024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147222
3984	NC_011989	CTT	2	6	235046	235051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147222
3985	NC_011989	CAC	2	6	235076	235081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147222
3986	NC_011989	CAT	2	6	235100	235105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147222
3987	NC_011989	GGA	2	6	235127	235132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147222
3988	NC_011989	GCGG	2	8	235139	235146	0 %	0 %	75 %	25 %	222147222
3989	NC_011989	CG	3	6	235201	235206	0 %	0 %	50 %	50 %	222147222
3990	NC_011989	ATGC	2	8	235224	235231	25 %	25 %	25 %	25 %	222147222
3991	NC_011989	GAA	2	6	235236	235241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147222
3992	NC_011989	CCA	2	6	235297	235302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147222
3993	NC_011989	TGCCG	2	10	235436	235445	0 %	20 %	40 %	40 %	222147222
3994	NC_011989	GTC	2	6	235458	235463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147222
3995	NC_011989	ATC	2	6	235480	235485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147222
3996	NC_011989	CGA	2	6	235562	235567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147222
3997	NC_011989	GGGC	2	8	235571	235578	0 %	0 %	75 %	25 %	222147222
3998	NC_011989	CGC	2	6	235617	235622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147222
3999	NC_011989	CAG	2	6	235659	235664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147222
4000	NC_011989	GCC	2	6	235671	235676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147222

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