MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011989	GAT	2	6	178336	178341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147167
3002	NC_011989	CAACA	2	10	178361	178370	60 %	0 %	0 %	40 %	222147167
3003	NC_011989	TCG	2	6	178371	178376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147167
3004	NC_011989	GC	3	6	178494	178499	0 %	0 %	50 %	50 %	222147167
3005	NC_011989	CCT	2	6	178555	178560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147167
3006	NC_011989	GCAAT	2	10	178714	178723	40 %	20 %	20 %	20 %	222147167
3007	NC_011989	CCAC	2	8	178724	178731	25 %	0 %	0 %	75 %	222147167
3008	NC_011989	GGA	2	6	178736	178741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147167
3009	NC_011989	CCAG	2	8	178798	178805	25 %	0 %	25 %	50 %	222147167
3010	NC_011989	CCA	2	6	178833	178838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147167
3011	NC_011989	AAT	2	6	178855	178860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147167
3012	NC_011989	CTCCAA	2	12	178873	178884	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222147167
3013	NC_011989	GCC	2	6	178943	178948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147167
3014	NC_011989	TGC	2	6	179005	179010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147167
3015	NC_011989	GC	3	6	179009	179014	0 %	0 %	50 %	50 %	222147167
3016	NC_011989	TTGA	2	8	179359	179366	25 %	50 %	25 %	0 %	222147168
3017	NC_011989	GAA	2	6	179422	179427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147168
3018	NC_011989	AGA	2	6	179516	179521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147168
3019	NC_011989	GGC	2	6	179523	179528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147168
3020	NC_011989	GC	3	6	179533	179538	0 %	0 %	50 %	50 %	222147168
3021	NC_011989	AAGGTC	2	12	179650	179661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222147168
3022	NC_011989	CCA	2	6	179691	179696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147168
3023	NC_011989	GAAG	2	8	179727	179734	50 %	0 %	50 %	0 %	222147168
3024	NC_011989	GTC	2	6	179780	179785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147168
3025	NC_011989	GAT	3	9	179787	179795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147168
3026	NC_011989	CAA	2	6	181358	181363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147169
3027	NC_011989	CAT	2	6	181409	181414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147169
3028	NC_011989	AGGAT	2	10	181471	181480	40 %	20 %	40 %	0 %	222147169
3029	NC_011989	GTTCTG	2	12	181491	181502	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222147169
3030	NC_011989	TGGA	2	8	181518	181525	25 %	25 %	50 %	0 %	222147169
3031	NC_011989	GTT	2	6	181589	181594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147169
3032	NC_011989	TTG	2	6	181611	181616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147169
3033	NC_011989	GC	3	6	181619	181624	0 %	0 %	50 %	50 %	222147169
3034	NC_011989	TGG	2	6	181846	181851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147169
3035	NC_011989	CGT	2	6	181910	181915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147169
3036	NC_011989	TCCT	2	8	181967	181974	0 %	50 %	0 %	50 %	222147170
3037	NC_011989	TCGG	2	8	182009	182016	0 %	25 %	50 %	25 %	222147170
3038	NC_011989	TCA	2	6	182025	182030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147170
3039	NC_011989	GCG	2	6	182160	182165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3040	NC_011989	GCGGTC	2	12	182206	182217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147170
3041	NC_011989	CG	3	6	182279	182284	0 %	0 %	50 %	50 %	222147170
3042	NC_011989	TGC	2	6	182310	182315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3043	NC_011989	ATC	2	6	182363	182368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147170
3044	NC_011989	GCG	2	6	182468	182473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3045	NC_011989	GGT	2	6	182488	182493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147170
3046	NC_011989	GATG	2	8	182557	182564	25 %	25 %	50 %	0 %	222147170
3047	NC_011989	GAG	2	6	182597	182602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147170
3048	NC_011989	GCA	2	6	182713	182718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3049	NC_011989	CCG	2	6	182727	182732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147170
3050	NC_011989	GCC	2	6	182795	182800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147170
3051	NC_011989	CCT	2	6	182997	183002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147170
3052	NC_011989	CG	3	6	183017	183022	0 %	0 %	50 %	50 %	222147170
3053	NC_011989	GAT	2	6	183043	183048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147170
3054	NC_011989	TGA	2	6	183058	183063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147170
3055	NC_011989	GCA	2	6	183091	183096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3056	NC_011989	TGC	2	6	183099	183104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147170
3057	NC_011989	GGC	2	6	183134	183139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3058	NC_011989	CGG	2	6	183184	183189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3059	NC_011989	GGC	2	6	183218	183223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147170
3060	NC_011989	TCC	2	6	183535	183540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147171
3061	NC_011989	AAG	2	6	183544	183549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147171
3062	NC_011989	GCT	2	6	183583	183588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147171
3063	NC_011989	TCA	2	6	183686	183691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147171
3064	NC_011989	GCC	2	6	183814	183819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147172
3065	NC_011989	GCC	2	6	183833	183838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147172
3066	NC_011989	CAA	2	6	183912	183917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147172
3067	NC_011989	CAA	2	6	184005	184010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147172
3068	NC_011989	CCAT	2	8	184052	184059	25 %	25 %	0 %	50 %	222147172
3069	NC_011989	GC	3	6	184076	184081	0 %	0 %	50 %	50 %	222147172
3070	NC_011989	AAG	2	6	184096	184101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147172
3071	NC_011989	CGC	2	6	184368	184373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3072	NC_011989	CGA	2	6	184380	184385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147173
3073	NC_011989	GCC	2	6	184411	184416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3074	NC_011989	GCC	2	6	184495	184500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3075	NC_011989	GAA	2	6	184512	184517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147173
3076	NC_011989	AAG	2	6	184543	184548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147173
3077	NC_011989	GCC	2	6	184564	184569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3078	NC_011989	GC	3	6	184576	184581	0 %	0 %	50 %	50 %	222147173
3079	NC_011989	TCAG	2	8	184655	184662	25 %	25 %	25 %	25 %	222147173
3080	NC_011989	TTC	2	6	184801	184806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3081	NC_011989	TGC	2	6	184838	184843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147173
3082	NC_011989	GCC	2	6	184890	184895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147173
3083	NC_011989	GAA	2	6	185026	185031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147173
3084	NC_011989	CTT	2	6	185043	185048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3085	NC_011989	CTT	2	6	185085	185090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3086	NC_011989	TGGA	2	8	185176	185183	25 %	25 %	50 %	0 %	222147173
3087	NC_011989	TGC	2	6	185216	185221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147173
3088	NC_011989	GC	3	6	185220	185225	0 %	0 %	50 %	50 %	222147173
3089	NC_011989	GGC	2	6	185227	185232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147173
3090	NC_011989	CTT	2	6	185322	185327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147173
3091	NC_011989	TGG	2	6	185391	185396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147173
3092	NC_011989	TGA	2	6	185929	185934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3093	NC_011989	GGC	2	6	185938	185943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3094	NC_011989	CATC	2	8	185987	185994	25 %	25 %	0 %	50 %	222147174
3095	NC_011989	TC	3	6	186013	186018	0 %	50 %	0 %	50 %	222147174
3096	NC_011989	GCG	2	6	186057	186062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3097	NC_011989	GCGG	2	8	186073	186080	0 %	0 %	75 %	25 %	222147174
3098	NC_011989	ATGT	2	8	186110	186117	25 %	50 %	25 %	0 %	222147174
3099	NC_011989	ATG	2	6	186176	186181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3100	NC_011989	CGC	2	6	186265	186270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147174
3101	NC_011989	TGA	2	6	186283	186288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3102	NC_011989	GAT	2	6	186292	186297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3103	NC_011989	GCC	2	6	186362	186367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147174
3104	NC_011989	AGC	2	6	186387	186392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147174
3105	NC_011989	AGCTGG	2	12	186441	186452	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222147174
3106	NC_011989	ATG	2	6	186453	186458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147174
3107	NC_011989	TGG	2	6	186573	186578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147174
3108	NC_011989	CATG	2	8	186616	186623	25 %	25 %	25 %	25 %	222147174
3109	NC_011989	GTG	2	6	186731	186736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147174
3110	NC_011989	GGC	2	6	186767	186772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3111	NC_011989	GCG	2	6	186780	186785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3112	NC_011989	TTGA	2	8	186821	186828	25 %	50 %	25 %	0 %	222147174
3113	NC_011989	CGCT	2	8	186869	186876	0 %	25 %	25 %	50 %	222147174
3114	NC_011989	CAT	2	6	186880	186885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147174
3115	NC_011989	AT	3	6	186928	186933	50 %	50 %	0 %	0 %	222147174
3116	NC_011989	CAC	2	6	186952	186957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147174
3117	NC_011989	GCG	2	6	186978	186983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3118	NC_011989	GGT	2	6	187003	187008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147174
3119	NC_011989	CGA	2	6	187090	187095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147174
3120	NC_011989	GGGCGA	2	12	187135	187146	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222147174
3121	NC_011989	CAT	2	6	187167	187172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147174
3122	NC_011989	GGC	2	6	187173	187178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147174
3123	NC_011989	AGA	2	6	187207	187212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147174
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3132	NC_011989	GCGT	2	8	187596	187603	0 %	25 %	50 %	25 %	222147174
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3234	NC_011989	TCCG	2	8	193097	193104	0 %	25 %	25 %	50 %	222147179
3235	NC_011989	GGCG	2	8	193108	193115	0 %	0 %	75 %	25 %	222147179
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3360	NC_011989	CGAGC	2	10	199436	199445	20 %	0 %	40 %	40 %	222147186
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3362	NC_011989	GA	3	6	199916	199921	50 %	0 %	50 %	0 %	222147187
3363	NC_011989	TGT	2	6	199945	199950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147187
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3480	NC_011989	GCACGA	2	12	207040	207051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147195
3481	NC_011989	CCGCG	2	10	207183	207192	0 %	0 %	40 %	60 %	222147196
3482	NC_011989	GCCA	2	8	207247	207254	25 %	0 %	25 %	50 %	222147196
3483	NC_011989	GCC	2	6	207283	207288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147196
3484	NC_011989	CGAT	2	8	207306	207313	25 %	25 %	25 %	25 %	222147196
3485	NC_011989	GGC	2	6	207388	207393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147196
3486	NC_011989	AGA	2	6	207404	207409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147196
3487	NC_011989	CTTGTG	2	12	207436	207447	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	222147196
3488	NC_011989	GCC	2	6	207497	207502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147196
3489	NC_011989	ACA	2	6	207519	207524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147196
3490	NC_011989	GC	3	6	207571	207576	0 %	0 %	50 %	50 %	222147196
3491	NC_011989	GCC	2	6	207578	207583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147196
3492	NC_011989	GGC	2	6	207721	207726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147196
3493	NC_011989	TCG	2	6	207734	207739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147196
3494	NC_011989	GAC	2	6	207810	207815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147196
3495	NC_011989	CCG	2	6	207819	207824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147196
3496	NC_011989	AGCAC	2	10	207830	207839	40 %	0 %	20 %	40 %	222147196
3497	NC_011989	GAT	2	6	207853	207858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147196
3498	NC_011989	ACC	2	6	208095	208100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147197
3499	NC_011989	ACG	2	6	208116	208121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147197
3500	NC_011989	ACG	2	6	208167	208172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147197

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