MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011989	GGC	2	6	28874	28879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147046
502	NC_011989	TTG	2	6	29017	29022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147047
503	NC_011989	GCC	2	6	29091	29096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147047
504	NC_011989	AAG	2	6	29097	29102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147047
505	NC_011989	GAC	2	6	29305	29310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147048
506	NC_011989	CAGG	2	8	29317	29324	25 %	0 %	50 %	25 %	222147048
507	NC_011989	GGA	2	6	29332	29337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147048
508	NC_011989	TCG	2	6	29387	29392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
509	NC_011989	CGC	2	6	29421	29426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147048
510	NC_011989	CGG	2	6	29495	29500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147048
511	NC_011989	ATCT	2	8	29501	29508	25 %	50 %	0 %	25 %	222147048
512	NC_011989	AGC	2	6	29562	29567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147048
513	NC_011989	TAT	2	6	29608	29613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147048
514	NC_011989	CGGTGG	2	12	29628	29639	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222147048
515	NC_011989	CCA	2	6	29646	29651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147048
516	NC_011989	GC	3	6	29654	29659	0 %	0 %	50 %	50 %	222147048
517	NC_011989	CAC	2	6	29713	29718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147048
518	NC_011989	AACGC	2	10	29738	29747	40 %	0 %	20 %	40 %	222147048
519	NC_011989	ACA	2	6	29757	29762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147048
520	NC_011989	CGG	2	6	29799	29804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147048
521	NC_011989	CTG	2	6	29807	29812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
522	NC_011989	TGC	2	6	29886	29891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
523	NC_011989	CAT	2	6	29905	29910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147048
524	NC_011989	TGC	2	6	29949	29954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147048
525	NC_011989	CG	3	6	29958	29963	0 %	0 %	50 %	50 %	222147048
526	NC_011989	TTC	2	6	30005	30010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147048
527	NC_011989	CGA	2	6	30129	30134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147048
528	NC_011989	ATC	2	6	30258	30263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147048
529	NC_011989	CATT	2	8	30366	30373	25 %	50 %	0 %	25 %	222147049
530	NC_011989	CAA	2	6	30379	30384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147049
531	NC_011989	GT	3	6	30408	30413	0 %	50 %	50 %	0 %	222147049
532	NC_011989	CAGCGA	2	12	30426	30437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147049
533	NC_011989	CCG	2	6	30447	30452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147049
534	NC_011989	CGG	3	9	30487	30495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147049
535	NC_011989	ATC	2	6	30608	30613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147049
536	NC_011989	CGG	2	6	30622	30627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147049
537	NC_011989	TGC	2	6	30687	30692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147049
538	NC_011989	CAA	2	6	30763	30768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147049
539	NC_011989	CGT	2	6	30863	30868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147049
540	NC_011989	CGC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147050
541	NC_011989	TGG	2	6	31060	31065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147050
542	NC_011989	CGGCG	2	10	31077	31086	0 %	0 %	60 %	40 %	222147050
543	NC_011989	GGT	2	6	31092	31097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147050
544	NC_011989	GCT	2	6	31101	31106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147050
545	NC_011989	AGC	2	6	31110	31115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147050
546	NC_011989	CAA	2	6	31184	31189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147050
547	NC_011989	CTT	2	6	31195	31200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147050
548	NC_011989	GAA	2	6	31277	31282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147050
549	NC_011989	CGG	2	6	31291	31296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147050
550	NC_011989	TTG	2	6	31305	31310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147050
551	NC_011989	GCCC	2	8	31318	31325	0 %	0 %	25 %	75 %	222147050
552	NC_011989	ACC	2	6	31328	31333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147050
553	NC_011989	TCGC	2	8	31401	31408	0 %	25 %	25 %	50 %	222147050
554	NC_011989	GCA	2	6	31595	31600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
555	NC_011989	AGTC	2	8	31707	31714	25 %	25 %	25 %	25 %	222147051
556	NC_011989	CTT	2	6	31816	31821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147051
557	NC_011989	GA	3	6	31832	31837	50 %	0 %	50 %	0 %	222147051
558	NC_011989	GCC	2	6	31838	31843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
559	NC_011989	CAG	2	6	31846	31851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
560	NC_011989	CCG	2	6	31898	31903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
561	NC_011989	CCAG	2	8	31906	31913	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
562	NC_011989	CCAG	2	8	31920	31927	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
563	NC_011989	CGC	2	6	32043	32048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
564	NC_011989	GCCA	2	8	32056	32063	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
565	NC_011989	CGG	2	6	32125	32130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147051
566	NC_011989	ATG	3	9	32159	32167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147051
567	NC_011989	TGG	3	9	32322	32330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147051
568	NC_011989	CCG	2	6	32352	32357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147051
569	NC_011989	AGC	2	6	32379	32384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
570	NC_011989	TGCCGG	2	12	32475	32486	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222147051
571	NC_011989	GAA	2	6	32494	32499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147051
572	NC_011989	GCA	2	6	32565	32570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
573	NC_011989	CTT	2	6	32596	32601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147051
574	NC_011989	TAG	2	6	32615	32620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147051
575	NC_011989	TTG	2	6	32642	32647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147051
576	NC_011989	GCGCG	2	10	32754	32763	0 %	0 %	60 %	40 %	222147051
577	NC_011989	CAG	2	6	32776	32781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
578	NC_011989	GGC	2	6	32842	32847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147051
579	NC_011989	CCA	2	6	32855	32860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147051
580	NC_011989	GCCA	2	8	32887	32894	25 %	0 %	25 %	50 %	222147051
581	NC_011989	CCA	2	6	32959	32964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147051
582	NC_011989	GC	3	6	33048	33053	0 %	0 %	50 %	50 %	222147051
583	NC_011989	GCG	2	6	33104	33109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147051
584	NC_011989	GCA	2	6	33111	33116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147051
585	NC_011989	GGC	2	6	33133	33138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147051
586	NC_011989	CTC	2	6	33190	33195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147051
587	NC_011989	ATG	2	6	33197	33202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147051
588	NC_011989	TTG	2	6	33570	33575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147052
589	NC_011989	ACG	2	6	33576	33581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147052
590	NC_011989	GCC	2	6	33685	33690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147052
591	NC_011989	GCC	2	6	33747	33752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147052
592	NC_011989	CGA	2	6	33838	33843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147052
593	NC_011989	TCA	2	6	33846	33851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147052
594	NC_011989	CTG	2	6	33872	33877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147052
595	NC_011989	CG	3	6	33905	33910	0 %	0 %	50 %	50 %	222147052
596	NC_011989	CTG	2	6	33951	33956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147052
597	NC_011989	AGC	2	6	33960	33965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147052
598	NC_011989	GTG	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147052
599	NC_011989	GATG	2	8	34120	34127	25 %	25 %	50 %	0 %	222147052
600	NC_011989	AAG	2	6	34193	34198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147052
601	NC_011989	TGG	2	6	34206	34211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147052
602	NC_011989	TCT	2	6	34644	34649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147053
603	NC_011989	GCG	2	6	34658	34663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147053
604	NC_011989	CTG	2	6	34739	34744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
605	NC_011989	GCCTCG	2	12	34778	34789	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222147053
606	NC_011989	TGC	2	6	34917	34922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
607	NC_011989	GCC	2	6	34923	34928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147053
608	NC_011989	CTG	3	9	34979	34987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
609	NC_011989	TGC	2	6	35019	35024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
610	NC_011989	TGGC	2	8	35072	35079	0 %	25 %	50 %	25 %	222147053
611	NC_011989	TGC	2	6	35097	35102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
612	NC_011989	CGGG	2	8	35136	35143	0 %	0 %	75 %	25 %	222147053
613	NC_011989	GATC	2	8	35148	35155	25 %	25 %	25 %	25 %	222147053
614	NC_011989	TGA	2	6	35166	35171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147053
615	NC_011989	GTG	2	6	35198	35203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147053
616	NC_011989	CTG	3	9	35387	35395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
617	NC_011989	GCG	2	6	35419	35424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147053
618	NC_011989	CGGCG	2	10	35450	35459	0 %	0 %	60 %	40 %	222147053
619	NC_011989	GGA	2	6	35470	35475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147053
620	NC_011989	GC	3	6	35492	35497	0 %	0 %	50 %	50 %	222147053
621	NC_011989	GCC	2	6	35582	35587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147053
622	NC_011989	GTCA	2	8	35591	35598	25 %	25 %	25 %	25 %	222147053
623	NC_011989	AGC	2	6	35673	35678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147053
624	NC_011989	CCG	2	6	35707	35712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147053
625	NC_011989	GC	3	6	35768	35773	0 %	0 %	50 %	50 %	222147053
626	NC_011989	TGG	2	6	35817	35822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147053
627	NC_011989	GCA	3	9	35841	35849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147053
628	NC_011989	ATC	2	6	35909	35914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147053
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631	NC_011989	CGT	2	6	36034	36039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147053
632	NC_011989	ACCG	2	8	36107	36114	25 %	0 %	25 %	50 %	222147053
633	NC_011989	TGCA	2	8	36305	36312	25 %	25 %	25 %	25 %	222147054
634	NC_011989	CCT	2	6	36387	36392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147054
635	NC_011989	CGA	2	6	36438	36443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147054
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642	NC_011989	GGA	2	6	37212	37217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147055
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645	NC_011989	GAT	2	6	37267	37272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147055
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648	NC_011989	GCG	2	6	37409	37414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147055
649	NC_011989	TCG	2	6	37436	37441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147055
650	NC_011989	GCCG	2	8	37453	37460	0 %	0 %	50 %	50 %	222147055
651	NC_011989	CCT	2	6	37522	37527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222147056
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665	NC_011989	TGG	2	6	38332	38337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147057
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684	NC_011989	GAT	2	6	39073	39078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147057
685	NC_011989	CTG	2	6	39080	39085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147057
686	NC_011989	TGA	2	6	39138	39143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147057
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752	NC_011989	TGC	2	6	43266	43271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147059
753	NC_011989	CT	3	6	43338	43343	0 %	50 %	0 %	50 %	222147059
754	NC_011989	GAT	2	6	43474	43479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147059
755	NC_011989	CGG	2	6	43485	43490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147059
756	NC_011989	GCT	2	6	43555	43560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147059
757	NC_011989	TGA	2	6	43600	43605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147059
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773	NC_011989	GGT	2	6	44476	44481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147060
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1000	NC_011989	GCA	2	6	57013	57018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147067

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