MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011989	CGA	2	6	466230	466235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147436
8002	NC_011989	TAT	2	6	466357	466362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147437
8003	NC_011989	AGAGA	2	10	466391	466400	60 %	0 %	40 %	0 %	222147437
8004	NC_011989	TTC	2	6	466497	466502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147437
8005	NC_011989	CAT	2	6	466529	466534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147437
8006	NC_011989	GCA	3	9	466567	466575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147437
8007	NC_011989	CGA	2	6	466604	466609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147437
8008	NC_011989	ACGC	2	8	466620	466627	25 %	0 %	25 %	50 %	222147437
8009	NC_011989	CAA	2	6	466680	466685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147437
8010	NC_011989	GC	3	6	466688	466693	0 %	0 %	50 %	50 %	222147437
8011	NC_011989	TGG	2	6	466963	466968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147438
8012	NC_011989	CGT	2	6	467128	467133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147438
8013	NC_011989	GAC	2	6	467150	467155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147438
8014	NC_011989	CGG	2	6	467158	467163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147438
8015	NC_011989	CTG	2	6	467212	467217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147438
8016	NC_011989	GCC	2	6	467279	467284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147439
8017	NC_011989	T	6	6	467318	467323	0 %	100 %	0 %	0 %	222147439
8018	NC_011989	GAT	2	6	467350	467355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147439
8019	NC_011989	GAT	2	6	467365	467370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147439
8020	NC_011989	CCA	2	6	467416	467421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147439
8021	NC_011989	TGCG	2	8	467511	467518	0 %	25 %	50 %	25 %	222147439
8022	NC_011989	TAT	2	6	467547	467552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147439
8023	NC_011989	CCCG	2	8	467553	467560	0 %	0 %	25 %	75 %	222147439
8024	NC_011989	GAT	2	6	467587	467592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147439
8025	NC_011989	GTC	2	6	467617	467622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147439
8026	NC_011989	GAA	2	6	467625	467630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147439
8027	NC_011989	CTT	2	6	467828	467833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147440
8028	NC_011989	GTT	2	6	467884	467889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147440
8029	NC_011989	TCA	2	6	467944	467949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147440
8030	NC_011989	A	6	6	467955	467960	100 %	0 %	0 %	0 %	222147440
8031	NC_011989	CCATG	2	10	467978	467987	20 %	20 %	20 %	40 %	222147440
8032	NC_011989	TCA	2	6	468052	468057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147440
8033	NC_011989	CGA	2	6	468122	468127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147440
8034	NC_011989	AAC	2	6	468139	468144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147440
8035	NC_011989	CAT	2	6	468267	468272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147440
8036	NC_011989	CTG	2	6	468276	468281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147440
8037	NC_011989	GCT	2	6	468332	468337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147440
8038	NC_011989	GGT	2	6	468339	468344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147440
8039	NC_011989	CAGC	2	8	468425	468432	25 %	0 %	25 %	50 %	222147440
8040	NC_011989	TAT	2	6	468653	468658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147441
8041	NC_011989	ACGG	2	8	468714	468721	25 %	0 %	50 %	25 %	222147441
8042	NC_011989	CTT	2	6	468728	468733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147441
8043	NC_011989	CTT	2	6	468852	468857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147441
8044	NC_011989	CT	3	6	468997	469002	0 %	50 %	0 %	50 %	222147441
8045	NC_011989	CGC	2	6	469046	469051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147441
8046	NC_011989	TCGC	2	8	469107	469114	0 %	25 %	25 %	50 %	222147441
8047	NC_011989	CTGG	2	8	469277	469284	0 %	25 %	50 %	25 %	222147441
8048	NC_011989	CAG	2	6	469403	469408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147442
8049	NC_011989	AT	3	6	469430	469435	50 %	50 %	0 %	0 %	222147442
8050	NC_011989	ATT	2	6	469453	469458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147442
8051	NC_011989	TCA	2	6	469463	469468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147442
8052	NC_011989	GAT	2	6	469477	469482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147442
8053	NC_011989	TTG	2	6	469511	469516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147442
8054	NC_011989	CTG	2	6	469517	469522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147442
8055	NC_011989	AGC	2	6	469589	469594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147442
8056	NC_011989	A	6	6	469724	469729	100 %	0 %	0 %	0 %	222147442
8057	NC_011989	GGT	2	6	469741	469746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147442
8058	NC_011989	CGC	3	9	469781	469789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147442
8059	NC_011989	TGT	2	6	469942	469947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147442
8060	NC_011989	ATT	2	6	469996	470001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147442
8061	NC_011989	T	6	6	470120	470125	0 %	100 %	0 %	0 %	222147442
8062	NC_011989	GATCA	2	10	470176	470185	40 %	20 %	20 %	20 %	222147442
8063	NC_011989	GCT	2	6	470188	470193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147442
8064	NC_011989	ATC	2	6	470224	470229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147442
8065	NC_011989	CCA	2	6	470542	470547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147443
8066	NC_011989	TTCA	2	8	470597	470604	25 %	50 %	0 %	25 %	222147443
8067	NC_011989	GCA	2	6	470636	470641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147443
8068	NC_011989	AAC	2	6	470642	470647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147443
8069	NC_011989	AAT	2	6	470801	470806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147443
8070	NC_011989	ACA	2	6	470835	470840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147443
8071	NC_011989	CGG	2	6	470893	470898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147443
8072	NC_011989	CTG	2	6	470923	470928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147443
8073	NC_011989	AT	3	6	471042	471047	50 %	50 %	0 %	0 %	222147443
8074	NC_011989	GAT	2	6	471050	471055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147443
8075	NC_011989	AAT	2	6	471079	471084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147443
8076	NC_011989	GC	3	6	471108	471113	0 %	0 %	50 %	50 %	222147443
8077	NC_011989	TTC	2	6	471188	471193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147443
8078	NC_011989	ACGG	3	12	471240	471251	25 %	0 %	50 %	25 %	222147443
8079	NC_011989	GCA	2	6	471274	471279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147443
8080	NC_011989	CCGC	2	8	471397	471404	0 %	0 %	25 %	75 %	222147443
8081	NC_011989	ATC	2	6	471536	471541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147443
8082	NC_011989	GCAGCT	2	12	471544	471555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222147443
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8084	NC_011989	TC	3	6	471575	471580	0 %	50 %	0 %	50 %	222147443
8085	NC_011989	TTG	2	6	471612	471617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147443
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8087	NC_011989	AAT	2	6	471723	471728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222147443
8088	NC_011989	ATC	2	6	471789	471794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147443
8089	NC_011989	GCC	2	6	472217	472222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147444
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8091	NC_011989	GGC	2	6	472313	472318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147444
8092	NC_011989	ACGA	2	8	472321	472328	50 %	0 %	25 %	25 %	222147444
8093	NC_011989	GCC	2	6	472574	472579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147444
8094	NC_011989	G	6	6	472765	472770	0 %	0 %	100 %	0 %	222147444
8095	NC_011989	CCAG	2	8	472774	472781	25 %	0 %	25 %	50 %	222147444
8096	NC_011989	GTG	2	6	472826	472831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147444
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8098	NC_011989	ATCC	2	8	472901	472908	25 %	25 %	0 %	50 %	222147444
8099	NC_011989	GCAC	2	8	473307	473314	25 %	0 %	25 %	50 %	222147445
8100	NC_011989	CAA	2	6	473417	473422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222147445
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8102	NC_011989	ACG	2	6	473475	473480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147445
8103	NC_011989	TGC	2	6	473535	473540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147445
8104	NC_011989	AG	3	6	473604	473609	50 %	0 %	50 %	0 %	222147445
8105	NC_011989	AGCG	2	8	473624	473631	25 %	0 %	50 %	25 %	222147445
8106	NC_011989	GA	3	6	473687	473692	50 %	0 %	50 %	0 %	222147445
8107	NC_011989	GAGG	2	8	473714	473721	25 %	0 %	75 %	0 %	222147445
8108	NC_011989	GAC	2	6	473744	473749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147445
8109	NC_011989	ACC	2	6	473829	473834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147445
8110	NC_011989	TGC	2	6	474069	474074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147445
8111	NC_011989	TTA	2	6	474552	474557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222147446
8112	NC_011989	CGG	2	6	474571	474576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147446
8113	NC_011989	AGGA	2	8	474606	474613	50 %	0 %	50 %	0 %	222147446
8114	NC_011989	CAC	2	6	474639	474644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147446
8115	NC_011989	TGA	2	6	474729	474734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147446
8116	NC_011989	TCG	2	6	474745	474750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147446
8117	NC_011989	GTT	2	6	474821	474826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147446
8118	NC_011989	CAC	2	6	474849	474854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147446
8119	NC_011989	GCT	3	9	474884	474892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147446
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8121	NC_011989	GCCC	2	8	476342	476349	0 %	0 %	25 %	75 %	222147447
8122	NC_011989	GTT	2	6	476375	476380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147447
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8483	NC_011989	GAT	2	6	498657	498662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147458
8484	NC_011989	GCT	2	6	498727	498732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147458
8485	NC_011989	TGC	2	6	498746	498751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147458
8486	NC_011989	GCGCGG	2	12	498835	498846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147458
8487	NC_011989	TGC	3	9	498869	498877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147458
8488	NC_011989	AGCA	2	8	499051	499058	50 %	0 %	25 %	25 %	222147458
8489	NC_011989	TGC	2	6	499065	499070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147458
8490	NC_011989	GCG	2	6	499101	499106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147458
8491	NC_011989	AGG	2	6	499238	499243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147458
8492	NC_011989	GCC	2	6	499297	499302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147458
8493	NC_011989	GATG	2	8	499305	499312	25 %	25 %	50 %	0 %	222147458
8494	NC_011989	A	7	7	499324	499330	100 %	0 %	0 %	0 %	222147458
8495	NC_011989	GGC	2	6	499335	499340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147458
8496	NC_011989	TGGC	2	8	499369	499376	0 %	25 %	50 %	25 %	222147458
8497	NC_011989	TGC	2	6	499396	499401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147458
8498	NC_011989	GCA	2	6	499428	499433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147458
8499	NC_011989	CAT	2	6	499455	499460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147458
8500	NC_011989	GCC	3	9	499486	499494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147458

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