MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_011988	GAAA	2	8	1208641	1208648	75 %	0 %	25 %	0 %	222107115
21002	NC_011988	ATT	2	6	1208660	1208665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107115
21003	NC_011988	TCT	2	6	1209161	1209166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107116
21004	NC_011988	GCG	2	6	1209167	1209172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107116
21005	NC_011988	CAG	2	6	1209184	1209189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107116
21006	NC_011988	GGC	2	6	1209214	1209219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107116
21007	NC_011988	CCG	2	6	1209281	1209286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107116
21008	NC_011988	GCC	2	6	1209295	1209300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107116
21009	NC_011988	AAG	2	6	1209329	1209334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107116
21010	NC_011988	GGC	2	6	1209361	1209366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107116
21011	NC_011988	GC	3	6	1209492	1209497	0 %	0 %	50 %	50 %	222107116
21012	NC_011988	GGC	2	6	1209610	1209615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107116
21013	NC_011988	CAG	2	6	1209829	1209834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107116
21014	NC_011988	CTT	2	6	1209856	1209861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107116
21015	NC_011988	CTG	2	6	1209883	1209888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107116
21016	NC_011988	CAT	2	6	1209977	1209982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107117
21017	NC_011988	CAT	2	6	1209998	1210003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107117
21018	NC_011988	AG	4	8	1210030	1210037	50 %	0 %	50 %	0 %	222107117
21019	NC_011988	GAT	2	6	1210061	1210066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107117
21020	NC_011988	CAT	2	6	1210082	1210087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107117
21021	NC_011988	GCC	2	6	1210094	1210099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107117
21022	NC_011988	GCCA	2	8	1210175	1210182	25 %	0 %	25 %	50 %	222107117
21023	NC_011988	TTG	2	6	1210191	1210196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107117
21024	NC_011988	TCA	2	6	1210210	1210215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107117
21025	NC_011988	TGGC	2	8	1210287	1210294	0 %	25 %	50 %	25 %	222107117
21026	NC_011988	GCC	2	6	1210301	1210306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107117
21027	NC_011988	ATG	3	9	1210307	1210315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107117
21028	NC_011988	TGCG	2	8	1210340	1210347	0 %	25 %	50 %	25 %	222107117
21029	NC_011988	GTAG	2	8	1210374	1210381	25 %	25 %	50 %	0 %	222107118
21030	NC_011988	CGG	2	6	1210451	1210456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107118
21031	NC_011988	CCAG	2	8	1210503	1210510	25 %	0 %	25 %	50 %	222107118
21032	NC_011988	ATG	2	6	1210511	1210516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107118
21033	NC_011988	AAG	2	6	1210556	1210561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107118
21034	NC_011988	GAAC	2	8	1210611	1210618	50 %	0 %	25 %	25 %	222107118
21035	NC_011988	CCAG	2	8	1210668	1210675	25 %	0 %	25 %	50 %	222107118
21036	NC_011988	TTG	2	6	1210691	1210696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107118
21037	NC_011988	TTC	2	6	1210697	1210702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107118
21038	NC_011988	CAG	2	6	1210744	1210749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107118
21039	NC_011988	TCA	2	6	1210872	1210877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107118
21040	NC_011988	TGC	2	6	1210902	1210907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107118
21041	NC_011988	GAT	2	6	1210914	1210919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107118
21042	NC_011988	CCTT	2	8	1210984	1210991	0 %	50 %	0 %	50 %	222107119
21043	NC_011988	CAC	2	6	1211024	1211029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107119
21044	NC_011988	CGG	2	6	1211035	1211040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107119
21045	NC_011988	CGA	2	6	1211089	1211094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107119
21046	NC_011988	ACC	2	6	1211119	1211124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107119
21047	NC_011988	TTC	2	6	1211193	1211198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107119
21048	NC_011988	CAG	2	6	1211222	1211227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107119
21049	NC_011988	CTT	2	6	1211246	1211251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107119
21050	NC_011988	ACA	2	6	1211280	1211285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107119
21051	NC_011988	GAA	2	6	1211319	1211324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107119
21052	NC_011988	GAAG	2	8	1211417	1211424	50 %	0 %	50 %	0 %	222107119
21053	NC_011988	CAGG	2	8	1211441	1211448	25 %	0 %	50 %	25 %	222107119
21054	NC_011988	GCG	2	6	1211457	1211462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107119
21055	NC_011988	ATG	2	6	1211463	1211468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107119
21056	NC_011988	TCG	2	6	1211490	1211495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107119
21057	NC_011988	GCG	2	6	1211507	1211512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107119
21058	NC_011988	CCAG	2	8	1211569	1211576	25 %	0 %	25 %	50 %	222107119
21059	NC_011988	CGC	2	6	1211671	1211676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107119
21060	NC_011988	GAT	2	6	1211678	1211683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107119
21061	NC_011988	GAA	2	6	1211752	1211757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107119
21062	NC_011988	GCC	2	6	1211768	1211773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107119
21063	NC_011988	GAT	2	6	1211888	1211893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107119
21064	NC_011988	GAA	2	6	1211909	1211914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107119
21065	NC_011988	GAA	2	6	1211945	1211950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107119
21066	NC_011988	AGGAC	2	10	1211971	1211980	40 %	0 %	40 %	20 %	222107119
21067	NC_011988	CAGATC	2	12	1212108	1212119	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222107119
21068	NC_011988	CAT	2	6	1212131	1212136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107119
21069	NC_011988	GCC	2	6	1212143	1212148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107119
21070	NC_011988	GAA	2	6	1212161	1212166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107119
21071	NC_011988	CAG	2	6	1212194	1212199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107119
21072	NC_011988	TCA	2	6	1212283	1212288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107119
21073	NC_011988	GC	3	6	1212303	1212308	0 %	0 %	50 %	50 %	222107119
21074	NC_011988	TGG	2	6	1212319	1212324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107119
21075	NC_011988	ACGCCG	2	12	1212393	1212404	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222107119
21076	NC_011988	GTG	2	6	1212427	1212432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107119
21077	NC_011988	AGCC	2	8	1212441	1212448	25 %	0 %	25 %	50 %	222107119
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21081	NC_011988	ACG	2	6	1212573	1212578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107119
21082	NC_011988	TCA	2	6	1212583	1212588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107119
21083	NC_011988	GAA	2	6	1212614	1212619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107119
21084	NC_011988	GCG	2	6	1212664	1212669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107119
21085	NC_011988	CTG	2	6	1212704	1212709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107119
21086	NC_011988	CAT	2	6	1212716	1212721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107119
21087	NC_011988	ACAT	2	8	1212768	1212775	50 %	25 %	0 %	25 %	222107119
21088	NC_011988	TCT	2	6	1212784	1212789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107119
21089	NC_011988	CATT	2	8	1212810	1212817	25 %	50 %	0 %	25 %	222107119
21090	NC_011988	CAT	2	6	1213299	1213304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107120
21091	NC_011988	CAT	2	6	1213314	1213319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107120
21092	NC_011988	AC	3	6	1213348	1213353	50 %	0 %	0 %	50 %	222107120
21093	NC_011988	TGA	2	6	1213358	1213363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107120
21094	NC_011988	CCTT	2	8	1213585	1213592	0 %	50 %	0 %	50 %	222107120
21095	NC_011988	TCA	2	6	1213673	1213678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107120
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21097	NC_011988	CGA	2	6	1213790	1213795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107120
21098	NC_011988	CGG	2	6	1213820	1213825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107120
21099	NC_011988	GCGG	2	8	1213856	1213863	0 %	0 %	75 %	25 %	222107120
21100	NC_011988	ATG	2	6	1213915	1213920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107120
21101	NC_011988	CCG	2	6	1213985	1213990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107120
21102	NC_011988	CAG	2	6	1214031	1214036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107120
21103	NC_011988	ACC	2	6	1214080	1214085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107120
21104	NC_011988	TGC	2	6	1214095	1214100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107120
21105	NC_011988	CAC	2	6	1214127	1214132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107120
21106	NC_011988	GAT	2	6	1214669	1214674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107121
21107	NC_011988	ACG	2	6	1214691	1214696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107121
21108	NC_011988	GGC	2	6	1214738	1214743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107121
21109	NC_011988	GTT	2	6	1214758	1214763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107121
21110	NC_011988	ATA	2	6	1214775	1214780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107121
21111	NC_011988	GCAG	2	8	1214830	1214837	25 %	0 %	50 %	25 %	222107121
21112	NC_011988	AGC	2	6	1214928	1214933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107121
21113	NC_011988	TGG	2	6	1214949	1214954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107121
21114	NC_011988	AGG	2	6	1214976	1214981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107121
21115	NC_011988	AGGGC	2	10	1215118	1215127	20 %	0 %	60 %	20 %	222107121
21116	NC_011988	AC	3	6	1215171	1215176	50 %	0 %	0 %	50 %	222107121
21117	NC_011988	CGA	2	6	1215218	1215223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107122
21118	NC_011988	GCG	2	6	1215239	1215244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107122
21119	NC_011988	GCG	3	9	1215282	1215290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107122
21120	NC_011988	GAT	2	6	1215293	1215298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107122
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21231	NC_011988	CAG	2	6	1221907	1221912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107128
21232	NC_011988	CGC	2	6	1221942	1221947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107128
21233	NC_011988	TTG	2	6	1222070	1222075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107128
21234	NC_011988	GCA	2	6	1222148	1222153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107128
21235	NC_011988	GTCGTG	2	12	1222216	1222227	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	222107128
21236	NC_011988	GCGG	2	8	1222272	1222279	0 %	0 %	75 %	25 %	222107128
21237	NC_011988	GGA	2	6	1222362	1222367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222107128
21238	NC_011988	CAG	2	6	1222438	1222443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107128
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21241	NC_011988	CTG	2	6	1222627	1222632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107128
21242	NC_011988	T	6	6	1222639	1222644	0 %	100 %	0 %	0 %	222107128
21243	NC_011988	GTC	2	6	1222648	1222653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107128
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21253	NC_011988	GCG	2	6	1223095	1223100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107128
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21344	NC_011988	GGCT	2	8	1228659	1228666	0 %	25 %	50 %	25 %	222107134
21345	NC_011988	GC	3	6	1228687	1228692	0 %	0 %	50 %	50 %	222107134
21346	NC_011988	CCA	2	6	1228703	1228708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107134
21347	NC_011988	ATA	2	6	1228713	1228718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222107134
21348	NC_011988	CAAT	2	8	1228724	1228731	50 %	25 %	0 %	25 %	222107134
21349	NC_011988	CCT	2	6	1228784	1228789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222107134
21350	NC_011988	GGC	2	6	1228827	1228832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107134
21351	NC_011988	GGC	2	6	1228878	1228883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107134
21352	NC_011988	GAT	2	6	1228890	1228895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107134
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21354	NC_011988	CCA	2	6	1229066	1229071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107134
21355	NC_011988	TGGG	2	8	1229107	1229114	0 %	25 %	75 %	0 %	222107134
21356	NC_011988	GCGT	2	8	1229139	1229146	0 %	25 %	50 %	25 %	222107134
21357	NC_011988	CGC	2	6	1229208	1229213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107134
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21359	NC_011988	GCG	2	6	1229270	1229275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107134
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21362	NC_011988	GCC	2	6	1229380	1229385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107134
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21364	NC_011988	CGAG	2	8	1229435	1229442	25 %	0 %	50 %	25 %	222107134
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21366	NC_011988	GCG	2	6	1229491	1229496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107134
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21368	NC_011988	TGC	2	6	1229553	1229558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107134
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21373	NC_011988	GC	3	6	1229870	1229875	0 %	0 %	50 %	50 %	222107135
21374	NC_011988	AG	4	8	1229910	1229917	50 %	0 %	50 %	0 %	222107135
21375	NC_011988	GCA	2	6	1229940	1229945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107135
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21378	NC_011988	TGC	2	6	1230161	1230166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107135
21379	NC_011988	GAC	2	6	1230184	1230189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107135
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21382	NC_011988	GTC	2	6	1230238	1230243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107135
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21450	NC_011988	CAT	2	6	1233870	1233875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107139
21451	NC_011988	GGCG	2	8	1233876	1233883	0 %	0 %	75 %	25 %	222107139
21452	NC_011988	GCT	2	6	1233891	1233896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21453	NC_011988	GCG	2	6	1233922	1233927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107139
21454	NC_011988	GCG	2	6	1233953	1233958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107139
21455	NC_011988	AT	3	6	1233984	1233989	50 %	50 %	0 %	0 %	222107139
21456	NC_011988	GCC	2	6	1234081	1234086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107139
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21458	NC_011988	TAT	2	6	1234192	1234197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222107139
21459	NC_011988	TCG	2	6	1234205	1234210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21460	NC_011988	CGA	2	6	1234224	1234229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21461	NC_011988	CCA	2	6	1234259	1234264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107139
21462	NC_011988	AAG	2	6	1234294	1234299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107139
21463	NC_011988	TGCC	2	8	1234397	1234404	0 %	25 %	25 %	50 %	222107139
21464	NC_011988	ACA	2	6	1234415	1234420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107139
21465	NC_011988	TGA	2	6	1234466	1234471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107139
21466	NC_011988	GAT	2	6	1234617	1234622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107139
21467	NC_011988	GAC	2	6	1234680	1234685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21468	NC_011988	GAA	2	6	1234819	1234824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222107139
21469	NC_011988	GAC	2	6	1234833	1234838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21470	NC_011988	CGC	2	6	1234853	1234858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107139
21471	NC_011988	GGT	2	6	1234936	1234941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107139
21472	NC_011988	TGA	2	6	1234982	1234987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107139
21473	NC_011988	TGT	2	6	1235004	1235009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222107139
21474	NC_011988	CTG	2	6	1235027	1235032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21475	NC_011988	GCT	2	6	1235053	1235058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107139
21476	NC_011988	CAA	2	6	1235197	1235202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222107140
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21478	NC_011988	TCA	2	6	1235232	1235237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222107140
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21480	NC_011988	GCT	2	6	1235311	1235316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107140
21481	NC_011988	GAT	2	6	1235320	1235325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107140
21482	NC_011988	GCG	2	6	1235349	1235354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107140
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21484	NC_011988	GCA	2	6	1235560	1235565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107140
21485	NC_011988	CGG	2	6	1235584	1235589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222107140
21486	NC_011988	CGC	2	6	1235674	1235679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107140
21487	NC_011988	GAT	2	6	1235737	1235742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107140
21488	NC_011988	TCG	2	6	1235790	1235795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222107140
21489	NC_011988	TGG	2	6	1235803	1235808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222107140
21490	NC_011988	TGTT	2	8	1235862	1235869	0 %	75 %	25 %	0 %	222107140
21491	NC_011988	ACCAG	2	10	1236342	1236351	40 %	0 %	20 %	40 %	222107141
21492	NC_011988	GCC	2	6	1236359	1236364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107141
21493	NC_011988	CAC	2	6	1236382	1236387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222107141
21494	NC_011988	ATG	2	6	1236407	1236412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222107141
21495	NC_011988	GA	3	6	1236497	1236502	50 %	0 %	50 %	0 %	222107141
21496	NC_011988	TTC	2	6	1236517	1236522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222107141
21497	NC_011988	ACG	2	6	1236650	1236655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107141
21498	NC_011988	CCG	2	6	1236794	1236799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222107141
21499	NC_011988	A	6	6	1236856	1236861	100 %	0 %	0 %	0 %	222107141
21500	NC_011988	CGA	2	6	1236867	1236872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222107141

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