MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_011988	GAT	2	6	1001549	1001554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106941
17502	NC_011988	TGGC	2	8	1001649	1001656	0 %	25 %	50 %	25 %	222106941
17503	NC_011988	TGA	2	6	1001668	1001673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106941
17504	NC_011988	TCT	2	6	1001736	1001741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106941
17505	NC_011988	GTTG	2	8	1001776	1001783	0 %	50 %	50 %	0 %	222106941
17506	NC_011988	AGT	2	6	1001806	1001811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106941
17507	NC_011988	GCC	2	6	1001957	1001962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106941
17508	NC_011988	GTC	2	6	1002009	1002014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106941
17509	NC_011988	GCT	2	6	1002113	1002118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106941
17510	NC_011988	GA	3	6	1002120	1002125	50 %	0 %	50 %	0 %	222106941
17511	NC_011988	GGC	2	6	1002145	1002150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106941
17512	NC_011988	TCC	2	6	1002174	1002179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106941
17513	NC_011988	CAT	2	6	1002196	1002201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106941
17514	NC_011988	GC	3	6	1002203	1002208	0 %	0 %	50 %	50 %	222106941
17515	NC_011988	CTG	2	6	1002233	1002238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106941
17516	NC_011988	GAA	2	6	1002347	1002352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106941
17517	NC_011988	ATA	2	6	1002679	1002684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106942
17518	NC_011988	GAC	2	6	1002709	1002714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
17519	NC_011988	TGA	2	6	1002860	1002865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106942
17520	NC_011988	TGA	2	6	1002894	1002899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106942
17521	NC_011988	CAG	2	6	1002973	1002978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
17522	NC_011988	GCGCC	2	10	1003064	1003073	0 %	0 %	40 %	60 %	222106942
17523	NC_011988	TGCA	2	8	1003111	1003118	25 %	25 %	25 %	25 %	222106942
17524	NC_011988	CAG	2	6	1003201	1003206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
17525	NC_011988	GC	4	8	1003239	1003246	0 %	0 %	50 %	50 %	222106942
17526	NC_011988	CGGTC	2	10	1003272	1003281	0 %	20 %	40 %	40 %	222106942
17527	NC_011988	TCA	2	6	1003293	1003298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106942
17528	NC_011988	ATC	2	6	1003325	1003330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106942
17529	NC_011988	TCG	2	6	1003355	1003360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106942
17530	NC_011988	CCA	2	6	1003398	1003403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106942
17531	NC_011988	AATCG	2	10	1003450	1003459	40 %	20 %	20 %	20 %	222106942
17532	NC_011988	TTC	2	6	1003468	1003473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106942
17533	NC_011988	CAG	2	6	1003564	1003569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106942
17534	NC_011988	GAA	2	6	1003846	1003851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106943
17535	NC_011988	CGGTA	2	10	1003972	1003981	20 %	20 %	40 %	20 %	222106943
17536	NC_011988	GGTT	2	8	1004061	1004068	0 %	50 %	50 %	0 %	222106943
17537	NC_011988	CCA	2	6	1004136	1004141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106943
17538	NC_011988	GAT	2	6	1004179	1004184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106943
17539	NC_011988	ATG	2	6	1004186	1004191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106943
17540	NC_011988	CGG	2	6	1004220	1004225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106943
17541	NC_011988	GTCGCT	2	12	1004248	1004259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106943
17542	NC_011988	CAG	2	6	1004311	1004316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106943
17543	NC_011988	GGA	2	6	1004336	1004341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106943
17544	NC_011988	CTG	2	6	1004462	1004467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106943
17545	NC_011988	GCG	2	6	1004513	1004518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106943
17546	NC_011988	AGC	2	6	1004587	1004592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106943
17547	NC_011988	GGT	2	6	1004599	1004604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106943
17548	NC_011988	GAG	2	6	1005470	1005475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106944
17549	NC_011988	CTG	2	6	1005500	1005505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106944
17550	NC_011988	TGC	2	6	1005517	1005522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106944
17551	NC_011988	GGC	2	6	1005529	1005534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106944
17552	NC_011988	GC	3	6	1005749	1005754	0 %	0 %	50 %	50 %	222106945
17553	NC_011988	TCG	2	6	1005789	1005794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106945
17554	NC_011988	GGC	2	6	1005869	1005874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106945
17555	NC_011988	TGC	3	9	1005910	1005918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106945
17556	NC_011988	AAT	2	6	1005968	1005973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106945
17557	NC_011988	GA	3	6	1006107	1006112	50 %	0 %	50 %	0 %	222106945
17558	NC_011988	T	6	6	1006159	1006164	0 %	100 %	0 %	0 %	222106945
17559	NC_011988	TTAC	2	8	1006318	1006325	25 %	50 %	0 %	25 %	222106946
17560	NC_011988	GC	3	6	1006342	1006347	0 %	0 %	50 %	50 %	222106946
17561	NC_011988	CCG	2	6	1006371	1006376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106946
17562	NC_011988	CGA	2	6	1006383	1006388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106946
17563	NC_011988	GAA	2	6	1006470	1006475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222106946
17564	NC_011988	GC	3	6	1006486	1006491	0 %	0 %	50 %	50 %	222106946
17565	NC_011988	TGA	2	6	1006503	1006508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106946
17566	NC_011988	GAC	2	6	1006513	1006518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106946
17567	NC_011988	CCGG	2	8	1006568	1006575	0 %	0 %	50 %	50 %	222106946
17568	NC_011988	CGA	2	6	1006626	1006631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106946
17569	NC_011988	CCA	2	6	1006719	1006724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106946
17570	NC_011988	CAG	2	6	1006768	1006773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106947
17571	NC_011988	CGG	2	6	1006794	1006799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106947
17572	NC_011988	CGAC	2	8	1006806	1006813	25 %	0 %	25 %	50 %	222106947
17573	NC_011988	GCT	2	6	1006867	1006872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106947
17574	NC_011988	GAGG	2	8	1006933	1006940	25 %	0 %	75 %	0 %	222106947
17575	NC_011988	GCT	2	6	1006977	1006982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106947
17576	NC_011988	TGCTTC	2	12	1007011	1007022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222106947
17577	NC_011988	CGA	2	6	1007419	1007424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106948
17578	NC_011988	CCGA	2	8	1007502	1007509	25 %	0 %	25 %	50 %	222106948
17579	NC_011988	GA	3	6	1007508	1007513	50 %	0 %	50 %	0 %	222106948
17580	NC_011988	CGA	2	6	1007515	1007520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106948
17581	NC_011988	GCA	2	6	1007644	1007649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17582	NC_011988	GCA	2	6	1007653	1007658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17583	NC_011988	CCA	2	6	1007782	1007787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106949
17584	NC_011988	TTG	2	6	1007847	1007852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106949
17585	NC_011988	GCC	2	6	1007930	1007935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106949
17586	NC_011988	AAT	2	6	1007974	1007979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106949
17587	NC_011988	GCT	2	6	1008040	1008045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17588	NC_011988	GC	3	6	1008072	1008077	0 %	0 %	50 %	50 %	222106949
17589	NC_011988	CGGG	2	8	1008133	1008140	0 %	0 %	75 %	25 %	222106949
17590	NC_011988	GCG	2	6	1008187	1008192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106949
17591	NC_011988	CAG	2	6	1008293	1008298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17592	NC_011988	TCG	2	6	1008340	1008345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17593	NC_011988	GCGG	2	8	1008407	1008414	0 %	0 %	75 %	25 %	222106949
17594	NC_011988	GCC	2	6	1008416	1008421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106949
17595	NC_011988	GTC	2	6	1008494	1008499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17596	NC_011988	GGC	2	6	1008517	1008522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106949
17597	NC_011988	CGG	2	6	1008574	1008579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106949
17598	NC_011988	CGG	2	6	1008586	1008591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106949
17599	NC_011988	GCC	2	6	1008683	1008688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106949
17600	NC_011988	GCC	2	6	1008821	1008826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106949
17601	NC_011988	CGA	2	6	1008931	1008936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106949
17602	NC_011988	AGG	2	6	1009083	1009088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106949
17603	NC_011988	GGTCCG	2	12	1009147	1009158	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222106949
17604	NC_011988	AGCTTG	2	12	1009185	1009196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222106949
17605	NC_011988	GC	3	6	1009245	1009250	0 %	0 %	50 %	50 %	222106949
17606	NC_011988	GGC	2	6	1009294	1009299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106950
17607	NC_011988	GCT	2	6	1009446	1009451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106950
17608	NC_011988	CAT	2	6	1009468	1009473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106950
17609	NC_011988	CCAG	2	8	1009474	1009481	25 %	0 %	25 %	50 %	222106950
17610	NC_011988	AGG	2	6	1009540	1009545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106950
17611	NC_011988	GCC	2	6	1009579	1009584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106950
17612	NC_011988	GCTGC	2	10	1009756	1009765	0 %	20 %	40 %	40 %	222106950
17613	NC_011988	TGA	2	6	1009854	1009859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106950
17614	NC_011988	ATG	2	6	1010087	1010092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106950
17615	NC_011988	ATG	2	6	1010264	1010269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106950
17616	NC_011988	CTG	2	6	1010529	1010534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106951
17617	NC_011988	GAC	2	6	1010621	1010626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106951
17618	NC_011988	CGA	2	6	1010706	1010711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106952
17619	NC_011988	GCG	2	6	1010742	1010747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106952
17620	NC_011988	ATG	3	9	1010789	1010797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106952
17621	NC_011988	AGC	2	6	1010807	1010812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106952
17622	NC_011988	CGG	2	6	1010826	1010831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106952
17623	NC_011988	GCC	2	6	1010840	1010845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106952
17624	NC_011988	GATG	2	8	1010922	1010929	25 %	25 %	50 %	0 %	222106952
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17626	NC_011988	ATG	2	6	1011005	1011010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106952
17627	NC_011988	ACTGA	2	10	1011032	1011041	40 %	20 %	20 %	20 %	222106952
17628	NC_011988	GCC	2	6	1011049	1011054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106952
17629	NC_011988	GGA	2	6	1011055	1011060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106952
17630	NC_011988	GTG	2	6	1011107	1011112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106952
17631	NC_011988	TGA	2	6	1011159	1011164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106952
17632	NC_011988	CTG	2	6	1011181	1011186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106952
17633	NC_011988	ATG	2	6	1011202	1011207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106952
17634	NC_011988	CGC	2	6	1011255	1011260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106952
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17637	NC_011988	GGC	2	6	1011412	1011417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106952
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17639	NC_011988	GC	3	6	1011500	1011505	0 %	0 %	50 %	50 %	222106952
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17642	NC_011988	GCC	2	6	1011599	1011604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106952
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17644	NC_011988	TTG	2	6	1011812	1011817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106952
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17647	NC_011988	CGC	2	6	1012013	1012018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106952
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17650	NC_011988	CCTG	2	8	1012139	1012146	0 %	25 %	25 %	50 %	222106952
17651	NC_011988	GCTG	2	8	1012224	1012231	0 %	25 %	50 %	25 %	222106952
17652	NC_011988	CTG	2	6	1012275	1012280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106952
17653	NC_011988	GCG	2	6	1012323	1012328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106952
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17846	NC_011988	CGC	2	6	1022113	1022118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106958
17847	NC_011988	GCC	2	6	1022124	1022129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106958
17848	NC_011988	GGGGC	2	10	1022132	1022141	0 %	0 %	80 %	20 %	222106958
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17850	NC_011988	GCG	2	6	1022373	1022378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106959
17851	NC_011988	CTG	2	6	1022391	1022396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106959
17852	NC_011988	CACGG	2	10	1022423	1022432	20 %	0 %	40 %	40 %	222106959
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17866	NC_011988	TTC	2	6	1023042	1023047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106959
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17868	NC_011988	TTA	2	6	1023155	1023160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106959
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17874	NC_011988	GCT	2	6	1023338	1023343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106959
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17955	NC_011988	GCGG	2	8	1028335	1028342	0 %	0 %	75 %	25 %	222106961
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17958	NC_011988	TGC	2	6	1028486	1028491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106962
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17960	NC_011988	GCG	2	6	1028607	1028612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106962
17961	NC_011988	TGGC	2	8	1028625	1028632	0 %	25 %	50 %	25 %	222106962
17962	NC_011988	GCGG	2	8	1028767	1028774	0 %	0 %	75 %	25 %	222106962
17963	NC_011988	GC	3	6	1028811	1028816	0 %	0 %	50 %	50 %	222106962
17964	NC_011988	GGAA	2	8	1028868	1028875	50 %	0 %	50 %	0 %	222106962
17965	NC_011988	TGC	2	6	1028891	1028896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106962
17966	NC_011988	CCG	2	6	1028943	1028948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106962
17967	NC_011988	AAT	2	6	1028956	1028961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106962
17968	NC_011988	CTG	2	6	1029098	1029103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106962
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17981	NC_011988	CT	3	6	1029776	1029781	0 %	50 %	0 %	50 %	222106963
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18000	NC_011988	GCGG	2	8	1030682	1030689	0 %	0 %	75 %	25 %	222106964

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