MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 22342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_011988	AAT	2	6	633915	633920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106637
11003	NC_011988	AT	3	6	634013	634018	50 %	50 %	0 %	0 %	222106637
11004	NC_011988	AAT	2	6	634320	634325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106638
11005	NC_011988	CAAA	2	8	634336	634343	75 %	0 %	0 %	25 %	222106638
11006	NC_011988	CTGG	2	8	634368	634375	0 %	25 %	50 %	25 %	222106638
11007	NC_011988	GCC	2	6	634512	634517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106638
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11009	NC_011988	CGG	2	6	634728	634733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106639
11010	NC_011988	TACA	2	8	634750	634757	50 %	25 %	0 %	25 %	222106639
11011	NC_011988	TC	3	6	634804	634809	0 %	50 %	0 %	50 %	222106639
11012	NC_011988	CTG	2	6	634927	634932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106639
11013	NC_011988	GCG	2	6	634994	634999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106639
11014	NC_011988	CAC	2	6	635021	635026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106639
11015	NC_011988	GATG	2	8	635043	635050	25 %	25 %	50 %	0 %	222106639
11016	NC_011988	CAGA	2	8	635056	635063	50 %	0 %	25 %	25 %	222106639
11017	NC_011988	GGCA	2	8	635154	635161	25 %	0 %	50 %	25 %	222106639
11018	NC_011988	GGC	2	6	635227	635232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106639
11019	NC_011988	ACC	2	6	635242	635247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106639
11020	NC_011988	TCG	2	6	635252	635257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106639
11021	NC_011988	TCGG	2	8	635361	635368	0 %	25 %	50 %	25 %	222106639
11022	NC_011988	TGGGG	2	10	635408	635417	0 %	20 %	80 %	0 %	222106639
11023	NC_011988	AGC	2	6	635480	635485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106639
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11025	NC_011988	TTTGA	2	10	635532	635541	20 %	60 %	20 %	0 %	222106639
11026	NC_011988	AAT	2	6	635575	635580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222106640
11027	NC_011988	TTG	2	6	635628	635633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106640
11028	NC_011988	A	6	6	635659	635664	100 %	0 %	0 %	0 %	222106640
11029	NC_011988	TGA	2	6	635668	635673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106640
11030	NC_011988	ATT	2	6	635745	635750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222106640
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11032	NC_011988	GGC	2	6	635795	635800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106640
11033	NC_011988	GCC	2	6	635842	635847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106640
11034	NC_011988	CCTCAG	2	12	635881	635892	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106640
11035	NC_011988	CGT	2	6	635959	635964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
11036	NC_011988	CGC	2	6	635997	636002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106640
11037	NC_011988	TCG	2	6	636081	636086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
11038	NC_011988	GGA	2	6	636115	636120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106640
11039	NC_011988	GTC	2	6	636149	636154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
11040	NC_011988	GGC	2	6	636229	636234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106640
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11044	NC_011988	CGA	2	6	636379	636384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106640
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11046	NC_011988	CTG	2	6	636428	636433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
11047	NC_011988	CG	3	6	636534	636539	0 %	0 %	50 %	50 %	222106640
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11051	NC_011988	CGG	2	6	636633	636638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106640
11052	NC_011988	ATG	2	6	636693	636698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106640
11053	NC_011988	TCT	2	6	636701	636706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106640
11054	NC_011988	GCA	2	6	636755	636760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106640
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11056	NC_011988	TGG	2	6	636955	636960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106640
11057	NC_011988	GCT	2	6	637064	637069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
11058	NC_011988	GGCCT	2	10	637114	637123	0 %	20 %	40 %	40 %	222106640
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11063	NC_011988	GCA	2	6	637330	637335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106640
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11068	NC_011988	CGCA	2	8	637505	637512	25 %	0 %	25 %	50 %	222106640
11069	NC_011988	GCTG	2	8	637557	637564	0 %	25 %	50 %	25 %	222106640
11070	NC_011988	TGGC	2	8	637593	637600	0 %	25 %	50 %	25 %	222106640
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11102	NC_011988	CT	3	6	639340	639345	0 %	50 %	0 %	50 %	222106640
11103	NC_011988	GCA	2	6	639475	639480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106640
11104	NC_011988	GCT	2	6	639482	639487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
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11108	NC_011988	CGG	2	6	639822	639827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106640
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11110	NC_011988	CTG	2	6	639837	639842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
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11119	NC_011988	CTG	2	6	640191	640196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106640
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11237	NC_011988	ATC	2	6	646640	646645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106641
11238	NC_011988	ACC	2	6	646648	646653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106641
11239	NC_011988	CAC	2	6	646655	646660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106641
11240	NC_011988	ACC	2	6	646681	646686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106641
11241	NC_011988	GATGT	2	10	646744	646753	20 %	40 %	40 %	0 %	222106641
11242	NC_011988	GCGGG	2	10	646867	646876	0 %	0 %	80 %	20 %	222106641
11243	NC_011988	GTG	2	6	646904	646909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
11244	NC_011988	CGA	2	6	646911	646916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
11245	NC_011988	TCA	2	6	647021	647026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106641
11246	NC_011988	GC	3	6	647052	647057	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
11247	NC_011988	AAACC	2	10	647087	647096	60 %	0 %	0 %	40 %	222106641
11248	NC_011988	TTG	2	6	647197	647202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106641
11249	NC_011988	GAC	3	9	647218	647226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
11250	NC_011988	CAGC	2	8	647254	647261	25 %	0 %	25 %	50 %	222106641
11251	NC_011988	CAGCGC	2	12	647392	647403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222106641
11252	NC_011988	GCG	2	6	647530	647535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106641
11253	NC_011988	TGCGCC	2	12	647577	647588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222106641
11254	NC_011988	GC	3	6	647592	647597	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
11255	NC_011988	TGC	2	6	647624	647629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
11256	NC_011988	GC	3	6	647723	647728	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
11257	NC_011988	GCC	2	6	647775	647780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
11258	NC_011988	TTC	2	6	647785	647790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106641
11259	NC_011988	CG	3	6	647795	647800	0 %	0 %	50 %	50 %	222106641
11260	NC_011988	ACA	2	6	647848	647853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106641
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11262	NC_011988	GCC	2	6	647901	647906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
11263	NC_011988	TGC	2	6	647939	647944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
11264	NC_011988	GCT	2	6	647952	647957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
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11266	NC_011988	CTG	2	6	648100	648105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
11267	NC_011988	TTC	3	9	648106	648114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106641
11268	NC_011988	TTC	2	6	648175	648180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106641
11269	NC_011988	TGG	3	9	648201	648209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106641
11270	NC_011988	TCA	2	6	648215	648220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106641
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11274	NC_011988	GCA	2	6	648348	648353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106641
11275	NC_011988	GCC	2	6	648381	648386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106641
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11277	NC_011988	TGA	2	6	648398	648403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106641
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11280	NC_011988	GCT	2	6	648555	648560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
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11282	NC_011988	CA	3	6	648624	648629	50 %	0 %	0 %	50 %	222106641
11283	NC_011988	CGTG	2	8	648648	648655	0 %	25 %	50 %	25 %	222106641
11284	NC_011988	TTCA	2	8	648697	648704	25 %	50 %	0 %	25 %	222106641
11285	NC_011988	CTG	2	6	648715	648720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106641
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11324	NC_011988	TCG	2	6	651022	651027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106642
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11338	NC_011988	CGGG	2	8	651808	651815	0 %	0 %	75 %	25 %	222106643
11339	NC_011988	TGG	2	6	651820	651825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106643
11340	NC_011988	GC	3	6	651849	651854	0 %	0 %	50 %	50 %	222106643
11341	NC_011988	CTGG	2	8	651927	651934	0 %	25 %	50 %	25 %	222106643
11342	NC_011988	GCGCA	2	10	651942	651951	20 %	0 %	40 %	40 %	222106643
11343	NC_011988	GCT	2	6	651968	651973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11344	NC_011988	CAA	2	6	652031	652036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222106643
11345	NC_011988	GGTC	2	8	652094	652101	0 %	25 %	50 %	25 %	222106643
11346	NC_011988	CGG	2	6	652156	652161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
11347	NC_011988	GGGT	2	8	652300	652307	0 %	25 %	75 %	0 %	222106643
11348	NC_011988	GGCGAA	2	12	652308	652319	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222106643
11349	NC_011988	TCA	2	6	652351	652356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106643
11350	NC_011988	GGC	2	6	652440	652445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
11351	NC_011988	CTG	2	6	652464	652469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11352	NC_011988	TCCG	2	8	652537	652544	0 %	25 %	25 %	50 %	222106643
11353	NC_011988	GGC	3	9	652559	652567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
11354	NC_011988	CAG	2	6	652595	652600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11355	NC_011988	AT	3	6	652709	652714	50 %	50 %	0 %	0 %	222106643
11356	NC_011988	CAAT	2	8	652751	652758	50 %	25 %	0 %	25 %	222106643
11357	NC_011988	TCG	2	6	652845	652850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11358	NC_011988	TTG	2	6	652917	652922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222106643
11359	NC_011988	GGC	2	6	652949	652954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
11360	NC_011988	GGT	2	6	652973	652978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106643
11361	NC_011988	GAGGCA	2	12	652992	653003	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222106643
11362	NC_011988	CTG	2	6	653037	653042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11363	NC_011988	CTG	2	6	653114	653119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11364	NC_011988	TGC	2	6	653167	653172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
11365	NC_011988	CTG	2	6	653178	653183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106643
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11368	NC_011988	GGC	2	6	653228	653233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106643
11369	NC_011988	TGA	2	6	653282	653287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106643
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11372	NC_011988	A	6	6	653408	653413	100 %	0 %	0 %	0 %	222106644
11373	NC_011988	GCA	2	6	653480	653485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106644
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11376	NC_011988	ATG	2	6	653547	653552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106644
11377	NC_011988	CGG	2	6	653599	653604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106644
11378	NC_011988	ATG	2	6	653606	653611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106644
11379	NC_011988	CGC	2	6	653654	653659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106644
11380	NC_011988	TGG	2	6	653767	653772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222106644
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11384	NC_011988	CGA	2	6	653932	653937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106644
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11386	NC_011988	GCC	2	6	654164	654169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106644
11387	NC_011988	TGC	2	6	654217	654222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106644
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11393	NC_011988	GCTG	2	8	654595	654602	0 %	25 %	50 %	25 %	222106644
11394	NC_011988	GC	3	6	654626	654631	0 %	0 %	50 %	50 %	222106644
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11419	NC_011988	TCGACC	2	12	655641	655652	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222106645
11420	NC_011988	CGCC	2	8	655669	655676	0 %	0 %	25 %	75 %	222106645
11421	NC_011988	GA	3	6	655677	655682	50 %	0 %	50 %	0 %	222106645
11422	NC_011988	GCC	2	6	655700	655705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106645
11423	NC_011988	GCC	2	6	656060	656065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106645
11424	NC_011988	TTC	2	6	656205	656210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222106646
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11427	NC_011988	TG	3	6	656423	656428	0 %	50 %	50 %	0 %	222106646
11428	NC_011988	CAC	2	6	656524	656529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106646
11429	NC_011988	TCG	2	6	656639	656644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106646
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11451	NC_011988	GACA	2	8	658086	658093	50 %	0 %	25 %	25 %	222106647
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11455	NC_011988	GATC	2	8	658240	658247	25 %	25 %	25 %	25 %	222106648
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11459	NC_011988	ATC	2	6	658320	658325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106648
11460	NC_011988	CAG	2	6	658397	658402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106648
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11462	NC_011988	GCGCA	2	10	658469	658478	20 %	0 %	40 %	40 %	222106648
11463	NC_011988	GCA	2	6	658483	658488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106648
11464	NC_011988	GCGG	2	8	658517	658524	0 %	0 %	75 %	25 %	222106648
11465	NC_011988	TCC	2	6	658536	658541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106648
11466	NC_011988	GCA	2	6	658567	658572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106648
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11470	NC_011988	TCGTG	2	10	658699	658708	0 %	40 %	40 %	20 %	222106648
11471	NC_011988	TCA	2	6	658732	658737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106648
11472	NC_011988	CCAG	2	8	658744	658751	25 %	0 %	25 %	50 %	222106648
11473	NC_011988	GGC	2	6	658823	658828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106648
11474	NC_011988	CCG	2	6	658848	658853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106648
11475	NC_011988	CGG	2	6	658867	658872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222106648
11476	NC_011988	GCC	2	6	658905	658910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106648
11477	NC_011988	CAC	2	6	658922	658927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222106648
11478	NC_011988	AGG	2	6	658948	658953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222106648
11479	NC_011988	TGA	2	6	658966	658971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106648
11480	NC_011988	TCA	2	6	658981	658986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106648
11481	NC_011988	GCGG	2	8	659078	659085	0 %	0 %	75 %	25 %	222106648
11482	NC_011988	ATC	2	6	659154	659159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106648
11483	NC_011988	ATC	2	6	659187	659192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106648
11484	NC_011988	CTC	2	6	659199	659204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222106649
11485	NC_011988	GCGG	2	8	659310	659317	0 %	0 %	75 %	25 %	222106649
11486	NC_011988	GAT	2	6	659344	659349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222106649
11487	NC_011988	AGGA	2	8	659390	659397	50 %	0 %	50 %	0 %	222106649
11488	NC_011988	CAT	2	6	659428	659433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222106649
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11490	NC_011988	CCCG	2	8	659559	659566	0 %	0 %	25 %	75 %	222106649
11491	NC_011988	GCA	3	9	659619	659627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106649
11492	NC_011988	GCT	2	6	659629	659634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222106649
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11494	NC_011988	CGC	2	6	659763	659768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222106649
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11496	NC_011988	CGA	2	6	659790	659795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106649
11497	NC_011988	CAGA	2	8	659809	659816	50 %	0 %	25 %	25 %	222106649
11498	NC_011988	CAG	2	6	659839	659844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106649
11499	NC_011988	GCA	2	6	659873	659878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106649
11500	NC_011988	GCCAAG	2	12	659947	659958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222106649

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