MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011988	TGCCA	2	10	772386	772395	20 %	20 %	20 %	40 %	222106743
502	NC_011988	CTGCA	2	10	772440	772449	20 %	20 %	20 %	40 %	222106743
503	NC_011988	TGGCT	2	10	772527	772536	0 %	40 %	40 %	20 %	222106743
504	NC_011988	CTTGC	2	10	773545	773554	0 %	40 %	20 %	40 %	222106743
505	NC_011988	TCGGC	2	10	773804	773813	0 %	20 %	40 %	40 %	222106743
506	NC_011988	GCGCC	2	10	779553	779562	0 %	0 %	40 %	60 %	222106750
507	NC_011988	CAGAG	2	10	782703	782712	40 %	0 %	40 %	20 %	222106752
508	NC_011988	CAATG	2	10	784448	784457	40 %	20 %	20 %	20 %	222106753
509	NC_011988	GGCAT	2	10	784988	784997	20 %	20 %	40 %	20 %	222106754
510	NC_011988	CGGGC	2	10	785398	785407	0 %	0 %	60 %	40 %	222106754
511	NC_011988	CGTGC	2	10	786836	786845	0 %	20 %	40 %	40 %	222106755
512	NC_011988	CGGGC	2	10	787688	787697	0 %	0 %	60 %	40 %	222106755
513	NC_011988	GCGCC	2	10	788776	788785	0 %	0 %	40 %	60 %	222106756
514	NC_011988	GTGCG	2	10	790637	790646	0 %	20 %	60 %	20 %	222106757
515	NC_011988	CTGGC	2	10	793221	793230	0 %	20 %	40 %	40 %	222106760
516	NC_011988	TGCTT	2	10	794453	794462	0 %	60 %	20 %	20 %	222106761
517	NC_011988	CGGCC	2	10	794679	794688	0 %	0 %	40 %	60 %	222106761
518	NC_011988	TGCCA	2	10	800271	800280	20 %	20 %	20 %	40 %	222106765
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520	NC_011988	TCGGC	2	10	806318	806327	0 %	20 %	40 %	40 %	222106771
521	NC_011988	GGCCA	2	10	806457	806466	20 %	0 %	40 %	40 %	222106771
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529	NC_011988	GGTCT	2	10	814405	814414	0 %	40 %	40 %	20 %	222106777
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531	NC_011988	CGGCT	2	10	820429	820438	0 %	20 %	40 %	40 %	222106783
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534	NC_011988	GGAGC	2	10	827144	827153	20 %	0 %	60 %	20 %	222106789
535	NC_011988	CGGCG	2	10	827535	827544	0 %	0 %	60 %	40 %	222106789
536	NC_011988	ACCAG	2	10	830493	830502	40 %	0 %	20 %	40 %	222106793
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541	NC_011988	TCGTC	2	10	847344	847353	0 %	40 %	20 %	40 %	222106808
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548	NC_011988	GGATC	2	10	862732	862741	20 %	20 %	40 %	20 %	222106820
549	NC_011988	GTTTC	2	10	863182	863191	0 %	60 %	20 %	20 %	222106820
550	NC_011988	CGCGC	2	10	864104	864113	0 %	0 %	40 %	60 %	222106821
551	NC_011988	ACCCG	2	10	867144	867153	20 %	0 %	20 %	60 %	222106823
552	NC_011988	AAAAG	2	10	867221	867230	80 %	0 %	20 %	0 %	222106823
553	NC_011988	TTGCG	2	10	868738	868747	0 %	40 %	40 %	20 %	222106824
554	NC_011988	GGCCT	2	10	870253	870262	0 %	20 %	40 %	40 %	222106826
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565	NC_011988	CCATC	2	10	886726	886735	20 %	20 %	0 %	60 %	222106842
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575	NC_011988	GCCGA	2	10	904924	904933	20 %	0 %	40 %	40 %	222106857
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754	NC_011988	GCAAT	2	10	1225453	1225462	40 %	20 %	20 %	20 %	222107130
755	NC_011988	GCCCA	2	10	1227092	1227101	20 %	0 %	20 %	60 %	222107132
756	NC_011988	TCCGG	2	10	1229224	1229233	0 %	20 %	40 %	40 %	222107134
757	NC_011988	TCGCT	2	10	1231183	1231192	0 %	40 %	20 %	40 %	222107136
758	NC_011988	TGGTG	2	10	1231433	1231442	0 %	40 %	60 %	0 %	222107136
759	NC_011988	TGCCA	2	10	1233535	1233544	20 %	20 %	20 %	40 %	222107138
760	NC_011988	ACCAG	2	10	1236342	1236351	40 %	0 %	20 %	40 %	222107141
761	NC_011988	CCAGC	2	10	1238701	1238710	20 %	0 %	20 %	60 %	222107142
762	NC_011988	ATGGC	2	10	1241250	1241259	20 %	20 %	40 %	20 %	222107146
763	NC_011988	CAAGA	2	10	1242406	1242415	60 %	0 %	20 %	20 %	222107147
764	NC_011988	CTGTG	2	10	1244284	1244293	0 %	40 %	40 %	20 %	222107148
765	NC_011988	GGCAT	2	10	1244793	1244802	20 %	20 %	40 %	20 %	222107148
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767	NC_011988	CGAAC	2	10	1245448	1245457	40 %	0 %	20 %	40 %	222107149
768	NC_011988	TCTGG	2	10	1245721	1245730	0 %	40 %	40 %	20 %	222107149
769	NC_011988	TTCTG	2	10	1245966	1245975	0 %	60 %	20 %	20 %	222107149
770	NC_011988	ATCGC	2	10	1246962	1246971	20 %	20 %	20 %	40 %	222107150
771	NC_011988	CAGGG	2	10	1247062	1247071	20 %	0 %	60 %	20 %	222107150
772	NC_011988	GGCGC	2	10	1247171	1247180	0 %	0 %	60 %	40 %	222107151
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776	NC_011988	TCCGA	2	10	1252500	1252509	20 %	20 %	20 %	40 %	222107155
777	NC_011988	CGATC	2	10	1252786	1252795	20 %	20 %	20 %	40 %	222107155
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779	NC_011988	CGGCG	2	10	1261073	1261082	0 %	0 %	60 %	40 %	222107162
780	NC_011988	GGGGC	2	10	1261179	1261188	0 %	0 %	80 %	20 %	222107162
781	NC_011988	AGGGC	2	10	1261252	1261261	20 %	0 %	60 %	20 %	222107162
782	NC_011988	GCCTG	2	10	1263136	1263145	0 %	20 %	40 %	40 %	222107164
783	NC_011988	TGCTG	2	10	1263394	1263403	0 %	40 %	40 %	20 %	222107164
784	NC_011988	GGCGC	2	10	1265409	1265418	0 %	0 %	60 %	40 %	222107166
785	NC_011988	GGCCG	2	10	1265703	1265712	0 %	0 %	60 %	40 %	222107167
786	NC_011988	CAAGC	2	10	1266023	1266032	40 %	0 %	20 %	40 %	222107167
787	NC_011988	GTGAT	2	10	1266388	1266397	20 %	40 %	40 %	0 %	222107167
788	NC_011988	GCGGT	2	10	1267688	1267697	0 %	20 %	60 %	20 %	222107168
789	NC_011988	TGGAT	2	10	1271692	1271701	20 %	40 %	40 %	0 %	222107172
790	NC_011988	CCGCC	2	10	1272865	1272874	0 %	0 %	20 %	80 %	222107173
791	NC_011988	GGGCG	2	10	1273249	1273258	0 %	0 %	80 %	20 %	222107173
792	NC_011988	TTTGG	2	10	1276627	1276636	0 %	60 %	40 %	0 %	222107176
793	NC_011988	TCCAG	2	10	1279680	1279689	20 %	20 %	20 %	40 %	222107178
794	NC_011988	AGTGG	2	10	1280716	1280725	20 %	20 %	60 %	0 %	222107179
795	NC_011988	GGGCA	2	10	1281908	1281917	20 %	0 %	60 %	20 %	222107180
796	NC_011988	TGCCG	2	10	1282219	1282228	0 %	20 %	40 %	40 %	222107180
797	NC_011988	CGGTC	2	10	1282358	1282367	0 %	20 %	40 %	40 %	222107180
798	NC_011988	CCAAT	2	10	1282384	1282393	40 %	20 %	0 %	40 %	222107180
799	NC_011988	GCGAT	2	10	1282511	1282520	20 %	20 %	40 %	20 %	222107181

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