MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 6796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011987	TGG	3	9	233312	233320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102188
4002	NC_011987	TCT	2	6	233342	233347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102188
4003	NC_011987	CAG	2	6	233350	233355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102188
4004	NC_011987	GCT	2	6	233364	233369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102188
4005	NC_011987	GCG	2	6	233387	233392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102188
4006	NC_011987	CCG	2	6	233478	233483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102188
4007	NC_011987	CGC	2	6	233551	233556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102188
4008	NC_011987	TC	3	6	233592	233597	0 %	50 %	0 %	50 %	222102188
4009	NC_011987	GGC	2	6	233789	233794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4010	NC_011987	GCGG	2	8	233795	233802	0 %	0 %	75 %	25 %	222102189
4011	NC_011987	GTG	2	6	233838	233843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102189
4012	NC_011987	GTT	2	6	233852	233857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102189
4013	NC_011987	CGG	2	6	233911	233916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4014	NC_011987	AGCG	2	8	233953	233960	25 %	0 %	50 %	25 %	222102189
4015	NC_011987	GGC	2	6	233986	233991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4016	NC_011987	GCC	2	6	233997	234002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102189
4017	NC_011987	ACA	2	6	234015	234020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102189
4018	NC_011987	TGC	2	6	234022	234027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102189
4019	NC_011987	CG	3	6	234067	234072	0 %	0 %	50 %	50 %	222102189
4020	NC_011987	GAT	2	6	234124	234129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102189
4021	NC_011987	CTG	2	6	234130	234135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102189
4022	NC_011987	TCA	3	9	234177	234185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102189
4023	NC_011987	GGC	2	6	234226	234231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4024	NC_011987	GCG	2	6	234248	234253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4025	NC_011987	TGC	2	6	234318	234323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102189
4026	NC_011987	GCG	2	6	234344	234349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4027	NC_011987	TCG	2	6	234381	234386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102189
4028	NC_011987	AGG	2	6	234387	234392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102189
4029	NC_011987	CG	3	6	234456	234461	0 %	0 %	50 %	50 %	222102189
4030	NC_011987	TCG	2	6	234489	234494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102189
4031	NC_011987	GGC	2	6	234500	234505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102189
4032	NC_011987	ATG	2	6	234562	234567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102189
4033	NC_011987	GC	3	6	234659	234664	0 %	0 %	50 %	50 %	222102190
4034	NC_011987	GC	3	6	234685	234690	0 %	0 %	50 %	50 %	222102190
4035	NC_011987	GAC	2	6	234726	234731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102190
4036	NC_011987	CG	3	6	234733	234738	0 %	0 %	50 %	50 %	222102190
4037	NC_011987	CGG	2	6	234837	234842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102190
4038	NC_011987	TCC	2	6	234851	234856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102190
4039	NC_011987	CGC	2	6	234861	234866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102190
4040	NC_011987	TTTG	2	8	234880	234887	0 %	75 %	25 %	0 %	222102190
4041	NC_011987	CGG	2	6	234996	235001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102190
4042	NC_011987	CCG	2	6	235070	235075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102190
4043	NC_011987	GGC	2	6	235081	235086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102190
4044	NC_011987	GC	3	6	235121	235126	0 %	0 %	50 %	50 %	222102190
4045	NC_011987	GCC	2	6	235213	235218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102190
4046	NC_011987	GAC	2	6	235258	235263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102190
4047	NC_011987	GCC	2	6	235273	235278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102190
4048	NC_011987	GGC	2	6	235299	235304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102190
4049	NC_011987	GGC	2	6	235336	235341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102190
4050	NC_011987	CGA	2	6	235404	235409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102191
4051	NC_011987	GCG	2	6	235500	235505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102191
4052	NC_011987	TCT	2	6	235506	235511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102191
4053	NC_011987	GGC	2	6	235651	235656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102191
4054	NC_011987	CGC	2	6	235741	235746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102191
4055	NC_011987	CAT	2	6	235809	235814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102191
4056	NC_011987	GCC	3	9	235829	235837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102191
4057	NC_011987	CAT	2	6	236184	236189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102192
4058	NC_011987	CTT	2	6	236234	236239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102192
4059	NC_011987	GCC	2	6	236324	236329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102192
4060	NC_011987	CCG	2	6	236345	236350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102192
4061	NC_011987	CCA	2	6	236377	236382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102192
4062	NC_011987	GCGA	2	8	236385	236392	25 %	0 %	50 %	25 %	222102192
4063	NC_011987	TCGAA	2	10	236467	236476	40 %	20 %	20 %	20 %	222102192
4064	NC_011987	CCAG	2	8	236494	236501	25 %	0 %	25 %	50 %	222102192
4065	NC_011987	GTTT	2	8	236504	236511	0 %	75 %	25 %	0 %	222102192
4066	NC_011987	ATC	2	6	236565	236570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102192
4067	NC_011987	AAC	2	6	236577	236582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102192
4068	NC_011987	GC	3	6	236684	236689	0 %	0 %	50 %	50 %	222102192
4069	NC_011987	CTG	2	6	236818	236823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102192
4070	NC_011987	GCC	2	6	236875	236880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102192
4071	NC_011987	CTT	2	6	236896	236901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102192
4072	NC_011987	AT	3	6	236908	236913	50 %	50 %	0 %	0 %	222102192
4073	NC_011987	TCG	2	6	236914	236919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102192
4074	NC_011987	CGG	2	6	237087	237092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102193
4075	NC_011987	CAG	2	6	237199	237204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102193
4076	NC_011987	CGT	2	6	237210	237215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102193
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4078	NC_011987	GGCC	2	8	237336	237343	0 %	0 %	50 %	50 %	222102193
4079	NC_011987	GGCT	2	8	237374	237381	0 %	25 %	50 %	25 %	222102193
4080	NC_011987	AGG	2	6	237401	237406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102193
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4082	NC_011987	AGG	2	6	237470	237475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102193
4083	NC_011987	TCG	2	6	237518	237523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102193
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4089	NC_011987	CAT	2	6	237804	237809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102193
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4091	NC_011987	GTG	2	6	237904	237909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102193
4092	NC_011987	CGA	2	6	237932	237937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102193
4093	NC_011987	TGC	2	6	238142	238147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102193
4094	NC_011987	GAT	2	6	238152	238157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102193
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4098	NC_011987	TCG	2	6	238326	238331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102194
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4101	NC_011987	TCCG	2	8	238400	238407	0 %	25 %	25 %	50 %	222102194
4102	NC_011987	GTG	2	6	238472	238477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102194
4103	NC_011987	GAG	2	6	238517	238522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102194
4104	NC_011987	CCGA	2	8	238552	238559	25 %	0 %	25 %	50 %	222102194
4105	NC_011987	GGC	2	6	238571	238576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102194
4106	NC_011987	TC	3	6	238626	238631	0 %	50 %	0 %	50 %	222102194
4107	NC_011987	CGC	2	6	238632	238637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102194
4108	NC_011987	TGA	2	6	238695	238700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102194
4109	NC_011987	GAT	2	6	238703	238708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102194
4110	NC_011987	TCG	2	6	239291	239296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102195
4111	NC_011987	GCG	2	6	239388	239393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102195
4112	NC_011987	CTT	2	6	239464	239469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102195
4113	NC_011987	CACC	2	8	239520	239527	25 %	0 %	0 %	75 %	222102195
4114	NC_011987	GCA	2	6	239565	239570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102195
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4119	NC_011987	CG	3	6	240342	240347	0 %	0 %	50 %	50 %	222102196
4120	NC_011987	CTATT	2	10	240424	240433	20 %	60 %	0 %	20 %	222102196
4121	NC_011987	TGA	2	6	240526	240531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102196
4122	NC_011987	TCT	2	6	240867	240872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102196
4123	NC_011987	GCG	2	6	240924	240929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102196
4124	NC_011987	CCGT	2	8	240932	240939	0 %	25 %	25 %	50 %	222102196
4125	NC_011987	GC	3	6	240968	240973	0 %	0 %	50 %	50 %	222102196
4126	NC_011987	AAGG	2	8	240980	240987	50 %	0 %	50 %	0 %	222102196
4127	NC_011987	TGT	2	6	242390	242395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102197
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4129	NC_011987	GCG	2	6	242509	242514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102197
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4133	NC_011987	GGC	2	6	242606	242611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102197
4134	NC_011987	CCT	2	6	242640	242645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102197
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4136	NC_011987	CTG	2	6	242969	242974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102198
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4143	NC_011987	CAT	2	6	243237	243242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102198
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4145	NC_011987	TTG	2	6	243325	243330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102198
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4150	NC_011987	C	6	6	243535	243540	0 %	0 %	0 %	100 %	222102198
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4155	NC_011987	CGT	2	6	243741	243746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102198
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4229	NC_011987	GCG	2	6	247387	247392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102201
4230	NC_011987	CAA	2	6	247393	247398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102201
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4232	NC_011987	TCG	3	9	247452	247460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102201
4233	NC_011987	CCA	2	6	247476	247481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102201
4234	NC_011987	ACA	2	6	247590	247595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102201
4235	NC_011987	GTC	2	6	247616	247621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102201
4236	NC_011987	GC	3	6	247622	247627	0 %	0 %	50 %	50 %	222102201
4237	NC_011987	CCGTA	2	10	247662	247671	20 %	20 %	20 %	40 %	222102201
4238	NC_011987	ATC	2	6	247715	247720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102201
4239	NC_011987	TGC	2	6	247738	247743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102201
4240	NC_011987	TGA	2	6	247836	247841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102202
4241	NC_011987	TGA	2	6	247921	247926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102202
4242	NC_011987	GA	3	6	247990	247995	50 %	0 %	50 %	0 %	222102202
4243	NC_011987	CA	3	6	248004	248009	50 %	0 %	0 %	50 %	222102202
4244	NC_011987	ACTG	2	8	248074	248081	25 %	25 %	25 %	25 %	222102202
4245	NC_011987	TGA	2	6	248106	248111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102202
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4247	NC_011987	TGG	2	6	248196	248201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102202
4248	NC_011987	GAT	2	6	248301	248306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102203
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4251	NC_011987	CATT	2	8	248777	248784	25 %	50 %	0 %	25 %	222102204
4252	NC_011987	CGGC	2	8	248999	249006	0 %	0 %	50 %	50 %	222102204
4253	NC_011987	CAGG	2	8	249227	249234	25 %	0 %	50 %	25 %	222102204
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4365	NC_011987	GTTC	2	8	255689	255696	0 %	50 %	25 %	25 %	222102211
4366	NC_011987	AAT	2	6	255704	255709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102211
4367	NC_011987	GTC	2	6	255740	255745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102211
4368	NC_011987	CGAG	2	8	255764	255771	25 %	0 %	50 %	25 %	222102211
4369	NC_011987	AG	3	6	255770	255775	50 %	0 %	50 %	0 %	222102211
4370	NC_011987	CAT	2	6	255926	255931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102211
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4372	NC_011987	CAT	2	6	256015	256020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102211
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4378	NC_011987	GCAGA	2	10	256712	256721	40 %	0 %	40 %	20 %	222102212
4379	NC_011987	TC	3	6	256757	256762	0 %	50 %	0 %	50 %	222102212
4380	NC_011987	CAA	2	6	256780	256785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102212
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4403	NC_011987	CG	3	6	257986	257991	0 %	0 %	50 %	50 %	222102212
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4475	NC_011987	TCCGA	2	10	261610	261619	20 %	20 %	20 %	40 %	222102215
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4480	NC_011987	TCG	2	6	261890	261895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102216
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4484	NC_011987	CCA	2	6	262001	262006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102216
4485	NC_011987	CTCGC	2	10	262039	262048	0 %	20 %	20 %	60 %	222102216
4486	NC_011987	CGT	2	6	262083	262088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102216
4487	NC_011987	CG	3	6	262105	262110	0 %	0 %	50 %	50 %	222102216
4488	NC_011987	CG	3	6	262158	262163	0 %	0 %	50 %	50 %	222102216
4489	NC_011987	GAA	2	6	262188	262193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102216
4490	NC_011987	GC	3	6	262217	262222	0 %	0 %	50 %	50 %	222102216
4491	NC_011987	GCG	2	6	262241	262246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102216
4492	NC_011987	CGCA	2	8	262260	262267	25 %	0 %	25 %	50 %	222102216
4493	NC_011987	ATCA	2	8	262276	262283	50 %	25 %	0 %	25 %	222102216
4494	NC_011987	CTC	2	6	262365	262370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102216
4495	NC_011987	TGC	2	6	262389	262394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102216
4496	NC_011987	GC	3	6	262464	262469	0 %	0 %	50 %	50 %	222102216
4497	NC_011987	GCC	2	6	262471	262476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102216
4498	NC_011987	GTG	2	6	262531	262536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102216
4499	NC_011987	GGAC	2	8	262537	262544	25 %	0 %	50 %	25 %	222102216
4500	NC_011987	CTG	2	6	262714	262719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102216

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