MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 6796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011987	GAA	2	6	203665	203670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102158
3502	NC_011987	CGT	2	6	203685	203690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102158
3503	NC_011987	TGG	2	6	203691	203696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102158
3504	NC_011987	TTCG	2	8	203721	203728	0 %	50 %	25 %	25 %	222102158
3505	NC_011987	CGG	2	6	203765	203770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102158
3506	NC_011987	GCC	2	6	203791	203796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102158
3507	NC_011987	AGCC	2	8	203798	203805	25 %	0 %	25 %	50 %	222102158
3508	NC_011987	TTG	2	6	203819	203824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102158
3509	NC_011987	CGA	2	6	203997	204002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102158
3510	NC_011987	CTC	2	6	204010	204015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102158
3511	NC_011987	GCC	2	6	204049	204054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102158
3512	NC_011987	GAA	3	9	204067	204075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102158
3513	NC_011987	GCC	2	6	204076	204081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102158
3514	NC_011987	GCCG	2	8	204136	204143	0 %	0 %	50 %	50 %	222102158
3515	NC_011987	ACG	2	6	204161	204166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102158
3516	NC_011987	GCG	2	6	204212	204217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102158
3517	NC_011987	AAT	2	6	204382	204387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102159
3518	NC_011987	GTC	2	6	204761	204766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102160
3519	NC_011987	GAG	2	6	204785	204790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102160
3520	NC_011987	CAT	3	9	204805	204813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102160
3521	NC_011987	AGG	2	6	204840	204845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102160
3522	NC_011987	CTG	2	6	204977	204982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102160
3523	NC_011987	AAG	2	6	204990	204995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102160
3524	NC_011987	GCG	2	6	205101	205106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102161
3525	NC_011987	GTC	2	6	205160	205165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3526	NC_011987	GC	3	6	205182	205187	0 %	0 %	50 %	50 %	222102161
3527	NC_011987	CAC	2	6	205312	205317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102161
3528	NC_011987	GCC	2	6	205415	205420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102161
3529	NC_011987	GCA	2	6	205434	205439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3530	NC_011987	CCT	2	6	205464	205469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102161
3531	NC_011987	GCGAGA	2	12	205509	205520	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222102161
3532	NC_011987	TCA	2	6	205569	205574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102161
3533	NC_011987	TC	3	6	205645	205650	0 %	50 %	0 %	50 %	222102161
3534	NC_011987	GAA	2	6	205720	205725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102161
3535	NC_011987	CTG	2	6	205745	205750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3536	NC_011987	CTG	2	6	205754	205759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3537	NC_011987	GCT	2	6	205786	205791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3538	NC_011987	ATC	2	6	205793	205798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102161
3539	NC_011987	AGGCG	2	10	205813	205822	20 %	0 %	60 %	20 %	222102161
3540	NC_011987	GTC	2	6	205835	205840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
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3542	NC_011987	GCT	2	6	205909	205914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3543	NC_011987	CGG	2	6	205936	205941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102161
3544	NC_011987	GTC	2	6	205946	205951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3545	NC_011987	AAG	2	6	206009	206014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102161
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3549	NC_011987	AAG	2	6	206222	206227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102161
3550	NC_011987	CGA	2	6	206236	206241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3551	NC_011987	CGC	2	6	206260	206265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102161
3552	NC_011987	GAA	2	6	206270	206275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102161
3553	NC_011987	GCG	2	6	206289	206294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102161
3554	NC_011987	GCT	2	6	206302	206307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3555	NC_011987	GAA	2	6	206335	206340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102161
3556	NC_011987	TCG	3	9	206439	206447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3557	NC_011987	CCT	2	6	206512	206517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102161
3558	NC_011987	GGT	2	6	206545	206550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102161
3559	NC_011987	GCC	2	6	206570	206575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102161
3560	NC_011987	GAC	2	6	206596	206601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102161
3561	NC_011987	CGG	2	6	206646	206651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102161
3562	NC_011987	CGG	2	6	206656	206661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102161
3563	NC_011987	CA	3	6	207125	207130	50 %	0 %	0 %	50 %	222102162
3564	NC_011987	ACC	2	6	207135	207140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102162
3565	NC_011987	GTCG	2	8	207154	207161	0 %	25 %	50 %	25 %	222102162
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3568	NC_011987	TGT	2	6	207253	207258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102162
3569	NC_011987	CTG	2	6	207419	207424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102162
3570	NC_011987	GCA	2	6	207599	207604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102162
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3573	NC_011987	CGG	2	6	207637	207642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102162
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3579	NC_011987	TCGG	2	8	209823	209830	0 %	25 %	50 %	25 %	222102163
3580	NC_011987	CTT	2	6	209845	209850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102163
3581	NC_011987	TCCGT	2	10	210065	210074	0 %	40 %	20 %	40 %	222102164
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3583	NC_011987	ATCT	2	8	210167	210174	25 %	50 %	0 %	25 %	222102164
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3585	NC_011987	CCGG	2	8	210254	210261	0 %	0 %	50 %	50 %	222102164
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3591	NC_011987	CGG	2	6	211369	211374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102165
3592	NC_011987	CGG	2	6	211420	211425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102165
3593	NC_011987	ACC	2	6	211439	211444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102165
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3600	NC_011987	CCGA	2	8	211755	211762	25 %	0 %	25 %	50 %	222102165
3601	NC_011987	GGC	2	6	211766	211771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102165
3602	NC_011987	TGA	2	6	211774	211779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102165
3603	NC_011987	GTT	2	6	211835	211840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102165
3604	NC_011987	TCG	2	6	211848	211853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102165
3605	NC_011987	CAG	2	6	211862	211867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102165
3606	NC_011987	CGG	2	6	211903	211908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102165
3607	NC_011987	CCA	2	6	211950	211955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102165
3608	NC_011987	GGC	2	6	211961	211966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102165
3609	NC_011987	AGA	3	9	212022	212030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102165
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3611	NC_011987	CGA	2	6	212095	212100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102166
3612	NC_011987	TGCC	2	8	212125	212132	0 %	25 %	25 %	50 %	222102166
3613	NC_011987	CTG	2	6	212197	212202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102166
3614	NC_011987	CTT	2	6	212207	212212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102166
3615	NC_011987	CTT	3	9	212222	212230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102166
3616	NC_011987	GTG	2	6	212286	212291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102166
3617	NC_011987	GCC	2	6	212327	212332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102166
3618	NC_011987	TTGCC	2	10	212353	212362	0 %	40 %	20 %	40 %	222102166
3619	NC_011987	CGATCT	2	12	212368	212379	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222102166
3620	NC_011987	AGG	2	6	212409	212414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102166
3621	NC_011987	ATCG	2	8	212450	212457	25 %	25 %	25 %	25 %	222102166
3622	NC_011987	CAT	2	6	212542	212547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102166
3623	NC_011987	AGTGC	2	10	212586	212595	20 %	20 %	40 %	20 %	222102166
3624	NC_011987	GAC	2	6	212630	212635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102166
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3626	NC_011987	TCG	2	6	212694	212699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102166
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3632	NC_011987	GAT	2	6	213310	213315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102167
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3634	NC_011987	GAT	2	6	213379	213384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102167
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3645	NC_011987	CGA	2	6	213801	213806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102167
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3649	NC_011987	CGGC	2	8	213953	213960	0 %	0 %	50 %	50 %	222102167
3650	NC_011987	CGG	2	6	213990	213995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102167
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3726	NC_011987	GAT	2	6	219914	219919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102173
3727	NC_011987	GCC	2	6	219968	219973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102173
3728	NC_011987	CGA	2	6	220051	220056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102173
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3730	NC_011987	CATGC	2	10	220804	220813	20 %	20 %	20 %	40 %	222102174
3731	NC_011987	ACC	2	6	220816	220821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102174
3732	NC_011987	CCTT	2	8	220877	220884	0 %	50 %	0 %	50 %	222102174
3733	NC_011987	GCA	2	6	220916	220921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102174
3734	NC_011987	TGC	2	6	221033	221038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102174
3735	NC_011987	ACC	3	9	221093	221101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102174
3736	NC_011987	TCG	2	6	221102	221107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102174
3737	NC_011987	ATC	2	6	221144	221149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102174
3738	NC_011987	AGA	2	6	221160	221165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102174
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3740	NC_011987	AACCGC	2	12	221197	221208	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222102174
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3981	NC_011987	CGA	2	6	232287	232292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102187
3982	NC_011987	ACG	2	6	232337	232342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102187
3983	NC_011987	CGC	2	6	232479	232484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102187
3984	NC_011987	GCGG	2	8	232500	232507	0 %	0 %	75 %	25 %	222102187
3985	NC_011987	GAT	2	6	232566	232571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102187
3986	NC_011987	GCC	2	6	232579	232584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102187
3987	NC_011987	CGG	2	6	232650	232655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102187
3988	NC_011987	GGC	2	6	232669	232674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102187
3989	NC_011987	GC	4	8	232698	232705	0 %	0 %	50 %	50 %	222102187
3990	NC_011987	CCG	2	6	232796	232801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102187
3991	NC_011987	TCC	2	6	232814	232819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102187
3992	NC_011987	CGT	2	6	232867	232872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102187
3993	NC_011987	TGA	2	6	233090	233095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102188
3994	NC_011987	CCT	2	6	233109	233114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102188
3995	NC_011987	GAA	2	6	233116	233121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102188
3996	NC_011987	GT	3	6	233168	233173	0 %	50 %	50 %	0 %	222102188
3997	NC_011987	GATCG	2	10	233175	233184	20 %	20 %	40 %	20 %	222102188
3998	NC_011987	AGG	2	6	233231	233236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102188
3999	NC_011987	TCG	2	6	233277	233282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102188
4000	NC_011987	CGA	2	6	233301	233306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102188

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