MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011986	TC	3	6	418	423	0 %	50 %	0 %	50 %	222102330
2	NC_011986	AG	3	6	1666	1671	50 %	0 %	50 %	0 %	222102331
3	NC_011986	AG	3	6	1766	1771	50 %	0 %	50 %	0 %	222102331
4	NC_011986	GC	3	6	1996	2001	0 %	0 %	50 %	50 %	222102331
5	NC_011986	GC	3	6	2811	2816	0 %	0 %	50 %	50 %	222102332
6	NC_011986	CA	3	6	3423	3428	50 %	0 %	0 %	50 %	222102332
7	NC_011986	GC	3	6	3851	3856	0 %	0 %	50 %	50 %	222102332
8	NC_011986	TC	4	8	4031	4038	0 %	50 %	0 %	50 %	222102333
9	NC_011986	CG	3	6	4258	4263	0 %	0 %	50 %	50 %	222102333
10	NC_011986	GA	3	6	4289	4294	50 %	0 %	50 %	0 %	222102333
11	NC_011986	TC	3	6	5256	5261	0 %	50 %	0 %	50 %	222102334
12	NC_011986	TC	3	6	5711	5716	0 %	50 %	0 %	50 %	222102335
13	NC_011986	CG	3	6	7250	7255	0 %	0 %	50 %	50 %	222102336
14	NC_011986	GC	3	6	7443	7448	0 %	0 %	50 %	50 %	222102337
15	NC_011986	GC	3	6	7989	7994	0 %	0 %	50 %	50 %	222102337
16	NC_011986	GC	3	6	8584	8589	0 %	0 %	50 %	50 %	222102337
17	NC_011986	CG	3	6	9125	9130	0 %	0 %	50 %	50 %	222102337
18	NC_011986	AG	3	6	9148	9153	50 %	0 %	50 %	0 %	222102337
19	NC_011986	CG	3	6	9372	9377	0 %	0 %	50 %	50 %	222102337
20	NC_011986	TC	3	6	9754	9759	0 %	50 %	0 %	50 %	222102337
21	NC_011986	GA	3	6	10042	10047	50 %	0 %	50 %	0 %	222102337
22	NC_011986	AT	3	6	11239	11244	50 %	50 %	0 %	0 %	222102338
23	NC_011986	AT	3	6	11627	11632	50 %	50 %	0 %	0 %	222102338
24	NC_011986	GC	3	6	12745	12750	0 %	0 %	50 %	50 %	222102339
25	NC_011986	AG	3	6	13165	13170	50 %	0 %	50 %	0 %	222102339
26	NC_011986	AG	3	6	15328	15333	50 %	0 %	50 %	0 %	222102341
27	NC_011986	GT	3	6	15631	15636	0 %	50 %	50 %	0 %	222102342
28	NC_011986	GC	3	6	16396	16401	0 %	0 %	50 %	50 %	222102343
29	NC_011986	CA	3	6	16542	16547	50 %	0 %	0 %	50 %	222102343
30	NC_011986	CG	3	6	18867	18872	0 %	0 %	50 %	50 %	222102346
31	NC_011986	CT	3	6	18993	18998	0 %	50 %	0 %	50 %	222102346
32	NC_011986	CT	3	6	19577	19582	0 %	50 %	0 %	50 %	222102347
33	NC_011986	GA	3	6	19641	19646	50 %	0 %	50 %	0 %	222102347
34	NC_011986	GC	3	6	20084	20089	0 %	0 %	50 %	50 %	222102347
35	NC_011986	GC	3	6	21017	21022	0 %	0 %	50 %	50 %	222102347
36	NC_011986	AC	3	6	21093	21098	50 %	0 %	0 %	50 %	222102347
37	NC_011986	CG	3	6	21291	21296	0 %	0 %	50 %	50 %	222102347
38	NC_011986	GA	3	6	21343	21348	50 %	0 %	50 %	0 %	222102347
39	NC_011986	GC	3	6	21363	21368	0 %	0 %	50 %	50 %	222102347
40	NC_011986	GC	3	6	21552	21557	0 %	0 %	50 %	50 %	222102347
41	NC_011986	GC	3	6	22912	22917	0 %	0 %	50 %	50 %	222102349
42	NC_011986	TC	4	8	24043	24050	0 %	50 %	0 %	50 %	222102350
43	NC_011986	AC	3	6	24425	24430	50 %	0 %	0 %	50 %	222102351
44	NC_011986	GC	3	6	24690	24695	0 %	0 %	50 %	50 %	222102351
45	NC_011986	CT	3	6	24899	24904	0 %	50 %	0 %	50 %	222102352
46	NC_011986	GA	3	6	25803	25808	50 %	0 %	50 %	0 %	222102354
47	NC_011986	CG	3	6	26565	26570	0 %	0 %	50 %	50 %	222102355
48	NC_011986	TC	3	6	27091	27096	0 %	50 %	0 %	50 %	222102356
49	NC_011986	CA	3	6	27620	27625	50 %	0 %	0 %	50 %	222102357
50	NC_011986	GA	3	6	28882	28887	50 %	0 %	50 %	0 %	222102358
51	NC_011986	GA	3	6	30273	30278	50 %	0 %	50 %	0 %	222102359
52	NC_011986	GC	3	6	30398	30403	0 %	0 %	50 %	50 %	222102359
53	NC_011986	GC	3	6	30422	30427	0 %	0 %	50 %	50 %	222102359
54	NC_011986	CA	3	6	30708	30713	50 %	0 %	0 %	50 %	222102359
55	NC_011986	TC	3	6	30821	30826	0 %	50 %	0 %	50 %	222102359
56	NC_011986	GC	3	6	31060	31065	0 %	0 %	50 %	50 %	222102360
57	NC_011986	TC	3	6	32068	32073	0 %	50 %	0 %	50 %	222102361
58	NC_011986	CG	3	6	34615	34620	0 %	0 %	50 %	50 %	222102363
59	NC_011986	GC	3	6	37491	37496	0 %	0 %	50 %	50 %	222102368
60	NC_011986	GA	3	6	38490	38495	50 %	0 %	50 %	0 %	222102368
61	NC_011986	GT	3	6	44498	44503	0 %	50 %	50 %	0 %	222102377
62	NC_011986	GA	3	6	48011	48016	50 %	0 %	50 %	0 %	222102380
63	NC_011986	GC	3	6	49593	49598	0 %	0 %	50 %	50 %	222102382
64	NC_011986	GC	4	8	50169	50176	0 %	0 %	50 %	50 %	222102382
65	NC_011986	GC	3	6	50895	50900	0 %	0 %	50 %	50 %	222102382
66	NC_011986	GC	3	6	53913	53918	0 %	0 %	50 %	50 %	222102386
67	NC_011986	GC	3	6	55016	55021	0 %	0 %	50 %	50 %	222102387
68	NC_011986	GC	4	8	55737	55744	0 %	0 %	50 %	50 %	222102387
69	NC_011986	GC	3	6	57052	57057	0 %	0 %	50 %	50 %	222102387
70	NC_011986	AG	3	6	59456	59461	50 %	0 %	50 %	0 %	222102391
71	NC_011986	CA	3	6	59469	59474	50 %	0 %	0 %	50 %	222102391
72	NC_011986	CT	3	6	59722	59727	0 %	50 %	0 %	50 %	222102391
73	NC_011986	CG	3	6	60029	60034	0 %	0 %	50 %	50 %	222102392
74	NC_011986	GC	3	6	61163	61168	0 %	0 %	50 %	50 %	222102393
75	NC_011986	GC	3	6	62428	62433	0 %	0 %	50 %	50 %	222102395
76	NC_011986	TC	3	6	63647	63652	0 %	50 %	0 %	50 %	222102396
77	NC_011986	CA	3	6	66032	66037	50 %	0 %	0 %	50 %	222102399
78	NC_011986	GC	3	6	66497	66502	0 %	0 %	50 %	50 %	222102399
79	NC_011986	CG	3	6	66562	66567	0 %	0 %	50 %	50 %	222102400
80	NC_011986	GC	3	6	67215	67220	0 %	0 %	50 %	50 %	222102400
81	NC_011986	GT	3	6	68306	68311	0 %	50 %	50 %	0 %	222102401
82	NC_011986	TC	3	6	70084	70089	0 %	50 %	0 %	50 %	222102402
83	NC_011986	GA	3	6	73428	73433	50 %	0 %	50 %	0 %	222102405
84	NC_011986	GA	3	6	73714	73719	50 %	0 %	50 %	0 %	222102406
85	NC_011986	CG	3	6	73766	73771	0 %	0 %	50 %	50 %	222102406
86	NC_011986	GC	3	6	74161	74166	0 %	0 %	50 %	50 %	222102406
87	NC_011986	GC	3	6	74323	74328	0 %	0 %	50 %	50 %	222102406
88	NC_011986	TG	3	6	74622	74627	0 %	50 %	50 %	0 %	222102406
89	NC_011986	CG	3	6	74736	74741	0 %	0 %	50 %	50 %	222102406
90	NC_011986	GC	3	6	74847	74852	0 %	0 %	50 %	50 %	222102406
91	NC_011986	CT	3	6	74965	74970	0 %	50 %	0 %	50 %	222102407
92	NC_011986	GC	3	6	76917	76922	0 %	0 %	50 %	50 %	222102410
93	NC_011986	CG	3	6	78406	78411	0 %	0 %	50 %	50 %	222102411

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.