MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	A	6	6	346	351	100 %	0 %	0 %	0 %	222080118
2	NC_011982	A	6	6	718	723	100 %	0 %	0 %	0 %	222080118
3	NC_011982	C	6	6	810	815	0 %	0 %	0 %	100 %	222080118
4	NC_011982	A	6	6	4355	4360	100 %	0 %	0 %	0 %	222080121
5	NC_011982	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	222080122
6	NC_011982	T	7	7	15738	15744	0 %	100 %	0 %	0 %	222080133
7	NC_011982	T	7	7	16749	16755	0 %	100 %	0 %	0 %	222080133
8	NC_011982	T	6	6	28433	28438	0 %	100 %	0 %	0 %	222080140
9	NC_011982	T	7	7	40917	40923	0 %	100 %	0 %	0 %	222080148
10	NC_011982	T	6	6	48063	48068	0 %	100 %	0 %	0 %	222080152
11	NC_011982	A	6	6	52287	52292	100 %	0 %	0 %	0 %	222080156
12	NC_011982	G	6	6	52344	52349	0 %	0 %	100 %	0 %	222080156
13	NC_011982	G	6	6	54532	54537	0 %	0 %	100 %	0 %	222080159
14	NC_011982	C	6	6	64125	64130	0 %	0 %	0 %	100 %	222080163
15	NC_011982	C	7	7	64757	64763	0 %	0 %	0 %	100 %	222080164
16	NC_011982	A	6	6	65604	65609	100 %	0 %	0 %	0 %	222080165
17	NC_011982	T	7	7	83721	83727	0 %	100 %	0 %	0 %	222080182
18	NC_011982	A	6	6	99292	99297	100 %	0 %	0 %	0 %	222080197
19	NC_011982	A	7	7	101091	101097	100 %	0 %	0 %	0 %	222080199
20	NC_011982	A	6	6	104800	104805	100 %	0 %	0 %	0 %	222080202
21	NC_011982	T	6	6	105954	105959	0 %	100 %	0 %	0 %	222080203
22	NC_011982	G	7	7	108619	108625	0 %	0 %	100 %	0 %	222080205
23	NC_011982	A	6	6	109940	109945	100 %	0 %	0 %	0 %	222080206
24	NC_011982	A	7	7	138764	138770	100 %	0 %	0 %	0 %	222080226
25	NC_011982	A	7	7	145054	145060	100 %	0 %	0 %	0 %	222080229
26	NC_011982	T	6	6	145513	145518	0 %	100 %	0 %	0 %	222080230
27	NC_011982	T	6	6	148343	148348	0 %	100 %	0 %	0 %	222080231
28	NC_011982	T	6	6	150124	150129	0 %	100 %	0 %	0 %	222080231
29	NC_011982	C	6	6	154090	154095	0 %	0 %	0 %	100 %	222080233
30	NC_011982	C	6	6	154315	154320	0 %	0 %	0 %	100 %	222080233
31	NC_011982	C	6	6	155616	155621	0 %	0 %	0 %	100 %	222080234
32	NC_011982	A	6	6	158390	158395	100 %	0 %	0 %	0 %	222080237
33	NC_011982	T	6	6	161015	161020	0 %	100 %	0 %	0 %	222080240
34	NC_011982	G	6	6	163174	163179	0 %	0 %	100 %	0 %	222080242
35	NC_011982	T	7	7	165195	165201	0 %	100 %	0 %	0 %	222080244
36	NC_011982	C	6	6	166377	166382	0 %	0 %	0 %	100 %	222080245
37	NC_011982	A	7	7	166422	166428	100 %	0 %	0 %	0 %	222080245
38	NC_011982	T	7	7	167274	167280	0 %	100 %	0 %	0 %	222080245
39	NC_011982	T	6	6	168681	168686	0 %	100 %	0 %	0 %	222080248
40	NC_011982	G	6	6	171653	171658	0 %	0 %	100 %	0 %	222080250
41	NC_011982	A	6	6	175857	175862	100 %	0 %	0 %	0 %	222080254
42	NC_011982	T	6	6	176347	176352	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
43	NC_011982	T	6	6	176358	176363	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
44	NC_011982	T	6	6	176936	176941	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
45	NC_011982	T	7	7	177275	177281	0 %	100 %	0 %	0 %	222080254
46	NC_011982	A	6	6	178391	178396	100 %	0 %	0 %	0 %	222080255
47	NC_011982	G	6	6	183062	183067	0 %	0 %	100 %	0 %	222080258
48	NC_011982	A	6	6	184372	184377	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
49	NC_011982	A	7	7	184692	184698	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
50	NC_011982	A	6	6	185766	185771	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
51	NC_011982	A	6	6	186729	186734	100 %	0 %	0 %	0 %	222080259
52	NC_011982	C	6	6	200661	200666	0 %	0 %	0 %	100 %	222080273
53	NC_011982	A	7	7	206057	206063	100 %	0 %	0 %	0 %	222080277
54	NC_011982	T	6	6	208587	208592	0 %	100 %	0 %	0 %	222080280
55	NC_011982	T	6	6	215354	215359	0 %	100 %	0 %	0 %	222080284
56	NC_011982	A	6	6	215961	215966	100 %	0 %	0 %	0 %	222080284
57	NC_011982	C	6	6	216284	216289	0 %	0 %	0 %	100 %	222080284
58	NC_011982	T	7	7	216885	216891	0 %	100 %	0 %	0 %	222080284
59	NC_011982	G	6	6	221912	221917	0 %	0 %	100 %	0 %	222080287
60	NC_011982	T	6	6	223009	223014	0 %	100 %	0 %	0 %	222080288
61	NC_011982	A	6	6	228702	228707	100 %	0 %	0 %	0 %	222080293
62	NC_011982	A	6	6	237637	237642	100 %	0 %	0 %	0 %	222080301
63	NC_011982	A	6	6	255293	255298	100 %	0 %	0 %	0 %	222080317

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.