MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 316

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	TG	3	6	2615	2620	0 %	50 %	50 %	0 %	222080120
2	NC_011982	GA	3	6	3706	3711	50 %	0 %	50 %	0 %	222080120
3	NC_011982	CG	4	8	4119	4126	0 %	0 %	50 %	50 %	222080121
4	NC_011982	CG	4	8	4226	4233	0 %	0 %	50 %	50 %	222080121
5	NC_011982	GA	3	6	5249	5254	50 %	0 %	50 %	0 %	222080121
6	NC_011982	TG	3	6	5972	5977	0 %	50 %	50 %	0 %	222080122
7	NC_011982	AG	3	6	7925	7930	50 %	0 %	50 %	0 %	222080124
8	NC_011982	AG	3	6	8101	8106	50 %	0 %	50 %	0 %	222080124
9	NC_011982	GA	3	6	8365	8370	50 %	0 %	50 %	0 %	222080124
10	NC_011982	TG	3	6	10491	10496	0 %	50 %	50 %	0 %	222080126
11	NC_011982	CG	3	6	10545	10550	0 %	0 %	50 %	50 %	222080126
12	NC_011982	GC	3	6	11430	11435	0 %	0 %	50 %	50 %	222080127
13	NC_011982	TC	3	6	12050	12055	0 %	50 %	0 %	50 %	222080128
14	NC_011982	GC	3	6	12198	12203	0 %	0 %	50 %	50 %	222080128
15	NC_011982	AC	3	6	15924	15929	50 %	0 %	0 %	50 %	222080133
16	NC_011982	TC	3	6	17303	17308	0 %	50 %	0 %	50 %	222080133
17	NC_011982	GA	3	6	18259	18264	50 %	0 %	50 %	0 %	222080133
18	NC_011982	GC	3	6	18893	18898	0 %	0 %	50 %	50 %	222080134
19	NC_011982	CG	3	6	19239	19244	0 %	0 %	50 %	50 %	222080134
20	NC_011982	GC	3	6	20348	20353	0 %	0 %	50 %	50 %	222080135
21	NC_011982	TC	3	6	20877	20882	0 %	50 %	0 %	50 %	222080135
22	NC_011982	CG	3	6	25373	25378	0 %	0 %	50 %	50 %	222080138
23	NC_011982	CG	3	6	25517	25522	0 %	0 %	50 %	50 %	222080138
24	NC_011982	TA	3	6	25609	25614	50 %	50 %	0 %	0 %	222080138
25	NC_011982	CT	3	6	25870	25875	0 %	50 %	0 %	50 %	222080138
26	NC_011982	GC	4	8	26200	26207	0 %	0 %	50 %	50 %	222080138
27	NC_011982	AG	3	6	28239	28244	50 %	0 %	50 %	0 %	222080140
28	NC_011982	GC	4	8	29424	29431	0 %	0 %	50 %	50 %	222080141
29	NC_011982	CG	3	6	29597	29602	0 %	0 %	50 %	50 %	222080141
30	NC_011982	CG	3	6	29799	29804	0 %	0 %	50 %	50 %	222080141
31	NC_011982	TC	3	6	29867	29872	0 %	50 %	0 %	50 %	222080141
32	NC_011982	GA	3	6	31145	31150	50 %	0 %	50 %	0 %	222080142
33	NC_011982	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	222080144
34	NC_011982	GC	3	6	33633	33638	0 %	0 %	50 %	50 %	222080144
35	NC_011982	CG	3	6	35550	35555	0 %	0 %	50 %	50 %	222080146
36	NC_011982	CG	3	6	35567	35572	0 %	0 %	50 %	50 %	222080146
37	NC_011982	TG	3	6	44229	44234	0 %	50 %	50 %	0 %	222080149
38	NC_011982	AG	3	6	44701	44706	50 %	0 %	50 %	0 %	222080149
39	NC_011982	CT	3	6	45366	45371	0 %	50 %	0 %	50 %	222080150
40	NC_011982	GC	3	6	45667	45672	0 %	0 %	50 %	50 %	222080151
41	NC_011982	TG	3	6	46208	46213	0 %	50 %	50 %	0 %	222080151
42	NC_011982	GT	3	6	46568	46573	0 %	50 %	50 %	0 %	222080151
43	NC_011982	GC	3	6	47941	47946	0 %	0 %	50 %	50 %	222080152
44	NC_011982	GC	3	6	48845	48850	0 %	0 %	50 %	50 %	222080152
45	NC_011982	GA	3	6	49832	49837	50 %	0 %	50 %	0 %	222080153
46	NC_011982	GC	3	6	50284	50289	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
47	NC_011982	AT	3	6	50295	50300	50 %	50 %	0 %	0 %	222080154
48	NC_011982	GC	3	6	51080	51085	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
49	NC_011982	GC	4	8	51567	51574	0 %	0 %	50 %	50 %	222080155
50	NC_011982	CG	3	6	53962	53967	0 %	0 %	50 %	50 %	222080158
51	NC_011982	GC	3	6	54111	54116	0 %	0 %	50 %	50 %	222080158
52	NC_011982	CT	3	6	55210	55215	0 %	50 %	0 %	50 %	222080160
53	NC_011982	GC	3	6	56103	56108	0 %	0 %	50 %	50 %	222080160
54	NC_011982	CG	3	6	57058	57063	0 %	0 %	50 %	50 %	222080161
55	NC_011982	GC	3	6	57404	57409	0 %	0 %	50 %	50 %	222080161
56	NC_011982	CG	3	6	59219	59224	0 %	0 %	50 %	50 %	222080162
57	NC_011982	GC	3	6	59571	59576	0 %	0 %	50 %	50 %	222080162
58	NC_011982	AG	3	6	61053	61058	50 %	0 %	50 %	0 %	222080162
59	NC_011982	AC	3	6	62510	62515	50 %	0 %	0 %	50 %	222080163
60	NC_011982	CG	3	6	62540	62545	0 %	0 %	50 %	50 %	222080163
61	NC_011982	GC	3	6	62596	62601	0 %	0 %	50 %	50 %	222080163
62	NC_011982	GC	3	6	62784	62789	0 %	0 %	50 %	50 %	222080163
63	NC_011982	CG	4	8	63056	63063	0 %	0 %	50 %	50 %	222080163
64	NC_011982	GA	3	6	63210	63215	50 %	0 %	50 %	0 %	222080163
65	NC_011982	TG	3	6	63325	63330	0 %	50 %	50 %	0 %	222080163
66	NC_011982	CG	4	8	63474	63481	0 %	0 %	50 %	50 %	222080163
67	NC_011982	GA	3	6	63838	63843	50 %	0 %	50 %	0 %	222080163
68	NC_011982	GA	3	6	64590	64595	50 %	0 %	50 %	0 %	222080164
69	NC_011982	GC	3	6	64625	64630	0 %	0 %	50 %	50 %	222080164
70	NC_011982	TC	3	6	65671	65676	0 %	50 %	0 %	50 %	222080165
71	NC_011982	TC	3	6	66225	66230	0 %	50 %	0 %	50 %	222080165
72	NC_011982	GA	3	6	66254	66259	50 %	0 %	50 %	0 %	222080165
73	NC_011982	CG	3	6	69154	69159	0 %	0 %	50 %	50 %	222080167
74	NC_011982	CG	5	10	72307	72316	0 %	0 %	50 %	50 %	222080170
75	NC_011982	GC	3	6	73870	73875	0 %	0 %	50 %	50 %	222080172
76	NC_011982	CG	3	6	74216	74221	0 %	0 %	50 %	50 %	222080172
77	NC_011982	TG	3	6	75129	75134	0 %	50 %	50 %	0 %	222080173
78	NC_011982	CG	3	6	75444	75449	0 %	0 %	50 %	50 %	222080173
79	NC_011982	GC	4	8	75525	75532	0 %	0 %	50 %	50 %	222080173
80	NC_011982	GC	3	6	78065	78070	0 %	0 %	50 %	50 %	222080174
81	NC_011982	GC	3	6	79055	79060	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
82	NC_011982	CG	3	6	79229	79234	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
83	NC_011982	GC	3	6	79547	79552	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
84	NC_011982	CT	3	6	79965	79970	0 %	50 %	0 %	50 %	222080176
85	NC_011982	GC	3	6	80081	80086	0 %	0 %	50 %	50 %	222080176
86	NC_011982	GA	3	6	80667	80672	50 %	0 %	50 %	0 %	222080176
87	NC_011982	CG	3	6	81485	81490	0 %	0 %	50 %	50 %	222080177
88	NC_011982	GC	3	6	82095	82100	0 %	0 %	50 %	50 %	222080178
89	NC_011982	CG	3	6	83632	83637	0 %	0 %	50 %	50 %	222080182
90	NC_011982	GC	3	6	83655	83660	0 %	0 %	50 %	50 %	222080182
91	NC_011982	GC	3	6	84482	84487	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
92	NC_011982	CG	4	8	84783	84790	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
93	NC_011982	GC	3	6	84843	84848	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
94	NC_011982	GC	3	6	85162	85167	0 %	0 %	50 %	50 %	222080184
95	NC_011982	CG	3	6	86428	86433	0 %	0 %	50 %	50 %	222080185
96	NC_011982	CG	3	6	86445	86450	0 %	0 %	50 %	50 %	222080185
97	NC_011982	CG	3	6	87749	87754	0 %	0 %	50 %	50 %	222080187
98	NC_011982	GA	3	6	88027	88032	50 %	0 %	50 %	0 %	222080187
99	NC_011982	GC	3	6	88041	88046	0 %	0 %	50 %	50 %	222080187
100	NC_011982	CG	3	6	88242	88247	0 %	0 %	50 %	50 %	222080187
101	NC_011982	GC	3	6	88321	88326	0 %	0 %	50 %	50 %	222080187
102	NC_011982	GC	3	6	89640	89645	0 %	0 %	50 %	50 %	222080187
103	NC_011982	CG	3	6	92165	92170	0 %	0 %	50 %	50 %	222080189
104	NC_011982	CG	3	6	93394	93399	0 %	0 %	50 %	50 %	222080191
105	NC_011982	GC	3	6	95317	95322	0 %	0 %	50 %	50 %	222080193
106	NC_011982	GC	3	6	96042	96047	0 %	0 %	50 %	50 %	222080194
107	NC_011982	GC	3	6	96206	96211	0 %	0 %	50 %	50 %	222080194
108	NC_011982	GC	3	6	96378	96383	0 %	0 %	50 %	50 %	222080194
109	NC_011982	CG	3	6	99278	99283	0 %	0 %	50 %	50 %	222080197
110	NC_011982	GC	4	8	100405	100412	0 %	0 %	50 %	50 %	222080198
111	NC_011982	CT	3	6	100451	100456	0 %	50 %	0 %	50 %	222080198
112	NC_011982	CG	3	6	100477	100482	0 %	0 %	50 %	50 %	222080198
113	NC_011982	CG	3	6	100934	100939	0 %	0 %	50 %	50 %	222080198
114	NC_011982	AT	3	6	101200	101205	50 %	50 %	0 %	0 %	222080199
115	NC_011982	GC	3	6	102412	102417	0 %	0 %	50 %	50 %	222080200
116	NC_011982	TC	3	6	105417	105422	0 %	50 %	0 %	50 %	222080202
117	NC_011982	CT	3	6	105875	105880	0 %	50 %	0 %	50 %	222080203
118	NC_011982	TC	3	6	107964	107969	0 %	50 %	0 %	50 %	222080205
119	NC_011982	GC	4	8	108100	108107	0 %	0 %	50 %	50 %	222080205
120	NC_011982	CA	3	6	108237	108242	50 %	0 %	0 %	50 %	222080205
121	NC_011982	CG	4	8	108636	108643	0 %	0 %	50 %	50 %	222080205
122	NC_011982	CT	3	6	109449	109454	0 %	50 %	0 %	50 %	222080206
123	NC_011982	CG	3	6	110166	110171	0 %	0 %	50 %	50 %	222080206
124	NC_011982	AG	3	6	110279	110284	50 %	0 %	50 %	0 %	222080206
125	NC_011982	GC	3	6	110900	110905	0 %	0 %	50 %	50 %	222080207
126	NC_011982	GC	3	6	111068	111073	0 %	0 %	50 %	50 %	222080207
127	NC_011982	CG	3	6	111442	111447	0 %	0 %	50 %	50 %	222080207
128	NC_011982	AC	3	6	113901	113906	50 %	0 %	0 %	50 %	222080209
129	NC_011982	GC	3	6	114097	114102	0 %	0 %	50 %	50 %	222080209
130	NC_011982	GC	3	6	114200	114205	0 %	0 %	50 %	50 %	222080209
131	NC_011982	GC	3	6	115336	115341	0 %	0 %	50 %	50 %	222080210
132	NC_011982	GA	3	6	115485	115490	50 %	0 %	50 %	0 %	222080210
133	NC_011982	CG	3	6	115834	115839	0 %	0 %	50 %	50 %	222080210
134	NC_011982	GC	3	6	116387	116392	0 %	0 %	50 %	50 %	222080211
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136	NC_011982	TC	3	6	118928	118933	0 %	50 %	0 %	50 %	222080213
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138	NC_011982	CA	3	6	122134	122139	50 %	0 %	0 %	50 %	222080216
139	NC_011982	GC	3	6	123424	123429	0 %	0 %	50 %	50 %	222080217
140	NC_011982	AG	3	6	123694	123699	50 %	0 %	50 %	0 %	222080217
141	NC_011982	GC	3	6	124104	124109	0 %	0 %	50 %	50 %	222080217
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.