MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 476

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	ATCC	2	8	874	881	25 %	25 %	0 %	50 %	222080118
2	NC_011982	TTGA	2	8	1519	1526	25 %	50 %	25 %	0 %	222080119
3	NC_011982	CCAG	2	8	1601	1608	25 %	0 %	25 %	50 %	222080119
4	NC_011982	GCGT	2	8	1803	1810	0 %	25 %	50 %	25 %	222080119
5	NC_011982	CGAT	2	8	1871	1878	25 %	25 %	25 %	25 %	222080119
6	NC_011982	CTGA	2	8	2059	2066	25 %	25 %	25 %	25 %	222080119
7	NC_011982	GGGA	2	8	2152	2159	25 %	0 %	75 %	0 %	222080119
8	NC_011982	TCCA	2	8	2732	2739	25 %	25 %	0 %	50 %	222080120
9	NC_011982	TCCG	2	8	2751	2758	0 %	25 %	25 %	50 %	222080120
10	NC_011982	GAAG	2	8	2990	2997	50 %	0 %	50 %	0 %	222080120
11	NC_011982	TGCG	2	8	3169	3176	0 %	25 %	50 %	25 %	222080120
12	NC_011982	CGCA	2	8	3334	3341	25 %	0 %	25 %	50 %	222080120
13	NC_011982	GCAT	2	8	3579	3586	25 %	25 %	25 %	25 %	222080120
14	NC_011982	CGGC	2	8	3613	3620	0 %	0 %	50 %	50 %	222080120
15	NC_011982	TCGG	2	8	4551	4558	0 %	25 %	50 %	25 %	222080121
16	NC_011982	AGCG	2	8	4579	4586	25 %	0 %	50 %	25 %	222080121
17	NC_011982	GAAG	2	8	6646	6653	50 %	0 %	50 %	0 %	222080123
18	NC_011982	GCCG	2	8	7558	7565	0 %	0 %	50 %	50 %	222080124
19	NC_011982	GGGC	2	8	8340	8347	0 %	0 %	75 %	25 %	222080124
20	NC_011982	CGAG	2	8	9788	9795	25 %	0 %	50 %	25 %	222080125
21	NC_011982	TGGC	2	8	9837	9844	0 %	25 %	50 %	25 %	222080125
22	NC_011982	GGAT	2	8	10373	10380	25 %	25 %	50 %	0 %	222080126
23	NC_011982	TCCG	2	8	10456	10463	0 %	25 %	25 %	50 %	222080126
24	NC_011982	ATTG	2	8	10619	10626	25 %	50 %	25 %	0 %	222080126
25	NC_011982	CAGC	2	8	11643	11650	25 %	0 %	25 %	50 %	222080127
26	NC_011982	GCTG	2	8	12027	12034	0 %	25 %	50 %	25 %	222080128
27	NC_011982	TCGC	2	8	12384	12391	0 %	25 %	25 %	50 %	222080128
28	NC_011982	TCCA	2	8	12496	12503	25 %	25 %	0 %	50 %	222080128
29	NC_011982	TCCA	2	8	12546	12553	25 %	25 %	0 %	50 %	222080128
30	NC_011982	GAAC	2	8	12907	12914	50 %	0 %	25 %	25 %	222080129
31	NC_011982	AGCC	2	8	12990	12997	25 %	0 %	25 %	50 %	222080129
32	NC_011982	ATGG	2	8	13165	13172	25 %	25 %	50 %	0 %	222080130
33	NC_011982	CAGA	2	8	13413	13420	50 %	0 %	25 %	25 %	222080130
34	NC_011982	CGAT	2	8	14986	14993	25 %	25 %	25 %	25 %	222080132
35	NC_011982	GCGG	2	8	15161	15168	0 %	0 %	75 %	25 %	222080132
36	NC_011982	CCGG	2	8	15230	15237	0 %	0 %	50 %	50 %	222080132
37	NC_011982	CCGG	2	8	15782	15789	0 %	0 %	50 %	50 %	222080133
38	NC_011982	AGCG	2	8	15984	15991	25 %	0 %	50 %	25 %	222080133
39	NC_011982	CGGC	2	8	16362	16369	0 %	0 %	50 %	50 %	222080133
40	NC_011982	CCGG	2	8	16989	16996	0 %	0 %	50 %	50 %	222080133
41	NC_011982	ATCC	2	8	17458	17465	25 %	25 %	0 %	50 %	222080133
42	NC_011982	GGCG	2	8	17476	17483	0 %	0 %	75 %	25 %	222080133
43	NC_011982	CCAT	2	8	18115	18122	25 %	25 %	0 %	50 %	222080133
44	NC_011982	GGGC	2	8	20511	20518	0 %	0 %	75 %	25 %	222080135
45	NC_011982	CGCT	2	8	21842	21849	0 %	25 %	25 %	50 %	222080136
46	NC_011982	GCTT	2	8	22086	22093	0 %	50 %	25 %	25 %	222080136
47	NC_011982	TCGC	2	8	25816	25823	0 %	25 %	25 %	50 %	222080138
48	NC_011982	CAAA	2	8	26161	26168	75 %	0 %	0 %	25 %	222080138
49	NC_011982	GTTG	2	8	29741	29748	0 %	50 %	50 %	0 %	222080141
50	NC_011982	TCGC	2	8	29895	29902	0 %	25 %	25 %	50 %	222080141
51	NC_011982	GCAG	2	8	29988	29995	25 %	0 %	50 %	25 %	222080141
52	NC_011982	AACA	2	8	30109	30116	75 %	0 %	0 %	25 %	222080141
53	NC_011982	CGCA	2	8	31014	31021	25 %	0 %	25 %	50 %	222080142
54	NC_011982	GTTC	2	8	31111	31118	0 %	50 %	25 %	25 %	222080142
55	NC_011982	ATTA	2	8	32519	32526	50 %	50 %	0 %	0 %	222080143
56	NC_011982	TCCG	2	8	32673	32680	0 %	25 %	25 %	50 %	222080143
57	NC_011982	TCCT	2	8	32861	32868	0 %	50 %	0 %	50 %	222080143
58	NC_011982	GCAA	2	8	32869	32876	50 %	0 %	25 %	25 %	222080143
59	NC_011982	CCAG	2	8	32977	32984	25 %	0 %	25 %	50 %	222080143
60	NC_011982	GCTG	2	8	33462	33469	0 %	25 %	50 %	25 %	222080144
61	NC_011982	CGGC	2	8	33522	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	222080144
62	NC_011982	TCGC	2	8	33819	33826	0 %	25 %	25 %	50 %	222080144
63	NC_011982	TCCA	2	8	33931	33938	25 %	25 %	0 %	50 %	222080144
64	NC_011982	TCCA	2	8	33981	33988	25 %	25 %	0 %	50 %	222080144
65	NC_011982	TGCC	2	8	35277	35284	0 %	25 %	25 %	50 %	222080145
66	NC_011982	GCCA	2	8	35302	35309	25 %	0 %	25 %	50 %	222080145
67	NC_011982	TCTT	2	8	35558	35565	0 %	75 %	0 %	25 %	222080146
68	NC_011982	GGCC	2	8	35782	35789	0 %	0 %	50 %	50 %	222080147
69	NC_011982	CCCG	2	8	44843	44850	0 %	0 %	25 %	75 %	222080149
70	NC_011982	CGCT	2	8	44933	44940	0 %	25 %	25 %	50 %	222080149
71	NC_011982	GAAA	2	8	45153	45160	75 %	0 %	25 %	0 %	222080150
72	NC_011982	GGCA	2	8	47895	47902	25 %	0 %	50 %	25 %	222080152
73	NC_011982	CAGC	2	8	49853	49860	25 %	0 %	25 %	50 %	222080153
74	NC_011982	CGGC	2	8	50501	50508	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
75	NC_011982	CTGA	2	8	51432	51439	25 %	25 %	25 %	25 %	222080155
76	NC_011982	CTTC	2	8	51729	51736	0 %	50 %	0 %	50 %	222080156
77	NC_011982	GATG	2	8	52667	52674	25 %	25 %	50 %	0 %	222080157
78	NC_011982	GGGT	2	8	52998	53005	0 %	25 %	75 %	0 %	222080157
79	NC_011982	CCTT	2	8	53017	53024	0 %	50 %	0 %	50 %	222080158
80	NC_011982	AGGG	2	8	53380	53387	25 %	0 %	75 %	0 %	222080158
81	NC_011982	CGAA	2	8	53505	53512	50 %	0 %	25 %	25 %	222080158
82	NC_011982	CGAT	2	8	53850	53857	25 %	25 %	25 %	25 %	222080158
83	NC_011982	GCCG	2	8	54174	54181	0 %	0 %	50 %	50 %	222080158
84	NC_011982	CGCC	2	8	55300	55307	0 %	0 %	25 %	75 %	222080160
85	NC_011982	CCTG	2	8	56389	56396	0 %	25 %	25 %	50 %	222080160
86	NC_011982	GCTG	2	8	58085	58092	0 %	25 %	50 %	25 %	222080162
87	NC_011982	TCGA	2	8	58099	58106	25 %	25 %	25 %	25 %	222080162
88	NC_011982	AACG	2	8	58225	58232	50 %	0 %	25 %	25 %	222080162
89	NC_011982	GCCG	2	8	58458	58465	0 %	0 %	50 %	50 %	222080162
90	NC_011982	GGAT	2	8	58547	58554	25 %	25 %	50 %	0 %	222080162
91	NC_011982	CATC	2	8	58566	58573	25 %	25 %	0 %	50 %	222080162
92	NC_011982	ACCG	2	8	58843	58850	25 %	0 %	25 %	50 %	222080162
93	NC_011982	GAAG	2	8	59397	59404	50 %	0 %	50 %	0 %	222080162
94	NC_011982	CGAT	2	8	60089	60096	25 %	25 %	25 %	25 %	222080162
95	NC_011982	GTTC	2	8	60202	60209	0 %	50 %	25 %	25 %	222080162
96	NC_011982	GCTC	2	8	60608	60615	0 %	25 %	25 %	50 %	222080162
97	NC_011982	GGCA	2	8	60716	60723	25 %	0 %	50 %	25 %	222080162
98	NC_011982	CGCC	2	8	60801	60808	0 %	0 %	25 %	75 %	222080162
99	NC_011982	GCAG	2	8	60854	60861	25 %	0 %	50 %	25 %	222080162
100	NC_011982	CATT	2	8	62137	62144	25 %	50 %	0 %	25 %	222080163
101	NC_011982	GTCG	2	8	62451	62458	0 %	25 %	50 %	25 %	222080163
102	NC_011982	CGGA	2	8	62769	62776	25 %	0 %	50 %	25 %	222080163
103	NC_011982	TCGA	2	8	63718	63725	25 %	25 %	25 %	25 %	222080163
104	NC_011982	GAGC	2	8	64499	64506	25 %	0 %	50 %	25 %	222080164
105	NC_011982	GGGT	2	8	69520	69527	0 %	25 %	75 %	0 %	222080167
106	NC_011982	ATGC	2	8	69995	70002	25 %	25 %	25 %	25 %	222080168
107	NC_011982	ACCG	2	8	71662	71669	25 %	0 %	25 %	50 %	222080170
108	NC_011982	CGAA	2	8	71861	71868	50 %	0 %	25 %	25 %	222080170
109	NC_011982	TCGT	2	8	75003	75010	0 %	50 %	25 %	25 %	222080173
110	NC_011982	GTCA	2	8	75091	75098	25 %	25 %	25 %	25 %	222080173
111	NC_011982	TCGG	2	8	75119	75126	0 %	25 %	50 %	25 %	222080173
112	NC_011982	GAAC	2	8	75306	75313	50 %	0 %	25 %	25 %	222080173
113	NC_011982	GAAC	2	8	78131	78138	50 %	0 %	25 %	25 %	222080174
114	NC_011982	TCGG	2	8	79095	79102	0 %	25 %	50 %	25 %	222080175
115	NC_011982	GCGA	2	8	79314	79321	25 %	0 %	50 %	25 %	222080175
116	NC_011982	CGGC	2	8	79458	79465	0 %	0 %	50 %	50 %	222080175
117	NC_011982	CGCT	2	8	79799	79806	0 %	25 %	25 %	50 %	222080176
118	NC_011982	GAAA	2	8	81258	81265	75 %	0 %	25 %	0 %	222080177
119	NC_011982	CGGC	2	8	81423	81430	0 %	0 %	50 %	50 %	222080177
120	NC_011982	CGGT	2	8	81615	81622	0 %	25 %	50 %	25 %	222080177
121	NC_011982	GTTC	2	8	82027	82034	0 %	50 %	25 %	25 %	222080178
122	NC_011982	CGAA	2	8	82968	82975	50 %	0 %	25 %	25 %	222080180
123	NC_011982	CCGA	2	8	83937	83944	25 %	0 %	25 %	50 %	222080183
124	NC_011982	TCGC	2	8	84213	84220	0 %	25 %	25 %	50 %	222080183
125	NC_011982	TCCG	2	8	84355	84362	0 %	25 %	25 %	50 %	222080184
126	NC_011982	GACG	2	8	84391	84398	25 %	0 %	50 %	25 %	222080184
127	NC_011982	CCCG	2	8	84702	84709	0 %	0 %	25 %	75 %	222080184
128	NC_011982	TGTC	2	8	84960	84967	0 %	50 %	25 %	25 %	222080184
129	NC_011982	TTTC	2	8	85047	85054	0 %	75 %	0 %	25 %	222080184
130	NC_011982	CTTC	2	8	85371	85378	0 %	50 %	0 %	50 %	222080184
131	NC_011982	CTCG	2	8	85498	85505	0 %	25 %	25 %	50 %	222080184
132	NC_011982	CGCT	2	8	85801	85808	0 %	25 %	25 %	50 %	222080184
133	NC_011982	TGCC	2	8	86155	86162	0 %	25 %	25 %	50 %	222080184
134	NC_011982	GCCA	2	8	86180	86187	25 %	0 %	25 %	50 %	222080184
135	NC_011982	TCTT	2	8	86436	86443	0 %	75 %	0 %	25 %	222080185
136	NC_011982	GGCC	2	8	86660	86667	0 %	0 %	50 %	50 %	222080186
137	NC_011982	GACG	2	8	87590	87597	25 %	0 %	50 %	25 %	222080187
138	NC_011982	GAAG	2	8	88355	88362	50 %	0 %	50 %	0 %	222080187
139	NC_011982	TCAA	2	8	89494	89501	50 %	25 %	0 %	25 %	222080187
140	NC_011982	GCCC	2	8	89606	89613	0 %	0 %	25 %	75 %	222080187
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