MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011982	CTGATG	2	12	137646	137657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222080225
2002	NC_011982	AGC	2	6	137723	137728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080225
2003	NC_011982	GA	3	6	137762	137767	50 %	0 %	50 %	0 %	222080225
2004	NC_011982	GAC	2	6	137825	137830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080225
2005	NC_011982	GC	3	6	138229	138234	0 %	0 %	50 %	50 %	222080226
2006	NC_011982	ATG	2	6	138317	138322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080226
2007	NC_011982	TCT	2	6	138392	138397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080226
2008	NC_011982	TGC	2	6	138410	138415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080226
2009	NC_011982	GTCT	2	8	138487	138494	0 %	50 %	25 %	25 %	222080226
2010	NC_011982	GCA	2	6	138575	138580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080226
2011	NC_011982	AC	3	6	138592	138597	50 %	0 %	0 %	50 %	222080226
2012	NC_011982	ATAAAA	2	12	138619	138630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222080226
2013	NC_011982	ATTCCA	2	12	138654	138665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080226
2014	NC_011982	GC	3	6	138680	138685	0 %	0 %	50 %	50 %	222080226
2015	NC_011982	TA	3	6	138751	138756	50 %	50 %	0 %	0 %	222080226
2016	NC_011982	A	7	7	138764	138770	100 %	0 %	0 %	0 %	222080226
2017	NC_011982	GAGTG	2	10	138773	138782	20 %	20 %	60 %	0 %	222080226
2018	NC_011982	GAG	2	6	138800	138805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080226
2019	NC_011982	AC	3	6	138888	138893	50 %	0 %	0 %	50 %	222080226
2020	NC_011982	CCG	2	6	138938	138943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080226
2021	NC_011982	TTCG	2	8	138984	138991	0 %	50 %	25 %	25 %	222080226
2022	NC_011982	AAGC	2	8	139134	139141	50 %	0 %	25 %	25 %	222080226
2023	NC_011982	CGC	2	6	139191	139196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080226
2024	NC_011982	CCA	2	6	139208	139213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080226
2025	NC_011982	GAT	2	6	139242	139247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080226
2026	NC_011982	CAG	2	6	141744	141749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2027	NC_011982	ATC	2	6	141767	141772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080227
2028	NC_011982	GGC	2	6	141773	141778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080227
2029	NC_011982	TTG	2	6	141801	141806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080227
2030	NC_011982	AGC	2	6	141851	141856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2031	NC_011982	CG	3	6	141880	141885	0 %	0 %	50 %	50 %	222080227
2032	NC_011982	TGC	2	6	141895	141900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2033	NC_011982	GA	3	6	141943	141948	50 %	0 %	50 %	0 %	222080227
2034	NC_011982	CGA	2	6	141978	141983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2035	NC_011982	CGC	2	6	142065	142070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080227
2036	NC_011982	ACG	2	6	142131	142136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2037	NC_011982	ATT	2	6	142156	142161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080227
2038	NC_011982	GATT	2	8	142343	142350	25 %	50 %	25 %	0 %	222080227
2039	NC_011982	ACGG	2	8	142417	142424	25 %	0 %	50 %	25 %	222080227
2040	NC_011982	TTTC	2	8	142436	142443	0 %	75 %	0 %	25 %	222080227
2041	NC_011982	TCA	2	6	142459	142464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080227
2042	NC_011982	CTT	2	6	142557	142562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080227
2043	NC_011982	GAT	2	6	142580	142585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080227
2044	NC_011982	GGC	2	6	142653	142658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080227
2045	NC_011982	ACG	2	6	142708	142713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2046	NC_011982	GTC	2	6	142728	142733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2047	NC_011982	TTG	2	6	142737	142742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080227
2048	NC_011982	AGA	2	6	142757	142762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080227
2049	NC_011982	ACC	2	6	142788	142793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080227
2050	NC_011982	GCGATC	2	12	142794	142805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2051	NC_011982	GAAAA	2	10	142815	142824	80 %	0 %	20 %	0 %	222080227
2052	NC_011982	GAT	2	6	142939	142944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080227
2053	NC_011982	CAG	2	6	142967	142972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2054	NC_011982	TCG	2	6	143021	143026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2055	NC_011982	CGG	2	6	143064	143069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
2056	NC_011982	GTCAA	2	10	143072	143081	40 %	20 %	20 %	20 %	222080228
2057	NC_011982	CGTT	2	8	143091	143098	0 %	50 %	25 %	25 %	222080228
2058	NC_011982	TCA	2	6	143141	143146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080228
2059	NC_011982	TAA	2	6	143194	143199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080228
2060	NC_011982	TCG	2	6	143238	143243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2061	NC_011982	CGA	2	6	143395	143400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2062	NC_011982	GTT	2	6	143408	143413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080228
2063	NC_011982	ATCT	2	8	143445	143452	25 %	50 %	0 %	25 %	222080228
2064	NC_011982	GCGCC	2	10	143545	143554	0 %	0 %	40 %	60 %	222080228
2065	NC_011982	CGC	2	6	143619	143624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080228
2066	NC_011982	TAA	2	6	143668	143673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080228
2067	NC_011982	CGG	2	6	143690	143695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
2068	NC_011982	CGG	2	6	143753	143758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
2069	NC_011982	CTA	2	6	143790	143795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080228
2070	NC_011982	TAT	2	6	143836	143841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080228
2071	NC_011982	AAAC	2	8	143852	143859	75 %	0 %	0 %	25 %	222080228
2072	NC_011982	GCT	2	6	143917	143922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2073	NC_011982	TGC	2	6	144272	144277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2074	NC_011982	GC	3	6	144280	144285	0 %	0 %	50 %	50 %	222080229
2075	NC_011982	GCT	2	6	144335	144340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2076	NC_011982	GAA	2	6	144344	144349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080229
2077	NC_011982	CTT	2	6	144402	144407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080229
2078	NC_011982	GTC	2	6	144442	144447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2079	NC_011982	AT	3	6	144482	144487	50 %	50 %	0 %	0 %	222080229
2080	NC_011982	GGTGA	2	10	144600	144609	20 %	20 %	60 %	0 %	222080229
2081	NC_011982	CAA	2	6	144684	144689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080229
2082	NC_011982	GCGG	2	8	144836	144843	0 %	0 %	75 %	25 %	222080229
2083	NC_011982	CGTTC	2	10	144896	144905	0 %	40 %	20 %	40 %	222080229
2084	NC_011982	TC	4	8	144963	144970	0 %	50 %	0 %	50 %	222080229
2085	NC_011982	TAA	2	6	144977	144982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080229
2086	NC_011982	A	7	7	145054	145060	100 %	0 %	0 %	0 %	222080229
2087	NC_011982	CTC	2	6	145161	145166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080229
2088	NC_011982	GAT	2	6	145193	145198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080229
2089	NC_011982	CAG	2	6	145203	145208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2090	NC_011982	GAT	2	6	145256	145261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080229
2091	NC_011982	GGGCT	2	10	145277	145286	0 %	20 %	60 %	20 %	222080229
2092	NC_011982	AGA	2	6	145294	145299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080229
2093	NC_011982	GGC	2	6	145383	145388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080229
2094	NC_011982	TGAT	2	8	145402	145409	25 %	50 %	25 %	0 %	222080229
2095	NC_011982	T	6	6	145513	145518	0 %	100 %	0 %	0 %	222080230
2096	NC_011982	CGG	2	6	145552	145557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2097	NC_011982	CGG	2	6	145630	145635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2098	NC_011982	TTGC	2	8	145661	145668	0 %	50 %	25 %	25 %	222080230
2099	NC_011982	ACC	2	6	145684	145689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080230
2100	NC_011982	TTGA	2	8	145697	145704	25 %	50 %	25 %	0 %	222080230
2101	NC_011982	AGG	2	6	145708	145713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080230
2102	NC_011982	GTGAA	2	10	145725	145734	40 %	20 %	40 %	0 %	222080230
2103	NC_011982	GCGG	2	8	145744	145751	0 %	0 %	75 %	25 %	222080230
2104	NC_011982	AAG	2	6	145854	145859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080230
2105	NC_011982	GCG	2	6	145929	145934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2106	NC_011982	GCT	2	6	145978	145983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2107	NC_011982	GCT	2	6	146014	146019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2108	NC_011982	CAAAC	2	10	146171	146180	60 %	0 %	0 %	40 %	222080230
2109	NC_011982	GAT	2	6	146198	146203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080230
2110	NC_011982	GTG	2	6	146268	146273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080230
2111	NC_011982	CGA	2	6	146287	146292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2112	NC_011982	TCG	2	6	146343	146348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2113	NC_011982	GCG	2	6	146381	146386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2114	NC_011982	GC	3	6	146452	146457	0 %	0 %	50 %	50 %	222080230
2115	NC_011982	AGCG	2	8	146487	146494	25 %	0 %	50 %	25 %	222080230
2116	NC_011982	TCG	2	6	146541	146546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2117	NC_011982	TGCC	2	8	146568	146575	0 %	25 %	25 %	50 %	222080230
2118	NC_011982	ATCA	2	8	146580	146587	50 %	25 %	0 %	25 %	222080230
2119	NC_011982	CG	3	6	148237	148242	0 %	0 %	50 %	50 %	222080231
2120	NC_011982	CGT	2	6	148254	148259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2121	NC_011982	T	6	6	148343	148348	0 %	100 %	0 %	0 %	222080231
2122	NC_011982	CTT	2	6	148382	148387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080231
2123	NC_011982	TCTG	2	8	148485	148492	0 %	50 %	25 %	25 %	222080231
2124	NC_011982	GCA	2	6	148510	148515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2125	NC_011982	CGT	2	6	148639	148644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2126	NC_011982	GTCCG	2	10	148789	148798	0 %	20 %	40 %	40 %	222080231
2127	NC_011982	TGG	2	6	148902	148907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080231
2128	NC_011982	TCGT	2	8	148970	148977	0 %	50 %	25 %	25 %	222080231
2129	NC_011982	CCCGT	2	10	149058	149067	0 %	20 %	20 %	60 %	222080231
2130	NC_011982	GCT	2	6	149109	149114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2131	NC_011982	CGT	2	6	149161	149166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
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2137	NC_011982	GGCTG	2	10	149487	149496	0 %	20 %	60 %	20 %	222080231
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2142	NC_011982	GC	3	6	149688	149693	0 %	0 %	50 %	50 %	222080231
2143	NC_011982	TCA	2	6	149739	149744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080231
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2147	NC_011982	CG	3	6	150003	150008	0 %	0 %	50 %	50 %	222080231
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2150	NC_011982	GATC	2	8	150130	150137	25 %	25 %	25 %	25 %	222080231
2151	NC_011982	CTG	2	6	150179	150184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
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2161	NC_011982	TAT	2	6	150410	150415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080231
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2230	NC_011982	TCG	2	6	154223	154228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
2231	NC_011982	GTC	2	6	154243	154248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
2232	NC_011982	GGCTC	2	10	154266	154275	0 %	20 %	40 %	40 %	222080233
2233	NC_011982	C	6	6	154315	154320	0 %	0 %	0 %	100 %	222080233
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2236	NC_011982	TCG	2	6	154448	154453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
2237	NC_011982	GTC	2	6	154468	154473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080233
2238	NC_011982	GAACT	2	10	154503	154512	40 %	20 %	20 %	20 %	222080233
2239	NC_011982	CGC	2	6	154575	154580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080233
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2242	NC_011982	TGT	2	6	154677	154682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080233
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2244	NC_011982	TTG	2	6	154745	154750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080233
2245	NC_011982	TTC	2	6	154801	154806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080233
2246	NC_011982	TTGAG	2	10	154837	154846	20 %	40 %	40 %	0 %	222080233
2247	NC_011982	CT	3	6	154904	154909	0 %	50 %	0 %	50 %	222080233
2248	NC_011982	ATC	2	6	154921	154926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080233
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2258	NC_011982	GCTCG	2	10	155573	155582	0 %	20 %	40 %	40 %	222080234
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2353	NC_011982	CGT	2	6	160131	160136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080239
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2365	NC_011982	CCA	2	6	160937	160942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080240
2366	NC_011982	AAATCC	2	12	160970	160981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222080240
2367	NC_011982	CG	3	6	160982	160987	0 %	0 %	50 %	50 %	222080240
2368	NC_011982	T	6	6	161015	161020	0 %	100 %	0 %	0 %	222080240
2369	NC_011982	GTT	2	6	161080	161085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080240
2370	NC_011982	GCCG	2	8	161110	161117	0 %	0 %	50 %	50 %	222080240
2371	NC_011982	GCC	2	6	161138	161143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080240
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2374	NC_011982	ACG	2	6	161267	161272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080240
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2386	NC_011982	CT	3	6	162001	162006	0 %	50 %	0 %	50 %	222080240
2387	NC_011982	CCT	2	6	162021	162026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080240
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2390	NC_011982	ACGT	2	8	162255	162262	25 %	25 %	25 %	25 %	222080241
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2392	NC_011982	CTT	2	6	162461	162466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080241
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2395	NC_011982	GGCTGC	2	12	162619	162630	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222080241
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2397	NC_011982	CGT	2	6	162920	162925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080242
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2455	NC_011982	GCAC	2	8	166386	166393	25 %	0 %	25 %	50 %	222080245
2456	NC_011982	A	7	7	166422	166428	100 %	0 %	0 %	0 %	222080245
2457	NC_011982	GCCA	2	8	166445	166452	25 %	0 %	25 %	50 %	222080245
2458	NC_011982	TGCTC	2	10	166453	166462	0 %	40 %	20 %	40 %	222080245
2459	NC_011982	GTT	2	6	166491	166496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080245
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2462	NC_011982	ACCGC	2	10	166596	166605	20 %	0 %	20 %	60 %	222080245
2463	NC_011982	ACGTG	2	10	166667	166676	20 %	20 %	40 %	20 %	222080245
2464	NC_011982	ATC	2	6	166826	166831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080245
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2467	NC_011982	AAGA	2	8	166998	167005	75 %	0 %	25 %	0 %	222080245
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2470	NC_011982	T	7	7	167274	167280	0 %	100 %	0 %	0 %	222080245
2471	NC_011982	CGA	2	6	167295	167300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080245
2472	NC_011982	GC	3	6	167317	167322	0 %	0 %	50 %	50 %	222080245
2473	NC_011982	TCC	2	6	167343	167348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080245
2474	NC_011982	GTG	2	6	167397	167402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080245
2475	NC_011982	GAG	2	6	167434	167439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080245
2476	NC_011982	GA	3	6	167484	167489	50 %	0 %	50 %	0 %	222080245
2477	NC_011982	GCT	2	6	167494	167499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080245
2478	NC_011982	CGG	2	6	167549	167554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080245
2479	NC_011982	GACG	2	8	167572	167579	25 %	0 %	50 %	25 %	222080245
2480	NC_011982	ATC	2	6	167603	167608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080245
2481	NC_011982	GC	3	6	167645	167650	0 %	0 %	50 %	50 %	222080245
2482	NC_011982	GAAGG	2	10	167678	167687	40 %	0 %	60 %	0 %	222080245
2483	NC_011982	TCC	2	6	167721	167726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080245
2484	NC_011982	AGA	2	6	167727	167732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080245
2485	NC_011982	TC	3	6	167783	167788	0 %	50 %	0 %	50 %	222080245
2486	NC_011982	GTCC	2	8	167790	167797	0 %	25 %	25 %	50 %	222080245
2487	NC_011982	TTCCTC	2	12	167820	167831	0 %	50 %	0 %	50 %	222080246
2488	NC_011982	CGCCC	2	10	167866	167875	0 %	0 %	20 %	80 %	222080246
2489	NC_011982	ACG	2	6	167954	167959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080246
2490	NC_011982	CAT	2	6	168040	168045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080246
2491	NC_011982	GAA	2	6	168076	168081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080246
2492	NC_011982	TCG	2	6	168093	168098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080246
2493	NC_011982	CTT	2	6	168117	168122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080246
2494	NC_011982	ATC	2	6	168134	168139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080246
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2496	NC_011982	GCGA	2	8	168277	168284	25 %	0 %	50 %	25 %	222080247
2497	NC_011982	TTG	2	6	168319	168324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080247
2498	NC_011982	AAAC	2	8	168381	168388	75 %	0 %	0 %	25 %	222080247
2499	NC_011982	CAG	2	6	168429	168434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080247
2500	NC_011982	TCAG	2	8	168516	168523	25 %	25 %	25 %	25 %	222080248

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