MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011981	TGG	2	6	152042	152047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102553
2502	NC_011981	TGG	2	6	152096	152101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102553
2503	NC_011981	GCG	2	6	152132	152137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102553
2504	NC_011981	GCCA	2	8	152151	152158	25 %	0 %	25 %	50 %	222102553
2505	NC_011981	CGC	3	9	152176	152184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102553
2506	NC_011981	GAT	2	6	152190	152195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102553
2507	NC_011981	CGC	2	6	152255	152260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102553
2508	NC_011981	CGC	3	9	152290	152298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102553
2509	NC_011981	TTG	2	6	152303	152308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102553
2510	NC_011981	ATT	2	6	152314	152319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102553
2511	NC_011981	CGG	2	6	152373	152378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102553
2512	NC_011981	CAT	2	6	152409	152414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102553
2513	NC_011981	TGG	2	6	152429	152434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102553
2514	NC_011981	TG	3	6	152435	152440	0 %	50 %	50 %	0 %	222102553
2515	NC_011981	CTG	2	6	152491	152496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102553
2516	NC_011981	GCC	2	6	152510	152515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102553
2517	NC_011981	TGTT	2	8	152531	152538	0 %	75 %	25 %	0 %	222102553
2518	NC_011981	GGT	2	6	152553	152558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102553
2519	NC_011981	GCAG	2	8	152700	152707	25 %	0 %	50 %	25 %	222102553
2520	NC_011981	GAT	2	6	152949	152954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102554
2521	NC_011981	GGC	2	6	152959	152964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102554
2522	NC_011981	GC	3	6	153004	153009	0 %	0 %	50 %	50 %	222102554
2523	NC_011981	CGG	2	6	153156	153161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102554
2524	NC_011981	GCC	2	6	153206	153211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102554
2525	NC_011981	GC	3	6	153282	153287	0 %	0 %	50 %	50 %	222102554
2526	NC_011981	TGGC	2	8	153345	153352	0 %	25 %	50 %	25 %	222102554
2527	NC_011981	GCCA	2	8	153406	153413	25 %	0 %	25 %	50 %	222102554
2528	NC_011981	ACCGC	2	10	153434	153443	20 %	0 %	20 %	60 %	222102554
2529	NC_011981	CGC	2	6	153462	153467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102554
2530	NC_011981	CAT	2	6	153469	153474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102554
2531	NC_011981	CGC	2	6	153500	153505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102554
2532	NC_011981	CGC	2	6	153552	153557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102554
2533	NC_011981	GGC	2	6	153605	153610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102554
2534	NC_011981	GCC	2	6	153640	153645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102554
2535	NC_011981	CACGCC	2	12	153646	153657	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222102554
2536	NC_011981	AAC	2	6	153700	153705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102554
2537	NC_011981	CCG	2	6	153716	153721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102554
2538	NC_011981	GAG	2	6	153742	153747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102554
2539	NC_011981	GAT	2	6	153996	154001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102555
2540	NC_011981	GC	3	6	154016	154021	0 %	0 %	50 %	50 %	222102555
2541	NC_011981	GCTT	2	8	154058	154065	0 %	50 %	25 %	25 %	222102555
2542	NC_011981	AGG	2	6	154160	154165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102555
2543	NC_011981	TGA	2	6	154241	154246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102555
2544	NC_011981	CCG	2	6	154341	154346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102555
2545	NC_011981	CAC	2	6	154425	154430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102555
2546	NC_011981	CCAG	2	8	154691	154698	25 %	0 %	25 %	50 %	222102555
2547	NC_011981	GCG	2	6	154712	154717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102555
2548	NC_011981	GGC	2	6	154737	154742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102555
2549	NC_011981	CAC	2	6	154809	154814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102555
2550	NC_011981	GCACA	2	10	154818	154827	40 %	0 %	20 %	40 %	222102555
2551	NC_011981	A	6	6	154859	154864	100 %	0 %	0 %	0 %	222102555
2552	NC_011981	TCA	2	6	155003	155008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102555
2553	NC_011981	CCA	2	6	155054	155059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102555
2554	NC_011981	GCG	2	6	155075	155080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102555
2555	NC_011981	ACAATC	2	12	155141	155152	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222102555
2556	NC_011981	TGC	2	6	155156	155161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102555
2557	NC_011981	GGT	2	6	155172	155177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102555
2558	NC_011981	ATT	2	6	155183	155188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102555
2559	NC_011981	CAC	3	9	155199	155207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102555
2560	NC_011981	AAG	2	6	155216	155221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102555
2561	NC_011981	TCA	2	6	155434	155439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102556
2562	NC_011981	TCAC	2	8	155458	155465	25 %	25 %	0 %	50 %	222102556
2563	NC_011981	GGC	2	6	155581	155586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102556
2564	NC_011981	GCC	2	6	155628	155633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102556
2565	NC_011981	GCC	2	6	155668	155673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102556
2566	NC_011981	GGC	2	6	155685	155690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102556
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2568	NC_011981	TGC	2	6	155759	155764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102556
2569	NC_011981	CCAG	2	8	155795	155802	25 %	0 %	25 %	50 %	222102556
2570	NC_011981	GCG	2	6	155813	155818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102556
2571	NC_011981	TTC	2	6	155850	155855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102556
2572	NC_011981	CCA	2	6	155888	155893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102556
2573	NC_011981	GGA	2	6	155913	155918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102556
2574	NC_011981	TGC	3	9	155934	155942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102556
2575	NC_011981	CAG	2	6	155946	155951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102556
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2579	NC_011981	TCC	2	6	156297	156302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102557
2580	NC_011981	GGTT	2	8	156458	156465	0 %	50 %	50 %	0 %	222102557
2581	NC_011981	CA	4	8	156469	156476	50 %	0 %	0 %	50 %	222102557
2582	NC_011981	GCGG	2	8	156484	156491	0 %	0 %	75 %	25 %	222102557
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2585	NC_011981	AGA	2	6	156591	156596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102557
2586	NC_011981	GCT	2	6	156607	156612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102557
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2589	NC_011981	CCG	2	6	156771	156776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102557
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2592	NC_011981	CAT	2	6	156898	156903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102557
2593	NC_011981	GCT	2	6	156922	156927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102557
2594	NC_011981	GCCACC	2	12	156953	156964	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222102557
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2598	NC_011981	CAGC	2	8	157210	157217	25 %	0 %	25 %	50 %	222102557
2599	NC_011981	CGC	2	6	157221	157226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102557
2600	NC_011981	AGC	2	6	157242	157247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102557
2601	NC_011981	AAT	2	6	157250	157255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102557
2602	NC_011981	CAG	2	6	157304	157309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102557
2603	NC_011981	CGG	2	6	157318	157323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102557
2604	NC_011981	CAC	2	6	157340	157345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102557
2605	NC_011981	GCC	2	6	157390	157395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102557
2606	NC_011981	TCA	2	6	157404	157409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102557
2607	NC_011981	GGC	2	6	157474	157479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102557
2608	NC_011981	CCG	2	6	157559	157564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102557
2609	NC_011981	G	6	6	157649	157654	0 %	0 %	100 %	0 %	222102557
2610	NC_011981	ATCA	2	8	157655	157662	50 %	25 %	0 %	25 %	222102557
2611	NC_011981	GTTTT	2	10	157825	157834	0 %	80 %	20 %	0 %	222102557
2612	NC_011981	CAG	2	6	157924	157929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102558
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2615	NC_011981	TGG	2	6	158091	158096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102558
2616	NC_011981	CCGGC	2	10	158109	158118	0 %	0 %	40 %	60 %	222102558
2617	NC_011981	TGCGGC	2	12	158148	158159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222102558
2618	NC_011981	GCC	2	6	158180	158185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102558
2619	NC_011981	CCA	2	6	158205	158210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102558
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2621	NC_011981	ATG	2	6	158312	158317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102558
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2986	NC_011981	AAT	2	6	182206	182211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102575
2987	NC_011981	CTG	2	6	182212	182217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102575
2988	NC_011981	CCA	2	6	182337	182342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102575
2989	NC_011981	CCG	2	6	182436	182441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102575
2990	NC_011981	CAT	2	6	182457	182462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102575
2991	NC_011981	CCA	2	6	182631	182636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102575
2992	NC_011981	CCG	2	6	182675	182680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102575
2993	NC_011981	GCG	2	6	182696	182701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102575
2994	NC_011981	CCG	2	6	182711	182716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102575
2995	NC_011981	CAG	2	6	182832	182837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102576
2996	NC_011981	CAG	2	6	182919	182924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102576
2997	NC_011981	GGCGTG	2	12	182969	182980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222102576
2998	NC_011981	CGC	2	6	183009	183014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102576
2999	NC_011981	GCA	2	6	183032	183037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102576
3000	NC_011981	GA	3	6	183107	183112	50 %	0 %	50 %	0 %	222102576

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