MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011981	GAT	2	6	125083	125088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102529
2002	NC_011981	CG	4	8	125090	125097	0 %	0 %	50 %	50 %	222102529
2003	NC_011981	TGG	2	6	125159	125164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102529
2004	NC_011981	TGT	2	6	125180	125185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102529
2005	NC_011981	TGG	2	6	125222	125227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102529
2006	NC_011981	GGC	2	6	125257	125262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102529
2007	NC_011981	TTG	2	6	125285	125290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102529
2008	NC_011981	CGG	3	9	125349	125357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102529
2009	NC_011981	CCGCC	2	10	125406	125415	0 %	0 %	20 %	80 %	222102529
2010	NC_011981	CTG	2	6	125539	125544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102530
2011	NC_011981	GCT	2	6	125548	125553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102530
2012	NC_011981	CAT	2	6	125586	125591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102530
2013	NC_011981	ATG	2	6	125683	125688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102530
2014	NC_011981	ATC	2	6	125755	125760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102530
2015	NC_011981	TTGGC	2	10	125783	125792	0 %	40 %	40 %	20 %	222102530
2016	NC_011981	TTC	2	6	125857	125862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102530
2017	NC_011981	GTT	2	6	125871	125876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102530
2018	NC_011981	CAA	2	6	125961	125966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102530
2019	NC_011981	CGGT	2	8	125973	125980	0 %	25 %	50 %	25 %	222102530
2020	NC_011981	CGG	2	6	126083	126088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102530
2021	NC_011981	TCA	3	9	126245	126253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102530
2022	NC_011981	GGC	2	6	126294	126299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102530
2023	NC_011981	CTG	2	6	126310	126315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102530
2024	NC_011981	GCT	2	6	126372	126377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102530
2025	NC_011981	TCA	2	6	126410	126415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102530
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2029	NC_011981	TCT	2	6	126565	126570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102531
2030	NC_011981	GC	3	6	126577	126582	0 %	0 %	50 %	50 %	222102531
2031	NC_011981	GTCA	2	8	126600	126607	25 %	25 %	25 %	25 %	222102531
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2037	NC_011981	CTG	2	6	126864	126869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102531
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2040	NC_011981	TGGA	2	8	126931	126938	25 %	25 %	50 %	0 %	222102531
2041	NC_011981	GCT	2	6	126962	126967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102531
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2043	NC_011981	GCCA	3	12	127089	127100	25 %	0 %	25 %	50 %	222102531
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2047	NC_011981	ATCAT	2	10	127291	127300	40 %	40 %	0 %	20 %	222102531
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2049	NC_011981	CGG	2	6	127385	127390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102531
2050	NC_011981	TGA	2	6	127607	127612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102531
2051	NC_011981	CTG	2	6	127644	127649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102531
2052	NC_011981	CACC	2	8	127666	127673	25 %	0 %	0 %	75 %	222102531
2053	NC_011981	GGT	3	9	127683	127691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102531
2054	NC_011981	TCT	2	6	127763	127768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102531
2055	NC_011981	CAAG	2	8	127781	127788	50 %	0 %	25 %	25 %	222102531
2056	NC_011981	GCA	2	6	127952	127957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102532
2057	NC_011981	GAC	2	6	127996	128001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102532
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2059	NC_011981	CATC	2	8	128076	128083	25 %	25 %	0 %	50 %	222102532
2060	NC_011981	GGC	2	6	128129	128134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102532
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2062	NC_011981	GC	3	6	128232	128237	0 %	0 %	50 %	50 %	222102532
2063	NC_011981	CCA	2	6	128295	128300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102532
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2083	NC_011981	GCA	2	6	129720	129725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102533
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2088	NC_011981	CTGG	2	8	129894	129901	0 %	25 %	50 %	25 %	222102533
2089	NC_011981	CGG	2	6	129911	129916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102533
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2091	NC_011981	CCAT	2	8	129984	129991	25 %	25 %	0 %	50 %	222102533
2092	NC_011981	ATC	2	6	130029	130034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102533
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2096	NC_011981	GC	3	6	130173	130178	0 %	0 %	50 %	50 %	222102533
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2120	NC_011981	TCG	2	6	131325	131330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102534
2121	NC_011981	A	6	6	131647	131652	100 %	0 %	0 %	0 %	222102535
2122	NC_011981	TGC	2	6	131709	131714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
2123	NC_011981	GGT	2	6	131724	131729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102535
2124	NC_011981	AAG	2	6	132025	132030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102535
2125	NC_011981	GGC	2	6	132033	132038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102535
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2129	NC_011981	CTG	2	6	132421	132426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102535
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2242	NC_011981	CAT	2	6	138075	138080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102542
2243	NC_011981	TCC	2	6	138119	138124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102542
2244	NC_011981	CGATG	2	10	138138	138147	20 %	20 %	40 %	20 %	222102542
2245	NC_011981	GCG	2	6	138152	138157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102542
2246	NC_011981	GCGG	2	8	138163	138170	0 %	0 %	75 %	25 %	222102542
2247	NC_011981	GC	3	6	138206	138211	0 %	0 %	50 %	50 %	222102542
2248	NC_011981	GAT	2	6	138295	138300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102542
2249	NC_011981	TCA	2	6	138314	138319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102542
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2251	NC_011981	CAG	2	6	138439	138444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102542
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2253	NC_011981	GCA	2	6	138551	138556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102542
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2255	NC_011981	TCT	2	6	138647	138652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102542
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2257	NC_011981	CGG	2	6	138744	138749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102542
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2259	NC_011981	ATC	2	6	138874	138879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102542
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2261	NC_011981	ATG	2	6	138938	138943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102542
2262	NC_011981	CTG	2	6	138950	138955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102543
2263	NC_011981	GCCCG	2	10	138985	138994	0 %	0 %	40 %	60 %	222102543
2264	NC_011981	GGGT	2	8	139033	139040	0 %	25 %	75 %	0 %	222102543
2265	NC_011981	ACG	2	6	139117	139122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102543
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2272	NC_011981	TGC	2	6	139556	139561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102543
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2322	NC_011981	GAC	2	6	141763	141768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102545
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2325	NC_011981	CCAG	2	8	141945	141952	25 %	0 %	25 %	50 %	222102545
2326	NC_011981	GCGA	2	8	142019	142026	25 %	0 %	50 %	25 %	222102545
2327	NC_011981	GCA	2	6	142061	142066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102545
2328	NC_011981	GCAG	2	8	142097	142104	25 %	0 %	50 %	25 %	222102545
2329	NC_011981	TG	3	6	142183	142188	0 %	50 %	50 %	0 %	222102545
2330	NC_011981	GGC	2	6	142225	142230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102545
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2333	NC_011981	CCAG	2	8	142466	142473	25 %	0 %	25 %	50 %	222102546
2334	NC_011981	GGGC	2	8	142489	142496	0 %	0 %	75 %	25 %	222102546
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2346	NC_011981	CAAC	2	8	143192	143199	50 %	0 %	0 %	50 %	222102546
2347	NC_011981	GTCTG	2	10	143205	143214	0 %	40 %	40 %	20 %	222102546
2348	NC_011981	ACC	2	6	143218	143223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102546
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2352	NC_011981	TGA	2	6	143366	143371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102546
2353	NC_011981	GAT	2	6	143505	143510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102546
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2355	NC_011981	ACA	2	6	143561	143566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102546
2356	NC_011981	GAA	2	6	143594	143599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102546
2357	NC_011981	TCACT	2	10	143648	143657	20 %	40 %	0 %	40 %	222102546
2358	NC_011981	TTG	2	6	143668	143673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102546
2359	NC_011981	GCT	2	6	143690	143695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102546
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2361	NC_011981	TGG	2	6	143937	143942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102546
2362	NC_011981	CTG	2	6	143961	143966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102546
2363	NC_011981	GCG	2	6	144072	144077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102546
2364	NC_011981	TCA	3	9	144083	144091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102546
2365	NC_011981	GCTC	2	8	144804	144811	0 %	25 %	25 %	50 %	222102547
2366	NC_011981	GGATC	2	10	144833	144842	20 %	20 %	40 %	20 %	222102547
2367	NC_011981	G	6	6	144853	144858	0 %	0 %	100 %	0 %	222102547
2368	NC_011981	GAT	2	6	144886	144891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102547
2369	NC_011981	GAT	2	6	144901	144906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102547
2370	NC_011981	GCC	2	6	144929	144934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102547
2371	NC_011981	CAC	2	6	144977	144982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102547
2372	NC_011981	T	8	8	145016	145023	0 %	100 %	0 %	0 %	222102547
2373	NC_011981	GCA	2	6	145048	145053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102547
2374	NC_011981	TGG	2	6	145063	145068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102547
2375	NC_011981	CAG	2	6	145070	145075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102547
2376	NC_011981	GC	3	6	145126	145131	0 %	0 %	50 %	50 %	222102547
2377	NC_011981	TGG	2	6	145138	145143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102547
2378	NC_011981	CAG	2	6	145214	145219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102547
2379	NC_011981	GAA	2	6	145223	145228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102547
2380	NC_011981	GTT	2	6	145273	145278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102547
2381	NC_011981	CAG	2	6	145316	145321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102547
2382	NC_011981	ATC	2	6	145325	145330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102547
2383	NC_011981	CCT	2	6	145426	145431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102547
2384	NC_011981	TTG	2	6	145590	145595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102547
2385	NC_011981	GGCT	2	8	145615	145622	0 %	25 %	50 %	25 %	222102547
2386	NC_011981	ACC	2	6	145740	145745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102547
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2389	NC_011981	CGG	2	6	145870	145875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102547
2390	NC_011981	CG	3	6	145891	145896	0 %	0 %	50 %	50 %	222102547
2391	NC_011981	AAG	2	6	146045	146050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102548
2392	NC_011981	CAG	2	6	146085	146090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102548
2393	NC_011981	GGC	2	6	146146	146151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102548
2394	NC_011981	GCG	2	6	146194	146199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102548
2395	NC_011981	CCA	2	6	146262	146267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102548
2396	NC_011981	CCG	2	6	146406	146411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102548
2397	NC_011981	CCT	2	6	146460	146465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102548
2398	NC_011981	TCCA	2	8	146515	146522	25 %	25 %	0 %	50 %	222102548
2399	NC_011981	GTGATG	2	12	146534	146545	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222102548
2400	NC_011981	TCAG	2	8	146546	146553	25 %	25 %	25 %	25 %	222102548
2401	NC_011981	GC	3	6	146618	146623	0 %	0 %	50 %	50 %	222102548
2402	NC_011981	CAA	2	6	146631	146636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102548
2403	NC_011981	CAA	2	6	146673	146678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102548
2404	NC_011981	TGA	2	6	146715	146720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102548
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2410	NC_011981	AGGCGA	2	12	147087	147098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222102549
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2412	NC_011981	GAT	2	6	147106	147111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102549
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2414	NC_011981	TCC	2	6	147197	147202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102549
2415	NC_011981	CTG	2	6	147211	147216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102549
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2417	NC_011981	GCT	3	9	147263	147271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102549
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2420	NC_011981	GGCG	2	8	147561	147568	0 %	0 %	75 %	25 %	222102549
2421	NC_011981	CAG	2	6	147607	147612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102549
2422	NC_011981	GCT	2	6	147620	147625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102549
2423	NC_011981	GC	3	6	147702	147707	0 %	0 %	50 %	50 %	222102549
2424	NC_011981	ATCA	2	8	147745	147752	50 %	25 %	0 %	25 %	222102549
2425	NC_011981	GGCGC	2	10	147763	147772	0 %	0 %	60 %	40 %	222102549
2426	NC_011981	CAATCG	2	12	147942	147953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222102549
2427	NC_011981	GGGGC	2	10	148003	148012	0 %	0 %	80 %	20 %	222102549
2428	NC_011981	TGA	2	6	148185	148190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102549
2429	NC_011981	GGCT	2	8	148198	148205	0 %	25 %	50 %	25 %	222102549
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2432	NC_011981	CAT	2	6	148344	148349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102549
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2434	NC_011981	GAC	2	6	148538	148543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102549
2435	NC_011981	AGC	2	6	148547	148552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102549
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2438	NC_011981	CAG	2	6	148633	148638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102549
2439	NC_011981	GCG	2	6	148664	148669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102549
2440	NC_011981	TGA	2	6	148962	148967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102550
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2442	NC_011981	CTG	2	6	149057	149062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102550
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2451	NC_011981	CTG	2	6	149444	149449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102550
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2481	NC_011981	TGAT	2	8	150964	150971	25 %	50 %	25 %	0 %	222102552
2482	NC_011981	TTG	2	6	151057	151062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102552
2483	NC_011981	GGC	2	6	151134	151139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102552
2484	NC_011981	GC	3	6	151190	151195	0 %	0 %	50 %	50 %	222102552
2485	NC_011981	CGG	2	6	151202	151207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102552
2486	NC_011981	TGC	2	6	151285	151290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102552
2487	NC_011981	GAT	2	6	151383	151388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102552
2488	NC_011981	CGG	2	6	151406	151411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102552
2489	NC_011981	TGA	2	6	151426	151431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102552
2490	NC_011981	TCA	2	6	151567	151572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102552
2491	NC_011981	GAA	2	6	151641	151646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102552
2492	NC_011981	ATC	2	6	151678	151683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102552
2493	NC_011981	TCT	2	6	151697	151702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102552
2494	NC_011981	CG	3	6	151714	151719	0 %	0 %	50 %	50 %	222102552
2495	NC_011981	GCA	2	6	151730	151735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102552
2496	NC_011981	TGG	2	6	151753	151758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102552
2497	NC_011981	GC	4	8	151825	151832	0 %	0 %	50 %	50 %	222102552
2498	NC_011981	GCCGT	2	10	151848	151857	0 %	20 %	40 %	40 %	222102552
2499	NC_011981	CCTGT	2	10	151891	151900	0 %	40 %	20 %	40 %	222102552
2500	NC_011981	GAT	2	6	151999	152004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102553

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